BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-123K23.T7 (MSMg01no123_k23.b1) | MSMg01-123K23.TJ (MSMg01no123_k23.g1) |
ACC | AG333227 | AG333228 |
length | 1,194 | 1,195 |
length of high quality (start - end) | 331 (135 - 465) | 274 (130 - 403) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_k23.b1 PHD_FILE: MSMg01no123_k23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:44 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no123_k23.g1 PHD_FILE: MSMg01no123_k23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:33:44 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCAAACTTNNNNNCGGAACATTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAG
GATCCGCGGAATTCAGGCCCATACCTAACCATGTATAAAAGCAATCTACA
GCAAACCAGTAGCCAACATCCCCCTTAAATGGTGAGAAGCTTGAAGCAAT
CCCACTAAAATCAGGGACTAGACAAGGCTGTCCAGTCTCTCCCTACCTAT
TCAACATTGTACTTGAAGTCCTAGCCAGAGCAATTAGACAACAAAAGGAG
ATCAAGGGGATACAAATTGGAAAGGAGAAGTCAAATTATCACTTTTTGCA
GATGATATGATAGTATATATACGTGACCCTAAAAATTCTACCAGAGAACT
CCTAAGCCTGATAAACCGCTTCAGTGAAGTAGCTGGAGATAAAATTAACT
CAAACAAGTCAATGTTCTTTCTCTACAAAAAGGACAAACAGGCTGAGAAA
GAAATTAGGGCTTTTTTTTCCCCCCCCCTAGTCACAAATAATATAAAATA
CAAAAAAATGAGTCTAACTAAGGAAGTGAAAGATCTCTATGACAAGAACT
TCAAGTCTCTGAAGAAAGAAATTAAAGAAGATCTCAGAAGATGGAAAGAT
CTCCCATGCTCATGGATTGGCAGGATCAAAATTGTAAAAATGGCTATCTT
GCCAAAAGCAATCTACAGATTCAATGCAATCTCCATCAAAATTCCAACTC
AATTCTTCAACGAATTAGAAAGGGCAATCGGCAGATTCATCTGGAATAAC
AAAAAACCTAGGATAGCAAAAACTCTTCTCAAGGATAAAAAGAACCTCTG
GTGGAATCACCATGCCCGACCTAAAGATGTACTACAGAGCAATTGTGATA
AAACCTGCATGCTACTGGGTATAGTGACCGACAAGTAAACCATTATAACA
GAAATTGAATACCCCGAGATGAACCCCCCCCCCTTAGGTCCCTTTGGATC
TTTCGACAAGGTATCTTAACCCTTCCTGTTGGAAAAAAACTGTTTTTTTC
CACAAATGGTGCCTGGCCAAATTGGCTCTTTATTTTGTTACAAAATTTTT
GAATTTGACTCCGTTCCTATTCTCCTTGGACCTAATGGCCAAATCTCTAG
TGGGATTTAATAAAACTCCTCCCTTATAAACCCTAAAACCCTTGTAAATC
TTTTTCTAGTTACTACATTTTTGGTTAAAAATTCTTCCTAAAAA
| GATTCTNNTTTTATTGATGGGAGTCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCACTTTATAGGCTCTACAGGGTCTCGC
ATCACAGGGCATCGACCTTTACAAAATTGGAGAATAAGTAGCAGGATTTC
AGGAGGAAGAGTTTGTAGCAATCGACATTGTGATTTTTCACAAAGCACAC
ATATCCTCCCACAGGATGCTAAACATTCTTCCAATCTATGTGAATCATGC
AGTGGGTATCCAGCAGAGACAAACCCCTTAGACTCAGGACTTGTTAGAGC
ATGTGCAGCTATTCGGAGAACTTTTTCCCCATTAAGATAGAAAAAGTATA
TACAGCCAGTGTGTATGGAGACTCAGGTGGCCTTTAGGGATCTGAGAGAC
TCAAAGATGTCAAGGCACTATATAAAATTTAAAGCTATACAACACAACTT
GACATCTGTTCTCTCTGACTTCTGTCAAGGCCTCCTAAAGGAATCATAAA
AGTTCTTCCTTTTGTTTTTCCCTAATCGGCAATTGAACAACATTCTGTTA
GCATCTAAAGTGAGACAGACTTCCTTCTGCTTCACTGCCTTCATCCCAGT
GTAACATAGGGATGTTAGGCATTTTCATGTTTTTAAATACATGAAACATT
