BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124H22.T7 (MSMg01no124_h22.b1) | MSMg01-124H22.TJ (MSMg01no124_h22.g1) |
ACC | AG333834 | AG333835 |
length | 1,282 | 1,243 |
length of high quality (start - end) | 33 (207 - 239) | 458 (129 - 586) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_h22.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_h22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_h22.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_h22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:40 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NGGATTCTCNNNNAACATTGTGCGCTATATACTCTCATATGGAGAGAATC
TCCGCAATTTTCTACTTGCTGAAAACCAATAAATACTCCTATATTTTTGC
CTTAACACTGGGTACTCTATATAACCCTCTAGCACCTTAGTTGTCCTACC
AATCTCTGGATCCTATTTATTTCCAATATGGGAGTAAAGTCCCCTGAATT
TTCCTTTCTCCTTTCAAGCCAGACATTTATTTTTAACAAGCTATGAAATC
ATCTGAGAGCAACTCGGTCACATCTGTTACTTTATATCTCGCTATCCTAT
TACCTTACATCTGACCTTGATTTCCCACTACTTTGATATTGCTGCCTCCT
CACTAATCCTTACGTAATTGCGATTTCCGAGCTGCATCCCCTTACTCGCT
CATTTACTTCTTGTTATCATACACTCATATGAAAGCCAGAGTCTCCACTC
GATCGGAGAGGTTTTTGCGTTCGACCCTGGACCACAGGCTGATGCGAGCA
AAAGAGCCTAATCACCTGTGGACGGCAGCATCGCGGGCCTCTGCTGAGGC
CCACAATGACTCTCGTTTATACTGAAGCTCGACCCTCCTATCAANAGTGT
CATATTTCACAGGCTCTCTTGAGAGGTCACAGGGACCTCAGGTTACTATA
TAGAGCACCTGCCATTACCCCCTATGTGTCTCCATCTACCACTCACCCTA
TCCGGACCACTTCCCTCCCTCTAAACGATATCCACCTGTCGCCCTGTCAG
GAAGAATTATACTTTCACGTTAGCTGCGCCACTGTGTGTATCGACTTCTC
CAGAATGGGCTCCTTCGACTCCGAATGTGTACATTAAATGCTTTGCCCCA
CCCTTTATGCCTGAACAGCTTCAGCCTTTTCCCGGTTTCCCATTCGACCT
TTTTGTCCCTACCCCGTGTGTTTAGCCTAACTTTATTCCCCCCTTTACAA
TCCACCCCCTTTTATATAACTTTATTTACTCTAAACCCAAACTTTTCCTA
CATCCACTTCCTTCCCCATATTTCCTTTAATTATCCTTGTCTCTTATCTT
ACCGGTTTCACCCCTCTTAATAAACACTTATTTTTCTTAATTCCTCCTCC
TCTTCCATTTACATCCCCGACTTTTCCTCTTCTAAATAAAATAACAACCT
TGATTAACGCTTCTTTTTATCTCCTCTTCATATTCAATTGCCCCCCTTTT
CTATCTTTAACCAATATCTCTTCTATTTCTTTGTGTTACACTAAACCTCC
TAACTTTACATTATCTCCCTACTATATATAAG
| ATCTTATCNNTCCCCATCGGGAGGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCACTTTTAGATGAGGAATAATCCCA
GTACTGAGATCACACAACCCTTTCTTCAAAATAAGATTAAGAACTCTGCA
TTCTGGAAGAGAGACCCTGTCTGGTGATTAGTTGCCTGGAAGAGCTTGTT
ACAAGCCGAATAGAAGGAACTGTCATCCTGTTGACGGTTTCCAGGGACCA
AGGCTCCAGGACCTGCAGTAATTTCATTTGTCATCATTGCAAAACCAGAT
GGTCACGTGAGCTGCCAAAGCCTGCATCCGAGGAGGTTCACTTGCCAACT
GTCCTTAGTAATCAGAACTCGAGGTAGACAAGGCAGCTGTTTAGACAGAA
TTATTTCTATCGGTTACATTATCATCGTGGAAAAAAAATGGAGGCAACGC
AGTGGGAAAAACTCGTACTAAGTTCCAAACTCTAGGCAAAACCTGTAGCA
ATGAGGAAACCTCTAGAAATTGTGATGATAACCATGGCCACAGCCATGGC
CATTGTAAGGATGCTCCAAAAGAGTTCTCAACAGACAGGGTAGCACCACT
GTGCCATGAGGAGAGAGAAGTGTGACCCTGGGTGTCATGTGTGAGCTGAG
GGATGTGCATAGAGAGGTGGCTATTCAATCCAGGACATGGTGTCCTAAGG
