BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-346F15
Chromosome4 (Build37)
Map Location 33,878,174 - 33,977,002
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLyrm2, Ankrd6, LOC665298, Rragd, 4933421O10Rik, Ube2j1, LOC100039142, Gabrr2, Gabrr1, Acy1l2, Srrp, Pnrc1, Rngtt
Downstream geneLOC100041919, LOC100041924, Cnr1, Spaca1, LOC100039220, LOC665361, LOC665367, 2700059D21Rik, Orc3l, Rars2, Slc35a1, 1700003M02Rik, Gm136, 1810030N24Rik, Zfp292, Cga, Mobkl2b
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-346F15.bB6Ng01-346F15.g
ACCGA128273GA128274
length1,1111,084
definitionB6Ng01-346F15.b B6Ng01-346F15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,975,888 - 33,977,002)(33,878,174 - 33,879,260)
sequence
gaattctgctacacacacagtaggaattaggatttctgtgaactaatact
tgatatataattgttttctttcctcttaaataacatcgccttctgttgat
tcatgtcaacacaattctgtgtgatcctgtgtgagcagttctaggggaag
gaaacggaatcatgagcctcttgggatccctagtggaaagatatttgggg
aacttagggtaagaaatacaaaaccaggaagaatgtggctaccctaaagg
ttattcacggcatcttggactaactaatactgctttttattaaaagatgt
tgtcaagtatgatggttcattctcatcaataccagcccttaaaaggcagg
tacaggaggatttccatgacttccaagccagcgtgggctacagaataaaa
ccttaaccagaaaacaaagcaaaacaaaacaaaacaaaacccctacagtt
ttcacatgtggtcacaattattacttcttttatttgagtttcaaggactt
ttccaaaggtgagcaaaatttacataagaaagtcatctgtattgaataaa
attggctgttaaagaacaccttattctagaagtacttgtcaaatacttct
ttacttgtttaatggggaaatcatcttttattttcccccagaaactcagt
gtggagatgaataactcctcctccaaagggggttcttgttagtccattgt
cattttagctgcagcagaagggacagcagaatagggttgaagggacctca
gtgttcccaagttacaaaggaagagtcagagatatctcaaagaggtcaac
caactcaggagcacgggcagacaaaatgaatggaaatgggaagaaacttg
gtgacaacttgttcttgagaaaaccattacttgtgagttctttaaaatgg
gaaggattctaattccatgtcccaacttgctgtgaaggtctgtacgtaat
aacttggaaaactctgaaatacactgagagacgaaggcaagcctggtgcc
tgagaagtatcactgtgttgattgactgtagtcagctttttgggcacagt
ctgagcttcagttagctgcaccaactggcaaatgttccctactgatgaaa
catcacccaca
gaattcagaaggctgagacaggaggatcacaagttcaaggacactctggg
atatacaggtagaccttgttataaacaaacaaacaaacaaacaaacaaac
aaatagatgaccatagcattagaagacttcatcatttacatgttttaatg
ccctaacatagaaaaagcctccactcccaaaagagtactgatttgtttta
caaatctactaatttctgcaagccatgaaatactgaaagacaagtgacag
gctgggaaaaatatttcctatgtgtttagtggctaatgtacatagcatat
taaaatttcatttatatcagagataaacaatgcagtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgcatatgtgcatgtgtgcgtgttctgtaagactg
aaatagacaattcctagaagaaaaacctcagatggcataagcaaaggcca
cttgaaaagatgctgagtcacaagagctaccacatcaaaggcagagacac
gtcttcgaaagacagcttcaaccaaaagtaggacccttctgctcaacggt
tccacctgtagcagtctttcccataaaacttttagtgtcccataaacctt
tatatataagtaaaaggatgcatgggtgagaatactgtgatattgtttgt
gctaatgaaaacatgtaaatgaactaaatgtttactattgaattatgaca
gtctgcattaaggaacattatgcagctactaaaaagaatgacataagtca
atattcatagacaggagaataacccctagtaagtcatggggtgaagggac
cagtgacaggacaatgtatgtgacatcatgactattagagacaaagtagt
tataggtgtgtgtgtgtttacttgcatatgtgttacatgtatacatgtgt
gctgtataaatgcaggaatcctgctcctcttgttgatcacagcagcttca
gttgtgatctgtggctgaaggcgcagtatgatcttttctaaaaagaatta
attacatttcattaaatgtcctttacgttggcatcatctaaggaagctta
tattacaaagctgtgtggaagcagagagcatagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_33975888_33977002
seq2: B6Ng01-346F15.b_46_1156 (reverse)

seq1  TGTGGGTGATGTTTCATCAGTAGGGAACATTTGCCAGTTGGTGCAGCTAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGTGATGTTTCATCAGTAGGGAACATTTGCCAGTTGGTGCAGCTAA  50

