BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-315K03.T7 (MSMg01no315_k03.b1) | MSMg01-315K03.TJ (MSMg01no315_k03.g1) |
ACC | AG436221 | AG436222 |
length | 719 | 752 |
length of high quality (start - end) | 547 (50 - 596) | 338 (75 - 412) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no315_k03.b1 PHD_FILE: MSMg01no315_k03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:57:10 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no315_k03.g1 PHD_FILE: MSMg01no315_k03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:57:10 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NAATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCTTACAAGCTCGCCTTCTGATCTCCACACATATGCCTTGGTG
CTTGCGCGCACGCGCGTGTGCACACACACGCACACACACGCACACTCACT
CACTCACTCACTTAGAGCATGTTCTGCCAGGTCCTACATGATTTGTGTTG
ATGTTTAAGTGAGAAGCACTTCAGCAGTAGGACGTGATCTCTCAGAAGGC
TGTCTGTCTGGAACCTGCCCACTCATGCCTGGAGACAGGTCTACTACTGT
CCCTGTAGTTGGCCTCAGGTAGCGCTAGTTGGCAGTAATTCTCAGGACCC
ACAACTGCCCAGGCTGCTCCTGCTTCTTGTCACTGTTCTCTTATTGTTGG
TGTCACTCAGACTCTTACCCCCCCNGCCTCCCATGTCTCTTGGCTTTACA
TGTCTTACTCTAGAGCAGGCCTGTGCCTGTCCCAAGCAGCTTCGGGTGCC
TTCTCATTTTCTGGGATGAAGGCGGATGCTGTGAGCACCAGCTTTCAGTC
TGTTTCTTCTGCCCAGGCAGCACTGGATGGAGGCCAGTGGGCCACCACTC
AGGATGATGGTGCTTAGCAGCACCTTGATTGGATGGTCGAGTGTCATCAT
GGTTCCAGTTGCTAGCCCCGAAGCGCGGCTGCGCGTAACGAAAGGCACAG
TTCCCTACTGAGTGGCTGG
| CATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGTTTGGCGTGGAAAATATCAACCCA
GCTTTCAAGCTGTTTGAGCAGTAGCCATGGAAAATTGTAGAGCCCCTCAA
AATCCTCCGATTCTCTTTTTCCTTCTCAACCAGACTTCCAAAGGGACATT
ATAAGCACTCATTCCCCAACAGGGCCTGCCATGTAGGAGGCACTCAGGCA
TGCTTATTGGCCAAAGAAATAGTCACGCACAGAGAAGACGACAAATGTTG
TGAAATTTGGTTGTTAAAAAATGCCTTTATTTGCCAGGCAGTGGTGGCGC
ACGCCTTTGATCCCAGCACTTGGGAGGCAGAGACAGGCGGATTTCTAAAA
GTTTGAAGACAGCCCCCCCCACAAATCAAGTTCCAGGACGGCCAAAGGCT
GTTACAGAGAAACCTGGTCTTGAAAAAACAAAAACCTAACAAGCAAACAA
AACAAAAAAACCTTTTCTTTCCCACTTTTATTTGATGGGTGCAGGGAAAA
AAACGGTGGTACCTTATTGAATTATTAGGGAAAAGGCCCGAAATTTTTAC
CCCTTTAACTTGTGTCTAAATTGGGGGAGGGGGTATTTACAAAATATTCC
CGTCTGGGATCTCGAAATTTGGGATATTGGGGGGGGATTACCTGGAATAA
CCCTCTGGTGGACCATTGGGGGGGGTTCTCACAGACGGGGGGCAAAAAAA
AC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 9 9 9 9 9 14 14 11 11 15 28 27 39 39 39 37 37 37 37 28 26 22 30 23 25 33 41 28 28 28 25 23 21 25 9 7 7 7 7 7 10 8 8 8 8 13 13 20
25 33 34 33 33 36 36 47 53 59 33 33 26 23 10 12 10 10 8 8 8 12 23 34 47 37 37 37 41 41 36 36 50 50 50 50 53 53 57 53 59 59 59 59 59 59 59 59 48 59
59 59 59 59 57 59 57 57 57 54 54 68 68 57 57 68 57 59 54 54 54 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 51 51 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 62 62 45 52 52 57 57
57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 59 59
59 59 59 59 57 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 44 42 28 28 14 21 28 33 35 31 43 38 44 59 59 50 50 50 57 57 59 59 59 59 59 59 48 48 57 57 57 48
