BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-350G05
Chromosome4 (Build37)
Map Location 97,150,600 - 97,317,312
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC620883, EG638698
Upstream geneLOC665095, Cyp2j6, Cyp2j9, Cyp2j5, LOC100039415, LOC620779
Downstream geneNfia, LOC100039459, LOC669426, LOC384106, 0610025J13Rik, Tm2d1, Inadl
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-350G05.bB6Ng01-350G05.g
ACCGA131074GA131075
length1,1781,076
definitionB6Ng01-350G05.b B6Ng01-350G05.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(97,316,105 - 97,317,312)(97,150,600 - 97,151,679)
sequence
gaattctctgagtgctctcgccatagcctagagagctcttcaaaagtgtt
cctttacccacacatgctttgcagtccactgtaaggagaaatggccactt
ttcagattaagtgggcagaaaccaagtcagcaatagtcctctaaaaggaa
cttggtgaccagggtaagcagagaacgcaggcctctctaagaaacctcag
agacctttagtcataataagaactgaaactctgaactgattataaagatc
taggggaccctatccatatttgactcacccttgctcctgtgtctagtaac
cactcaccaggaatctgaggaagaaccaagagaacaggaaagagtctctg
tgtgcattagaaactatctgccattgggacagtccaccttctatatttaa
agtttagcatttcatccagatgctggttgcaaactttacagagatccttg
tgctcagagaagctgggaaacttgacttagacggttagatgctttgtaga
gcagacccaacagtgagctcgcctattgtcactgagtggaccagagcagg
taacagaatgtattgagggatcttgtccttagtcctgtacttactatttc
gagtctctctggagaatgtacagacatcatcagactggtcagggaaggat
ggcgctgttcttgtctcagaggaaatgaccaatgagttaattttggattg
gagctgtttgctccgggatccggcacaggtggcctgtgtatagcagaaga
aggattgcttatgttcagatagaatgggatttagccccatgtgggtcagc
gtgcctgttgcctaggaaagggcaccttggacgcctctcagttggaagat
attatctccagatggagtcctctgcctgctggcaaagtcaccagcattat
ttggtaatatttgatgtgctatttatatggaaaggggctttattggcata
tctttcacatcatgcacaaacagctctaacttttctcctaaaggggtggc
agcatgagatgcaaagctgaaagggatcaggcaagatggccagctatgag
ctcagccaacacatgtgtctgacagagagtcaagtctagctgattgcatt
cagctgccatctctgctgctgactgactgctgtcaccttgacgatctgca
gatcttcggaactcaggcttcaatgaac
gaattccaggcaggttacaaaggtcatcacgaagcaggaagagttaatga
acctctgaaaccacttcccaatcctcacaccaaaactaaagcagatttta
ggggctcctcgttaataaattttaagtaattgaaataaatcatgtgttat
ctctagtttaaacttggaaaagttagctgaataaaaaattaatgttctgt
tcaaatcccttagccactagggatatctctttttaaaagaaaaacaagac
aataaacatatctatagtattgactgcagaaggaaacttgaatgtctatc
acttgattttccctctttcacacacacacacacacacacacacacacgca
cacgcacacgcacacgcacacactctcatttgcatgcatacacacatttc
ttatctaccaccaagcaagtcttacacttgaattcagatcttaggcttgg
cttcaggactctttaccagacaagtcatttgctgacactatgatgtcact
tttacttttactatttgatccatttcaaatttattttgatgtacagtatg
aacaggaatccaaaattactgcccaaatggatatctgataattgctgtaa
aaatatctattcacaaatctctcagttcacacacatgtacagtgctgtga
actggccagtttacatgatgtatcatttaccgtgtatttgtaagttctac
aggggggctttcttctctggtcctttggttttacttttcagccaatgttt
tctgtttattcaacaagcaggatatcttttaatatctcctaaaaaaagca
ttttccctttctatgaatctatttattctcatttactttttaaaatatca
tttggtgttatattaggactatgtgtgatttaaagactaatataaaaaaa
cctttccatttatcttagaatgagtcttcctatcagcgaacttcttgtat
aaatttgttcagctctctttcattgtaatctcagaacatgaatgttatgt
gtatgctgtacactgtgcatatgtatgagttgtggctgtacatatgtata
tgattcattattatactttgcatata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_97316105_97317312
seq2: B6Ng01-350G05.b_51_1228 (reverse)

