BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123F21.T7 (MSMg01no123_f21.b1) | MSMg01-123F21.TJ (MSMg01no123_f21.g1) |
ACC | AG332986 | AG332987 |
length | 1,185 | 1,587 |
length of high quality (start - end) | 436 (41 - 476) | 153 (133 - 285) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_f21.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_f21.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_f21.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_f21.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:00 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NGGGTTTTNNNNNNAGTCACTGCGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGG
ATCCGCGGAATTCCGCACCTAGGGCAAAGGCTTTTATTGAGAGATTATTA
ACAGACAATGAATCATAATCCCCATGACACCCAGAAGGACAAACTTTGCG
CAGTACCGAAATCTATCTGTATTCATGAGGGACTTAGTTAAAAATCTTGT
AAGACCCTTGAGATAAAGACAAATAAAAGCAGTGATCTCAAATATTAATG
CTTTTAACAAAGGCCTGATAAAACCTTTACATATTTTTCTTCATTATTCT
GACCGTGAAATTAAAAAAAACAAAACAAAAATAAAAGTTCTGTGACTTAC
AGTAAGGTTTTTAAGAGAAGGAAAGAGAAACTCTATGCAAGAGGAATGCT
ATGTAGGAAAGCTGATTTTATAGGTCTTCAGAGGTCTTGGCATACCACCT
CAGCTGCAGGCTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCATAATACGCTTCCCC
CGCCCAAAAAAAAAAAGGAGGTGACACATTCTATTTACTTGATAAGTTAA
TGTGAGTTTTAATCACCAAAATTTTGTCTTTATCACATACTCATGGCCAA
CCTATTTTTATAGTTTAGTTTATTCATTAATTTTACAACAATTGGTTATT
TGTAGTACCTTTGTCCAACCTAGATTCAATGCATAACAGCCCTCTTACTC
CTCCTTAAAGCTTCTGACATTATGCCCCGCAAAAAACGCTCCCATTAGCC
TCAATCTCCTCTGGTTTCCCTACAAATCCAAATTTTCCTGGCTTTGCCTT
ACTCTAAAAAAAACCTGCCTTGGCTTTTTCTATCCAACCCTTCCCTCCTT
TTTTCCCCCCACTCCTTGTTACTCTAATGTACCTTGCGCCGATCCACAAA
CTCCCACCTTGCCGCACCATTTGTCTCTTCTTCTCCTCTGCTCCCATGTC
TCTCCTTTTATCCCTGCTCTCTTCTGGGCTTACTCCCTCAATCCTCCCTT
CCTTCCCGTCCCTCATACCCTCTCTCCCTCTGTCTTTCCTCACTCCTTTT
ATCACCATTCTTACATCCTCTTTCCCCCCCACTTCCTCTCCTCCCTCACT
CTTAACCAACCCCCTGTCATTCTCTCCTCTCCATATCTCTCTTATCTACT
TCTCCTCCGTCTTCCAATTCCTCTCTTTATTTCAT
| AAGATATNTNNNNAAAGACGGTAGNCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTGGATGGAAAGAGATAAACT
GAGAAAACCTGTCTCAAGACCTAGAAAGACCCGAAAAAATCTGAAAGAAA
GAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGGAAGGAAGGAAGG
AAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGCAGGAAGGAAGGAAGGAA
GGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGACCACCCCCCTCCCCC
TCACTCCCCCCTCCCCCTTCTCCCCTCCCCTCTACCCCCCCCTTCCTCCC
CCCTCTCCCCCCCCCCCTTCTTCCCCCTCCCTCCTCTCTCACCCCCCCCC
CCCCCTCTCCCACTCCCCTCCTTTTTTCTTTCTTCCCCCCCCTCCCCCCC
CCTCTCTTCTCTTCTCCGGCTCCCACTACCCCCCCTTTTTTTTTTTCCCC
CCCCCCCGAAATTTCCCTCCCCCCTCCCCCCCCACAAAAAAAAAAGGGGG
GGTTCTTNTTCTCCCTATCTTCCCTCCTTACTCCCCTCTTCTCCTCCTCC
CCCCTCCCATCCCTCCCCCTCCTTCTTCTCTCTCCCTCCCCCCTCTCCTT
CTCTCCTTCCTCCTCTCCCCCCCTCACCTCCCCTCCCCCTCCCTCCCCCT
CCTCCCTCCTCCCCTACTCTCCCCATCTCCCCTTCCCCCCCTCCCCCCTT
CCTCTCCCCCTCCTCTCCCCTCTCTTCTTCCTCCCTTCTCCTCCCCCTCC
CCTCTCCCCCCTTCCTCCCTTCCCCCTCCCACCTCCCCCCTCACTTTTCC
CTTCCCCCCTCTCCCTCCCTTATTCCCTACTCCATCTCCTCTTCCTCCTC
CCCCTTCACTCCCCCCCCTCCCCTACCTTCCTCCGCCCACTCCTCTCCCT