CCATGATATTGAGTCTCGAAAGGGTACCAGAACTCGTGGCAGAATCATAG
GCAAACAGGTTTGTTCTTACTTTAGTTCACTCTATTAGCCCATGTGTCTC
AGACAATTCTCAGTCAACAATCTCCCTAAATTTGCTATTGTAGCCAAATA
GCTCCATCTCCTCCATGTTCTTTCCGGTACCACTAGGCCAATATGACCCT
TCCCCCTCTTCTTTCTTTTACCAGGTATTCCTCCCCTGAATGAAAAAAAC
TTTTTTACATCTTTACTCTCCCCCAATTACATGGTCTTTTCTTACCTACA
GGACCCTGCATAAAATTTCCCATTCCCTTGTCCTCTCCCCTTAAGGCAAG
CCTCTCGCATATCCTAATTTTACCCACTCGGCTCTAGTCATCAATAGTAT
AATGGTTCCCTCCTAAAATGTCATGGCTCTCTTCTTCCTTTAAATGGCTT
GGTAACCCCCCCTTTTGTTTTGGCCCCCTTATGGGACATCTCCTTGTCCC
TCTCTTCTTCAATCATCTCTATCTCCTTTCTTTTCACCTCGGT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 8 9 9 9 3 0 0 0 0 3 6 6 6 7 6 6 9 9 9 6 8 6 7 10 8 10 6 6 8 8 8 10 11 15 10 10 8 18 18 19 15 9 10 10 10 10
11 11 10 12 17 20 15 15 15 10 10 10 10 16 9 9 9 9 9 9 11 10 8 8 6 6 8 8 10 10 11 11 18 13 13 15 15 12 11 11 23 27 21 10 10 11 23 15 10 11
19 10 10 10 14 10 9 9 10 9 9 10 11 10 10 9 9 9 6 6 7 7 14 15 12 14 8 8 8 8 8 8 10 14 15 9 12 15 8 8 8 10 8 6 6 6 6 17 22 28
19 18 22 16 21 17 11 11 10 22 13 13 10 15 13 13 10 10 11 21 21 15 15 11 8 8 10 10 19 8 12 12 11 15 15 26 19 24 25 30 28 28 10 10 10 9 9 11 15 20
24 13 13 13 12 12 12 24 26 36 37 37 28 28 25 43 43 48 48 39 37 37 20 20 11 15 16 32 31 40 40 43 43 31 31 20 25 23 15 9 9 10 12 17 26 30 15 12 12 14
10 11 16 17 21 19 11 11 11 15 17 9 9 9 9 9 9 13 16 19 21 26 14 13 13 23 25 33 34 42 42 23 23 10 10 11 28 22 24 14 12 8 8 8 8 8 8 8 10 12
15 14 15 12 28 23 22 22 22 38 25 20 20 17 15 15 13 18 11 11 11 23 26 24 30 22 32 15 15 14 14 14 28 24 24 15 14 14 15 21 23 14 12 26 12 12 11 12 12 12
12 11 12 12 27 27 23 23 20 20 24 27 27 31 18 18 18 24 22 22 18 15 12 10 11 11 17 18 18 20 24 21 18 8 10 10 10 9 10 8 11 8 8 8 8 8 13 8 8 8
19 15 8 9 9 8 13 9 11 11 11 12 11 12 12 12 16 17 30 32 28 25 18 12 9 11 9 11 9 12 12 18 16 22 15 13 12 15 15 18 28 21 13 13 15 22 12 10 10 10
10 10 10 10 11 11 11 11 15 16 12 12 12 12 25 28 28 19 12 12 11 11 11 11 14 11 11 10 10 13 13 8 8 8 8 8 19 17 18 10 18 10 13 13 13 10 8 11 11 16
18 18 18 13 12 11 10 10 10 10 10 16 25 25 39 34 39 35 24 22 15 11 11 11 18 18 23 19 19 15 21 15 15 18 18 18 11 11 12 12 15 18 12 13 16 22 12 12 11 22
11 15 14 14 10 10 8 10 8 8 8 8 8 7 6 8 8 9 10 10 10 10 13 10 10 10 10 9 11 12 12 12 19 17 10 10 10 13 10 15 13 10 13 3 0 3 13 10 10 10
12 15 18 28 25 17 10 12 9 9 10 12 16 11 12 12 11 21 11 11 15 11 12 12 12 15 15 21 12 13 12 12 11 11 10 11 15 13 11 11 11 12 15 11 13 17 16 16 21 24
21 13 15 11 11 11 12 13 12 15 11 9 10 12 12 11 15 12 24 25 22 24 22 15 20 10 10 8 7 7 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 18 21 22 18 15 10 10 10 19