CATATATGCTAATTTTCTTGCCAAATCTCACAAAACTATTGTATTAAAAA
TGAGAGAAAGTGTTTATAAAAAGGTGTGATTGCTTATTTCTTCAACAAGA
ATGGTCTGAGAAAAGTGAGGCCAATTTTTACCACATTAAAGGAAACTTTG
TCTCATTGTCTCTGCAGAGCATTTCCTCCAGTAACGCAGCACTCAACTGG
ACCCCACACCATGCCGGGACTGAAGGATATGTGCGATAGCCGAAAGTGCT
CCTTCCCCCTACTGAGCAAATAAATCCCAGCTTCAGCTTGGAAACACTGC
TAACCTAACATGCCAAAGAGCTCCCCCCCCTTTCCCCAAAGGTTTTCCTG
GTACAAGACCCAAACCGAAAGGATTTTCCTTACCCTTCCTTAAAAGAGCT
TTATCCCCTCTCCCCTCTCTTAGGCAAAAATAAAAAAAAGTCCCTTTTTG
CCCTCGACAACACAAAAAGGATTGTGTCCCCGCACCTTACCTTTGTACAG
GTTCTATAAATTTTCTCCAAACACCCATCCCCTATTATATGGTAC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 7 6 6 6 3 0 0 0 0 0 3 9 9 10 7 7 8 9 7 6 8 11 10 10 8 6 6 6 6 8 19 19 8 8 8 10 12 16 22 28 36 36 35 35 28 33
33 37 48 47 47 40 34 34 37 42 22 22 10 8 8 22 26 36 36 33 33 33 33 31 25 25 19 15 12 11 8 8 8 8 9 9 17 30 28 47 43 48 48 36 36 38 50 42 38 34
39 39 43 43 59 59 50 36 36 36 36 31 50 50 46 41 39 30 25 18 13 14 14 14 20 22 21 23 14 12 12 15 12 13 15 24 29 30 28 28 28 37 43 48 53 57 57 53 53 50
48 48 42 36 36 42 42 47 68 68 57 57 57 57 57 57 43 50 50 41 41 47 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 50 50 51 50 50 50 68 68 68 57 57 57 57 42 37 37 37 42
43 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 52 52 43 43 52 52 52 57 57 59 59 57 68 68
57 57 57 59 59 59 57 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 52 57 57 57 59 68 68 68 68 68 59 59 52 57 57 59 57 57 68 57 57 57 57 54 59 59 68 59 57 57 57 54
54 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 59 59 59 47 42 35 35 35 44 44 57 57 57
57 59 59 59 59 59 43 47 46 57 57 57 57 57 59 59 57 54 54 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 57 48 48 48 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 47 47 30 32 21 18 11 11 10 10 10 10 12 24 36 36 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 48 48 48 48 48 48 48 43 43 48 48 48 48 57
59 59 59 59 59 59 59 28 19 10 10 10 10 15 28 29 24 18 18 16 15 15 16 18 24 14 15 11 12 11 18 29 34 59 47 47 47 59 37 37 28 28 28 23 23 23 23 32 25 23
12 12 12 19 16 12 12 12 10 10 10 10 10 15 28 34 59 59 59 59 48 48 48 57 48 48 48 59 59 59 57 57 57 48 48 48 59 59 57 57 57 48 48 48 43 43 43 46 46 59
59 39 39 32 37 37 46 46 59 68 59 59 59 57 54 57 57 57 57 57 43 43 44 46 44 44 32 32 13 13 13 26 32 32 32 18 19 19 22 22 28 44 40 48 48 48 57 57 57 68
68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 68 57 57 59 59 59 68 68 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 59 52 52 43 50 50 57 59 34 27 14 13 12 27 27 52 52 59 59 59 57 68