CCTCCTCCCCCTCCACTCCCCCTCTCTGCTTCCTCACTCACCTCCCCTCC
TCCCCCCCTTTCCTCCCCCCCCTCTCCTCCATCTCCTCCCTCTCTCCTCT
CCCCCCACCTTCATCCCCTTCCTCNTCTTCATTTCTCATCCCCTTCCTCT
CCCTTCTCTCCACTCTCCCCCTCCTCCTTCTTCCTTCCTCCTCCCCCTCC
TCCCTCTGCTCCTCCCTACCTCCTACCTTCCCTTCCCCCCCACTCCCTCC
CCTTGCTCCCCTCCTCTCTCCCCCCCCCTCTTCTCCTCCTCTCACCCCTT
CCCTTGCCTCTCCCTCTCCCACCTCTCCCCCTCACTCCTCCCACTACTCT
CCCCNCTTCCTCCCTTCTCTCTCCTCCCCTCTCCCCCTCCTCTCCTCTCC
TTTCTCCTCTCTCTATCCAGCCCCCTCTTTTCCGCTCTCTCTCACTCTCC
CTCCTCCTTCTCATCTCTTCCCCCTTCTTCTCCTCCATCTTTCCCTCCCT
CTCCCTCCTCCCTTCCTCCTCTCCCCCTCTCCCTATCCTCCTCCTCTCCC
TCCTACCCTCTTATCCCCCACTTTCACCTCCTCCCCTCCCTTTCCTCTCC
CCCTCCTCCTCTCTCCCTCTCTCTCTCCCTCTCTTTC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 8 11 9 3 0 0 0 0 0 0 3 9 9 9 7 7 8 8 8 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 11 12 9 12 10 16 15 20 24 24 35 28 28 35 30 30 33
33 30 27 21 21 21 22 22 29 26 28 23 20 16 13 18 29 32 31 31 25 30 30 36 43 43 48 43 34 37 28 28 37 37 43 42 42 33 40 36 43 48 57 48 54 54 54 48 48 42
42 30 30 22 36 25 24 24 33 40 57 47 48 41 36 36 40 40 41 25 25 15 15 15 19 30 28 37 24 25 11 11 11 18 19 36 42 42 42 43 43 43 43 37 37 50 50 43 48 46
50 43 30 24 11 12 12 12 32 38 44 44 36 36 37 57 36 36 32 36 42 48 50 35 35 35 50 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 28 28 13 15 15 12 26
38 43 39 43 32 38 27 27 21 27 18 32 43 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 57 54 54 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 35 35 35 62 62 57 57 57 57 52 52 57
52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 38 38 20 38 35 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 29 29 29 44 44 57 59 57 57 52 43 43 35 35 35 50 50 54 54 59 59
59 59 44 44 33 33 35 44 44 57 57 57 57 57 57 59 59 59 52 52 48 48 44 50 44 43 43 44 43 43 43 44 50 47 47 47 57 47 48 48 47 57 42 42 42 42 42 44 44 39
39 35 42 42 57 57 54 47 47 57 57 57 57 43 43 39 37 43 43 43 43 43 43 43 43 39 32 33 32 32 35 39 39 43 43 40 40 28 28 23 23 28 33 33 39 35 35 39 39 47
43 43 34 34 25 25 25 34 34 34 36 24 19 15 10 11 8 9 9 9 9 9 16 26 30 37 37 37 43 36 36 39 37 32 35 35 39 37 23 24 28 28 19 23 28 28 28 29 34 39
37 34 34 34 33 33 39 35 37 35 36 39 41 36 30 30 26 29 31 29 30 37 22 20 10 12 10 11 18 16 15 12 12 12 18 18 28 34 22 11 8 8 8 8 8 8 8 8 13 13
8 8 8 8 8 8 8 9 11 11 14 14 16 8 9 9 8 8 8 7 9 9 16 23 25 41 41 41 48 48 48 48 57 57 57 57 48 48 48 48 48 44 43 33 30 25 25 30 40 34
34 15 15 11 11 11 23 23 43 43 43 28 28 13 13 13 18 18 20 32 20 20 20 36 34 32 32 20 23 23 34 30 32 19 19 19 24 30 24 21 21 24 24 35 32 24 21 13 13 13
19 21 37 32 39 39 43 43 40 37 24 20 20 20 18 24 16 20 20 19 19 17 13 13 21 21 24 24 17 17 17 24 23 24 12 12 12 16 17 17 11 11 10 15 13 12 12 12 19 21
30 27 30 17 8 8 6 6 8 8 15 16 22 15 14 10 10 9 9 13 13 12 12 12 18 18 13 15 12 11 12 12 12 14 13 9 9 9 9 9 9 10 14 17 15 16 10 10 11 10
