BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-050H04.T7 (MSMg01no050_h04.b1) | MSMg01-050H04.TJ (MSMg01no050_h04.g1) |
ACC | AG279525 | AG279526 |
length | 1,234 | 1,243 |
length of high quality (start - end) | 327 (118 - 444) | 499 (121 - 619) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_h04.b1 PHD_FILE: MSMg01no050_h04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:48:46 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_h04.g1 PHD_FILE: MSMg01no050_h04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:48:46 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NTTCACTGCGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCT
TTGTTTGGCTCTGTACCCCATTTTAATATGGTTATTTGGTTCTCTGAAGT
CTAGCTTCTTGAGATCTTTGTATTTATTGGATATTTGCCCTCAAACGGAT
GTAGGGTTCATGTTAATCTCCTCACAATCTCTAGGTTGCCATTTTGTCCT
ACTGAAAATGTCCTCTGCCTTACAGAAGCTTTTCAATTTTGGGTGGTCCC
ATTTGTTAATAGTTGATCTCAGAGCCTGAGCCATTGGTGTTTTCCCTTTC
CCTCTTTCTCTTCTATTAGATTCAGTGTATCTGGTTTTATGTGGAGGTCC
TTGATCTACTTGAACTTGAGCTTTGTACAAGCAGATAAGACTGGATTATT
TTGCATTTTTCTACATGCTGCCAGCCACTTGAATCAGTACCATCTGTTGA
ATCTGCTGCCTCTTTTCCACTGGATGGTTTTGGCTTCATAGGCAAAGTTC
AGGTGACCATAGGTATGTGCGTCCATTTCTGTGCCTTCAATTCTATTCCA
TTGATCTACCTTTCTGTCTCCGTACCAATACTATGCACGTGTTTTTTGTT
TTGCTTTGCTTTTACCCCTATTTCTCTGTAGTAAATCTTTAGGTCAGGGA
TGGTGATTCCCCCAGAAGTTCCAATATTGCCGAGAATAGTTTTCCTTATT
CTGGGTCTTTTTGTTATTCCAGATGAATTTGAAAATTGCTCTTTCCTATC
TCTGTGAAAAATCGAACTAAGGCATTTGATGCATACCGCATTGAATATGT
AAACTGCTTTTTGTCAATATGCTCCATTTTTACCGCCTATCCTGCTGATC
CCATAACCTTGGGCATATTTCTTATTTCTTTCTGAAGTCTTTAATCCAAT
TTCTCTTTTTTTTCATCTCCCAAATGCTTGTCAAAATAAACACAGTTTCT
CACAAACCCTATGGTTTCATGATTTTAACCCATAATTTTTTCCTCAATAG
TTCTGTAATTAATTTTTCCCACACCTCTTCTTTCAAATTTATAATCCACT
TCCTCCCCATTTATCTCTAATGGGTCTTTACTCCTCCTCTTCCCTAATAC
ATTTTATCCCCCTAAATTGGTTTCCCAATTTCAAGCTCAATATCTCGCTT
TCTCTCCTTATTCTATCTATCTATCTCTTTATACCAAACTCTTCTCCTTA
AAATATCTTTTCTTCTTCTAATTTATATCCTTCT
| NTTAAACTATGGTAGCTGGGGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCTCTTACATGCCCAGTAATGCATTGACATCACTG
TATGGATCCTATTACACTACATTTTTCCTAAAAATTATAAAGGGGAAATA
CAGTTACTAAAAACAGCAGAACACCACAATCTATTTGAATAATGGTACTG
GCTTCTGTCTTGTCTTTGGATTAAAAGACAATTTAGAAGGACAAAAGGTG
ATGTCCATTTGAATCCTGATTTATTTTCATCCAGACAGTGTCCTACGATA
GAAAGGGAACATAGTCATTGGACTTTAAATCCTCATTATGGCATCCAGCA
GAAGTACACCACCTTGAGTAACTGACTTCATCTCTTAGAATTCAGATTAC
TCTCCTGTGGAAGCACCAGTATGTTCCCTACCTACTTTCTTATACACGCT
TGTGGGGAAGCAATGGGAATATATCACCAAAATGCCTCAGGCCTTCTTAG
CACAGCAAATGGTAGATATGAAAGATGTCAAGGACCCAAGCATTGTTCTT
CTCATCTACCTCCTCTTCCTGCTACTTTCCTGCCCTACCCTTGCTCTCCC
AACACTGCACCTAACTTCAAAAGCCAGCTAACAGCAGAGCTTCACCCCTA
CCAGTATGTCAATACTCCACTCCACAACCAATTCTACAATAGACAAGAGG
