BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-304N20.T7 (MSMg01no304_n20.b1) | MSMg01-304N20.TJ (MSMg01no304_n20.g1) |
ACC | AG430015 | AG430016 |
length | 1,293 | 1,312 |
length of high quality (start - end) | 689 (132 - 820) | 771 (91 - 861) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_n20.b1 PHD_FILE: MSMg01no304_n20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:44:04 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_n20.g1 PHD_FILE: MSMg01no304_n20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:44:04 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNNCCCGTTCANNNNNNNNACATTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXCGCGGAATTCCCATTTAATCAAGGGTCCTTTTAGATCCAATTAAT
TACAGAGACTCTCAGTTCCACCACTTTGAAGCTGAAAATCACTGTTTCAT
TTAATTTTTGAAGCCCTGGGGGAAACCTCAACAAAGAAATACAACAAGGA
ATTTCTAAACTTCTTATGGAAGTTGGAGAAAGAGTAGTGGCTGCCTAAGG
ACATCAAGACTTGGGAAACCCCAAGCCAGTAAAACCTATGCCTATCCCTG
TGTTTTAGTAGTCCCTTCTATGTATATCTCTGAGCAATGTACATTACCAG
TGAAAAAAATATTCAAAGAAAAGCCATTGTCCAGAAGCCATGAGACTCAC
TAACATGTAGCCTAATACCAGAAATTCTTGGTTTTAGCCACAGCCATACC
ACTTTCTATCAAAAGCCAAGACAAAGGTCCCCTCTCTCTACCTCATCCTT
AACCAGCACACACACACATCATTATCAGGGGTTCAGGAAAATTGATCTGG
AATTTGGAAGGAAGTCTTCCAGCCTACCACCAGGACAGAAGGAAGCAGCT
GATAGGCTCCTCTAGAACTCTGTGCTAAATCACCTGTCTGGACTGGACAC
AAAGGATCACCCTTCCTTCCTCAACATGCACTCAATGTGCACAAAAAGAC
AACTGAACATCTAGTCCTTGCCTGGCAATCAGGTGTGCTTCAAAACCACA
GTTAGTATCTAGAGATAAGCAGAGGATCCTCCTGCCTTAGTAGTAAAATG
AGAAGGAAGGCAGCAAGTGGAAGAAGATGCTGTCACCACTGTACTGTGTT
CTTTATCTGTGAATAAACCTTCCAAACATCATAAAACAATGGGAAATGGA
ACAGAAATCCGCCTAACAATATGTGGCCAAAGGAAAAAACTCAGTATTTA
CTAAAGCAAATTTAAAACTTAAAATGGGAAATTCTTAACATGTCCTAACC
CCCACAGGATATAAAAAAAAGCTTTGAGTACTAACCTTTCCAAAAAAAGA
CTCCCACCAAAATTCTAGTTTCTCTCCCACCCTAAAGAAGAAAGCTAACC
CCCTTAGGGACAAAAAAAAAAAGGTGGTAAAAGAAACAAATGGGGTTTAA
TCTTGAAAATGTTGGAAAAAAACTGCTTTTCCAAAGCCCATAATTTAGAA
CCCTCCCACGGAGAGATTATAAAAAGGTGGAGTCCTTTTAAAAAAAAAAA
AACAAGGTTATCCCTTAAAAAGACACAAAAGAAGTGGTAAAAT
| NNCCGATTCCNNNNNNAATGCATGGAGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTTCAACTAGCAACTTAACA
GCACATCAGAAACTCTAGACCTAATAGAAGCAAATGTACCCAAGAGCATG
GATGGCAGAAAACAATCAAACTGAGGGCTGAAATCAATAAAATAGAAAGA
AAGAGAGACAGAGACAGAGACAGACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAATACAAAGAATCA
ATACAAGAAAGAATTGGAGAAAAATCAGTAAAATAGGAAAGCCTGTATCT
TTATTAAGTAAAAGGCAAAGAGAATATCCAAATCAACAAAACCAGTAACA
AAAAGCAGTACATATCAACCAAAAGCAAGGAAATCCAATGAACTATAAAG
TCATATTTCAAAAACCTATACTCCAAAAAACTGGAAAATTTAAAACAAAT
GGAGAATTTTCTCGATAGATGCCACATACCAAAGTTAAATCAAGATCAGG
TAAACAACTTAAATTGGTCTATTTAATCCCTCAGAAAATAGAAATACTCA
TTCAAAGACTCCCAAACAGAAAAAGCCCAGAGGCATAGTTTTAGTGAAGA
ATTCTATGAGACTTTGAAAGAAGACCTAAGGCCAATACTCCTTAAATTAT
TCCACAAAATAGAAACAGAAAAAACATTGTCAAATTTATATGAAGTCAGA
TTTACCCTGATATCCAAACCACATGATGATTTCTCAAAGAGAATTATATA
CCAATCATCAACTTGATGCAAATGTATTCAATAAAATACTTGAAATCTGA
ATATAAGAACACATNCAAAGGAACATCCACTATGATCAAACAGGCTTCAT
TCCAGAAATGCAGGGATGGATCAGCACACAAAATTTGTCCACATAATTTA
CCCTATAAATAATATAAAAGAAAAAAAACCCCGATGAATATACCCTTAGA
AGCCCAACAACATTTAAAAAAACCCAAACCCTTCCTGACAAATGCCTTGG
AAAAAATCAGGAACCAGGGACAAACCTAACCTAATAAAGGCGATTTCAAG
AAAGTCTTTTCCCACCTCCAATTAAAGGGAGGAAAAGTAAATTATTTCTC
