BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-050I17.T7 (MSMg01no050_i17.b1) | MSMg01-050I17.TJ (MSMg01no050_i17.g1) |
ACC | AG279593 | AG279594 |
length | 1,264 | 1,243 |
length of high quality (start - end) | 119 (128 - 246) | 49 (264 - 312) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_i17.b1 PHD_FILE: MSMg01no050_i17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:49:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no050_i17.g1 PHD_FILE: MSMg01no050_i17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:49:00 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TATGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTCTTGT
GGACTGGAACACCCTTAAAGGAAACAGAAGTCTTATCACTATATTATTCT
CACCCCTATTCTAGTAGAAATGACCTGACCTCTGTCTTAAACAACTACCC
TCTGTGTGTTAGTGTAATCACACCATTTGAGATGAGATTTATGAACTTAC
CCCTATGCCCTGTGTTCCTATAAGCAAGTGGCACTTCAGTATCAGCAAGT
GTGCTTGCTATACATTGCTTTGAGATAATATCTATGACAATCAATTTATG
AAGAAGAAATATTCAAGTCTAATTACAATTTTAATTCTAACTATCATACA
ATTTTATGCCTGTATCATGGACAGGTCAAAAATATGCTCAATTTATTTAT
TTAAGGGAATAAGTGTTTTGTAGAGGAGATAATGCCGAAGACTAAAACTT
GGTAGAAATAATCGTACTATTTCTAGAATATTGACCATTGGACTCCCGTT
TACACTTCCTACCATCTCACATTTTGTAGGTATTACATCATATACCATGA
CTATATCACAGCGAAACACTGGAAGTTTCCTATGGTACAAATTATAACAG
CAGATTTTATTACAAAAAAACGTAAAAAATTTGTACTCATTTCTGTCCAG
TGCCTGTGAGCTATGATTAAAGGACAGGAGTTATTTTCAGTGTCTGGCTT
GTCTATTTTATCATAACGTTTTCTAAATGAAAACCTTCCATGTTCTCTTA
TTATAAAGGCTTCTTCTTTCTTTTCTTACTTTTCCTCCCTTTCTTTCTTT
TCTTACTTACATTTAATCTCTTTTTTTTGCGCATTGTTTTTGCCCCAACT
CGATTTATATCTTGTATTGTTACCCTTCTTATGATTTTGTTGTCTAATAT
ATTTTGCCCTTATATTAAATTCTCTTCTCTATTGACCCTAGTATCTTTTT
ATTGCTTGTCCTGTTAATCTTTATTTGTAACTTTTCCTTAAACAAAATTT
CATTTTTGGAATTTAATTTTTTTATCCATTTTATAAATAAATTTTGTTTT
ATATTCTTCTTTTATCCTTATTATAAATGAATTTTTTGTCTACTGTTATG
TCCCATTTTTAATACTTTTTGGAAAACTGTGGTTCGTCTCCACTTTATAA
TAATTATCTTCTCTCTTTCCACTTTCTTTTCTCACTTCAAATGTTGGGAT
TATTTTTTAAATGGTGCCTCTTGGTGGTCAATTATATACCCATCTGTATT
ATATCTCTCTATTC
| TCATGGTAGCCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXCCCCCTTAACCTCTTATGGGNGAATAGAGCTTGAATATAT
AATCCCTTACATAGTCCACATTGTTCTTAATTTGTATATCTCTTGAAGGC
ATTCTAGGCTGGTTCTATAGGTTTGTTTTAAATAGCGTTATAATACCATC
GTAAAGCAAATTTATTGTTGGTAATTGACTTCAAATCCTTATAGGAACTG
ACCCAGAAGTAGTTATACATGAATCATATGTAATTCCTATTTTCAATTTT
TGAGGTATTATCATACTGATTTTATTAATAAACCTGAATAAAACTTAAAA
ATGGAAATGTTATGAATTTAGAAATATTAATGTATAAAAATAATTTTTTT
TTTCTGTTTTTATTAATTATTTTATCTATTTTTATGCCAAATGTTTCCCC
CCTCTCAGACCCACTCTCAGAATTCTTCTCTACTTCCCCCTCCTCATCAC
CTCTGATATGGTGCCCCTTGGTAGTATTCTCCTACTATTTGGCACCTCGA
CTGCAAGATTATCTACATCATTTCTCACTGATGTCCGACTAGGCATCCCT
CTGTTACATATGTGCTGGCTAGTTGCTGCTCAGAACAGCCTATCTTAAGC