seq1  CTGGAAGCTCAGACTGTGCCCAAAAAGCTTGACTACAGTCAATCAACACA  100
      || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CT-GAAGCTCAGACTGTGCCCAAAAAGC-TGACTACAGTCAATCAACACA  98

seq1  GTGATACTTCTCAGGCACCAGGCTTTGCCTTTCGTCTCTCAGTGTATTTC  150
      ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||
seq2  GTGATACTTCTCAGGCACCAGGC-TTGCC-TTCGTCTCTCAGTGTATTTC  146

seq1  AGAGTTTTCCAAGTTATTACGTACAGACCTTCACAGCAAGTTGGGACATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTTTCCAAGTTATTACGTACAGACCTTCACAGCAAGTTGGGACATG  196

seq1  GAATTAGAATCCTTCCCATTTTAAAGAACTCACAAGTAATGGTTTTCTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTAGAATCCTTCCCATTTTAAAGAACTCACAAGTAATGGTTTTCTCA  246

seq1  AGAACAAGTTGTCACCAAGTTTCTTCCCATTTCCATTCATTTTGTCTGCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACAAGTTGTCACCAAGTTTCTTCCCATTTCCATTCATTTTGTCTGCC  296

seq1  CGTGCTCCTGAGTTGGTTGACCTCTTTGAGATATCTCTGACTCTTCCTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGCTCCTGAGTTGGTTGACCTCTTTGAGATATCTCTGACTCTTCCTTT  346

seq1  GTAACTTGGGAACACTGAGGTCCCTTCAACCCTATTCTGCTGTCCCTTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAACTTGGGAACACTGAGGTCCCTTCAACCCTATTCTGCTGTCCCTTCT  396

seq1  GCTGCAGCTAAAATGACAATGGACTAACAAGAACCCCCTTTGGAGGAGGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCAGCTAAAATGACAATGGACTAACAAGAACCCCCTTTGGAGGAGGA  446

seq1  GTTATTCATCTCCACACTGAGTTTCTGGGGGAAAATAAAAGATGATTTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTCATCTCCACACTGAGTTTCTGGGGGAAAATAAAAGATGATTTCC  496

seq1  CCATTAAACAAGTAAAGAAGTATTTGACAAGTACTTCTAGAATAAGGTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTAAACAAGTAAAGAAGTATTTGACAAGTACTTCTAGAATAAGGTGT  546

seq1  TCTTTAACAGCCAATTTTATTCAATACAGATGACTTTCTTATGTAAATTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTAACAGCCAATTTTATTCAATACAGATGACTTTCTTATGTAAATTT  596

seq1  TGCTCACCTTTGGAAAAGTCCTTGAAACTCAAATAAAAGAAGTAATAATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCACCTTTGGAAAAGTCCTTGAAACTCAAATAAAAGAAGTAATAATT  646

seq1  GTGACCACATGTGAAAACTGTAGGGGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGCTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACCACATGTGAAAACTGTAGGGGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGCTTT  696

seq1  GTTTTCTGGTTAAGGTTTTATTCTGTAGCCCACGCTGGCTTGGAAGTCAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCTGGTTAAGGTTTTATTCTGTAGCCCACGCTGGCTTGGAAGTCAT  746

seq1  GGAAATCCTCCTGTACCTGCCTTTTAAGGGCTGGTATTGATGAGAATGAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATCCTCCTGTACCTGCCTTTTAAGGGCTGGTATTGATGAGAATGAA  796

seq1  CCATCATACTTGACAACATCTTTTAATAAAAAGCAGTATTAGTTAGTCCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCATACTTGACAACATCTTTTAATAAAAAGCAGTATTAGTTAGTCCA  846

seq1  AGATGCCGTGAATAACCTTTAGGGTAGCCACATTCTTCCTGGTTTTGTAT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGCCGTGAATAACCTTTAGGGTAGCCACATTCTTCCTGGTTTTGTAT  896

seq1  TTCTTACCCTAAGTTCCCCAAATATCTTTCCACTAGGGATCCCAAGAGGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTACCCTAAGTTCCCCAAATATCTTTCCACTAGGGATCCCAAGAGGC  946

seq1  TCATGATTCCGTTTCCTTCCCCTAGAACTGCTCACACAGGATCACACAGA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGATTCCGTTTCCTTCCCCTAGAACTGCTCACACAGGATCACACAGA  996

seq1  ATTGTGTTGACATGAATCAACAGAAGGCGATGTTATTTAAGAGGAAAGAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTGTTGACATGAATCAACAGAAGGCGATGTTATTTAAGAGGAAAGAA  1046

seq1  AACAATTATATATCAAGTATTAGTTCACAGAAATCCTAATTCCTACTGTG  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAATTATATATCAAGTATTAGTTCACAGAAATCCTAATTCCTACTGTG  1096

