BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-146P20.T7 (MSMg01no146_p20.b1) | MSMg01-146P20.TJ (MSMg01no146_p20.g1) |
ACC | AG350382 | AG350383 |
length | 1,219 | 1,229 |
length of high quality (start - end) | 617 (140 - 756) | 506 (120 - 625) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_p20.b1 PHD_FILE: MSMg01no146_p20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:09:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no146_p20.g1 PHD_FILE: MSMg01no146_p20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:09:26 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CGATACTTNNNNNNATCACTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XCGCGGAATTCTCAACTGAGGAATACCCCTTAAAGGACAAGNACCTGAAA
AAATGTTCAACATCCTTCTTTATCAGGGACATGCAACCCCAAACAACCTT
GAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGGA
CAGCAGATGTTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTT
GGTGGGATTGCAAGCTGGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGTTC
CTCAGAAAATTGGACATAGCACTACCGGAGGATCCCGCAATACCTCTCCT
GGGCATATATCCAGAAGATATCCCAACCGGTAAGAAGGACACATGCTCCA
CTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGTACCC
AGATGTCCCTAGATAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGTACATTTACAC
AATGGAGTACTACTCGGCTATTAAAAGCAACCTGTAGTTTTTAACCATGC
CCCCTGAAACCTGTAATGTACTTCTCTCTTAGTCAGTGTTCTTTTGTTCT
GAAGAAAGCATGACATCTCTTATAAAGGAAAGCATTTAATAGGGGCTGAC
TTATTGTTCAGGGGTTTCGTTCATTATAGTCATGGTGGCACACAGACTAA
TGTGGTGCTATAGAGTACCCAAGAGATCTGTCATGATCCATGGGCAACAC
TTGGCCTGGCTTGAGCACTTGAAACCTCCAAGCCAATCTTCCTAGTAGTG
CCACTCCCTATGAGCCTATAGTGGCCATTTTCATTCAAACCACCACAGTG
TCCAACCCAAGTAAGCCAGCTCTCACACCAGCCTAAGGAAAACAGAGTTC
CGCCCCCATTTCCACCCCAATGTTGGGGAAATCAGAATCCCTGGGCCCAG
AATTGAAATAGGACAGGGCTTTTGAGGTTTCCCAGCCCCCCAAAAAAAAG
CGTCCTGATGTCTTTTCAAAAAGAAGTTTTAATGGTCCCCGCTTGAATGG
GGGCAAGGTCCACTTTCCTGGGAAATTAAATCCAGTCCTCCAAAATACCC
CAAAAATCTCCGCTCTCCTAAAATTTGGTCCAAATCTATAGCAATAGGTT
TTCAAATATGGTCCCCGGGCACCCTGTAATCTTCCTGTTGTCGTGTTTGA
CACTCGGTGTTCTCCCTTC
| TCTTNTTGACGCATGTGAGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAATAAAACTTGGNAGCTTGGAAGGAGACC
TTATCTGAGACCCTTTCTTTATAGAGACGCCCAGGCTAAAATGAGGTCAT
CAGAGCGCATTCCAACCCAGTCTGAATGGTGCCCTTGTAAGAAAGGGAAG
TTTAGACATGTTTAGAGAGACAACTGCGTGGAGGCAGAGGGAGGAGAAGA
TGGTTACCTACAAGCTAAGGAAAGTGGCCTCAAGAAATTCTCTTAGCGTT
CTTAGAAGGAGACAACCCTGCTGCGGAGTTGATTTCAGGTTTTTGGCTTT
TGGAAGGTGAGGCAGCAAGTTTCCATTGTGTAAGCCAAATGTGTTTGTTG
TTGAGGCCAAAGCATCTTATAGAAAGAAAGATTTGTGTTGGCTCCCTGTC
TCAGAGGGTTCCAGTTCACGGTGGCGGAGTCGGGTAGGATAGAGCAGTCC
GGTGTGGTAGCTGCAGCATGTGACAGATGTTCTCATATGACAGAGGATGA
GGAAGCAGAGGAGGAGGCTGAAGGAAGGGATGACTTTCAGGGTTGGTCTC
CAGTAGCTACTTTGCAGCTTCCCAAGACAGTACCAGGATAGTACCAGGAT
AGTGGGGGACACAGTACCAGGATAGTACCAGGATAGTGGGGGACACAGCA
CCAGGATAGTACCAGGATAGTGGGGGACACAGTTACCAGGATAGTACCAG
GATAGTGGGGGACACAGTATCAGGATAGTACCCAGGATAGTGTGGGGACA
CAGTACCAGTATAGTACCTGGAATAGTGTTGGAATTTGTATAATCAATAG
TCCGTTTTCTCAGCTTGTCAGATTCCTAATGGTCTCCTTTATCATATTTA
ATGCATAGTTAGCGTACTAGCTTCCTGGTGTGGTTGGTTTATTTCTGCAT
TTTATATTCATTTCTTATTCTTCCTTCCTTATTATATTTATTTCTCCTAT
AATTTTAATCTTTTTTTTTTCCTTTATAGGTAACTTTTTTGTTTTATTTC
TCTTTTTTTTTTTCTTCTTTTCAGTGTTGTTAAATATACTTTCTTTTTTA
GCCTTTTTTTTTCTGCTTATATCTTGATTTATAACTCTTTTTTGGTTCTA
TTATCATTTTTTCTCCTTTTATTTCTTCTTCTCTTCTCTTGTCCTTCTAT