TATTTGTTGATGGTTCAGTCTCTGGAACTACTCATGAGTCCATGTTGGTT
GATCAGTTTCTCTTTCTTTGGTTTTTGCATTCCCTTCATTTTCTTCTATT
TTTCCCTCTAACTTTTGCTTCTACTGTTCCTTCTTTCTCTTGTCTTATTT
CTTGATTGTGACTTTCTTGCTATTGCTTCCAGTCAAAAAATTTATTTTTT
TCTCTATTATTGTCTAAACATTTTAAATAAATTTCTATGATATATTTTTA
TTCGTTTTATCCAAATGTTTTTTTAATTTTTCCCTTTTGAATTTTCCCTT
TTATGATTTAATTAAACCCCTTTTTTTTTTTCTTTCGGGATATTTTTGAT
TGTCTTAAATGGGTTATTAAATTATATTCCTTCCCTAGTTAATTTTTTTT
TTATCCTTTTTTGGTTTTTATTCAATATTACATGGCTATCTCCTTATTTA
TACACTTTTTTTGGCTATATCCTATCTATAACAGATACTATTTGTTCCTT
TATTGAAATTTTTTTTTTATTTTATTTCACCATTTATTTATCATTCTTAG
TGTCTCTTCTATCTCTCGTTAATTTCAATTTTTCCTTTCTTTC
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 8 10 14 18 20 13 8 8 8 8 8 13 17 10 10 10 10 10 12 23 23 32 32 36 36 23 26 14 14 15 27 29 37 37 33 33 36 32 32 43 37 37 43 43 43 31 31
24 24 28 35 23 14 10 10 10 9 9 9 15 16 22 14 10 9 9 9 9 9 11 12 21 16 16 16 24 24 30 37 37 33 36 36 36 36 36 36 29 32 29 24 21 18 14 19 30 25
19 10 8 8 8 8 8 9 10 10 13 14 9 13 17 12 13 13 26 26 26 26 15 11 11 13 18 24 24 33 21 24 24 26 28 28 19 24 14 17 24 28 28 28 32 33 34 34 37 30
30 15 15 11 18 24 31 34 31 24 16 14 14 19 21 24 30 40 33 37 37 37 29 21 16 11 15 15 15 12 12 13 24 24 11 24 24 44 37 48 48 44 44 47 47 43 47 47 57 57
57 47 47 47 47 57 50 48 48 50 50 43 57 50 50 42 37 43 43 27 18 12 12 12 32 32 43 43 28 20 20 20 27 43 43 43 32 32 24 32 32 30 32 20 20 20 32 24 18 13
13 12 12 20 36 27 27 27 43 44 33 33 23 27 27 38 38 38 43 43 38 38 17 17 17 36 32 24 24 15 15 20 38 43 52 50 43 35 35 35 43 43 43 38 23 43 38 43 43 36
32 17 23 28 28 13 12 16 16 11 12 12 27 27 29 29 29 24 24 15 15 20 29 32 32 20 12 12 15 24 26 35 42 44 42 42 42 32 32 20 20 20 36 44 32 31 24 28 28 28
36 44 47 47 48 57 47 47 35 35 32 32 32 39 29 19 10 10 10 10 11 18 18 10 10 10 13 13 17 18 24 22 23 24 24 23 21 30 21 28 28 20 23 15 10 8 8 8 6 6
6 8 8 8 9 12 15 11 12 12 24 22 35 35 37 39 43 43 43 28 28 18 22 12 11 11 16 16 19 26 26 28 24 21 15 11 11 15 12 12 11 11 11 16 16 10 10 8 8 6
6 8 8 15 15 17 26 26 32 32 23 23 23 34 34 39 39 35 43 43 40 40 39 39 35 22 23 11 11 11 23 22 39 33 28 26 14 12 12 12 12 13 28 21 19 8 8 8 8 8
17 17 21 10 10 10 16 20 33 43 39 43 40 19 19 8 8 8 10 15 20 23 28 34 34 28 28 14 14 14 28 21 32 32 33 25 24 24 36 23 19 15 10 10 12 29 40 36 40 25
25 25 36 28 28 24 20 20 16 20 23 18 18 11 13 15 15 15 15 30 24 14 14 14 21 25 40 37 33 33 30 26 26 13 13 11 19 11 12 12 11 15 18 23 18 13 11 10 10 17
15 21 21 21 24 27 30 36 28 25 24 21 13 12 12 12 12 10 10 10 12 13 13 15 15 18 13 12 12 30 27 33 33 30 30 19 14 9 9 9 18 22 28 28 14 14 12 22 15 20