seq1  GTTCATTGAAGCCCTGAG-TCTGGAGCTCTTGCCAGATTCGTCAGAGTGA  49
      ||||||||||| |||||| || | || |||   |||| ||||||  ||||
seq2  GTTCATTGAAG-CCTGAGTTCCGAAGATCT--GCAGA-TCGTCAAGGTGA  46

seq1  CAGGCGAGTCCAGCTTCAGCAGCCAGAGAT-GCAGCCTGAATGCAAATCA  98
      |||   ||| |||  ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||
seq2  CAG--CAGT-CAG--TCAGCAG-CAGAGATGGCAG-CTGAATGC-AATCA  88

seq1  AGGCTAGGCCTGGGCTCTCTGGCCAGGACACATGGTGTTGGGCCTGAGCT  148
        |||| | || | ||||||| |   ||||||| |||||||  |||||||
seq2  --GCTA-GACTTGACTCTCTGTC--AGACACAT-GTGTTGG--CTGAGCT  130

seq1  CATAGCTGGCCAATTCTTTGCCCTGATCCCTTTCCAAGCTTTGCCATCTT  198
      ||||||||||||  ||||   |||||||||||||  ||||||| |||| |
seq2  CATAGCTGGCCA--TCTT--GCCTGATCCCTTTC--AGCTTTG-CATC-T  172

seq1  CATTGCTGCCACCCCTTTTAGGAAGAAAAGTTAGAGCTGTTTGTGCATGA  248
      || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CA-TGCTGCCACCCC-TTTAGG-AGAAAAGTTAGAGCTGTTTGTGCATGA  219

seq1  TGTGAAAGATATGCCAATAAAGCCCCTTTCCATATAAATAGCACATCAAA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TGTGAAAGATATGCCAATAAAGCCCCTTTCCATATAAATAGCACATC-AA  268

seq1  ATATTACCAAATAATGCTGGTGACTTTGCCAGCAGGCAGAGGACTCCATC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTACCAAATAATGCTGGTGACTTTGCCAGCAGGCAGAGGACTCCATC  318

seq1  TGGAGATAATATCTTCCAACTGAGAGGCGTCCAAGGTGCCCTTTCCTAGG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGATAATATCTTCCAACTGAGAGGCGTCCAAGGTGCCCTTTCCTAGG  368

seq1  CAACAGGCACGCTGACCCACATGGGGCTAAATCCCATTCTATCTGAACAT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGGCACGCTGACCCACATGGGGCTAAATCCCATTCTATCTGAACAT  418

seq1  AAGCAATCCTTCTTCTGCTATACACAGGCCACCTGTGCCGGATCCCGGAG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAATCCTTCTTCTGCTATACACAGGCCACCTGTGCCGGATCCCGGAG  468

seq1  CAAACAGCTCCAATCCAAAATTAACTCATTGGTCATTTCCTCTGAGACAA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAGCTCCAATCCAAAATTAACTCATTGGTCATTTCCTCTGAGACAA  518

seq1  GAACAGCGCCATCCTTCCCTGACCAGTCTGATGATGTCTGTACATTCTCC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAGCGCCATCCTTCCCTGACCAGTCTGATGATGTCTGTACATTCTCC  568

seq1  AGAGAGACTCGAAATAGTAAGTACAGGACTAAGGACAAGATCCCTCAATA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGACTCGAAATAGTAAGTACAGGACTAAGGACAAGATCCCTCAATA  618