TTTTATTCCCCTCTACCTGGGTTCCAAAGTTGCCGTTGAGATAGCCCGTA
TACACCATACCTTTAATAAATATTTCTAGAGTCTGCTTACTCTCGGAAAT
ACCCACGGACTATAAGTTATAGAGCTCGGCAATTTTAAATCGTATTCCTT
TGAGGATCTCCTTTAACTCCCCAATTAAAATATATGGGTTAAATACATTG
AAAAACTTTCTCCCCCCCACCTTGGCCTGTTGGGCTGTGGGAATTGCAAT
CTTGTAATACCTATTCTGTAAAATCTATCTTGGCCGCTCCCTCATAACAA
ATGGGACACTATAACTACTGGAAGGACCTCCCCAAAACTCCCTCCTGGGC
CCACCCATCCAAAGCATTTCTTATTCCCCTTAAAAAAAAACCCATGCCTC
CCCTCTGGTTCCAAACCATCCCCTATATTTTTTAAAACCCCACAAACTCT
GGAATACAACACCTCTTTGTGCCTCTCTCACACAAAGTTTTCGTGTTCTC
TAGATAAGCGCTCTTANTNATTTATNTACCGTTGTATTTTACT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 9 10 10 11 14 15 18 14 12 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 13 15 19 17 24 30 37 47 47 47 47 37 37 34 34 30 24 24 25 24 27 30 34 37 37 41
39 43 43 48 50 50 59 59 59 44 35 35 36 36 29 21 22 19 12 17 13 24 19 25 32 37 39 39 42 42 43 48 48 43 48 43 43 43 47 42 42 47 47 50 50 47 47 42 42 33
33 36 36 26 25 12 22 17 26 16 13 8 8 8 8 13 15 22 25 17 28 34 33 36 36 36 36 34 35 32 32 43 43 53 53 57 59 57 57 57 57 48 48 48 59 59 54 54 54 57
57 48 43 43 40 39 39 39 43 47 47 47 47 50 53 36 36 50 50 47 36 48 41 37 33 28 25 17 12 12 12 12 9 16 15 24 24 34 37 28 28 28 37 28 26 15 24 32 43 47
47 47 47 48 48 48 57 48 48 48 48 43 43 43 48 48 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 59 57 50 57 47 47 47 47 57 57 57 47 44 47 47 47 47 44 44 57 57
57 57 57 57 47 47 47 57 57 47 57 57 57 57 57 59 68 57 57 57 47 44 43 50 43 48 57 57 52 57 52 52 57 57 57 52 37 52 52 52 52 57 59 57 59 57 59 59 59 59
59 57 59 59 59 59 68 59 59 59 59 57 57 57 57 38 38 14 38 38 57 57 57 57 57 45 45 52 44 44 42 32 21 38 13 13 24 38 44 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 59
57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 43 43 32 32 32 43 43 50 43 59 50 42 35 31 29 33 32 35 37 44 44 35 42 42 42 42 43 30 19 9 9 9 9 10
27 32 35 37 39 46 47 59 48 48 48 47 47 59 47 43 47 46 48 48 43 39 35 35 35 39 39 39 40 43 48 43 42 28 21 12 12 27 34 57 27 27 12 12 12 25 11 11 11 12
12 13 18 18 26 20 24 15 16 16 24 26 47 47 46 43 39 28 28 19 23 21 33 43 43 43 32 32 28 37 28 24 12 11 11 10 10 10 9 9 9 9 9 14 19 32 39 42 44 57
48 40 40 30 30 39 44 46 44 36 25 25 30 30 34 36 32 24 19 11 11 11 12 16 32 37 57 57 59 28 24 11 11 12 24 25 42 48 48 57 57 57 59 59 68 59 59 57 54 54
54 57 57 50 54 52 46 41 41 41 46 46 46 30 30 16 24 29 43 43 43 35 44 44 57 57 47 47 47 47 57 57 57 57 34 32 15 15 14 27 24 24 12 13 13 26 26 35 42 42
57 59 43 31 27 29 29 30 42 44 57 21 25 10 10 12 8 8 14 20 42 57 47 48 47 41 37 24 19 13 13 19 15 24 25 42 42 43 42 42 35 32 32 39 39 28 28 24 19 19