15 19 19 19 24 32 23 32 10 10 10 10 12 10 10 8 10 10 10 10 14 19 19 19 24 11 11 12 10 9 9 13 19 22 22 17 14 12 12 14 19 15 13 8 8 8 8 15 18 15
9 9 9 9 10 10 22 19 34 26 21 12 10 10 10 11 12 10 11 18 23 23 23 14 12 12 16 14 21 16 12 10 10 10 9 8 8 8 8 8 10 10 12 19 13 11 8 8 8 8
8 8 17 15 16 31 20 15 15 15 15 13 10 10 10 10 10 15 19 19 18 10 10 8 10 10 18 22 37 37 24 28 24 13 13 8 10 12 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10
10 10 15 11 11 15 10 17 8 8 6 8 13 10 12 12 11 10 10 12 10 11 18 11 11 18 19 23 10 11 11 10 17 16 10 10 10 10 14 10 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8
8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 6 6 6 7 10 9 9 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 9 8 8 8
8 11 22 12 11 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 13 8 10 10 10 8 10 10 8 9 9 9 9 9 11 11 11 15 18 23 10 10
10 10 11 10 10 10 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 18 12 13 11 12 9 9 9 10 9 10 11 12 12 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 13 13 8 8 8
8 8 8 12 11 10 10 10 10 9 9 9 10 9 9 9 10 15 15 11 8 8 6 6 8 8 8 9 11 8 13 12 12 10 9 9 9 12 8 10 9 10 13 15 10 10 10 8 8 8
8 8 8 8 6 6 12 6 6 8 8 10 6 8 8 8 8 10 8 9 6 10 6 6 8 10 8 9 9 9 10 11 13 18 13 15 8 8 8 8 9 13 13 16 8 8 8 11 8 8
7 8 8 8 8 8 15 15 16 7 7 6 6 6 8 8 20 17 12 10 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 8 9 8 8 8 8 11 11 8 10 10 10 13 15 8 8 8 8 8
10 8 6 6 11 8 8 7 9 15 8 8 6 7 10 19 10 11 8 10 6 6 8 7 8 11 12 10 12 7 6 8 8 8 6 6 8 8 6 13 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8
7 7 9 9 12 10 12 12 13 8 8 8 8 8 7 7 7 7 8 13 13 8 8 8 8 6 6 6 8 6 8 8 11 10 10 10 10 8 8 8 8 8 9 10 10 8 10 8 8 8
8 8 10 8 8 6 7 10 10 8 8 10 10 10 | Open.Hide. 6 6 6 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 17 11 8 8 8 9 9 12 9 9 9 10 13 13 19 20 10 10 10 23 22 23 11 11 11 16 19 19 15 23 23 32 34
39 37 33 33 33 31 30 23 15 9 8 8 8 8 8 8 9 10 12 11 11 12 9 9 9 10 15 12 22 3 0 3 17 13 22 26 33 25 32 25 25 31 34 26 26 13 14 14 27 25
12 9 9 9 12 12 15 12 11 10 12 12 10 12 10 10 10 11 11 24 18 21 19 19 19 19 22 22 25 37 33 40 30 30 28 20 26 26 28 30 25 32 31 29 26 23 23 23 15 19
9 9 10 10 15 15 15 20 41 32 39 44 30 24 24 20 21 24 21 30 32 30 28 27 20 17 16 16 18 11 12 12 24 11 11 11 11 16 17 24 32 20 23 23 22 22 18 28 32 23
23 23 32 27 33 33 33 43 43 38 38 24 24 24 15 15 13 13 12 24 12 11 11 19 27 38 43 35 42 38 38 22 17 17 24 38 43 57 52 52 43 43 32 35 35 37 37 43 43 44
35 35 32 32 15 13 13 15 24 16 14 14 13 28 19 25 32 27 27 26 36 33 35 35 42 44 43 42 42 30 30 30 32 41 44 31 35 32 42 39 36 29 29 25 25 30 30 30 35 41