TAATCTTTTATTCTTTCTTATATATCTTN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 6 6 6 8 3 0 0 0 0 0 0 3 8 7 7 7 7 10 8 10 10 10 8 8 8 8 8 12 19 17 8 8 8 8 10 12 22 26 35 28 26 33 33 33 36 42 47
47 48 48 43 43 43 43 42 42 53 53 53 53 38 36 35 31 31 31 30 33 37 37 29 21 16 12 12 9 10 10 9 8 8 9 9 9 9 10 9 3 0 3 17 19 23 25 28 30 37
59 59 53 53 57 53 53 50 50 33 33 37 37 25 23 16 11 11 10 10 10 10 10 12 15 24 18 12 11 11 11 25 27 27 20 11 11 12 12 11 11 23 27 59 59 37 39 33 33 36
36 50 50 53 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57 59 57 48 48 48 42 48 48 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 54 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57
57 57 54 57 54 54 54 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 68 59 59 54 54 57 57 57 57 57 57 54 54 52 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 43 43 52 57
57 57 57 43 45 59 59 59 68 68 68 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
62 62 62 62 43 39 23 13 12 13 39 39 43 43 62 52 52 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62
43 43 39 43 39 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 52 62 52 45 45 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 57 57 59 57 52 52 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 52 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 43 43 44 43 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 57 52 52 43 43 43 27 27 43 44 43 50 50 54 57 57 50 54 54 59 59
43 43 33 44 44 57 47 57 43 43 44 57 47 48 48 43 47 43 48 48 57 44 57 57 57 59 57 48 48 39 39 37 37 37 39 47 46 48 47 47 48 39 41 35 35 35 39 47 43 48
48 48 59 42 42 35 42 35 43 43 43 43 43 43 43 43 47 47 47 43 48 57 59 59 48 47 34 32 23 23 23 28 30 30 31 35 36 37 37 39 39 39 36 39 39 36 23 23 11 11
11 16 22 26 22 19 12 16 17 30 30 40 43 43 36 36 25 32 32 23 28 28 37 39 39 40 43 34 33 33 33 33 33 37 37 37 37 37 36 39 32 30 25 30 30 34 32 33 32 36
30 30 22 19 18 18 21 13 11 13 11 19 23 24 24 22 23 28 34 33 30 25 21 19 10 14 13 9 8 10 15 19 22 21 18 11 11 12 26 26 37 39 32 32 21 16 11 11 11 14
19 18 11 11 11 15 16 12 12 12 22 28 32 28 28 28 30 24 14 10 10 8 9 9 9 9 8 12 10 23 19 17 17 14 27 19 21 13 13 12 15 14 13 13 16 21 21 20 14 13
13 13 17 13 15 12 13 14 11 14 11 11 11 10 16 20 30 30 19 19 11 16 16 13 10 9 11 10 13 12 13 8 10 11 8 6 6 8 8 9 15 10 8 8 8 8 10 10 11 11
13 11 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 15 15 9 9 8 8 8 10 10 12 12 11 11 10 21 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 10 12 11 11 11 9 9 9 9
9 9 10 11 12 10 9 11 8 8 9 9 10 15 15 15 18 18 24 27 20 19 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 14 16 15 12 11 12 11 14 14 15 15 13 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 8 8 10 16 22 11 11 10 11 12 14 10 14 8 10 8 8 6 7 7 6 8 8 8 8 6 6 8 8 9 11 10 11 11
9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9 9 9 9 9 9 11 12 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 6 6 6 8 7 6 8 8 9 9 10 9 9 9 12 15 12
12 10 10 10 17 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 10 8 10 11 8 8 8 9 9 9 11 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 7 6 8 8 9 12 9
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 6 8 6 6 8 6 9 9 9 6 6 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 10 10 10 11 8 8 8 8 8 7 7 9
