BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-290D05.T7 (MSMg01no290_d05.b1) | MSMg01-290D05.TJ (MSMg01no290_d05.g1) |
ACC | AG419546 | AG419547 |
length | 733 | 730 |
length of high quality (start - end) | 468 (131 - 598) | 293 (75 - 367) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no290_d05.b1 PHD_FILE: MSMg01no290_d05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:24:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no290_d05.g1 PHD_FILE: MSMg01no290_d05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:24:40 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTACAGGATCCGCG
GAATTCTCACCTGAGGATTACCGAATGGCAGAGAAGCACCTGAAAAAATG
TTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCCAATCAAAACAACCCTGAGAT
TCCACCTCACACCAGTCAGAATGCCTAAGATCAAAAATTCAGGTGGATAT
TAGCCCAAAACCTAGGATACCCAAGATATAAGATACAATTTCCTAAACAC
ATGAAACTCAAGAAAAATGAAGACTGAAGTGTGGACACTATGCCCCTCCT
TAGAAGTGGGAACAAAACACCCTTGGAAGGAGTTACAGAGACAAAGTTTG
GAGCTGAGATGAAAGGATGGTCCATGTAGAGACTTCCATATCCAGGGATC
CACCCCATAATCAGCATCCAAATGATGACACCATTGCATACACTAGCAAG
ATTTTATGGAAAGGACCCAGATGTAGTTGTCTCTTGTGAGACTATGCCGG
GGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTAATGGATGGATC
ACAGGGCTCCCAATGGAGGAGCTAGAGAAAGTAGCCAAGGAGCTAAAGGG
ATCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACATTATGAACTAACCAGTACCCCGG
AGCTCTTGACTCTAGCTGCATATATATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCAT
CACTGGAAAGAGAGGCCCATTGGACATGCAAAC
| AATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACCAAGGAACCATCTAATACATTGTA
AATTCTACTGCAGCTAATTGGCCAAAGCTTCAATAGCACCTAAAGTGATT
TAGAAATAAGAATTTTCTAACATTACATTCATTAATTCATTGTTTCGGAT
TCCCTTCTAGCAGACATGAGTGTGTTCATTTATCATTTAATTGACCTCTT
AGAGGTGAGTGCTGATTTTACATCCAGTTTCACAAACTACACTGTGATGT
GCACATGGATGTATTGGCTTGAGTAGGTTTCTTAGAGCAACACAGAGGTG
TGATTTGTAGAGCAAGCATGTAATGTTTTACTCAAATTGAACTTACCTGA
AAATGGTAGGGCCTTAATAATTTTCATCCTATAACAACGCCAACCTGGAT
ATATAAAAATATATATTTGCTGCACACATACATGTGGCAACTTAAAGCTC
TCATAGTGTTAAAAAAATCCTTTTCCCCATTTCCCCAATGACACTTTTCA
TCTTTAAATGACTCATTTTGCATCATAATGATGCAAGACCAACATTCTTT
GAACTTCTAAGTATGTCTACTTATTAGTTAGCCATACATCTCTACTTTTG
ATTTGTGACATGGAATTTTAGTTCATTTCCCTTTTGTAACATAGGTTGGT
CTTCAAGTATATTTTAAGAAAACTCCCTCT
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 13 8 13 24 34 32 29 28 24 22 22 28 37 30 26 24 32 30 30 39 41 30 28 28 28 28 31 59 59 30 20 11 11 10 10 10 11 10 22 12 13 13 24 30 48 47
35 36 35 35 50 36 53 44 44 39 31 31 27 23 10 8 6 6 8 12 22 34 34 42 42 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 53 53 53 50 50 53 53 47 47 51 51
47 53 53 53 53 47 53 53 53 57 57 53 53 53 53 53 53 53 47 37 29 21 23 14 20 20 21 20 12 13 14 21 25 34 41 50 50 50 50 53 53 57 59 57 53 53 37 37 37 47