seq1  CATTCTGTTACCTGCTCTGGTCCACTCAGTGACAATAGGCGAGCTCACTG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTGTTACCTGCTCTGGTCCACTCAGTGACAATAGGCGAGCTCACTG  668

seq1  TTGGGTCTGCTCTACAAAGCATCTAACCGTCTAAGTCAAGTTTCCCAGCT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTCTGCTCTACAAAGCATCTAACCGTCTAAGTCAAGTTTCCCAGCT  718

seq1  TCTCTGAGCACAAGGATCTCTGTAAAGTTTGCAACCAGCATCTGGATGAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTGAGCACAAGGATCTCTGTAAAGTTTGCAACCAGCATCTGGATGAA  768

seq1  ATGCTAAACTTTAAATATAGAAGGTGGACTGTCCCAATGGCAGATAGTTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTAAACTTTAAATATAGAAGGTGGACTGTCCCAATGGCAGATAGTTT  818

seq1  CTAATGCACACAGAGACTCTTTCCTGTTCTCTTGGTTCTTCCTCAGATTC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAATGCACACAGAGACTCTTTCCTGTTCTCTTGGTTCTTCCTCAGATTC  868

seq1  CTGGTGAGTGGTTACTAGACACAGGAGCAAGGGTGAGTCAAATATGGATA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGAGTGGTTACTAGACACAGGAGCAAGGGTGAGTCAAATATGGATA  918

seq1  GGGTCCCCTAGATCTTTATAATCAGTTCAGAGTTTCAGTTCTTATTATGA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCCCTAGATCTTTATAATCAGTTCAGAGTTTCAGTTCTTATTATGA  968

seq1  CTAAAGGTCTCTGAGGTTTCTTAGAGAGGCCTGCGTTCTCTGCTTACCCT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAGGTCTCTGAGGTTTCTTAGAGAGGCCTGCGTTCTCTGCTTACCCT  1018

seq1  GGTCACCAAGTTCCTTTTAGAGGACTATTGCTGACTTGGTTTCTGCCCAC  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCACCAAGTTCCTTTTAGAGGACTATTGCTGACTTGGTTTCTGCCCAC  1068

seq1  TTAATCTGAAAAGTGGCCATTTCTCCTTACAGTGGACTGCAAAGCATGTG  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCTGAAAAGTGGCCATTTCTCCTTACAGTGGACTGCAAAGCATGTG  1118

seq1  TGGGTAAAGGAACACTTTTGAAGAGCTCTCTAGGCTATGGCGAGAGCACT  1198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTAAAGGAACACTTTTGAAGAGCTCTCTAGGCTATGGCGAGAGCACT  1168

seq1  CAGAGAATTC  1208
      ||||||||||
seq2  CAGAGAATTC  1178

seq1: chr4_97150600_97151679
seq2: B6Ng01-350G05.g_67_1142

seq1  GAATTCCAGGCAGGTTACAAAGGTCATCACGAAGCAGGAAGAGTTAATGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGCAGGTTACAAAGGTCATCACGAAGCAGGAAGAGTTAATGA  50

seq1  ACCTCTGAAACCACTTCCCAATCCTCACACCAAAACTAAAGCAGATTTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTGAAACCACTTCCCAATCCTCACACCAAAACTAAAGCAGATTTTA  100

seq1  GGGGCTCCTCGTTAATAAATTTTAAGTAATTGAAATAAATCATGTGTTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCTCCTCGTTAATAAATTTTAAGTAATTGAAATAAATCATGTGTTAT  150

seq1  CTCTAGTTTAAACTTGGAAAAGTTAGCTGAATAAAAAATTAATGTTCTGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGTTTAAACTTGGAAAAGTTAGCTGAATAAAAAATTAATGTTCTGT  200

seq1  TCAAATCCCTTAGCCACTAGGGATATCTCTTTTTAAAAGAAAAACAAGAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATCCCTTAGCCACTAGGGATATCTCTTTTTAAAAGAAAAACAAGAC  250

