BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124H23.T7 (MSMg01no124_h23.b1) | MSMg01-124H23.TJ (MSMg01no124_h23.g1) |
ACC | AG333836 | AG333837 |
length | 1,235 | 1,214 |
length of high quality (start - end) | 550 (126 - 675) | 328 (121 - 448) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_h23.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_h23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_h23.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_h23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:40 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TTTATATCATTGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAA
TTCAGTAAGAATGTTATCCCTTTATGAAAGCCTTCAAATTTACTTCTAGT
AGAGACTGTAGCCCTTACAAAGAACGAAGCTAGAAGATCTAAGGGTTTGT
CTGCAGAGTGATTACTTAGGCCAGTAGCCAGTCTTACCCAAACAAGGGAA
TATACAATGGCCTAGCCATGGGTTTACTGAAAAAGTTAGGGAATCCCACT
GAGACAGGAATCTTCACTATAGCCAGGTATAGTAGGCTACATTGCATTTT
AGAAGCAAGTTGGTGAATTCTTCTTACAAATGGAGATTCCCCACAGATAC
TTTAAAGAACAGCCAAGTTATACTCATGAAAGAATTTATCAAGGCCTAGG
AAATAGGAGGTTTGTGGTATTGCATTATTCATGAGAAGGTCTGCTAGAGC
AGAACCCCCTGGTGCTACCTTTCACAAGGCTCAAAGGAGTAGCACAAATT
GTGACTAGGTTGAAATCCTTACCTGTCATTAGCTGACCCTAGGCAGGGCT
GTTTTATCTTTACTGTAAATATTACATGGTTCCTGTAGGTCCTTTTGAAG
TCATTCCTTTGTTTTGTGTCAGGTAACTTCAATGTACTTTGCCTGCCATG
ACATCCTACCCCTTTGTTTTCTGTATTATATAAGACTGGTGTTCACTTTG
TGAAAATACACTCCAATTCAATACGTTCTCTTGTGTAGTATTTGTTTGTC
ATTCGCTGACTCCTTGCCCACCTGCAACTAGGGACCTGTTTCGCGCAGAT
AAAAGACCCCAAAAAAGGTCTTATTCTGGGCGCAATTCCCAAAGAAACAG
CTCCATTTCTGGCCATTGATCTTTTTCTTTTGCCAACCCCTGGTAACTTA
ATAAGGGAAATTGGCTATCCCTGCTTTAACGGTAACTAACTTCTAAATTT
TTTTCCCCAAAAATTTAAAAGCCCCCCATTGAATGTGTGGTTGAAATCCA
GGTAAAACAAATCCCCCCCAGACAGTGTTCTTTTATACCCACCAGAAGTT
CTTTGGATTAACCCTCCCCAACTTTTTATCTCTTTAAGGGAGGGAATGGA
AAAATAATTATTCCCCGGAATACTCGGCTTTGACTCTTCTCATGTGGCCC
CATTGGGCGTGTTATAATTGCTAGCGAAGTCCTCCCCTCTAATATGTTCC
CTTACCAGAATTATTTGTTNGTGTTATTGTGTGAC
| TTTTTTTAACATGGTAGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXCGCCCTTAACTTTTACCTTGTAAGACTTGACAACTG
TTCCAATCTTTGACATCAACTGGCACTGATGTAACCTGACAGCAAGACTC
TTTTTGCTAATAGCAAGCACTGCTTGTACCCCGGCTTCTGATCGCTAAGC
TCTTACTACCTAACAACCATGGAATTCAGTGAATGTTTGAAACTTGCAAC
CATTGCCCAGTCAAATGCACTGAACACAGACCTATGCAATGTACAAGAAA
ATGGTTATAACAAATAACACATTTCTGCTTTATGGGGCAACCTGGCTTCA
ATTAAAGCCCATGTGCCCAGTGCTAAATGATATAATTAATAACAGTGATC
AAGGCTGAAATATTTCAAACGATCACCTTCATTTTATACTTCTTAGAAGG
ACAGAACCTTAAAAAGCAAGAACACAAGTTACATCCGTCTATATCTCTAT
GCAGAGAAGTCCACATATTTCTGCCTACAACACATTCAATTGTAAAGGGG
ATTATTTACTTAAGCCAGAAACTCAATAGGAAGTTGATCAAGATCAGAAG
AATTATCAGTGTTGACCATATTAGCGGCTCTTCTGTTGATGTGCTAAAAC
