BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-417K05.T7 (MSMg01no417_k05.b1) | MSMg01-417K05.TJ (MSMg01no417_k05.g1) |
ACC | AG513171 | AG513172 |
length | 741 | 757 |
length of high quality (start - end) | 593 (48 - 640) | 242 (77 - 318) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no417_k05.b1 PHD_FILE: MSMg01no417_k05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:36:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no417_k05.g1 PHD_FILE: MSMg01no417_k05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:36:34 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | GGATCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGC
GGAATTCACTCGTTAATTCACACTATTCATTTGGGTTTCACTTTTTGGTT
CATTTTGCCAGGCTTATCTGGTAGATACAAGTAACTTTAAAAATACATGT
ATCTCCCCGTTGAACTGCAGTACTTTCAGCTGTAGCTCCTTATTTGAACA
GCTTGAGGACTAATTTGAATCGCACTTCTCTTGTGGGTGTTCCAAAAGCT
TGTGCTATCTCAGGGAGTTGCCTTGTGGAGACATTAAAGATGTTTTTTAA
ATGAAGCACATCAAGATTCGCTAAATTACATATGGTTTGATCTAGGAAAG
GACAATTGGAGACTTCATTAAAATAGATTTATTCCAACTTCATGTATGGA
AATAAATTTTCTTGTGATAACTTGGTCTGTGCCCATCCAGATTGTAGCAT
TTCCCTAGTTTCTAAATTAAATGTTTCTACATGTGAATCTTGGCTCTATA
TGGGCATATATTAAAAGGCTTAGTCATCATTATTTTAAGTATCCCAGAAT
TGAGTCAGGTTTCTCAGGAGCTTTGCAGCTTACTCGCTTGCTTTGACTTG
GTTCACTTTCAATTATCTTCCCTTCCTCTTCTCCTGTGCCTCTGCCTTTA
TAAAAAATATCTATTTCAACTTTAGGTAAGAACTAAACTATCCTCTGTTG
CATAAATCTTGGTCTTCTCTGCATTGTTGCCTTCAAATGCN
| CCCGATGATAGTGCGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAATACCGAATGGCA
GAGAAGCACTTGAAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCA
AATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGA
TCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGA
ACACTCCTCCATTGTTGGTGGGAGTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAA
ATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGATTACTGGACATAGTACTACCGGAGGATC
CAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAACAGGTAAG
AAGGACATATGCTCCACTATGTTCATAGTAGTCTTATTTATAATAGCCAG
AAGCTGGAAAGAATCTAGATGCCCCTCAATAGAGGAATGGATACAGAAAA
TGTGGTACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTACAAAGAATGAA
TTTATGATACTCCTACCCCTATGCATGGACCTGTATCCCCTCCTCCTGAT
CGAGTTCATCCCTCCTTACCCATTCTCCCTCTATATGTACTCTCCGATTC
TCTGCACATTTAGCCCCACCCCCCAGGTAACTCCCTGTATTTAATTATTT
CCCTCTTGTTAACTTTCCTTGACTCCTCTTCCCCCTATGCATCACCTGCC
TACCGCG
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 10 8 8 9 10 10 12 26 34 39 37 37 31 16 18 9 10 10 9 13 17 28 31 22 17 24 15 17 9 18 9 9 9 9 12 19 34 37 19 16 12 13 13 19 25 47
35 29 22 22 28 32 31 28 28 28 25 24 24 28 25 30 22 31 31 36 36 36 37 40 57 42 37 36 36 42 42 59 68 68 68 57 54 54 54 48 50 50 59 68 68 51 50 47 48 41
47 47 50 50 57 57 48 41 41 41 41 48 57 68 57 57 68 57 57 57 57 68 57 57 43 43 42 41 41 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 50 50 50 50
50 50 50 50 57 54 52 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 57 57 52 52 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62
62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 52 52 57 57 68 68 59 59 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 68 57 68 57 57 52 52 43 44 43
