BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-391E24.T7 (MSMg01no391_e24.b1) | MSMg01-391E24.TJ (MSMg01no391_e24.g1) |
ACC | AG493116 | AG493117 |
length | 795 | 824 |
length of high quality (start - end) | 233 (117 - 349) | 251 (75 - 325) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no391_e24.b1 PHD_FILE: MSMg01no391_e24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:35:29 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no391_e24.g1 PHD_FILE: MSMg01no391_e24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:35:29 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | AGGAACGTTCTNNNNNNNNNANNTTTCCAAATCCCCGGNATTCTCTGAGA
ATTCCCACAGCACAACTTGCCAAGGGCAGAGTTCAGATTGCCCAAGGCTC
TTCCCTTATAAATAACGATTGCGTTAGCCTGCTTGTCCTCATTTGTTGGT
TTCCTTGCTGGGTGGAATAATCACAATCTACTTGTAAATCTATTCCGAAC
CCCACGGCCCAAGTCCAGGACAGACTGTACAGCAGTGGCCCCGGGCTCAG
CTGGCTGATCACTGATCCGCTCCAAAGGCCACGCTTGGAGATTCATGAGT
GCCAGAGATTTATTGCTCTGTTCCTACTCTGAACTCTCAGTCCCATGGCA
TAGCTGTGCGAGGCAGGACAGCTCTGACGTAGAAGTTTGCAATTGCGACC
AGCACACTCCGTAAATAGACTCCCTATGTGGAGAGATGACCTGCAATGCC
TCCCGAAAAAAAAGGATAATCCCCCCCACCCCCCAAATAGCATGTTGTGA
CTACCACGTGCCCCCCAATTCAATGTCCGCTGCACTCTCTGTGTATTTTC
CGCTGCCCCACCCCTCCTTTATTTGTCACCCTTCCTCCATAACCCCCCCC
TCAATTTATAATACCCCACCCACCCCCCCTATAAATAATATCCCCCCCCT
CCCCCCCCTCGAAATTTCTCCCCCCCCCATAAATTTCCAGGCGCACCCTC
CCTCTCCAGGAAAATTCTCCCCTCACTCCTTTGTCCNCCCGCCCCCCCCC
TCCCCCCCATAATTANACCCACCCCTCCCCTCCGCCCCTCTCCTC
| AATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTAGATTGTCTTTGTTAGTAAACCAT
TTCTCACATTCACTGCATTTGTAAGGTTTCTCTCCTGAATGAAATTTCTG
ATGAATACTAAGATGGGATTTTCGGGTAAAGAATTTGTCACATTCACTAC
ATTTGTAAGGTTTCTCTCCTGTATGAATTCTCTGATGCATACTAAGATTG
GATTGTCTGGTACAGCATTTGTCACATTCACTACATTTGTAAGGTTTCTC
TCCTTTATGAATTCCCTGATGATTATTTTTGATGGGATTTTTGGGGAGAG
CACTTGTCACATTCATGACATTTGTAAGGATTCTCTTCTGTGCGAAGTCT
CTGATGAATTCTCACATTGCTCCTGTTAGTACAGCATTTCTCATATTCAC
TGCACTCGTCCGTCTTCCCCTCCCGTATAATTTTCTGATGAACTACTCCC
TCCGTCCTGTTCCCCCCCCGTCCCCTTTCCCTTTACCCTCTCTCTCTTTT
TTTTCCTTCTCCCTCGCTCCTCCCCCGCCTTTCCCCCCTTTCTTTTCCCC
TTCCTATCTCTTTTCGCTCTCCCCTTTTTTTCTTCCCCTTCCCCTTTCCC
CTCCCCCTTCTCCTATGTTCGTTCCAATAAGCTTACTACTCCCTCTCTCT
ATTTTCCCTTATCCTTTCACCCCCCCCCCCCCCTTTTATTTCCACCCCCC
CCTTTTCTTCCCCCCCCTCTCCCTTCTTCCCCCCTTTTCTTCCTGCCCTC
CCTTTCCCCCCTTTTTCGTCCTTN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0 3 7 6 6 6 6 8 8 8 8 9 12 11 6 3 0 3 8 9 13 20 23 30 25 27 11 9
9 9 10 10 10 9 9 9 11 11 11 12 12 16 15 19 15 26 23 27 16 19 18 19 16 12 27 27 53 53 53 53 53 50 50 50 50 53 57 57 47 47 47 47 38 36 44 28 28 28
28 35 59 43 25 17 6 6 6 8 8 8 21 16 26 13 14 18 28 32 43 43 43 34 34 23 23 20 34 32 24 30 28 32 34 41 41 28 28 30 37 37 43 39 35 32 32 37 30 30
36 39 39 40 30 26 15 12 11 11 11 11 12 15 25 29 37 37 37 30 30 14 14 14 28 28 48 48 44 44 39 30 36 43 43 57 48 48 48 48 54 57 59 42 39 35 42 59 59 59
57 21 21 10 10 10 15 20 30 37 37 59 59 46 43 44 42 43 32 32 24 24 35 39 42 46 40 44 44 44 47 46 42 44 39 39 35 31 30 27 36 32 28 20 20 20 32 32 32 43
35 43 43 43 43 37 50 43 57 57 57 52 52 52 57 52 54 54 52 52 43 43 32 42 44 43 43 52 52 57 57 52 43 43 43 43 20 27 27 43 44 57 50 43 32 24 43 23 43 43
52 50 43 37 38 37 36 36 32 21 12 10 9 9 9 11 24 32 43 59 59 59 57 43 43 43 42 44 31 31 31 42 35 37 59 47 30 30 17 22 27 41 44 36 36 36 18 16 8 8
8 8 8 10 19 12 12 12 11 12 11 12 12 19 15 20 19 26 18 23 26 31 41 35 35 32 37 33 23 23 12 12 12 22 12 12 16 19 12 12 15 15 15 16 12 11 11 18 23 16
12 12 9 12 9 11 9 11 10 9 9 9 13 13 22 26 14 10 8 15 10 12 16 18 18 10 12 10 23 15 18 13 12 11 16 16 15 11 10 10 10 10 11 10 8 8 10 10 10 8