ACCATAACCAAGGCAACTTATAAAAAGATCTTATTTTAACGTACAGTTCC
AGAGAATTAGATTCAATAATACTGGGACTGCAGGGCAGCAAGCATCAGTC
TCACAGGGTGTAAAGGAAGCTAAAAAATCATTTCTTAAACCTCAAGCATG
AAGGATAGAGAGCAAACCAGCAAAAAGAAGGTTTACATTCCCAAAGCCCA
TAACCCGTGCCACACTTAGGCCATCCAAGACCCCCCCCCAACCTTTTCCA
GGTTAACATCACCCAACCGGTAACCATCTTTTTCAATATGCCTGAACCCT
AAGGTGAATCATTTTCCCATTTCCAACCCCCTAACAGCTTGTCCTTTCAA
AGGGACATTCTTTAAATTAAAATTCTCCTATTCCCAAATCTAAAAATTCC
TTTTGGCACTTCCAACTCAAAAATTTTATTTAAGCAATTTTTAAGACAAA
AATTTCTCAAATCTTCACCGAAAAATGTGTGAAAGAATTTCCCTGTTAAC
ATTCCTGCCTAAATCTCCAATATAAAATCTATCTCTACAACAATTTTTTC
AATTTGGTCCTTAA
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 8 9 11 11 9 11 9 10 10 11 11 13 12 12 19 13 8 8 9 15 15 17 12 10 10 10 16 16 24 24 37 37 34 34 42 42 42 42 42 42 42 39 39 40 34 43 43
43 43 34 28 22 30 36 36 53 44 41 37 37 37 37 19 19 9 9 9 8 10 8 8 7 8 8 9 8 8 9 9 9 12 10 19 23 31 33 36 36 53 53 53 42 42 36 36 36 36
36 33 50 50 50 33 33 21 21 9 9 9 14 12 22 21 12 12 21 25 20 15 15 13 13 13 26 28 32 42 43 43 43 47 59 59 59 43 43 48 48 48 54 57 57 57 57 48 43 43
43 42 37 30 30 28 37 44 48 54 54 57 54 54 57 57 57 43 43 41 44 41 47 43 43 48 42 46 44 44 43 42 24 25 19 35 27 27 31 40 42 57 57 57 57 57 47 43 43 50
57 57 57 57 48 48 48 57 59 50 37 37 50 43 43 52 52 52 52 57 57 57 57 52 57 57 52 52 52 52 52 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 52 52 52 43
44 43 52 52 52 57 57 59 59 59 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 45 43 43 57 43 52 57 57 57 57 52 43 43 43 43 43 43 43 52 62 52 52 52 62 62 44 44
35 35 35 43 43 52 52 52 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 54 54 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 39 43 29 29 23
39 39 39 27 13 13 13 27 27 43 43 52 62 62 62 62 43 43 41 44 43 52 52 62 62 62 62 62 62 52 45 43 43 35 35 43 44 44 62 45 45 62 62 62 62 52 52 52 62 62
62 43 43 43 34 43 43 43 43 43 44 43 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 43 35 35 43 43 43 35 43 43 35 35 39 43 57 57 57 57 57 57
57 44 44 43 43 43 44 43 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 52 59 59 57 57 57 39 57 43 57 57 59 57 52 43 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 54 54 54 54 54 57
54 52 52 57 52 52 52 54 57 57 57 52 38 38 28 38 42 52 52 57 57 59 57 57 57 48 43 43 37 37 37 47 44 57 43 44 43 44 37 43 43 57 57 57 57 54 46 44 42 57
47 42 40 36 42 42 48 48 44 57 57 57 57 43 43 43 43 42 42 43 31 31 31 31 36 37 37 43 43 43 31 31 23 23 25 30 34 39 44 59 48 48 48 43 43 43 43 43 39 39
36 36 36 43 43 48 48 48 59 59 37 37 33 33 32 32 37 37 43 59 47 32 32 20 20 20 32 19 24 24 23 23 19 20 20 32 32 32 35 39 39 32 32 23 23 23 34 34 47 39
