BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-439K10.T7 (MSMg01no439_k10.b1) | MSMg01-439K10.TJ (MSMg01no439_k10.g1) |
ACC | AG529954 | AG529955 |
length | 738 | 744 |
length of high quality (start - end) | 294 (326 - 619) | 237 (76 - 312) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no439_k10.b1 PHD_FILE: MSMg01no439_k10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:05:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no439_k10.g1 PHD_FILE: MSMg01no439_k10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:05:50 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAAGAGAATCCGCNGGA
ATCTATGAGATTCCGNAAACAAGACCTAAGGCCAATACTCCTTAAATTAT
TCCACAAAATAGAAACAGAAAAAACATTGTCAAATTTATATGAAGTCAGA
TTTACCCTGATATCCAAACCACATGATGATTTCTCAAAGAGAATTATATA
CCAATCATCAACTTGATGCAAATGTATTCAATAAAATACTTGAAATCTGA
TATATAAGAACACATCAAAAGGAACATCCACTATGATCAAACAGGCTTCA
TTCCAGAAATGCAGGGATGGTTCTGCACACAAAATTTGTCAACATAATTT
ACCATATAAATAATATAAAAGAAGAAAAACCCAGATGATTATACCATTAG
ATGCTCAAACAACATTTAACAAAACCCAAACCCTTCATGACAAATGCCTT
GGAGAGATCAAGGATACAAGGGACAAACCTAAACATAATAAAGGCAATTC
AAAGTAAGTCTATAGCCAACATCAAATTAAATGGAGAGAAAGTTAAATCA
ATTCCACTAAAACCAGGAGGGACAAGGGTGTCCAGTCTTTCCATATCTAT
TCAATATATTACTCGAAGGTTTAGCTAGAGCAATAAGACAGCTAAATGAT
AGTTTGTGGACTCACATTAGAAAGCAAGAAATTCTTAGTACACCTTAATG
ACCTCCCAAAATTATACTCAGGAGCTCCTTCCCCTGAT
| ATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXTACCAGAAAAATTCATAAATTAATTATAAAATCTCAGTAT
TAACATAGAAACTGTATTATAAATTTATATAATTACCCAAGTGTTCTATT
TTCCCTGAGGGTAGAACTTTTGCTTGAATAGAAAAAGAAAATTCAGTTCA
ACTCCTTAATTTTAATAAGAACACAATTTTTATGTCAGCTCCTCTTTTCT
TTTGACTTTTTGATATAATAATGCTACAAATGAAAGCAGAGAATAAGTTA
TTTATGCGTTTCTTGATCNTATGAGTCGTATAATTATCTTCATTAGTGTC
CTTTGCTGTGTGCACTCTTTTGGAGTCCCAGGAAAAGCTAAACCTTGCTT
CCCCTATATTTTACATTTCTGAGAAATTTATACACCTCCTTCTCTTATAC
ACAGACAACCGTGCTTTTACCTCCCTGCCCTTACAGTCATCCTTCCCTTC
ATTATTGTGTCATTATTTTTCTATGGGATATAGGTACGATCTGACTCTAA
TATGATTATTTTATTCTCTTGCCTTTACAATTTGCCCCTTGCTATCTGTA
CATCCCTGAATTTTCTCCTTCCCGAGTGTTTATGCCCCAGCAACTCTTTT
GCATTAAAATGCCCCCTTCACTATACCCTGTCTGTTCCCTCTCCTTATTT
CTTTACCAATTGCTTTTCACCCTTTTGATATTTGCTTCCTTTTN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 9 15 27 34 32 25 25 22 19 19 25 23 21 12 12 10 22 22 36 22 11 11 10 10 13 8 8 11 10 8 8 8 7 7 8 8 8 8 10 12 8 3 0 3 14 7
26 24 24 25 27 27 12 6 6 6 6 7 7 6 3 0 3 8 8 8 8 8 10 21 32 29 33 34 37 48 41 47 39 47 47 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 50 53
42 42 36 36 36 41 42 48 48 51 51 42 26 21 12 15 15 12 16 18 18 20 23 28 44 44 57 57 50 51 47 47 47 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 48 48 48 46 46 50 57 44 57 57 57 59 59 68 68 68 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 50 50 50 50 50 51 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 50 51 51 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 57 57 57 57 68 68 57 68 68 68 68 32 35 19 18 10
10 10 11 19 24 34 32 57 48 57 57 57 57 68 59 59 59 48 48 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
59 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 41 23 15 9 9 6 6 6 6 6 6 6 9 11 19 30 36 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59