32 23 31 31 22 31 28 37 30 30 28 22 21 12 12 10 10 10 19 18 9 9 9 18 18 31 28 18 17 16 10 10 16 16 24 34 34 23 22 16 18 21 21 10 10 11 22 22 12 11
11 17 17 18 18 11 10 13 21 23 28 32 28 33 25 25 28 30 30 23 23 28 24 28 15 14 9 9 9 8 10 10 9 9 12 20 19 12 11 10 10 9 9 8 8 8 8 10 10 12
11 10 13 20 11 11 9 8 8 9 16 13 11 11 9 9 11 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 13 17 21 19 11 10 10 10 10 9 9 9 9 9 15 13 13 12 12 12 12 16 15
12 12 8 8 8 8 8 15 14 17 14 19 10 9 11 16 11 11 11 10 9 9 9 9 13 16 25 23 26 18 13 10 10 10 8 8 8 10 10 14 16 15 15 10 10 10 19 13 19 10
10 10 8 8 8 11 11 11 10 12 11 9 9 9 10 11 10 10 10 8 8 8 8 8 9 11 12 12 10 10 10 10 10 12 10 11 10 10 8 8 8 8 10 11 11 11 12 17 20 31
17 16 12 9 9 11 15 16 11 11 10 13 6 6 8 8 8 9 12 13 14 10 15 12 12 11 11 10 10 8 8 8 8 10 13 10 10 10 10 13 8 8 8 8 8 8 9 8 10 9
10 10 10 10 11 12 15 18 10 8 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 10 15 8 9 9 9 9 11 12 10 10 10 10 10 10 10 9 8 8 8 12 7 9 10 10 10 10
10 10 10 8 8 8 8 8 9 9 11 12 11 11 10 10 12 9 8 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 12 11 9 9
9 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 7 6 8 8 8 6 7 10 6 6 6 8 9 9 9 8 8 10 10 8 8 10 8 11 8 8 8 8 8 8 13 15 12 11 13 10 10 9
8 8 10 13 8 8 9 9 11 11 15 16 16 11 11 11 15 12 11 11 11 10 12 10 9 9 9 9 11 13 24 18 18 8 8 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 8 8 8 9 10 10 13 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 6 6 10 7
12 8 8 11 8 8 8 11 16 11 12 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 10 8 9 7 7 8 8 8 11 11 8 8 | Open.Hide. 0 3 6 6 8 6 6 7 7 7 6 6 6 6 8 10 8 9 9 6 14 9 9 8 8 8 6 8 8 9 13 8 8 12 15 18 33 21 19 9 9 9 19 21 10 10 14 27 23 36
28 32 59 39 37 48 48 43 47 41 39 39 27 23 9 11 9 10 10 10 9 9 9 11 11 13 12 14 14 13 10 19 16 24 37 43 44 50 47 50 50 50 47 39 43 36 36 33 33 33
33 33 28 25 15 10 10 11 10 10 11 13 19 19 22 22 10 14 10 10 13 23 30 39 47 41 37 37 37 30 37 37 57 53 53 53 53 50 47 48 43 40 34 30 30 39 42 43 43 48
39 39 39 41 46 48 48 48 48 48 57 59 57 54 54 47 48 47 47 46 57 46 48 57 47 47 47 44 36 36 28 33 36 44 46 57 59 54 54 48 48 46 46 40 43 41 44 57 57 57
42 43 35 50 50 57 50 50 50 57 57 57 68 68 68 59 59 54 52 52 52 50 52 37 37 52 59 59 57 52 52 57 38 38 17 17 17 38 38 52 52 52 52 52 57 57 57 54 54 57
44 44 33 33 33 43 43 48 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 57 48 44 42 42 42 57 57 44 47 47 47 44 44 44 41 39 44 44 43 47 43
57 57 44 34 31 20 20 28 32 39 39 37 37 33 23 23 11 11 12 9 9 9 24 23 47 47 47 48 47 48 57 57 48 48 48 47 59 37 37 32 22 15 8 6 6 8 8 19 19 20
