BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-151I17.T7 (MSMg01no151_i17.b1) | MSMg01-151I17.TJ (MSMg01no151_i17.g1) |
ACC | AG353680 | AG353681 |
length | 749 | 743 |
length of high quality (start - end) | 345 (71 - 415) | 431 (71 - 501) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no151_i17.b1 PHD_FILE: MSMg01no151_i17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:15:23 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no151_i17.g1 PHD_FILE: MSMg01no151_i17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:15:23 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | ATTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAGAACATCCGCG
GAATTCTGCAGCATTTTCGTGAAAAAGTGTGTCATGATCAGGACCCGCAG
CTCACGGCAGCACAGTCAAGGCCACAGTCCCTCTCTGCTGCTTTAGAATG
GAGGCAGCTTGCTCATGGTAATGCCTTCCAGGGTCTCGCCATTTCAGCTA
AGATCTGGTCACTTCACTTTAATCAGCCGTCCTCTGCATCTGCTCCCTGC
AAACAAGAAACAGTCCAGCTTAGACCAGTGTTAAGCAGATTAAATCAATA
TTAAAACCGCTACCTTATGCCTGTGCTTATCAAAAGACTTAATTTAAAGA
CTTCAATTAATTTTTAAAAAAGATTTATTTGTTATTATAGATAAAGTACA
CCGTAGCTGACTTCTCCCGCCCCAGAAGAGGGCATCAGATATCATTACGG
ATGGTTGTGAGCCACCATGTGGCTGCTGGGATTTGAACTCAAGACCTTCA
GAACAACCGTCAGCGCTCTTACCCACTGAGGCATCTTGCCCACCCCCAAT
CACTTTTTGTCTTTATTTTCCGCGACCGCTTTTCCCTCCCCCCCCCCTGC
CCCGCCCCGCCAACTTTCTCCGCACAACCCTGCCCCTCTCCAACCCCTAC
CCCCCTTCCGCCCCTGCCCCCCCTAACCCCCTTTATTCCCCCCCTTTCCC
CCCCCACTCCTCCCCTTCTTACTCCCCCCCCCTTTCCCCTTCCCCCCTT
| CXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGTAAGGAAGGCTAGGAGATGGGGGGTCAC
ACTTACTGTGTTCCTATGGAAACTTGGAATGTTTGTTTTATATGGATTTT
TATTCAGTTTTCCAACATGATACTAACGAGTGCCCTCAGCTGCTGAGCAA
GTGTATGTAGCTTGTGCATTGGCTGAAGCTCATGTTGTGACCCATTGTGA
AAATAAAGTATCTTGAAATAATTGGGCATCAGGGAATGTTTGCAAGTATC
CCTTAAAGAAGACACCAACTTCAGCACAGCCTGCTGTATCCGGTGAGTCT
AGCTCAGCACAGCACATAGGAGAGGTGGATGGCACAAGGCTGTGCCCTCT
CTGTACAGCCTCCATTTGCTTAGCCCATCCCAAGTGTGTGCAGTTGACTG
TGGACTTTGGGGCCCAGTGTCTGTTGGTGAGGAATGTCATTTGCCTAGCG
ACCTGTTGGCCTGGCCACTTCCTAGGGAGGACATCGAGGCTCTTTGAACC
TTGCCTGCAGAAACCCTGACTGTTTCCCTCAACCTTGACTTTCCCTGCAT
CATCCACTAGTAACAGTTGGAAGCACCATACCCCATTTGCCCGGCCATTT
CCTGCATTACATTCCCCCACCTTCTTCTCCAACTACCGCTACAAAGCCCC
CCCTGCCCCACCCATATTTCCCCCCTCCTTTTATTTCCCCCCN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 7 7 9 9 9 14 15 25 25 39 39 25 23 11 17 18 29 29 31 37 33 33 44 46 26 19 18 18 16 16 25 15 7 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 17 12 12 12 15
13 30 30 23 33 33 28 19 23 18 17 19 12 14 11 13 16 12 11 11 12 22 30 34 29 24 24 30 30 36 39 39 39 39 39 47 43 43 25 25 25 43 43 48 48 43 42 42 42 42
31 31 31 28 21 29 24 36 36 39 31 33 29 33 28 37 28 28 18 24 24 18 11 25 24 39 37 46 44 47 34 41 35 35 28 32 32 43 42 42 37 39 32 41 41 57 48 50 50 50
50 57 57 57 57 57 59 57 57 59 50 57 52 57 57 50 50 59 68 68 50 50 43 43 27 43 43 47 43 52 43 50 41 41 20 38 38 43 43 37 52 52 57 44 57 52 52 57 59 59
57 57 43 43 43 57 52 57 57 39 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 57 57 44 43 35 35 42 43 52 45 45 57 59 59 57 57 57 57 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 44 57 39 39 39 44 44 52 52 57 57 57 59 59 59 59 39 43 43 57 57 57 52 52 43 44 42 35 35 50 43
52 52 52 52 52 57 59 59 57 52 52 57 59 59 68 68 68 68 59 59 50 50 43 35 33 42 42 44 43 43 32 27 42 44 57 57 57 59 59 57 48 48 48 47 57 48 48 48 59 59