8 8 8 6 6 8 8 8 6 8 10 15 10 6 9 8 9 9 9 | Open.Hide. 6 6 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 11 8 8 8 15 15 8 8 8 8 8 11 19 19 20 9 10 10 17 19 30 30 30 35 38 36 34
35 34 34 34 34 29 33 36 47 48 48 50 50 42 41 32 23 15 9 9 9 9 9 9 9 12 12 11 11 11 17 17 3 0 3 21 21 29 30 31 37 37 50 50 53 36 38 36 36 36
31 44 39 50 42 41 27 23 11 9 10 10 9 9 9 9 11 12 19 21 23 29 30 31 33 32 31 20 18 12 12 12 16 16 22 26 37 37 37 48 48 59 59 59 53 50 48 48 48 48
57 48 48 48 57 57 57 59 48 48 48 43 43 43 43 48 48 41 41 41 41 47 50 50 53 68 57 57 57 44 43 32 32 42 37 36 38 38 50 46 57 57 57 59 59 48 48 48 59 59
57 57 57 47 47 47 57 57 48 48 48 57 57 57 57 54 59 59 59 57 50 43 43 50 57 57 59 57 57 52 52 52 57 57 54 54 59 52 57 52 43 43 43 43 39 43 43 59 59 57
59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 47 57 52 52 52 57 59 59
68 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 43 43 39 39 14 14
14 21 21 11 18 33 43 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 59 62 43 43 32 34 43
43 43 35 35 35 44 44 57 52 52 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 43 43 39 43 39 43 39 29 29 31 38 38 28 28 43 43 43 43 38 38 28 43 32 31 43
32 37 37 36 32 28 29 43 43 52 43 50 38 41 20 20 20 32 38 50 57 50 43 38 38 23 23 32 43 43 43 50 43 43 43 57 59 43 43 35 33 32 36 32 37 37 42 37 33 28
28 32 36 37 37 37 35 32 32 28 24 28 23 23 25 36 36 39 37 40 28 28 28 37 32 28 28 20 18 31 31 31 41 43 43 59 41 35 31 34 25 25 20 31 23 28 28 32 37 30
24 19 23 21 10 10 11 22 24 35 39 41 39 37 30 28 28 28 28 25 21 21 15 11 11 15 21 19 22 19 31 20 18 18 12 11 10 15 17 13 12 11 11 13 15 18 17 26 26 21
18 18 28 19 17 17 17 18 15 16 16 14 14 15 19 19 19 24 19 19 15 13 18 21 21 22 22 19 19 22 22 22 25 28 25 21 21 15 11 12 12 12 10 10 10 10 10 12 18 23
23 21 18 12 12 10 22 15 18 16 28 13 12 12 15 12 14 12 21 18 11 11 11 12 11 11 11 12 12 10 10 10 20 11 9 12 9 13 10 10 10 13 9 8 10 10 8 8 8 8
8 11 13 10 8 9 9 10 13 16 11 11 11 11 11 11 15 12 11 11 11 12 10 19 10 10 8 10 10 9 15 23 19 11 10 10 10 10 19 17 12 11 11 11 10 10 10 10 10 10
10 11 11 15 15 11 9 9 9 9 10 14 14 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 6 6 8 8 8 9 9 8 8
8 10 11 10 18 19 21 16 12 12 9 14 14 10 9 9 9 9 9 9 11 11 11 9 10 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 9 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 10 13 15
11 11 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 8 8 9 10 8 8 8 10 9 10 11 11 11 11 9 10 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 19 10 8 8 8 8 10 10
10 14 9 6 6 6 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 7 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10
10 10 8 11 10 8 8 8 7 7 8 9 9 11 11 16 18 15 12 13 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 13 13 10 6 6 8 8 6 8 8 8 8 8
9 11 8 12 10 13 13 11 10 11 11 12 12 15 13 13 9 9 8 8 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 9 8 8 8 8 8 10 15 19 24 29 15 15 12 11
9 10 10 10 12 13 17 12 13 8 10 10 15 8 8 6 6 8 8 8 8 8 11 13 8 8 6 6 8 8 13 10 8 8 6 7 10 9 14 15 10 10 9 9 8 9 9 9 9 8
9 10 10 8 8 8 8 10 8 10 12 8 10 6 6 8 12 16 11 12 9 9 12 10 12 12 11 9 9 7 7 6 8 8 12 12 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 8 12 23 12 8 8 13 12 10 10 6 6 8 10 7 6 6 6 8 8 8 6 3 0 |