TAAACCCGGAGAGGAAGGGGGGCGGGCCTTCCTTCTCTTTCCAAATTACC
CAAGGTTACGTAAGATAACACCCCATGAAAAAGGGGGTCCCTTAAAGCGA
AATTCAAAAAAAAAGAACTCCATATAACAGGACCCTTCCCTAAACCTTCC
AAGAATATAAAA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 7 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 7 7 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 12 15 8 8 8 8 10 14 19 25 35 28 24 28 24
26 33 33 37 37 37 33 33 32 32 32 21 24 32 33 30 31 33 31 31 31 33 33 33 37 24 19 7 7 6 6 6 11 12 10 8 8 7 7 9 8 10 10 11 10 12 21 29 37 37
37 41 33 36 53 50 50 38 36 35 35 35 31 31 31 31 31 30 44 27 27 11 11 11 11 11 12 11 11 13 21 21 28 30 20 28 28 39 43 38 42 42 47 47 50 50 50 53 53 53
53 53 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 53 53 53 53 53 57 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 34 30 23 11 8 8 8 11 17 24 34 37 41 50 50 50 53 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59
68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 48 57 57 57 57 57 57 59 57 59 59 59 54 47 57 47 47 48 57 57 68 68 57 57 59 59 59 59 59 57 57
57 48 48 47 48 47 59 43 57 48 57 47 57 46 46 48 48 48 48 57 57 48 48 48 57 57 59 59 59 59 48 48 48 48 48 48 48 46 46 59 59 47 44 44 37 36 38 37 37 41
41 41 40 34 37 33 33 36 43 43 50 44 59 48 48 41 41 41 41 41 39 39 37 37 43 43 59 41 41 41 41 41 41 31 31 43 37 41 41 41 41 47 48 47 59 59 39 34 31 28
24 30 34 43 39 37 37 39 41 41 39 39 37 37 35 31 34 40 41 41 36 32 43 32 37 43 36 36 39 37 32 26 26 32 37 41 41 47 47 41 41 41 37 37 37 30 29 32 37 43
39 41 37 44 59 47 47 47 43 39 37 37 36 39 37 37 34 36 36 41 23 19 11 11 11 20 22 31 31 39 37 34 39 37 31 31 24 24 17 17 17 17 17 25 34 34 37 37 39 39
35 28 24 24 24 26 30 29 29 27 32 39 41 41 31 29 16 9 9 9 9 9 8 14 12 12 11 12 12 25 29 34 34 23 23 20 25 32 32 34 28 35 35 25 25 11 11 11 16 16
36 31 34 34 36 37 28 28 14 13 11 21 10 14 16 26 15 15 31 32 26 10 11 11 9 9 10 11 13 10 12 16 16 16 30 28 21 15 9 8 8 8 9 8 16 8 8 8 9 9
8 12 10 10 11 19 12 10 9 8 8 8 8 13 10 19 19 13 10 12 12 18 13 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 9 8 7 8 8 7 8 11 10 10
10 10 17 17 26 28 13 9 8 8 8 10 18 18 14 19 14 13 10 10 10 15 17 13 11 11 11 10 8 10 10 7 6 6 6 8 6 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 11 11
16 21 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 9 8 8 8 8 8 9 8 8 8 15 11 8 10 6 6 8 8 8 6 13 6 6 8 7 14 16 20 8 7 6 6 6
6 10 10 10 9 10 10 10 10 9 9 9 9 11 12 11 11 11 6 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 11 8 8 10 13 10 11 11 14 15 10 10 9 10 9 8 6 6 6 6
6 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 7 7 6 6 8 10 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 10 21 12 9 9 9 15 9 8 8 8 8 8 8 11 11 12 12 11 9 9 9
11 10 9 9 10 8 9 17 10 8 8 8 8 10 19 16 20 28 28 28 17 17 11 11 11 15 12 14 18 11 9 9 10 8 8 9 9 12 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 8
12 12 11 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 9 6 6 6 6 6 6 18 10 8 8 8 8 6 7 8 8 10 8 8 6 6 8 11 8 11 15 18 9 9 9 9 22 24
