BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-192D19.T7 (MSMg01no192_d19.b1) | MSMg01-192D19.TJ (MSMg01no192_d19.g1) |
ACC | AG381981 | AG381982 |
length | 1,248 | 1,222 |
length of high quality (start - end) | 419 (28 - 446) | 381 (71 - 451) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no192_d19.b1 PHD_FILE: MSMg01no192_d19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:09:20 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no192_d19.g1 PHD_FILE: MSMg01no192_d19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:09:20 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNAAGCATTGGGCCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCC
TTATTCATGGGGTTTTGACTGGATTTACAGTTATGGGTATGACATTCCTT
GTGTGGAACTGGCCTCCATTCCAATAAGAAAATGGTTAGTTATTCTCAGA
ATAGTTACGCCACTCTTGCACTAGTGGGCATAACCTGTTTGACTGATGTT
GTGGATCATGAAGTTCACAGCTGGATAAAATTGTTGATGCTTTTTCTTCT
TCAGTAACTCATATGTCTACTGTCAGCACTATGAAAGCTGGCTAGCAGGT
AGCATACTTCTGGCTCTGTTCCAGCTGATTTCCCTACACGTAGCAACTGA
GGCATGTGGTGTCTTCAGTAATAGGGACTTAACAACTAAATCTGGTGGGC
AACCAAAGAGTGTGACAAAAACCTGTGTTGTTGGAGATTCTGGGTCTTTT
TATGCCCCGCCATGTTTTGAAAAGAAAAATGTGCAAAAATTTTTACATTT
GGATACATATAACATCCTTTGATTTTTTATGCTAGCAGTTGTTGATGCTC
ATTTATCAATGGATTTGTATTGTAAAATTGAGCTATTCTATCAGTCCTCC
ATTGGCTATTTAGAATAGTTCATTAAAGTGACTTTTTTAAAATTATTAAG
TTATTTTATTAATTTACATTCCAAAAGTTGCCTCCCTTCCTGGTACCCTC
TCCTCGGGTCTTCATCCCCCTTTCCCCACCTTTGAGAGGGTGCATTCCTT
CCCTTACCCCCACCTCACCCCCACCAGCATCCCTCTTCCCTGGGGCATCA
AGTTTCCACAGGATCAAGTGTATCCTCTCTCACTGAGGCTGTACAAGGCA
GTCCTCTGCTACACATGTCTCTCAAGNCCATAAATCACCCCATGTATGCT
CCTTTGGTTTTTTACTTAAACTTTTGGAACTCCGAGGAATCCCTTTAATT
GACCCTGTTGTTTTTTCTTTAGGGTTGGGTATCCCCTTAAGATCCTTTGG
GCCTCTTTTTAAATTTTTCTATTGGGGCGCCACCCCCCCCCCCGGGTTAT
TGTATAATTCTGCTTTTTTTTTCTCTATCCCTTGGATAACCTCCTCCATC
TCCCTTTAAATCTATACTTACTTCCTTTTCTTTTATATATTTTTTATAAG
TATATTAGTGCATGTATTCCCCTTTCCTTCTCTCCTCTTCTTCATTCCCT
TTCTTATTCCTTTTTTATTCTTTCCTTTTATTCATTCTTTACTCTCTC
| NNNCCTTGAGTGATGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTAAAAATCAAAAAGTCATTTCACATATG
GAAGTCACTAAATTGTTCATTTTTAAATGGTGAGGTTTTGTGCCTTCTTC
AATAATCTGTTAATTTTTCAAAAATGATTATTTCATTATCAGCCTTATCT
TTGGAAATTAGGTTAAAATGCTGGGCCATCAACCCTCTCTACTAAACAGC
TTTTGAGCAGTAGGTGGACCCTTAAAGACTGGCTCTGTCATATGTGCTGC
TTGGGGTTTTCAGATGTCACAGCCTGTTCATTTTGTGTAAAACTTCCTAC
AAACTCCATATTTTGGACACACATTTATAAAAAAAAAAAAACAAGTATTA
TTCTTCATTGCTGTTAGCAAATACTGCCCTAATCCACTGTTCAGGTTATT
TTTTTATCCCCCCCGGTGCCTTTACTTCCAGAGAAACAAAGAAGGCAAAC
ATGTCATGAGTGGCCCAGTTTGACTGAGAGCAGATCCATGCCACTGGTCA
CAAAGGTAAACACTTGAGACATTTAACCCAGCCCAGCAGTCCTAAATGGA
AGGGGGTGGTCATCTGGATTATGAATCACCTAATTGGCATGTCAGAAAAT
ACGCATTTTATTGACAGGAGGTGATTGTGGGGGAGAGTAATTTTTCATGT
AAATAGCAGACACCTGTCTCCTCCTCTCTTTATTCACACTACTGTGTGTG
GTGGGAGGGGCAAGAATCGGAGTGATTCTCTGCTGCAGCTTTGTATTCTG
TAACACATGATTTTATTTCAGCAGTCCTACAGCAATCCTGGATTGTCTGA
TTTCATGAAAGATCTTTAACTGTCTTTCTGTGTATCACATCAGTAGCTGC
TTTGGAAAAATACCCCTTGTCTATCTCTTCTTCTCTGGAGAATTTGTAAT
AATTAATTCCAAAAAAAAATTTTATGGATCTCTTTATAACCCCCAAAAAT
CATTGTTTATTCCCTTCTTCTCTCCATATATTTTTCCTCTATTTTTTTCT
TATAACATCTTAAAACCTTCCTTCTATTTACTTTTTCACTTCTATATAAT
AATATTTTCATTTTGTTGTCTTTTTTTCATTATTTTTATTCCTCTTTTTT