41 43 41 33 28 28 23 28 18 28 23 21 17 8 8 8 8 11 23 25 28 12 12 11 12 11 11 11 19 19 28 32 32 34 21 23 11 11 11 18 19 26 30 30 25 30 18 18 14 23
23 37 36 37 32 30 28 25 28 28 28 28 20 20 20 32 32 28 28 13 13 12 18 12 14 19 27 32 23 18 18 23 23 37 31 31 15 17 14 17 17 32 36 23 25 12 12 12 18 24
44 32 42 33 35 35 35 42 42 44 43 44 36 36 33 28 24 24 32 42 42 50 50 43 43 43 44 41 41 41 26 23 17 15 11 9 9 12 12 12 15 24 27 32 35 28 28 25 25 28
36 36 30 30 25 27 16 16 12 12 12 16 11 12 12 25 19 23 15 16 12 24 24 33 32 35 39 42 42 48 28 28 13 12 12 25 24 29 22 22 25 19 19 19 17 13 20 18 21 21
22 15 19 15 20 13 12 8 8 8 8 8 10 10 9 11 15 17 19 13 11 11 15 21 13 16 22 28 30 30 30 24 32 17 17 17 24 22 15 15 11 12 12 8 11 8 8 8 8 21
21 28 28 18 16 11 11 11 17 17 13 11 11 11 18 12 15 11 12 12 22 19 13 6 6 8 8 13 21 23 13 10 10 10 8 8 11 8 8 8 8 10 14 12 12 12 14 14 17 30
27 21 16 16 10 12 10 14 14 15 15 11 9 8 8 10 8 9 8 10 8 8 8 11 15 19 10 14 14 18 18 13 12 11 17 14 9 9 9 9 11 10 10 10 8 8 8 8 8 7
9 10 17 21 17 10 10 9 12 12 13 9 9 11 11 11 9 8 8 8 6 8 8 9 10 10 10 12 12 10 9 8 8 6 6 8 6 11 10 11 10 10 8 8 8 12 8 9 10 8
8 8 8 8 8 8 9 9 8 11 11 18 15 10 10 10 10 16 8 8 6 6 8 10 11 10 8 8 8 8 11 8 10 10 9 10 10 10 12 10 10 6 6 8 8 10 10 11 11 13
10 15 7 7 8 8 9 19 10 10 9 9 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 10 9 10 10 11 13 10 8 7 6 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 9
9 13 13 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 9 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 14 16 28 22 16
11 11 11 9 9 9 9 9 11 8 8 6 6 8 10 10 10 16 12 11 11 10 10 10 8 11 8 8 8 8 8 10 13 11 8 8 10 10 11 10 7 7 8 8 10 14 16 12 12 12
12 10 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 10 10 13 10 11 8 8 8 8 8 13 15 8 6 7 6 6 8 10 8 8 7 8 11 10 8 6 6 8 10 8 10
10 10 13 9 9 9 9 10 10 13 10 8 8 8 8 8 9 9 15 19 9 9 9 15 19 13 10 10 10 11 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 9 9 8 8 6 6
8 8 8 8 8 8 11 11 11 12 11 11 11 9 9 9 11 12 11 11 11 10 8 8 8 10 8 10 10 9 7 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 9 12 12 14 10 11 14 14
13 10 13 11 12 12 13 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 12 10 11 8 10 8 8 8 8 10
9 8 8 8 6 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 9 9 12 12 14 10 10 8 8 10 13 11 15
8 8 8 8 8 8 8 12 9 12 9 9 9 9 13 12 8 6 6 6 8 8 6 6 6 8 7 9 6 8 8 6 8 10 7 7 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 6 8 6 6 8 8 9 8 10 6 6 8 8 8 8 8 11 9 9 10 10 10 10 13 8 8 8 10 8 8 9 9 10 11 8 8 8 8 8 8 |