52 52 50 59 43 32 28 16 16 20 32 32 57 57 54 57 57 47 47 47 44 44 43 43 43 57 47 48 48 57 48 48 48 48 54 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 59 47 48 48 48
46 42 47 47 47 47 48 59 57 57 57 57 48 48 48 42 47 35 35 28 34 20 23 23 32 30 32 32 32 35 39 39 43 39 39 39 36 37 37 48 46 46 46 39 37 36 32 28 31 35
37 37 30 37 37 40 43 48 48 46 46 46 41 37 39 35 24 26 31 31 36 39 43 37 32 28 28 25 25 23 28 22 28 28 37 37 39 39 39 39 30 30 23 15 15 10 12 12 22 15
20 20 23 23 31 31 43 37 33 30 30 32 37 43 43 39 40 41 47 37 37 37 31 31 31 34 41 39 39 41 40 40 41 47 41 25 19 10 10 10 10 22 27 20 12 12 12 12 19 7
7 7 10 13 16 16 17 19 16 18 11 11 11 13 8 8 8 8 8 8 10 15 12 10 10 10 10 10 10 11 11 17 21 22 18 13 13 22 21 15 15 15 18 23 27 30 12 10 10 8
8 6 6 6 8 12 18 21 21 19 14 12 12 12 23 26 33 33 28 16 16 11 11 8 11 11 11 10 13 13 10 8 8 10 11 8 8 8 8 3 0 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 8 8 8 8 7 6 8 6 6 6 8 8 9 17 17 30 31 25 18 14 3 0 3 23 17 15 11 9 9 9 9 9 7 7 9 9 11 11 10 15 3 0 3 23 23
37 30 32 37 37 59 59 27 27 9 9 9 6 6 6 6 6 6 9 12 8 10 15 16 24 28 37 37 41 39 31 33 33 33 32 19 12 13 19 21 21 41 33 33 31 31 31 36 36 36
39 42 48 34 43 25 28 32 43 43 57 57 57 57 43 42 22 22 22 28 28 43 43 47 47 47 47 47 38 47 47 33 33 33 37 37 37 39 39 39 27 27 35 18 23 23 28 28 28 30
31 32 32 32 36 42 48 48 48 48 39 40 35 34 36 43 29 36 34 43 42 48 42 47 47 54 59 57 57 57 57 47 47 43 57 43 43 43 41 42 47 50 50 47 59 57 59 48 43 43
44 43 48 59 48 47 47 46 46 44 44 57 57 57 57 57 48 48 42 42 35 35 35 50 50 57 57 48 48 48 50 50 37 37 37 38 30 32 41 41 47 44 57 46 46 48 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 59 57 57 54 54 57 57 59 59 57 57 43 43 43 43 39 37 37 37 39 39 37 37 30 30 30 41 43 28 28 28 29 29 39 43 57 57 57 59 57 48 48 42 47
47 43 39 30 35 35 39 39 48 59 59 59 34 34 23 28 28 20 12 9 8 8 8 8 8 12 12 19 19 25 34 30 39 35 35 35 47 47 47 48 43 43 43 39 39 32 32 37 30 32
28 28 34 28 35 31 40 32 30 32 32 41 43 43 37 39 37 42 39 43 41 44 36 32 32 36 36 30 42 36 42 30 30 28 44 44 43 42 37 28 18 18 14 15 12 10 10 8 8 10
13 15 24 24 16 12 9 9 9 10 19 41 37 42 30 28 28 32 32 39 39 37 28 28 28 28 26 25 25 25 30 30 32 47 42 48 48 48 47 59 43 43 32 32 32 31 18 18 18 15
15 12 12 16 24 24 30 35 35 28 23 12 11 11 10 12 11 11 12 22 16 18 20 34 32 34 28 15 13 10 10 10 11 13 18 15 15 20 20 20 23 21 26 28 31 37 25 24 12 12
15 19 16 13 12 15 13 19 21 30 31 19 20 10 10 12 9 11 12 12 12 18 18 11 11 12 15 19 22 28 21 12 13 13 18 22 18 11 8 8 8 13 13 31 28 28 23 23 23 34
34 35 26 24 12 12 12 11 10 10 10 9 10 13 9 9 8 11 9 9 9 10 12 14 13 18 13 14 21 23 24 22 12 8 8 6 8 8 10 10 10 10 10 11 12 12 8 8 6 6
8 8 10 8 8 8 8 8 8 12 9 9 10 10 10 10 10 10 11 12 12 8 10 8 10 10 12 13 9 8 10 8 8 8 10 9 10 11 12 15 16 10 9 9 8 10 8 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 11 10 9 10 10 10 10 13 19 10 10 10 10 10 21 13 13 8 8 6 6 8 6 6 8 8 15 12 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 8 8 12 11 12
10 12 15 16 10 10 10 10 11 13 11 11 15 8 8 8 12 13 16 16 10 10 10 12 16 17 13 8 6 8 8 10 10 11 8 8 6 6 6 7 8 8 10 10 8 8 8 6 6 8
8 10 10 10 10 10 10 |