10 10 10 10 10 13 19 11 11 11 11 10 10 10 15 15 10 16 20 23 24 25 28 28 37 26 13 10 9 9 9 9 8 8 8 9 10 8 8 8 9 10 12 12 12 12 9 9 8 10
10 8 8 8 9 9 9 18 13 16 16 12 9 10 10 10 9 12 12 12 10 10 10 10 10 8 10 8 8 8 8 10 11 12 13 26 15 10 9 9 8 10 13 12 9 9 8 8 8 8
9 9 10 10 10 14 9 9 10 12 12 10 15 11 16 11 8 10 8 8 8 8 8 10 8 9 9 8 8 8 7 7 8 8 9 12 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 12 12
12 11 10 9 7 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 12 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8
8 8 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 7 7 6 6 8 10 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 12 12 12 9 9 11 11 11 16 11 11 9 8 8 8 8 8 10 11 10 10 16
13 10 10 11 10 9 8 10 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 11 12 13 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 11 8 8 8 9 8 8 8
8 6 6 12 10 9 9 10 10 13 14 11 11 9 10 9 12 10 16 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 8 8 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 15 8 8 10 10 9 9
9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 8 8 8 8 8 13 10 10 8 9 9 19 15 14 14 14 10 11 10 10 8 8 8 8 7 7 10 8 8 6 7 10 8 10 10 8 10 9
10 8 6 6 8 8 8 7 9 9 12 10 9 9 18 13 8 8 8 8 10 10 8 6 6 10 6 6 8 8 9 9 10 10 10 9 9 11 11 8 10 8 8 6 6 10 10 10 9 9
9 11 9 10 8 11 11 8 8 8 10 17 11 10 8 8 8 8 10 11 15 11 10 10 14 10 6 6 6 6 7 10 10 10 10 | Open.Hide. 7 7 8 7 7 8 3 0 3 0 0 0 0 3 12 9 9 9 6 6 6 6 6 3 0 3 7 7 9 9 9 10 13 12 12 9 9 7 7 11 12 15 19 8 10 10 22 15 22 22
28 28 28 35 26 29 17 23 20 22 26 33 36 50 50 50 50 44 44 39 39 37 37 25 14 10 10 10 9 9 9 9 9 9 13 11 13 11 13 18 28 34 36 38 38 42 36 36 25 18
23 27 27 36 50 50 34 26 14 21 14 26 14 17 19 11 9 9 8 8 8 8 11 11 12 24 24 21 18 15 14 12 12 16 21 31 59 59 25 27 14 12 12 28 24 25 20 20 23 32
43 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 54 57 54 59 57 57 57 54 54 57 59 59 59 44 42 30 33 33 33 42 42 47
48 43 43 43 43 43 43 43 43 43 43 44 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 54 54 54 57 57 57 59 59 44 42 33 33 35 44 47 57 47 47 47 48 57 57 57 57 57 57 54 54
54 57 57 57 54 54 54 57 54 54 54 54 54 54 54 54 54 54 54 54 54 48 46 47 43 43 37 32 28 28 18 18 8 8 8 8 10 10 10 14 12 18 8 8 8 8 8 8 8 6
6 8 8 6 6 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 10 7 6 8 8 15 15 12 11 11 11 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11
10 10 11 11 7 7 8 8 8 8 8 8 16 13 9 9 9 9 8 8 10 10 10 11 12 11 7 7 8 8 12 8 8 6 7 8 8 8 8 8 10 11 11 11 13 18 11 10 9 19
19 19 16 15 13 11 10 10 10 13 7 7 8 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 9 15 10 8 8 9 8 13 8 8 8 8 12 9 11 14 12 13 14 9 9 9 9 10 11 10 10
10 10 10 10 11 10 10 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 11 16 19 19 16 9 9 10 12 10 10 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10
27 27 33 30 17 15 9 9 10 13 9 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 12 12 9 9 9 13 15 15 11 10 13 10 8 8 8 8 14 16 16 27 21 12 10 6 6 6 7 10 7
