BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-162O12.T7 (MSMg01no162_o12.b1) | MSMg01-162O12.TJ (MSMg01no162_o12.g1) |
ACC | AG361882 | AG361883 |
length | 698 | 702 |
length of high quality (start - end) | 310 (46 - 355) | 280 (75 - 354) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no162_o12.b1 PHD_FILE: MSMg01no162_o12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:30:23 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no162_o12.g1 PHD_FILE: MSMg01no162_o12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:30:23 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTTTGTTCAGTTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATTTGATTT
TCTGAAGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATGTTGGATATTAGTCCCC
TATCTGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGTCTT
TTTGTCTTATTGACGGTGTCTTTTGCCTTGCAGAAACTTTGTAGTTTCAT
TAGGTCCCATTTGTCCATTCTCGATCTTACTGCACAAGCCATTGCTGTTC
TGTTCAGGAATTTTTCCCCTGTGCCCATATCTTCAAGGCTTTTCCCCACT
TTTTTTTTTATAACCTCCCCCCCCTCTGGTTTTGTGTGAAGTTCCTTGAT
CCACTTAGATTTGACCTTAGTACAAGGAGATAAGTATGGATCGATTCGCA
TTCTTCTACACGATAACAACCAGTTGTGCCAGCACCATTTGTTGAAAATG
CTGTCTTTCTTCCACTGGATGGTTTTAGCTCCCTTGTCGAAGATCAAGTG
ACCATAGGTGTGTGGGTTCATTTCTGGGTCTTCAACTCTATTCCATTGGT
CTACTTGTCTGTCTCTATACCAGTACCATGCAGTTTTTATCACAATTGCT
CTGTAGTAAAGCTTTAGGTCTGGCATGCTGATTCCGCCAGAAGTTCCG
| ATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCGCTAAACACTTTAAAGGAAACA
AACAGAGCCCAAACCAAAATGCAAAGCAAAAACAAAAATATCCTACCAGA
AAAAAAAAAGAGCAAATTTCATATAATGAATGTAACTAATACTTTGAAGT
AGAAGTATCTGCAATGATGCCAGAGAAGGATGGTGGAATTCTCATCAGGC
TATAAAACCATCTCCTTTTTCTTTACTCATTTAAGTTATTACTGTTGCAT
GTTCAGACTCGCTGGCAAAACATCAGATATTTTCGAAAGTGAATCCTCCA
CATGTTTCTTCAAACACACCTCACCACTCAAGTAAAGTGTTTAAAACGTG
CCAGACGCCGGAAGCGACCGAAAGTTACCCGCCCCACCCCCACCCCCATG
GAGGCTGCGTGCTGCCTTGTGGTTTGCTGCCTCTTCTTCCCGGGCATGCA
GCAGATGCTGCTCTATGGCTTGCCTTCATGTTTGCTAGAAACAATCACCA
TGGGTCAGAATCAGCCACGGAATGGCTGTGTTTCCATGCATAAAGTAGAA
GAGACACTGTACCGGGTCTTCAGTTTTGTGACTATTCAAGAAGTCAGACA
GGAACTCTTCATGAAGGCTCTCTCTTCGAATCAGTGTAAATTCCCTCAGG
AA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 12 28 36 32 29 27 25 22 22 32 37 33 33 33 37 37 37 47 35 24 24 28 28 32 36 47 50 50 50 50 57 57 48 48 34 34 28 30 30 42 43 57 57 41
41 41 42 50 51 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 59 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 44 59 37 35 35 39 37 43 44 57 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 25
29 12 9 9 10 10 9 12 12 18 12 11 8 8 8 8 8 10 15 22 10 10 10 11 11 11 19 18 31 21 19 8 6 6 8 15 29 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 53
53 50 50 50 53 59 44 41 28 28 25 32 30 32 33 43 25 23 11 11 11 12 20 24 34 30 39 37 44 44 50 48 57 47 47 46 43 47 48 48 48 48 48 57 48 59 59 59 59 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 54 57 68 53 53 50 48 54 50 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59