seq1  AATAAACATATCTATAGTATTGACTGCAGAAGGAAACTTGAATGTCTATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAACATATCTATAGTATTGACTGCAGAAGGAAACTTGAATGTCTATC  300

seq1  ACTTGATTTTCCCTCTTTCACACACACACACACACACACACACACACGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGATTTTCCCTCTTTCACACACACACACACACACACACACACACGCA  350

seq1  CACGCACACGCACACGCACACACTCTCATTTGCATGCATACACACATTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGCACACGCACACGCACACACTCTCATTTGCATGCATACACACATTTC  400

seq1  TTATCTACCACCAAGCAAGTCTTACACTTGAATTCAGATCTTAGGCTTGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTACCACCAAGCAAGTCTTACACTTGAATTCAGATCTTAGGCTTGG  450

seq1  CTTCAGGACTCTTTACCAGACAAGTCATTTGCTGACACTATGATGTCACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGGACTCTTTACCAGACAAGTCATTTGCTGACACTATGATGTCACT  500

seq1  TTTACTTTTACTATTTGATCCATTTCAAATTTATTTTGATGTACAGTATG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACTTTTACTATTTGATCCATTTCAAATTTATTTTGATGTACAGTATG  550

seq1  AACAGGAATCCAAAATTACTGCCCAAATGGATATCTGATAATTGCTGTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGAATCCAAAATTACTGCCCAAATGGATATCTGATAATTGCTGTAA  600

seq1  AAATATCTATTCACAAATCTCTCAGTTCACACACATGTACAGTGCTGTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATCTATTCACAAATCTCTCAGTTCACACACATGTACAGTGCTGTGA  650

seq1  ACTGGCCAGTTTACATGATGTATCATTTACCGTGTATTTGTAAGTTCTAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCCAGTTTACATGATGTATCATTTACCGTGTATTTGTAAGTTCTAC  700

seq1  AGGGGGGCTTTCTTCTCTGGTCCTTTGGTTTTACTTTTCAGCCAATGTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGGGGCTTTCTTCTCTGGTCCTTTGGTTTTACTTTTCAGCCAATGTTT  750

seq1  TCTGTTTATTCAACAAGCAGGATATCTTTTAATATCTCCTAAAAAAAGCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTTATTCAACAAGCAGGATATCTTTTAATATCTCCTAAAAAAAGCA  800

seq1  TTTTCCCTTTCTATGAATCTATTTATTCTCATTTACTTTTTAAAATATCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCCTTTCTATGAATCTATTTATTCTCATTTACTTTTTAAAATATCA  850

seq1  TTTGGTGTTATATTAGGACTATGTGTGATTTAAAGACTAATAATAAAAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TTTGGTGTTATATTAGGACTATGTGTGATTTAAAGACTAAT-ATAAAAAA  899

seq1  ACCTTTCCATTTATCTTAGAATGAGTCTTCCTATCAGCGAACTTCTTGTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTCCATTTATCTTAGAATGAGTCTTCCTATCAGCGAACTTCTTGTA  949

seq1  TAAATTTGTTCAGCTCTTCTTTCA-TGTAATCTCAGGAACATGAATG-TA  998
      |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||
seq2  TAAATTTGTTCAGCTC-TCTTTCATTGTAATCTCA-GAACATGAATGTTA  997

seq1  TGTGTATGCTGTACACCTGTGCATATGTATGAAGTTGTGCTTGTACATAT  1048
      ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||
seq2  TGTGTATGCTGTACA-CTGTGCATATGTATG-AGTTGTGGCTGTACATAT  1045

seq1  GTATAATGTATCATTATTATACTTTGCATATA  1080
      |||| |||  ||||||||||||||||||||||
seq2  GTAT-ATGATTCATTATTATACTTTGCATATA  1076