8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 12 12 16 12 12 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 11 10 10 10 8 15 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 13 15 14 13 12 9 10 8 9 9 8 8 8 8 19 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 10 10 10 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 13
13 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 9 10 10 10 8 8 8 8 8 10 13 11 9 9 11 8 10 8 8 8 8 8 9 10 10 9 9 10 10 8 8 8 8 11 11
8 8 8 10 8 8 8 8 9 11 8 8 9 10 9 9 10 10 9 8 10 7 6 8 6 8 10 8 9 9 9 11 11 10 10 10 10 10 10 11 11 11 11 15 11 11 10 10 8 11
9 9 11 8 10 8 8 8 8 8 8 8 14 18 9 8 8 10 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 12 10 11 13 10 13 9 9 9 10 10 12 9 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 8 6 7 10 8 11 10 8 8 6 6 8 6 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 9 9 10
8 8 8 10 8 8 10 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 10 12 15 15 12 9 9 11 9 11 11 9 9 9 9 10 15 19
17 15 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 8 8 11 9 10 10 10 10 9 10 10 10 8 8 9 9 9 13 13 8 8 8 10 10 10 9 8 10 8 6 6 8 8 8 8
8 8 8 7 6 10 10 10 10 11 6 6 8 10 12 10 12 9 6 8 6 6 8 8 13 10 12 7 7 6 6 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 10 9 9 7 7
8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8 6 6 8 13 15 14 13 15 10 12 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 12 12 10 11 10 10 7
7 6 6 8 6 6 8 10 10 8 6 6 8 6 6 8 10 14 8 8 10 8 7 7 6 6 8 8 8 8 10 9 9 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 11 11 8 10 8
8 8 8 10 8 10 8 8 6 6 8 8 10 13 10 10 13 13 15 9 9 10 9 8 10 10 8 8 8 8 6 6 | Open.Hide. 6 6 8 8 9 8 8 3 0 0 3 6 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 6 8 6 6 6 6 14 11 11 13 8 8 9 9 19 16 27 19 19 9 10 10 19 21 36 24 24
28 37 37 37 37 33 33 32 35 35 36 38 36 36 33 44 39 37 37 41 27 17 9 9 8 8 8 8 9 8 13 12 12 11 13 17 19 15 19 29 34 37 53 53 53 53 53 53 38 42
37 38 36 36 50 50 36 36 33 33 33 37 42 33 21 8 8 7 8 8 11 14 17 22 17 26 13 17 17 19 26 32 34 39 50 50 53 53 50 50 47 57 43 43 48 57 57 57 57 54
48 48 48 48 47 57 57 54 54 54 57 44 46 43 47 47 48 48 47 47 48 46 57 48 48 48 57 57 57 47 47 57 57 57 54 47 44 32 26 15 14 14 14 30 32 42 57 57 57 57
57 54 54 50 57 50 54 54 57 57 57 57 57 57 50 52 54 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 54 54 54 57 57 57 52 52 52 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52
59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 43 52 45 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 39 39 43 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 43 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 52 52 44 44 39 39 9 9 11 39 39 43 43 39 43 43 52 52 52 52 62 62 52 52 52 43 43 43 52 52 52 62 43 39 39 43 62 62 47 44 39 29 29 39 39 43 62 62