57 57 57 57 59 59 59 47 47 47 50 59 54 57 57 50 48 54 54 57 57 43 43 43 57 46 47 47 47 57 57 57 57 57 57 54 47 32 32 19 23 20 38 38 41 41 41 34 39 39
43 46 57 47 47 47 59 47 48 48 48 48 48 46 32 30 17 18 17 30 28 40 30 28 28 28 28 21 19 20 26 26 30 30 33 25 23 11 11 11 20 20 33 37 37 32 24 12 12 14
18 15 11 10 13 14 18 18 23 24 13 10 10 12 10 15 24 20 20 28 25 31 23 28 24 30 28 19 19 14 12 12 12 12 12 11 12 19 19 19 11 10 9 10 10 10 14 12 15 13
15 15 15 15 24 25 19 11 9 13 9 9 11 19 24 28 20 20 20 24 19 20 19 14 10 10 10 10 10 11 11 12 12 19 13 17 18 11 11 11 10 10 19 16 10 11 15 16 17 20
15 19 8 8 10 12 13 9 8 8 7 7 7 8 8 8 8 8 11 9 9 10 9 9 10 10 12 8 8 8 10 10 13 9 10 9 10 9 9 9 12 10 10 9 10 12 8 8 8 8
9 10 10 8 8 8 13 11 10 9 8 8 8 11 8 8 7 8 8 13 17 12 12 12 19 14 11 12 10 10 10 12 12 11 10 10 9 11 11 15 12 12 9 9 19 12 12 12 12 12
13 16 22 10 14 16 13 12 9 9 9 10 9 10 10 10 9 9 9 9 11 9 13 10 8 8 8 9 9 10 9 9 9 10 15 10 12 12 12 10 10 8 8 8 8 11 14 15 8 8
8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 9 8 15 8 8 9 11 12 10 8 8 7 7 8 8 8 8 7 9 10 10 11 11 10 11 11 15
14 14 14 15 10 10 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 8 8 10 9 6 8 8 6 10 11 11 10 8 8 8 10 8 8 10 11 11 12 15 10 10 7 7 8 8 10
9 10 10 10 10 8 8 8 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 13 13 13 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6
6 7 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 16 12 11 10 10 10 10 19 21 21 12 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 9 9 9 9 9 3 0 0 3 17 8 8 7 8 7 9 11 10 10 10 10 10 9 6 6 7 7 7 9 11 11 11 7 6 6 6 8 11 13 22 15 17 8 9 9 23 23 36 28 28
24 28 29 37 37 37 37 36 34 34 35 44 53 47 41 48 42 42 37 27 21 16 9 8 6 8 8 8 8 10 10 10 17 19 19 16 14 23 23 35 36 36 35 29 33 17 24 37 39 39
48 48 48 48 50 50 44 44 37 33 17 19 11 11 9 10 10 10 15 15 23 24 19 12 12 13 12 12 11 18 18 36 36 57 57 53 50 50 50 50 50 57 43 43 46 48 48 42 42 32
32 32 43 59 54 54 57 54 54 54 54 57 54 48 47 47 47 47 44 44 30 32 23 24 25 36 36 37 48 46 48 48 50 57 59 59 57 57 48 48 48 57 57 57 57 54 54 44 50 37
37 37 50 50 54 54 54 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 54 52 52 57 57 54 57 57 59 57 57 57 57 57 52 52 52 52 54 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57
57 52 57 57 57 44 57 39 43 43 29 29 18 32 24 43 43 57 43 52 52 52 57 52 57 57 52 38 38 38 38 43 43 43 52 52 52 43 59 43 43 43 57 43 39 39 39 57 57 57
