Query= MSMg01no289_m08.b1 MSMg01no289_m08.b1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no289_m08.b1 PHD_FILE: MSMg01no289_m08.b1.phd.1 CHEM: term DYE:
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(295 letters)
>mm_chr4_64838170_64838864
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Score = 93.5 bits (48), Expect = 1e-23
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Query: 246 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 293
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Sbjct: 493 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 446
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Query: 247 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 293
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Score = 87.7 bits (45), Expect = 8e-22
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Query: 246 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 294
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Sbjct: 513 atatatgtatatatatatacatatatatatatatatatatatatatatat 464
Score = 81.9 bits (42), Expect = 4e-20
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Query: 246 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 295
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Sbjct: 535 atatatatatatatatatatatatatatgtatatatatatacatatatat 486
Score = 81.9 bits (42), Expect = 4e-20
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Strand = Plus / Minus
Query: 246 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 295
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Sbjct: 537 atatatatatatatatatatatatatatatgtatatatatatacatatat 488
Score = 81.9 bits (42), Expect = 4e-20
Identities = 48/50 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 246 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 295
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||
Sbjct: 539 atatatatatatatatatatatatatatatatgtatatatatatacatat 490
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
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Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
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Number of extensions: 104
Number of successful extensions: 85
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 68
Number of HSP's successfully gapped: 27
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Length adjustment: 9
Effective length of query: 286
Effective length of database: 686
Effective search space: 196196
Effective search space used: 196196
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| Query= MSMg01no289_m08.g1 MSMg01no289_m08.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no289_m08.g1 PHD_FILE: MSMg01no289_m08.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 21:24:09 2005
(258 letters)
>mm_chr4_64953615_64954272
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Sbjct: 277 agatccacagtgacaggaaagtattgagagtgtgaactctggcttctgtactatcaagaa 218
Query: 121 aaattagttccacggaactcttcctcttcttcttcctcttcctctccctcccctctccct 180
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Sbjct: 163 ctctctttccctctctctctc--cctctccctctccctcctttctcttcctcctctcttc 106
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Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
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Number of sequences better than 10.0: 1
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Number of HSP's successfully gapped: 1
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Length of database: 658
Length adjustment: 9
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Effective length of database: 649
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Effective search space used: 161601
X1: 7 (13.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 7 (14.4 bits)
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|