62 62 62 44 44 39 39 14 11 11 11 11 16 23 43 43 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 35 35 27 39 39 43 43 52 52 52 52 52 62 52 52 43 43 31 33 33 43 43 62 52
45 43 43 39 39 39 20 18 18 14 15 15 9 11 9 9 21 29 43 23 20 20 20 43 43 62 62 62 43 43 35 38 41 32 32 31 26 26 16 23 24 33 33 43 27 27 23 20 20 35
43 43 62 52 43 43 35 35 39 35 43 43 43 43 44 43 45 52 52 43 44 21 21 11 12 12 32 28 57 52 52 57 57 57 43 42 39 39 35 43 35 35 35 43 43 43 29 29 27 27
27 32 33 43 43 43 43 42 42 35 32 43 35 42 30 30 14 16 30 32 38 38 27 24 24 16 18 18 24 24 32 27 27 20 20 20 24 27 20 30 16 14 12 10 13 13 19 19 19 30
24 16 11 18 12 16 19 19 12 12 24 24 35 35 37 37 35 32 24 28 20 24 24 36 23 23 12 12 12 15 15 17 17 22 22 25 23 23 22 18 18 19 12 9 11 13 26 28 15 26
14 12 12 18 12 14 15 18 16 16 16 11 11 9 9 9 18 23 12 11 11 15 22 26 30 19 17 26 15 15 14 14 26 19 21 22 19 19 14 15 18 18 19 22 30 26 23 15 15 11
12 12 21 14 16 11 12 12 14 24 22 15 13 13 13 16 11 10 14 14 16 21 13 13 13 13 15 15 12 12 10 10 10 10 10 14 12 10 10 11 12 12 12 12 16 13 11 11 10 15
12 12 10 10 8 8 8 10 11 14 15 15 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 11 9 9 9 9 10 11 11 15 17 24 28 25 23 13 11 11 13 13 13 13 11 10 9 10 10 12 12
10 11 12 20 20 24 20 24 24 21 18 12 15 12 13 12 12 18 10 12 9 9 12 13 12 12 10 10 9 11 11 14 18 12 14 14 13 15 10 10 8 8 10 8 10 8 8 8 10 9
9 11 6 6 6 6 8 8 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 10 10 9
12 13 10 10 10 10 9 9 9 15 10 10 10 10 10 11 9 10 10 10 8 10 10 10 9 9 9 9 9 9 10 10 14 20 13 14 12 10 8 8 10 15 21 11 10 9 11 8 9 10
10 10 15 15 10 6 6 8 8 10 10 10 10 10 11 9 9 9 12 12 12 15 15 12 12 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 12 9 8 8 8 8 8 8 8 11 11 8 9 9
8 8 10 13 11 10 11 10 9 9 9 10 10 9 10 13 9 9 8 8 8 8 8 10 11 17 9 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 7 9 10 10 13 14 15 10 10 10 10 10
11 12 15 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 9 11 10 10 10 10 10 10 11 11 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8
8 9 7 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 9 9 8 8 8 8 8 8 11 8 10 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 10 11 6 6 6 6 8
6 9 10 8 8 8 9 9 9 6 8 6 6 10 7 11 14 11 11 11 10 10 10 10 11 7 10 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 9 9 8 8 8 10 10 10 8 8
8 8 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 11 7 9 7 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 7 6 6 8 8 8 9 9 10 10 10 |