57 57 57 68 68 57 59 59 47 47 37 41 41 43 59 47 47 43 43 43 41 42 47 48 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 48 48 48 52 52 52 59 59 59 52 43 43 57 59 59 68 57 68 68 57 57 57 59 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59
57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 43 37 44 44 57 57 48 44 44 43 59 47 57 54 54 54 54 44 48 37
35 35 35 39 39 47 47 47 48 48 59 57 57 48 59 59 35 35 35 39 39 43 47 47 54 57 57 57 48 48 57 48 43 43 47 47 57 59 59 59 59 39 39 39 59 47 48 48 57 48
48 43 44 43 43 40 40 39 41 41 59 39 31 28 35 28 34 28 28 24 30 22 22 19 18 26 26 25 28 28 28 24 37 37 37 37 39 39 39 32 27 25 30 30 39 39 39 39 39 31
31 20 24 24 34 28 37 39 41 37 37 24 24 25 31 24 12 12 10 11 10 10 11 11 12 22 15 13 13 13 13 13 11 13 10 10 10 13 13 9 9 10 14 11 16 18 18 15 15 11
9 9 7 8 8 8 10 9 9 19 21 22 12 12 11 12 12 22 11 11 23 23 23 12 12 12 12 12 12 11 11 10 13 12 15 16 25 22 18 11 11 11 15 8 10 9 12 8 8 9
15 17 28 19 12 15 12 12 14 19 23 11 8 10 8 8 8 8 8 9 11 17 10 8 11 8 8 10 10 10 9 7 10 10 10 11 9 9 | Open.Hide.13 19 15 11 11 9 12 9 9 9 7 8 8 9 13 16 19 13 12 3 0 3 18 10 16 15 21 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 8 13 9 11 11 11 18 11 16 11 14
14 16 31 26 23 12 9 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 10 10 12 11 21 21 11 11 13 21 28 39 43 53 59 59 48 59 59 59 59 37 37 33 33 28 33 24 24 19 19 30 30
30 23 34 23 21 21 27 28 40 25 25 23 21 22 20 23 27 44 32 31 20 20 20 28 32 40 47 47 46 57 43 43 43 46 47 57 44 42 35 35 32 33 33 42 42 42 42 43 59 57
57 57 57 57 47 37 37 36 32 28 29 28 28 28 32 43 43 47 57 47 47 43 47 43 47 42 42 38 37 35 35 35 42 42 47 57 47 48 48 43 46 39 39 32 44 36 43 43 57 43
43 43 48 48 54 59 57 57 54 54 54 57 57 57 54 42 42 30 30 30 42 42 44 43 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48 59 59 46 46 30 27 12 11 11 12
27 30 59 59 47 47 59 59 59 48 48 57 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 48 59 43 43 37 35 28 32 28 32 23 23 32 32 30 25 25 25 36 36 43 43 43 40 39 37 39 39
37 39 37 48 46 37 34 28 17 17 11 12 12 15 14 17 9 3 0 3 19 23 28 15 14 30 30 34 28 23 23 23 34 32 41 37 41 39 37 37 39 35 28 28 22 22 17 22 24 41
37 32 41 34 18 10 8 7 7 8 10 9 12 9 8 8 8 8 13 17 32 23 23 23 28 32 39 32 29 17 17 17 17 17 24 28 23 25 18 28 21 28 29 40 42 47 48 48 48 48
43 43 37 37 33 37 28 28 28 41 29 25 12 12 11 15 15 22 12 12 12 12 12 22 25 28 30 33 33 43 39 39 35 35 35 39 39 39 39 43 43 50 43 43 24 22 12 12 16 22
13 13 10 10 10 12 13 13 13 13 15 19 31 32 32 28 28 12 8 8 8 8 8 8 10 13 13 17 14 14 13 13 10 10 13 9 9 10 10 17 15 13 9 8 8 8 8 8 9 10
10 9 9 9 10 17 10 10 9 10 9 9 9 9 9 9 10 11 12 18 21 25 27 19 11 10 10 10 13 10 14 14 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 14 11 11 11 11 9 9
10 12 10 14 23 14 9 9 10 9 9 13 13 13 10 10 10 10 10 13 19 22 22 19 14 9 9 9 9 9 13 18 17 11 14 10 10 10 10 9 10 10 8 8 8 8 10 8 6 8
6 6 10 7 12 10 10 8 8 9 9 9 11 10 10 8 8 8 10 9 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 10 13 13 15 15 9 8 8 8 8 8 10 10 10 9 12 11 14
12 12 11 11 11 11 11 11 12 12 12 12 12 15 16 11 9 8 6 6 6 6 6 10 10 8 10 12 12 11 11 8 10 10 10 10 10 9 9 9 9 12 12 10 10 6 7 9 10 10
17 17 13 11 8 8 8 8 8 12 16 12 12 14 17 18 12 10 9 9 9 9 15 12 10 6 6 8 8 8 8 13 6 9 11 8 6 8 6 6 8 8 3 0 |