9 8 8 8 8 9 3 0 3 8 6 6 8 8 8 6 6 8 10 19 9 10 12 9 8 8 15 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 9 11 11 9 16 16 13 10 8 8 11 10 8
8 8 10 8 12 10 10 11 10 9 10 10 9 7 8 10 10 10 6 6 8 15 8 8 7 6 8 10 12 12 10 9 10 10 19 12 12 11 11 11 8 8 13 13 15 8 8 8 8 9
10 15 16 10 12 8 8 8 8 9 10 10 8 10 7 7 8 9 9 12 12 12 13 10 8 8 8 8 8 10 10 13 9 7 10 8 9 9 10 10 9 12 11 6 6 8 8 14 8 8
8 8 8 10 10 6 6 8 8 8 10 8 11 8 9 9 9 8 8 10 10 10 10 9 9 10 10 13 13 8 8 6 6 8 10 15 16 19 13 11 12 15 12 12 13 14 11 11 11 15
13 12 13 13 10 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 7 14 12 15 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 10 10 17 21 17 15 15 19 16
16 8 8 8 10 10 8 10 8 8 7 6 8 8 6 6 8 8 9 9 9 10 12 10 10 9 9 10 10 6 6 8 6 6 10 10 13 10 10 17 11 8 8 6 6 8 8 9 8 8
8 10 10 12 16 17 10 10 6 6 8 6 6 8 6 8 10 10 8 7 7 10 8 16 12 10 8 8 6 6 6 8 8 9 9 11 9 9 10 11 6 6 6 6 8 8 8 8 8 13
12 10 12 10 8 8 8 8 6 7 10 8 11 11 11 13 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 13 10 10 8 8 8 10 9 9 9 15 10 7 6 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8
8 8 8 8 8 8 12 21 10 10 6 6 8 6 8 8 8 8 8 6 7 7 6 8 6 10 9 9 9 11 11 12 8 8 8 8 8 10 10 10 12 19 18 12 8 8 6 7 8 10
11 16 15 15 19 13 13 8 8 8 12 10 9 9 14 13 24 9 12 9 8 8 8 10 9 10 8 6 6 8 6 7 8 12 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 13 8 8 7
7 10 10 14 14 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 11 12 12 3 0 3 9 7 7 6 6 8 8 12 18 15 9 9 9 12 8 8 7 7 8 8 9 10 10 15
9 10 11 11 11 10 15 8 8 8 8 8 6 8 7 7 10 8 11 10 10 8 10 12 12 12 8 10 11 12 12 9 9 8 8 8 8 6 7 12 11 8 8 8 10 10 12 8 8 8
8 8 8 11 11 9 8 8 8 8 10 13 24 12 8 7 6 8 8 10 9 9 10 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 6 6 13 10 10 6 6 8 8 10 12 14 11 11 8
8 8 8 6 6 6 6 8 10 12 6 6 8 8 13 8 8 7 7 12 15 22 22 25 25 15 17 11 16 12 13 8 8 9 13 13 15 16 10 10 11 10 6 8 6 8 8 6 8 8
10 9 9 10 6 6 6 6 6 8 6 6 10 12 12 9 9 10 12 7 7 7 11 12 9 9 10 8 16 8 8 8 6 7 8 10 12 9 9 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8
11 11 17 3 0 3 11 8 8 8 8 10 10 9 7 7 6 10 10 12 12 7 7 8 10 13 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 7 7 10 8 8 6 6 8 6 6 6
7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 9 9 10 10 9 11 11 11 8 9 9 9 9 8 10 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 18 11 11 19
19 18 15 21 10 10 9 9 8 8 10 10 10 8 8 10 10 7 7 8 8 8 8 9 8 10 10 7 8 7 7 10 6 10 10 9 10 9 9 9 9 9 10 9 8 13 13 17 8 8
6 7 10 7 8 8 8 6 8 10 10 15 15 11 11 19 16 17 8 12 12 11 11 12 9 9 9 9 12 8 10 10 10 9 9 8 8 8 10 10 8 9 8 13 19 10 10 10 13 13
11 11 8 8 6 6 7 8 12 9 7 6 6 8 10 15 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 8 8 12 10 8 8 8 10 10 14 10 10 8 8 10 19 11 14 14 13 10 9
8 8 8 8 9 9 10 11 9 9 12 8 12 11 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 10 16 15 20 20 16 10 10 9 6 8 8 6 |