15 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 7 13 10 13 8 6 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 11 13 12 16 16 10 10 9 9 | Open.Hide. 0 0 3 8 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 3 7 7 6 7 7 7 9 9 10 10 8 6 6 6 8 8 10 11 8 8 9 8 9 8 12 13 20 20 17 20 21 30 29
28 22 22 22 24 24 28 37 37 37 40 37 37 42 42 38 38 38 53 53 53 53 50 50 25 23 11 9 16 12 14 18 10 10 10 10 15 15 10 10 13 32 32 36 36 36 38 53 42 57
57 57 53 50 50 50 50 50 50 50 53 50 51 47 42 23 21 10 10 11 11 11 11 18 23 24 37 37 37 37 39 43 43 47 46 41 39 39 46 57 59 57 57 57 59 59 57 68 68 68
68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57
57 57 57 68 68 59 59 59 68 59 59 59 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59
59 59 68 68 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 46 47 27 24 11 11 11 16 19 32 34 47 59 59 59 59 59 59 57 57 57 53 53 53 57 57 57 48 48 57 50 53 50 50 57 57 59 59 59 59 59
59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59
59 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 43 43 43 59 59 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 57 48 48
57 59 48 48 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 57 54 54 54 57 57 68 59 59 57 57 57 43 43 37 43 43 57 59 59 54 54 54 59 59 59 48 48 48 47 59 35 35 35
43 43 48 48 48 57 37 37 28 28 28 37 37 59 47 42 41 39 39 39 34 32 41 41 41 41 41 36 37 39 39 39 39 46 46 59 59 47 47 47 47 43 40 37 37 44 44 44 41 47
37 37 30 21 12 9 9 10 22 25 59 59 59 59 59 44 44 44 41 41 44 59 59 41 40 40 40 41 39 41 41 32 32 39 39 39 41 47 47 59 59 44 41 37 41 59 47 34 34 23
32 32 43 59 59 59 48 48 42 42 42 39 59 59 41 37 37 39 35 31 37 37 39 39 41 40 33 33 37 37 37 37 37 37 35 31 31 39 39 30 30 25 31 39 44 47 47 59 47 47
48 48 41 40 40 39 37 37 39 31 37 41 31 30 37 37 37 18 9 9 9 9 18 19 41 35 31 31 32 28 32 37 31 39 37 37 39 39 39 37 37 39 37 36 39 36 37 37 39 36
37 37 37 32 23 22 27 17 24 21 28 18 8 3 0 3 7 7 18 20 27 26 26 27 30 23 28 18 20 20 32 32 40 39 37 37 32 28 28 20 18 18 15 14 17 14 18 14 17 18
20 16 12 10 10 9 18 12 15 12 8 8 8 10 9 13 28 22 25 30 16 13 9 9 9 9 12 11 12 14 17 18 14 12 14 13 14 12 9 8 8 8 9 9 9 15 15 18 8 10
10 15 12 12 15 11 20 20 30 30 24 21 11 11 11 9 9 9 9 9 8 10 10 12 12 34 28 28 28 26 23 11 11 11 11 11 12 12 12 6 6 6 6 9 9 10 10 8 9 9
8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 14 9 14 10 8 8 8 12 10 10 19 13 16 11 10 8 8 8 9 7 8 6 6 6 8 12 8 8 8 8 8 8 12 14 14 19 13 12 8
8 8 9 8 9 10 10 10 12 12 11 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 9 9 10 13 15 13 19 19 16 16 12 14 12 12 12 15 12 9 6 6 6 8 8 8 10 10 11 10 9
8 6 6 6 6 6 10 11 12 14 14 16 10 10 10 11 9 9 8 8 10 9 9 9 10 11 11 12 9 6 6 6 6 10 8 12 11 17 8 8 8 8 8 8 9 8 7 6 6 6
8 10 10 16 11 11 8 8 6 6 6 6 6 7 12 9 9 9 11 11 8 7 6 6 6 7 11 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 8 8 8
8 12 10 10 8 8 7 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 7 8 6 6 6 8 9 10 10 8 7 8 8 8 8 9 9 8 12 9 9 15 11 9 8 8 8
8 8 9 9 9 11 17 11 15 10 10 10 12 13 8 10 10 7 7 7 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 13 10 10 6 6 6 6 8
8 9 8 8 7 7 6 6 6 11 11 7 |