TTTTTTTTCTACTCTCCTTTTCTTCTTACTTTTGTATATTATTATTTCTA
CCATTTCTTTTCTAATCTTTTT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 7 7 9 6 10 10 8 8 10 10 8 8 8 13 19 10 8 8 8 8 8 19 21 47 37 37 36 36 36 48 48 48 53 48 68 68 43 51 51 51 54 54 50
50 50 50 50 50 41 41 41 48 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 48 48 50 50 50 50 68 51 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50
50 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 51 51 50 50 50 50 51 50 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 41 41 32 23 20 23 24
40 44 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 50 50 50 50 53 53 50 59 59 25 25 11 15 16 16 13 13
18 18 18 19 10 8 8 8 8 8 6 6 9 12 20 30 37 59 59 59 59 59 48 47 47 43 43 43 39 34 34 28 17 11 10 8 8 12 14 25 28 32 34 25 30 24 32 39 44 57
57 57 53 53 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 54 54 54 54 54 57 59 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 54 54 54 54 54 54
57 54 54 54 59 43 43 43 43 37 37 28 35 35 59 59 48 48 48 48 48 48 57 57 57 59 57 48 48 48 48 41 47 47 59 59 37 37 35 35 37 37 41 41 46 46 43 44 43 50
48 57 57 59 59 59 57 48 48 48 48 48 57 57 57 59 48 48 48 59 59 48 48 48 59 48 48 48 48 46 39 39 37 37 41 59 59 41 41 37 28 16 16 18 14 18 19 33 59 59
50 50 43 37 28 28 22 32 34 47 39 39 35 35 35 39 43 59 59 59 59 59 44 44 37 39 41 32 32 30 32 32 28 34 16 16 12 19 14 25 32 41 59 41 47 41 46 39 41 32
28 28 41 30 44 36 36 36 37 39 32 32 18 18 28 32 32 37 37 44 41 39 39 31 31 35 36 36 39 39 40 34 34 28 33 33 37 32 37 43 43 41 41 44 44 39 41 40 41 40
48 48 48 53 44 44 36 36 36 37 37 37 37 30 32 20 20 28 32 30 19 19 21 17 19 37 37 31 25 24 24 26 25 23 23 10 10 10 18 13 18 24 30 30 25 21 21 25 32 23
23 11 11 11 12 23 24 32 32 22 23 11 11 11 22 19 24 23 28 28 31 17 10 7 7 3 0 3 8 11 15 17 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 10 13 8 8
8 9 10 12 14 10 10 9 10 10 17 19 16 11 11 10 11 8 8 8 8 10 10 7 7 7 8 8 8 8 9 9 9 12 14 15 11 12 12 10 12 10 14 15 15 12 8 8 8 8
8 9 9 8 10 10 10 11 8 11 10 11 8 8 8 8 8 9 9 11 11 11 17 15 17 15 16 8 8 8 8 8 8 22 22 25 22 10 8 8 8 8 8 8 9 13 11 8 8 10
10 8 8 8 8 10 11 13 13 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 10 10 8 6 6 6 8 12 12 12 12 11 12 16 21 15 12 11 11 11 12 13 10 10 10 10
10 8 8 6 7 13 10 8 8 6 6 8 8 8 9 9 11 15 19 13 12 8 6 7 15 10 10 8 8 8 8 10 9 6 6 6 6 8 10 14 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8
8 6 7 6 6 10 8 12 9 9 9 8 8 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 9 12 12 9 8 6 6
8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 7 7 14 8 8 8 8 9 9 9 9 9 8 8 8 12 9 9 12 12 11 15 11 16 16 15 10 10 10 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8
13 7 6 8 8 10 10 8 8 8 10 8 8 9 9 10 10 10 10 10 10 10 6 6 6 7 6 6 8 6 8 13 8 8 8 6 7 7 7 9 9 8 10 8 9 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 15 9 7 9 9 16 16 22 23 22 22 19 28 28 30 29 32 24 24 24 28 28 35 37 37 37 40 43
43 43 43 48 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 59 54 48 48 47 50 50 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 47