48 48 48 48 48 48 54 54 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 57 54 54 47 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 59 59 59 41 41 28 28 28 37 41 47 50 47 47 33 23 19 11 9 13 3 0 3 9 23 25 41 47 47 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 48 48 57 59 54 54 54 48 54 54 54 54 57 44 41 28 26 27 41 44 41 48 57 57 57 59 59 59 59 59 48 48 48 44 44 43 43 48 59 48 44 36 32 30 42 42 44 43
46 47 54 54 54 54 54 54 54 48 42 32 27 19 19 24 32 40 37 34 25 25 33 31 31 28 32 28 26 28 21 25 25 28 32 37 41 35 37 39 41 44 47 42 39 39 30 35 35 47
47 48 47 47 47 47 50 50 50 50 48 43 39 39 35 35 37 37 35 35 35 39 39 39 39 36 36 39 28 22 20 20 17 18 24 34 37 34 28 25 28 25 24 23 28 20 20 20 23 19
22 22 13 17 14 28 31 23 19 20 20 20 18 21 21 11 11 15 16 15 16 25 26 35 39 37 39 39 34 34 19 19 22 24 19 19 32 30 28 32 28 28 20 20 31 32 34 39 37 31
18 18 19 18 25 28 32 28 33 28 33 28 34 23 28 28 34 34 34 23 18 14 14 14 19 19 12 12 14 26 15 14 15 19 19 12 13 14 15 15 15 15 15 13 13 19 21 25 27 27
25 25 27 26 39 34 28 23 23 32 19 19 15 15 11 12 11 11 11 | Open.Hide. 8 10 15 10 8 9 9 9 14 3 0 3 18 18 31 31 41 39 39 39 39 39 42 37 37 37 37 27 23 18 9 9 9 11 9 9 9 10 11 9 8 8 8 8 8 21 23 33 33 33
33 33 36 50 50 41 28 22 16 11 11 11 11 14 11 12 12 20 17 28 29 29 31 31 33 36 36 50 50 59 59 57 59 43 43 43 43 37 42 48 42 42 42 50 48 53 54 48 48 48
47 47 59 42 50 50 43 43 43 57 57 57 57 54 59 59 57 47 37 37 28 28 32 42 44 57 57 57 47 54 57 41 41 41 41 41 41 57 46 54 54 59 59 59 57 57 57 50 57 50
50 50 50 50 51 68 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 59 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 35 35 35
43 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 52 52 37 57 52 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52
52 52 57 57 57 57 57 44 36 23 23 43 43 33 28 26 27 32 35 35 35 35 40 42 57 57 68 68 68 59 57 57 54 54 54 46 46 57 47 57 48 44 42 42 30 28 28 27 28 41
41 47 48 57 57 50 50 50 48 48 48 57 57 54 48 48 48 46 43 43 39 32 30 33 31 42 32 32 35 39 39 43 43 36 33 33 25 23 23 28 28 37 37 48 46 47 46 41 37 37
35 31 31 37 37 37 39 35 23 23 11 11 9 9 10 10 10 17 8 8 10 8 8 11 11 23 22 35 35 26 30 19 18 18 24 19 22 16 15 15 11 9 8 8 8 8 13 14 28 20
20 19 19 19 20 19 23 19 19 10 9 9 10 9 12 11 8 10 10 19 12 15 12 12 14 14 15 11 17 13 12 12 11 11 11 8 8 10 10 11 19 14 18 22 13 16 12 14 14 19
17 15 13 10 9 10 10 17 9 10 10 12 13 19 10 8 8 8 8 9 9 11 9 9 9 9 9 15 22 19 14 14 12 10 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 11 10 14 20 20 19
21 14 14 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 7 6 6 6 8 6 9 9 11 9 10 13 10 12 14 14 11 11 8 8 9 9 9 9 12 10 11 11 11 11
11 22 16 10 10 8 8 6 8 8 6 6 7 7 8 11 8 8 8 9 8 8 9 11 14 13 12 12 12 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 8 8 8 6 6 8 7 9
8 6 8 6 6 8 8 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 6 8 6 6 6 6 8 8 13 14 11 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 10
7 11 13 8 8 10 8 6 6 6 6 6 8 8 6 8 6 6 8 9 15 19 8 9 12 13 13 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 14 9 17 13 13 13 13 15 19 19 18 10 9
9 9 |