8 12 15 10 9 9 11 12 10 10 10 9 9 9 11 11 11 11 11 13 15 17 15 9 8 8 8 6 8 9 6 8 8 8 8 6 8 13 10 10 9 10 10 17 15 13 7 6 6 8
13 24 20 23 11 11 9 11 9 11 10 12 13 10 10 10 10 8 8 6 6 8 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 10 12 12 12 12 9
9 9 11 11 11 15 10 9 9 9 9 10 16 13 12 12 12 11 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 10 10 10 10 8 9 8 9 9 10 10 11 10
10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 16 13 10 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 15 16 22 18 17 9 9 9
8 10 10 10 10 13 14 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 11 12 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 6 6 8 8 6 7 8 8 12 11 9 9 6
7 6 9 7 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 8 12 8 10 10 12 10 8 8 8 11 9 10 9 9 9 10 10 9 9 3 0 3 12 9 11 11 18 20 31 35 30 27 15 8
8 8 8 8 10 10 16 10 8 8 8 6 6 6 3 0 3 11 8 8 6 6 6 10 7 9 14 15 13 6 6 8 8 10 11 13 11 6 7 6 8 8 7 6 6 | Open.Hide. 8 8 8 8 9 9 8 7 7 9 9 14 12 21 18 21 18 27 22 17 19 22 28 26 28 37 31 37 39 24 20 9 7 7 8 7 8 10 10 10 13 13 21 22 21 31 32 37 37 37
37 37 37 46 50 47 47 43 22 17 8 6 6 6 7 10 11 12 10 16 22 19 25 26 32 32 37 47 38 38 42 42 42 43 43 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 54 54 54 43
51 53 42 42 41 43 43 43 41 50 41 43 43 50 47 50 50 50 68 68 59 59 48 44 44 46 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 50 50 50 57 50 50
50 50 50 50 50 50 50 50 57 50 41 41 35 50 50 50 50 50 50 50 50 54 52 50 50 43 52 52 59 59 51 51 50 50 50 51 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57
57 57 57 57 57 57 57 59 52 43 43 52 57 59 59 57 57 57 52 52 43 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 57 57 57 57 57 57 57 57 44 41 41 39 42 42 37
37 57 57 44 57 48 44 40 36 40 44 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 48 48 48 48 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 54 43 43 35 35 35 47 47 43 43 43 47 59 59 48
48 48 59 59 57 57 48 48 48 48 48 48 48 48 59 59 41 41 39 24 22 12 12 11 12 10 14 12 12 9 9 9 15 23 22 30 28 30 30 37 47 32 39 32 32 41 32 32 32 28
28 39 39 39 59 35 35 35 37 37 27 27 15 11 11 11 20 12 11 11 12 16 18 12 21 21 18 23 12 12 12 21 20 24 18 28 25 15 15 10 10 10 10 10 13 15 15 18 30 30
28 32 32 32 28 28 28 26 26 21 10 10 11 9 9 12 21 13 16 10 12 9 9 10 10 10 10 10 11 11 10 10 8 8 8 8 8 9 12 8 9 9 9 9 10 15 16 10 10 10
10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 9 10 10 11 10 10 10 10 10 7 7 8 8 6 6 8 6 10 11 13 9 8 8 8 8 8 11 12 11 6 6 6 6 8 8 10 8 8
8 8 10 6 7 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 10 10 10 12 12 12 12 12 13 13 21 18 12 11 11 11 16 15 15 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 11 21
26 34 28 18 18 17 15 15 15 9 9 8 6 8 6 6 6 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 15 15 20 20 20 21 23 17 12 10 10 10 10 10 12 12 15 11 11 13 13 19
17 22 12 10 8 8 10 12 12 10 8 8 10 10 6 6 6 11 10 10 10 10 9 9 10 12 13 19 10 10 8 8 10 8 10 9 15 13 8 8 8 11 10 10 9 8 10 8 8 8
10 10 10 10 12 13 11 17 16 25 30 27 22 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 13 10 9 9 9 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 15 12 12
8 11 8 17 16 16 13 10 9 8 8 8 13 15 9 10 8 8 8 8 10 10 16 17 11 11 10 9 12 12 15 10 10 9 10 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 13 15 13
11 10 15 11 7 6 6 6 8 15 11 16 16 23 24 24 13 16 10 10 10 16 18 24 24 13 12 8 8 8 8 10 19 19 19 20 23 25 15 12 9 10 8 7 7 7 9 9 15 13
10 8 8 8 8 10 13 23 22 21 19 17 17 19 12 11 6 6 6 11 8 11 3 0 |