57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 57 50 57 57 57 57 57 57 50 51 51 50 50 50 50 43 43 42 43 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
51 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52
52 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 54 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57
57 57 52 57 57 68 59 59 57 47 47 35 35 35 59 47 59 57 57 57 57 57 57 52 57 52 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 57
57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 47 57 57 57 57 57 59 57 59 59 59 59 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 54 54 57 47 47 35 28 36 41 37
43 47 47 48 57 47 48 43 47 43 43 43 48 43 43 39 43 43 42 43 43 46 46 43 43 43 59 43 48 48 48 48 48 48 59 47 39 39 39 47 47 59 47 43 23 23 11 11 11 14
16 19 28 16 10 10 10 9 11 11 12 10 8 8 7 7 9 20 25 59 59 41 41 41 48 48 48 59 47 46 46 41 43 23 23 11 11 9 9 9 10 11 11 12 9 11 11 15 15 19
32 34 40 43 43 48 43 43 43 43 43 43 59 59 59 48 48 48 39 39 39 40 39 39 25 25 12 12 12 27 27 14 14 14 30 30 48 48 48 47 57 43 43 39 39 37 39 40 30 37
37 43 43 48 43 43 43 48 48 43 43 43 43 43 34 34 20 20 20 32 32 48 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 48 48 47 39 37 37 37 39 47 47 47 41 41 31 34 41
41 41 47 39 59 35 32 32 33 33 33 39 39 43 43 37 37 37 37 37 41 41 41 37 34 41 41 39 39 39 39 41 46 39 34 34 43 39 36 39 39 25 28 12 12 12 27 27 36 31
31 23 18 22 29 29 29 36 48 48 48 43 39 43 39 37 43 43 43 43 36 28 28 31 32 37 30 32 32 34 34 22 21 11 11 11 12 12 25 30 39 41 37 32 23 20 15 24 16 20
28 32 26 26 19 23 23 10 10 10 12 12 26 24 37 35 39 35 30 30 24 24 28 37 37 37 37 37 37 37 37 37 31 31 35 35 35 39 39 37 36 29 22 17 17 13 16 14 17 17
19 24 25 18 24 14 23 13 8 12 14 11 9 10 18 20 22 26 23 28 20 20 18 21 21 18 20 19 21 12 15 12 25 25 30 28 32 33 30 27 21 17 16 11 11 18 21 21 25 18
22 22 24 20 19 11 11 10 15 10 10 12 21 30 26 19 10 10 9 10 14 13 15 12 11 11 11 14 15 13 15 16 22 33 28 23 19 11 11 10 10 10 11 17 17 12 12 19 19 30
30 32 23 19 11 10 10 10 8 8 8 9 10 13 15 11 14 10 9 9 12 9 9 9 12 15 14 11 11 11 10 8 8 8 8 11 10 12 16 21 13 12 9 12 9 9 9 8 8 8
8 8 8 8 8 8 11 10 10 8 8 8 11 13 11 15 15 12 10 11 11 12 15 11 11 11 10 11 10 10 10 15 12 11 11 11 12 12 10 10 10 11 13 22 11 11 9 8 8 10
8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 13 14 21 17 15 13 12 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 13 15 12 9 9 9 10 10 10 10 12 13 9 9 9 13 10 8
8 8 8 8 10 9 8 8 10 10 8 8 8 10 13 14 10 10 10 8 8 8 6 6 8 15 8 10 10 8 8 8 16 14 12 12 7 7 8 8 8 8 10 8 10 10 10 10 10 10
9 9 9 6 6 7 7 8 8 9 9 9 10 10 9 9 6 6 6 7 10 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 13 14 9 7 8 6 6 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 15 8 8 9 10 9 9 9 9 12 9 10 9 10 8 8 6 6 8 10 11 11 11 11 11 11 11 9 9 8 10 6 6 7 7 7 11 21
8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 9 9 12 8 8 6 7 13 15 9 8 8 7 6 6 6 8 8 8 6 6 9 6 6 8 8 6 7 7 8 8 10 10 10 12 12 12 10 8
8 6 6 8 8 8 6 6 8 6 11 17 10 14 8 8 8 12 13 13 10 10 |