47 47 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 48 48 50 53 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 52 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 43 43 37 43 43 43 32 32 32 41 37 44 44 48 48 46 46 43 43 43 46 47 48 59 59 57 50 47 50 50 50
57 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 54 54 54 54 54 54 54 54 57 57 57 57 48 48 57 47 47 47 47 39 39 43 43 48 48 48 50
50 50 47 47 47 47 44 41 41 41 41 44 37 37 37 37 37 37 43 48 39 30 28 35 35 35 32 37 37 47 57 57 57 57 57 48 48 48 48 41 40 41 41 41 39 39 37 35 39 39
39 35 34 28 32 20 20 24 32 25 29 32 37 37 37 43 41 37 41 41 34 34 38 39 41 41 41 41 41 43 43 43 48 48 46 32 34 25 34 28 34 26 29 32 32 37 37 41 43 59
47 44 44 37 31 31 22 22 23 31 31 37 11 9 9 9 9 9 14 37 37 37 39 36 36 37 43 37 30 30 24 24 15 15 21 21 25 29 31 36 39 37 37 28 22 19 19 9 9 10
15 15 18 30 24 18 14 9 9 9 10 14 15 24 22 18 18 19 20 10 11 10 14 15 20 30 30 30 37 37 19 11 9 9 8 15 6 7 6 7 8 10 10 10 13 22 28 30 27 29
32 34 34 28 33 26 21 27 15 15 15 25 27 36 39 39 39 39 32 28 23 28 21 25 23 31 16 15 14 11 12 9 14 11 8 8 8 8 8 12 12 11 11 13 10 8 8 8 11 19
32 32 36 35 15 15 16 16 17 15 18 20 23 20 23 31 31 35 35 11 9 9 9 6 8 8 8 8 8 12 10 12 8 | Open.Hide. 9 15 10 10 6 6 8 15 17 30 32 37 41 41 41 47 39 37 42 41 37 37 39 39 39 44 44 39 41 42 39 39 35 32 32 30 28 28 33 33 36 36 53 53 53 57 50 50 50 50
50 53 53 68 68 68 68 68 57 42 36 29 24 31 28 30 30 17 14 19 27 42 50 50 54 68 68 68 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57
57 53 53 53 53 57 57 57 53 53 50 50 50 53 57 59 53 48 48 46 40 37 34 25 21 15 14 14 14 22 26 34 37 37 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 42 42 47 47 50
50 59 59 47 42 42 42 42 42 42 47 42 42 42 42 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 53 57 59 59 59 59 59 59 37 34 28 20 13 13 13 21 14 14 13 15 28 28 23 28 24 30 21 19 12 12 12 12 24 24 37 37 40 46 47 50 50 53 53 57 57 57
50 53 50 48 41 41 59 47 39 39 39 39 39 39 44 44 47 41 41 41 43 48 48 48 57 48 50 53 57 57 57 47 47 36 36 36 43 43 42 48 43 47 47 48 54 54 59 59 59 59
54 48 48 48 48 48 48 48 48 54 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 48 43 57 47 48 48 48 46 43 40 40 41 41 39 44 44 41 41 44 59 47 47 47
47 46 47 47 47 37 33 30 28 28 39 39 39 39 41 43 39 39 46 46 43 44 44 44 31 31 37 37 37 37 41 47 47 48 59 59 59 48 47 43 43 40 40 43 43 59 47 41 37 37
37 37 41 41 43 37 31 31 32 37 37 39 41 41 39 39 39 36 37 39 44 44 47 47 41 41 36 36 37 37 37 37 27 24 22 22 24 24 27 26 26 26 32 35 23 21 10 10 10 15
17 22 30 34 37 32 37 32 23 22 28 28 37 39 35 32 32 30 30 37 39 33 20 12 12 8 15 15 17 16 13 18 18 21 24 33 28 28 25 28 28 33 37 37 23 15 11 11 10 21
16 27 22 22 25 21 21 21 16 16 24 28 19 18 14 8 8 8 8 10 11 14 12 14 14 16 22 17 22 22 22 32 41 34 34 14 14 16 15 14 14 24 18 15 20 30 25 21 18 20
25 14 13 10 10 14 14 23 15 19 19 30 31 32 30 27 25 30 29 31 30 28 28 28 30 31 19 23 14 14 |