59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 57 57 57 57 57 59 57 57 48 48 48 44 59 44 44 43 57 44 57 57 57 46 46
41 41 41 42 44 50 48 48 48 48 54 54 59 59 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 59 59 59 48 48 59 57 48 48 59 59 59 59 59 59 59 47 47 41 41 39 39 36 36 35
37 39 39 40 40 41 43 48 37 32 18 12 12 12 29 29 48 48 48 43 39 39 33 33 33 33 32 36 32 37 37 39 32 31 31 27 34 36 28 28 23 23 24 28 28 35 39 43 43 43
39 33 26 33 25 30 37 32 30 30 25 24 22 20 28 24 28 28 39 39 39 18 16 17 13 13 9 9 9 12 17 21 25 26 20 18 15 17 23 16 12 9 9 8 9 9 9 9 | Open.Hide. 8 10 11 8 9 9 10 10 10 19 14 22 32 31 31 39 37 37 39 39 37 37 41 37 47 37 39 39 43 36 43 43 57 57 47 40 37 23 24 24 30 32 43 42 48 42 42 42 48 42
42 42 48 44 54 54 54 48 48 37 41 41 41 41 41 57 57 48 41 41 48 42 48 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57 57 48 48 48 57 57 50 50 50 50
50 50 57 47 47 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 37 37 37 43 44 54 54 54 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 52 52 47 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52
57 57 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 59 59 59 39 39 39 44 43 43 31 44 43 52 52 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 43 43
31 31 29 44 44 57 43 43 52 52 52 43 44 35 39 39 43 52 52 44 44 33 33 23 43 43 59 42 57 41 36 32 25 31 31 36 36 57 52 54 54 54 54 54 52 52 57 59 52 52
52 57 59 59 57 57 57 57 57 44 44 46 46 48 57 57 59 59 54 54 54 57 54 48 48 47 47 43 57 57 57 57 57 57 57 48 46 47 44 43 43 35 32 30 42 42 42 44 37 37
35 43 42 42 30 30 30 42 42 43 43 43 36 39 30 30 30 32 37 43 48 48 37 37 23 23 23 37 37 59 59 47 47 35 35 35 39 39 35 35 35 47 39 48 50 50 50 41 36 34
19 16 20 16 13 11 12 12 12 15 16 15 24 19 8 8 8 8 10 10 14 14 12 12 12 12 12 21 16 30 30 46 47 47 37 37 30 30 30 39 39 48 48 59 59 47 47 39 39 39
43 43 30 30 30 43 43 54 59 54 43 42 35 35 35 37 31 37 28 30 30 44 36 41 30 30 30 44 44 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 47 43 43 43
43 43 57 48 54 48 57 57 43 43 43 50 50 57 50 54 44 44 35 35 35 59 59 43 44 44 48 48 48 57 54 54 54 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 41 42 42 59 47
32 32 14 14 14 28 28 44 43 43 46 46 48 48 48 46 43 44 44 30 39 33 59 59 48 42 39 35 35 35 59 43 48 48 43 43 40 40 43 59 43 48 48 47 47 41 41 39 59 43
37 37 37 37 30 30 18 16 16 25 27 37 37 37 37 33 33 36 39 39 37 35 35 28 32 31 31 20 20 20 32 32 48 43 43 36 36 39 39 39 47 59 47 39 23 23 11 11 11 12
12 13 19 19 28 28 32 37 30 37 37 48 48 47 47 37 35 32 37 37 37 35 39 34 36 34 34 28 28 28 34 37 36 36 37 37 32 37 30 31 24 31 34 37 35 28 28 28 28 28
34 34 31 28 32 30 32 32 34 28 35 32 27 26 26 27 28 24 25 28 28 30 30 30 28 28 23 28 24 31 37 24 22 11 11 11 20 17 34 37 41 41 39 39 31 31 28 33 27 29
34 32 |