57 57 52 52 57 52 52 52 57 57 57 57 57 39 39 41 47 47 57 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 52 43 43 43 43 43 52 52 52 52 52 57 43 43 43 57 57
57 50 43 35 35 43 43 43 37 37 37 52 52 52 43 50 50 57 50 57 48 57 57 50 50 50 43 39 39 43 43 43 57 57 57 57 57 57 57 42 42 39 37 37 37 37 57 44 44 36
30 18 16 12 11 12 12 19 16 12 12 12 15 25 34 46 46 43 47 43 57 47 47 43 39 39 47 43 48 48 48 42 42 32 37 37 39 33 37 40 39 48 48 48 48 48 48 48 48 43
44 43 30 30 12 22 19 19 12 8 8 8 8 8 22 25 28 28 20 15 15 12 20 15 32 34 57 48 43 39 39 40 37 37 25 25 18 20 18 18 24 26 28 25 25 25 34 22 19 8
8 8 8 9 14 23 24 34 37 47 48 59 59 48 48 48 48 48 57 57 48 48 48 48 59 59 47 47 23 19 9 9 9 9 21 20 31 30 39 37 43 43 43 43 46 28 28 12 12 11
25 25 32 24 28 32 32 31 35 35 35 37 39 37 42 35 35 36 43 43 48 40 40 32 32 32 41 46 54 59 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 42 37 30 37
37 39 39 43 43 43 44 44 48 47 38 38 37 37 37 47 44 44 37 35 35 35 40 32 42 30 28 28 28 28 30 42 40 48 48 47 57 37 37 30 42 32 44 39 43 28 28 13 12 12
22 22 22 27 23 22 22 28 28 28 35 40 40 36 36 37 43 43 46 34 34 30 30 28 28 28 31 32 34 28 17 16 14 15 19 25 37 37 37 46 46 46 46 34 34 25 18 15 13 16
16 20 13 13 14 15 22 20 20 25 28 28 30 30 31 31 18 18 15 15 13 18 18 13 15 16 16 21 30 33 37 37 30 28 22 24 28 23 28 33 37 37 23 19 19 14 15 13 21 23
32 28 19 15 12 12 13 19 19 21 24 28 26 26 20 20 20 26 22 23 11 8 8 8 8 15 17 17 9 9 9 9 9 11 13 13 19 16 20 24 17 17 15 11 14 10 8 10 19 17
11 8 13 9 8 8 15 14 16 10 18 13 10 10 8 8 8 9 10 10 11 10 10 8 8 9 8 10 8 8 8 10 8 9 10 10 10 9 9 9 9 9 9 11 11 11 11 15 9 9
10 9 9 11 12 12 11 10 10 10 10 17 14 9 8 8 8 10 11 15 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 10 10 10 8 8 8
8 9 10 12 9 9 9 10 13 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 12 12 8 8 6 6 8 8 10
9 8 8 8 9 9 12 9 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 11 10 10 10 10 11 19 17 17 12 10 10 10 10 13 14 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
6 8 6 6 8 8 10 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 8 6 6 6 7 7 8 8 8 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8 8 9 8
10 6 7 8 12 19 14 11 10 9 9 10 10 10 8 8 8 21 17 12 10 9 8 8 8 8 8 12 12 11 11 11 11 11 11 11 11 10 8 8 8 10 8 10 14 19 16 15 12 11
11 11 6 6 7 6 8 8 8 6 7 10 10 9 9 12 15 10 10 10 9 10 13 10 10 10 10 10 9 11 8 8 8 8 8 11 9 9 10 10 9 8 10 6 6 8 8 6 6 11
8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 17 17 12 11 11 10 15 15 10 10 9 9 6 7 11 10 10 11 16 16 11 10 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 |