47 42 42 42 42 42 42 39 43 43 59 59 57 57 57 48 47 43 43 41 41 41 41 41 44 42 35 35 26 28 15 18 18 25 41 59 59 59 47 43 43 43 39 47 39 35 35 37 37 37
33 37 23 24 33 28 13 21 28 36 40 22 13 6 6 6 6 9 9 9 17 23 12 11 11 16 21 28 59 59 59 59 41 41 32 32 23 32 23 36 36 43 43 43 36 37 39 37 32 23
20 23 18 19 13 13 15 28 28 37 35 28 28 32 25 18 15 12 11 11 20 15 20 19 21 19 19 12 11 11 11 15 23 32 28 19 19 12 12 11 18 18 28 21 27 18 18 16 18 12
13 8 13 12 12 12 11 12 11 11 10 8 8 8 8 8 9 12 25 30 34 25 15 12 12 12 21 22 13 8 8 8 8 8 16 17 20 22 16 16 16 25 23 25 34 32 21 17 15 10
8 10 8 8 8 22 24 21 12 12 12 19 27 28 27 14 13 13 9 9 9 9 9 7 6 8 8 8 8 8 13 22 19 9 8 10 8 8 8 18 12 10 10 10 12 15 13 14 14 10
10 15 10 11 10 13 6 6 6 6 7 7 12 12 12 8 9 8 8 8 8 8 8 9 10 15 15 8 7 6 7 6 6 6 6 8 8 8 8 9 10 9 10 10 11 11 10 10 8 8
8 8 12 17 10 10 10 10 10 11 12 13 23 13 10 10 14 23 20 24 20 11 8 8 8 8 8 19 19 14 9 9 11 12 14 16 15 13 26 31 39 25 23 11 11 11 11 10 12 17
15 12 10 7 6 6 6 10 10 11 11 12 22 15 14 14 14 10 12 8 8 8 8 9 17 21 28 30 39 32 18 16 16 18 24 19 18 16 15 9 9 9 10 9 10 10 10 10 10 | Open.Hide. 9 9 9 14 14 23 22 22 21 25 23 24 14 21 23 23 27 39 27 21 12 21 21 22 23 15 9 9 9 11 15 12 10 10 12 12 21 19 28 34 37 48 33 36 36 33 33 28 39 30
35 35 57 43 41 26 28 33 23 31 22 19 19 14 11 23 27 26 27 19 14 14 32 35 68 68 68 68 68 44 44 26 26 37 44 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 35 44 25 28 30
35 35 37 42 57 39 39 35 48 59 59 44 47 42 43 43 44 44 68 68 50 50 48 43 44 44 43 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 51 50 42 32 26 26 43 44 57 44 57 37 37 39 43 43 52 57 57 57 57 57 57 52 57 57 68 68 68 57 59 59 43 43 43 39 43 43 57 59 59 52 43 57 57 57 57 57 59
68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 35 43 44 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 52 52 52 57 59 59 59 59
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 57 57 57 52 52 57 57 57 57 51 68 68 59 57 57 54 54 54 57 59 59 57 52
54 57 50 50 57 54 54 57 59 59 57 50 47 43 47 43 43 27 20 32 26 15 12 27 30 43 57 57 57 54 54 59 59 59 59 59 59 59 47 47 47 47 59 59 59 59 59 57 54 57
57 42 32 24 24 12 12 25 25 42 39 41 39 41 41 32 37 28 28 28 41 41 43 42 37 39 35 35 28 32 20 20 18 19 19 18 16 29 29 28 28 30 38 39 46 43 47 47 59 59
59 59 47 41 37 29 17 13 8 8 8 9 9 15 17 26 32 43 47 32 32 20 20 13 21 16 28 36 32 30 17 12 13 25 25 39 39 59 43 43 39 39 35 32 43 37 34 37 37 23
28 23 15 15 26 26 26 27 21 22 17 13 14 11 14 16 24 24 24 30 27 30 21 19 19 19 25 37 28 30 14 17 17 28 30 30 28 20 22 25 33 34 39 46 30 28 11 11 11 11
18 23 28 34 20 19 12 10 10 8 10 11 12 11 12 22 24 35 36 32 32 16 16 11 12 12 14 14 15 15 15 16 15 15 10 10 15 16 16 11 12 16 30 30 34 25 20 16 16 19
18 18 14 14 21 21 16 13 10 10 17 16 15 16 24 25 30 39 39 24 24 12 12 12 16 8 8 8 8 7 6 8 10 22 27 34 16 17 15 15 10 14 14 16 11 12 15 26 16 20
20 18 21 9 8 10 8 8 9 9 11 10 14 13 12 14 10 15 11 11 19 11 8 8 6 6 8 8 10 10 10 10 8 8 8 10 10 13 12 14 18 11 9 8 8 8 8 8 8 8
8 10 9 9 9 10 10 11 16 12 10 8 8 8 9 13 13 10 10 10 10 12 11 11 12 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 10 8 8 6 8 8 8 8 11 10 12
12 10 10 11 11 11 15 11 7 7 8 15 10 10 10 10 8 8 8 12 15 13 17 10 12 9 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 10 11 10 8 8 3 0 |