37 32 32 25 29 32 24 19 8 8 8 8 8 8 8 19 22 22 19 22 24 12 12 12 24 24 47 34 39 30 24 24 29 24 24 28 28 28 32 33 40 42 42 36 32 33 42 39 43 36
29 23 26 21 21 15 28 33 40 43 43 43 43 43 43 43 39 39 27 26 10 9 10 14 14 18 18 18 18 16 14 14 22 15 28 19 26 28 28 25 25 11 11 11 11 11 10 11 11 17
11 13 10 8 8 8 9 9 13 10 13 14 11 11 11 9 8 8 8 8 11 17 12 8 7 7 14 8 7 8 6 6 8 8 11 11 13 15 15 13 13 18 14 12 8 9 11 8 10 13
11 11 10 9 9 9 15 15 17 13 13 8 10 9 9 11 19 12 8 8 10 10 10 10 10 10 10 12 12 17 15 9 9 9 11 17 19 16 14 11 10 9 8 10 8 8 10 10 14 11
16 14 10 10 12 10 10 8 10 8 10 8 6 6 6 8 8 10 10 14 10 12 10 13 11 15 10 10 9 9 8 8 10 8 10 11 12 16 9 8 8 8 8 8 10 15 16 10 10 12
23 28 17 15 10 15 10 9 9 12 21 13 14 10 10 9 8 8 8 12 10 12 15 18 16 20 12 11 10 15 15 13 10 10 10 10 10 15 10 8 7 6 8 8 8 9 9 15 14 10
9 9 6 6 8 12 10 9 9 8 8 8 8 9 13 12 16 13 15 10 10 9 9 9 9 12 12 17 11 11 11 11 11 11 9 8 8 8 8 8 10 10 10 12 12 10 10 10 8 10
8 6 8 6 6 6 8 8 6 9 10 9 7 9 7 7 7 8 8 8 6 6 6 8 8 10 9 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 9 15 17 14 18 15 14 9 9 8 8 9 9
10 14 16 15 18 19 16 14 9 9 9 10 11 10 8 8 8 6 7 7 6 6 6 8 10 8 8 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 6 8 7 6 8 8 8
8 8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 9 8 9 9 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 6 6 6 8 8 6 6 6 7 8 8 10 10 8
6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 10 10 8 10 8 8 3 0 3 7 6 8 8 6 6 8 8 8 8 11 8 6 6 | Open.Hide. 9 9 19 19 8 6 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 7 7 13 8 8 8 17 11 8 9 9 16 19 13 8 8 8 8 10 17 19 28 24 24 26 35 35 35 30 28 28 28
33 32 32 32 47 44 41 39 37 37 37 23 23 10 6 6 6 8 8 10 11 12 11 12 12 23 27 33 35 35 35 35 35 28 35 37 37 37 47 50 50 50 53 53 53 53 44 33 33 33
23 22 10 13 8 6 6 6 6 6 13 12 11 11 11 17 11 15 15 15 21 21 31 31 36 36 36 36 36 43 50 50 50 53 53 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 42 43 42 47
48 48 57 59 57 50 50 43 43 37 42 37 38 39 43 43 48 48 48 41 41 39 33 31 23 18 10 10 10 12 12 12 12 20 24 32 37 39 37 37 24 28 20 23 23 30 30 53 48 57
48 48 48 50 50 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 48 48 46 43 43 43 43 43 46 46 48 48 43 43 48 57 59 59 57 54 54 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 57
57 57 57 57 54 54 57 57 43 43 43 43 44 44 57 57 47 47 47 47 57 59 57 59 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 50 50 43 43 43 52 43