20 20 32 32 35 39 39 39 39 43 43 43 47 43 40 40 36 36 23 21 11 11 11 21 26 57 48 47 43 43 43 47 47 48 25 25 12 12 18 32 44 46 46 43 43 28 29 24 30 30
28 30 30 42 25 32 32 32 43 43 22 21 10 10 12 25 21 57 44 44 43 47 25 34 13 15 20 32 44 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 52 43 43 43 36 19 10 10 12
27 24 43 36 20 20 17 20 20 32 29 33 32 38 27 20 20 20 38 38 52 38 38 17 17 13 28 24 35 35 39 43 57 57 57 57 57 57 32 32 23 32 38 50 43 52 36 38 20 18
15 18 9 11 11 12 10 21 20 32 36 24 35 31 31 31 43 44 43 43 35 35 35 37 37 43 38 32 20 20 20 27 32 27 26 12 11 9 19 9 9 9 19 23 48 48 48 57 59 59
47 47 47 59 59 43 27 19 12 12 27 32 43 54 57 47 32 30 13 12 12 24 24 43 42 42 37 35 35 40 41 43 41 41 42 42 39 39 37 42 48 42 42 42 48 48 48 39 37 32
30 30 32 32 37 37 43 36 36 39 43 39 37 36 27 19 22 23 20 27 21 20 12 11 12 11 16 16 28 34 34 37 29 15 15 12 13 15 28 21 31 32 31 20 20 32 32 43 42 25
20 15 11 11 12 17 10 10 10 10 10 17 17 11 12 10 13 10 10 10 16 22 21 12 12 11 15 15 17 17 20 21 15 14 12 11 10 9 10 13 9 9 9 10 10 9 12 11 13 13
15 15 10 10 10 15 8 8 8 12 12 22 28 34 31 35 29 25 13 12 12 11 12 10 10 10 10 16 16 22 19 23 18 14 10 12 10 14 11 12 12 22 10 8 8 7 7 8 10 8
8 8 8 8 12 14 28 28 21 16 11 11 12 9 8 8 7 7 11 12 21 19 21 13 12 12 15 10 10 10 10 10 8 10 8 8 8 8 13 10 6 6 8 8 12 11 8 8 10 8
8 8 10 8 8 11 18 18 11 9 9 9 10 10 10 9 9 8 8 10 8 11 12 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 8 10 10 10 9 9 9 9 8 8 8 10 8 8 8 9
8 9 9 11 13 13 10 10 10 10 13 13 10 10 10 11 12 19 17 10 10 10 8 8 8 8 10 10 20 13 10 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 11 13 12
13 10 10 8 8 8 8 8 13 15 16 12 19 11 10 9 10 8 10 9 9 9 18 11 10 10 9 9 8 8 8 8 7 8 10 9 14 14 8 8 10 8 9 8 9 8 10 8 8 8
8 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 10 8 6 6 6 8 6 10 10 11 12 12 12 10 8 8 7 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9
12 11 11 6 6 8 8 6 6 8 8 10 10 9 13 11 11 11 11 12 11 11 10 8 7 8 8 8 8 8 13 12 10 10 8 10 13 13 10 9 9 9 13 13 13 13 12 11 11 11
11 11 9 9 8 8 6 6 8 8 11 8 6 6 6 8 8 12 11 11 10 10 8 8 7 6 6 6 10 10 10 10 10 8 8 9 9 12 12 15 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10
7 10 6 6 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 7 7 8 6 7 7 7 10 8 8 8 8 10 13 15 12 11 11 11 11 8 8 8 8 10 10 10 9 9 8 7 11 8 8 8 8
7 7 9 10 10 10 9 10 10 8 8 8 8 10 14 10 8 8 8 8 6 8 6 6 6 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 9 8 8 8 8 8 8 10 11 16
16 10 9 9 10 9 9 7 7 9 6 6 6 6 8 3 0 3 0 3 8 11 10 9 3 0 3 7 6 8 6 6 6 8 8 6 8 9 13 12 13 9 9 |