seq1  TGTGTAGCAGAATTC  1115
      |||||||||||||||
seq2  TGTGTAGCAGAATTC  1111

seq1: chr4_33878174_33879260
seq2: B6Ng01-346F15.g_69_1152

seq1  GAATTCAGAAGGCTGAGACAGGAGGATCACAAGTTCAAGGACACTCTGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAAGGCTGAGACAGGAGGATCACAAGTTCAAGGACACTCTGGG  50

seq1  ATATACAGGTAGACCTTGTTATAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACAGGTAGACCTTGTTATAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAC  100

seq1  AAATAGATGACCATAGCATTAGAAGACTTCATCATTTACATGTTTTAATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGATGACCATAGCATTAGAAGACTTCATCATTTACATGTTTTAATG  150

seq1  CCCTAACATAGAAAAAGCCTCCACTCCCAAAAGAGTACTGATTTGTTTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAACATAGAAAAAGCCTCCACTCCCAAAAGAGTACTGATTTGTTTTA  200

seq1  CAAATCTACTAATTTCTGCAAGCCATGAAATACTGAAAGACAAGTGACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATCTACTAATTTCTGCAAGCCATGAAATACTGAAAGACAAGTGACAG  250

seq1  GCTGGGAAAAATATTTCCTATGTGTTTAGTGGCTAATGTACATAGCATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGAAAAATATTTCCTATGTGTTTAGTGGCTAATGTACATAGCATAT  300

seq1  TAAAATTTCATTTATATCAGAGATAAACAATGCAGTGTGTGTGTGTGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATTTCATTTATATCAGAGATAAACAATGCAGTGTGTGTGTGTGTGT  350

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGCATATGTGCATGTGTGCGTGTTCTGTAAGACTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGCATATGTGCATGTGTGCGTGTTCTGTAAGACTG  400

seq1  AAATAGACAATTCCTAGAAGAAAAACCTCAGATGGCATAAGCAAAGGCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAGACAATTCCTAGAAGAAAAACCTCAGATGGCATAAGCAAAGGCCA  450

seq1  CTTGAAAAGATGCTGAGTCACAAGAGCTACCACATCAAAGGCAGAGACAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAAAAGATGCTGAGTCACAAGAGCTACCACATCAAAGGCAGAGACAC  500

seq1  GTCTTCGAAAGACAGCTTCAACCAAAAGTAGGACCCTTCTGCTCAACGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTCGAAAGACAGCTTCAACCAAAAGTAGGACCCTTCTGCTCAACGGT  550

seq1  TCCACCTGTAGCAGTCTTTCCCATAAAACTTTTAGTGTCCCATAAACCTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACCTGTAGCAGTCTTTCCCATAAAACTTTTAGTGTCCCATAAACCTT  600

seq1  TATATATAAGTAAAAGGATGCATGGGTGAGAATACTGTGATATTGTTTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATAAGTAAAAGGATGCATGGGTGAGAATACTGTGATATTGTTTGT  650

seq1  GCTAATGAAAACATGTAAATGAACTAAATGTTTACTATTGAATTATGACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAATGAAAACATGTAAATGAACTAAATGTTTACTATTGAATTATGACA  700

seq1  GTCTGCATTAAGGAACATTATGCAGCTACTAAAAAGAATGACATAAGTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCATTAAGGAACATTATGCAGCTACTAAAAAGAATGACATAAGTCA  750

seq1  ATATTCATAGACAGGAGAATAACCCCTAGTAAGTCATGGGGTGAAGGGAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCATAGACAGGAGAATAACCCCTAGTAAGTCATGGGGTGAAGGGAC  800

seq1  CAGTGACAGGACAATGTATGTGACATCATGACTATTAGAGACAAAGTAGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGACAGGACAATGTATGTGACATCATGACTATTAGAGACAAAGTAGT  850

seq1  TATAGGTGTGTGTGTGTTTACTTGCATATGTGTTACATGTATACATGTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAGGTGTGTGTGTGTTTACTTGCATATGTGTTACATGTATACATGTGT  900

seq1  GCTGTATAAATGCAGGAATCCTGCTCCTCTTGTTGATCACAGCAGCTTCA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTATAAATGCAGGAATCCTGCTCCTCTTGTTGATCACAGCAGCTTCA  950

seq1  GTTGTGATCTGTGGCTGAAGGCGCAGTATGAGCTTTCTAAAAAAGAAATT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||
seq2  GTTGTGATCTGTGGCTGAAGGCGCAGTATGATCTTTTCTAAAAAG-AATT  999

seq1  AATTACA-TTCATTAAATGTCC-TTACGTTGGCATCATCTAAGGGAAGCT  1048
      ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AATTACATTTCATTAAATGTCCTTTACGTTGGCATCATCTAA-GGAAGCT  1048

seq1  TAATAATTTACAAAGCTGTGTGGAAGCAGAGAGCATAGG  1087
      | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  T-ATA--TTACAAAGCTGTGTGGAAGCAGAGAGCATAGG  1084