59 43 35 35 43 43 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 57 57 52 52 57 59 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 59 57 52 43 43 43 43 43 43 44 52 52
52 59 59 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 43 43 52 62 62 62 52 62 62 62 62 54 54 62 62 62 62 62 62 62 43 43 35 35 23 23 12 18 23 23 13
17 20 38 43 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 57 57 57 57 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 38 38 14 12 12 21 15 16
22 16 14 16 16 21 21 19 18 18 18 24 43 43 43 43 59 43 52 52 52 57 57 43 43 33 31 31 44 44 59 59 52 43 38 21 20 20 20 27 28 43 43 52 52 52 52 59 59 59
44 43 33 33 33 38 38 35 31 31 43 44 57 43 47 47 57 59 59 48 48 46 47 42 35 28 32 32 47 46 57 57 54 47 47 46 43 43 44 44 57 54 54 57 57 57 43 39 36 36
36 42 42 54 48 48 48 48 48 43 37 37 23 18 18 23 14 14 15 24 28 35 32 32 24 26 29 29 28 28 29 37 37 37 37 37 37 37 37 39 32 28 20 24 19 12 12 14 14 16
10 11 11 18 20 26 21 15 19 15 21 21 30 31 31 35 35 36 39 43 28 28 14 18 18 24 15 20 32 32 37 41 34 34 32 29 31 37 34 27 21 14 14 19 30 37 43 37 37 30
28 28 26 21 11 10 10 11 10 10 16 21 22 19 21 15 18 21 31 31 33 36 39 33 32 24 20 19 26 32 39 47 47 50 43 39 39 24 24 19 19 19 24 22 14 12 12 12 11 9
10 26 26 14 14 22 19 19 12 12 11 23 19 22 22 28 32 28 28 28 31 32 28 17 14 14 12 21 21 15 12 10 12 15 15 13 8 8 8 10 10 10 16 9 9 9 9 9 9 13
13 8 8 8 8 8 8 18 16 8 8 7 8 8 8 10 19 12 13 13 20 19 18 17 13 10 10 10 10 10 10 16 10 14 14 25 21 18 16 16 13 13 11 11 11 21 12 11 10 13
13 10 8 8 6 6 10 8 10 11 11 10 10 14 13 14 12 12 9 9 9 9 15 13 15 8 8 8 10 10 10 10 9 9 12 12 10 16 18 13 18 10 9 11 9 10 10 12 15 12
10 8 8 8 8 8 8 10 11 17 10 13 9 8 8 8 8 8 13 18 12 10 8 8 8 10 8 10 10 8 8 9 9 9 9 11 14 10 10 10 10 13 9 10 9 9 9 8 8 8
8 8 9 8 9 8 8 8 8 8 8 10 21 16 17 13 12 16 12 12 9 9 9 11 9 9 9 9 12 11 18 15 11 11 8 10 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 11 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 10 12 10 10 10 10 13 12 15 13 10 10 7 7 6 6 8 8 10 12 12 13 8 11 8 8 8 8 8 8 10 9 9 12 12 10 10
10 13 12 10 8 10 10 10 8 10 12 15 11 9 10 8 8 8 8 18 15 8 8 6 6 10 8 6 6 7 12 6 7 10 12 18 21 10 8 6 6 8 6 8 10 10 19 10 10 8
8 8 8 8 6 7 10 13 11 11 12 12 8 8 6 6 10 9 9 13 10 11 14 14 14 19 8 7 7 8 10 10 8 7 7 8 15 15 24 21 19 8 8 6 6 6 6 6 6 6
9 11 8 8 8 10 10 8 8 8 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 6 7 11 15 10 8 8 8 9 11 11 11 11 10 6 6 8 8 15 15 15 8 8 8 8 8 9 8 6 6
6 8 10 9 9 9 9 8 12 12 12 10 10 10 10 14 13 10 10 10 9 9 9 8 12 8 9 8 8 10 8 8 6 6 8 8 13 12 13 9 6 6 7 7 12 12 19 9 11 12
9 8 8 14 10 6 6 8 6 8 8 10 8 8 |