BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-475A05.T7 (MSMg01no475_a05.b1) | MSMg01-475A05.TJ (MSMg01no475_a05.g1) |
ACC | AG556939 | AG556940 |
length | 764 | 740 |
length of high quality (start - end) | 251 (77 - 327) | 358 (84 - 441) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no475_a05.b1 PHD_FILE: MSMg01no475_a05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:53:39 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no475_a05.g1 PHD_FILE: MSMg01no475_a05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:53:39 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCCATCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCAGAACACCG
CGGAATTCCAGCCTTTTTGCCTTCTCTGCCCAGTCATTAGCTGTTCAGCC
TTTTATTAACCTATCAAAGATAATTGAGCAACATTCTTTATACCAAATTA
ATACAGGAGATTCTCCAATATTCATGACAATGTCCATGTCTGGACTGCAA
CTTCATCTTAGGCCACAGAAATCAGCTTCTGAATACACAGAACACAAGAA
CCTCCTACAACTTTGGAGGAAATCTAAAGACAGCATAAAGACCAAGCTTT
TCCACAGTTGTTTCTTATAATGCCTTTTNATANTGTAGAGAGATCAGAAA
TACACAAGAAGGTGCAATTTGGTAAGAAAAGTTATGTGAGCAAGTTTATA
GGTTACCAAAACAAAATTAGTACAGAGAAAGCAGCTCTAATTGTTAAAGA
CATTTGGCTGGTACAATTAAAGAGAAACCATAAATTCTTCACGGAGACAA
TAGAAATGATGTTCCAAAGACAAGACATCAAGCAACAAAGGCTCAAGCTT
ATGAAAATGTCAATTCATTTACCAAGAGAAAGCCTGAGCTGATAATGAAA
CTAAAGGCGTTTCCTGCTTGAAAACAAACAACCCAGAAGAGTGGTCTCAA
AAACTCTCCCTATAGTCCACTATTGTTTTGTCAGCAGAAATTTCTGTGAT
ACCTTCCATTGGCTTAAGACCCCACAATCACTCCCCCTATGTGGCCTCTC
GGCATGTCAACAAN
| CCATTCCCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTATAGGTAAGACTGAAC
CTGGAGCACCCTGCCCCCATCTTAACCTTGGCATTCTACTATCTCTTTCT
GATAGTGGTGAGGTGTACTCTTTATGACTAATAATTTTATCTGTGGCTTT
GAACTGAATAGAACTTGGGAGCTGTGACTCAGTTTCTCCTAAATTAGGCC
CAAGAGCTTTCTTGTTTGGAGAGGTAATCAGACTCCAATTTCAGACGTTC
CAAAATACTTTCAGCCCTGGGTGGCTTCAACTGATTAAAGCATTTGAACC
AACTGCTAAATGCCATGGCTTCCAGCCCAGTGGGACCCTGGGAGAATGAC
CTGCCTCCCATGGGTACAGTGAAGAAAGCGTGTTAACAGAGTGACAGGCT
ATATTTCTGTCTCTCAGAGCCTCGAGCACCCCCTCCTCAAGCAGGCCCGG
GGTGTTCCCTTGCCAGCCTCCTTTTCCCTTAGGGTTTTTTTGGAAAACCG
GAGGATTTACATTGGGAAATGGTTTCAACTTCCCCGGACTGATGGTTTTG
GCTTAAATCGCCCTTGTCTTGCCCTCCTAAACCTCGGACGATCGCCCCCC
TCCCTTGTATCCTTACTGTACAACCTGTACTAGTCCCCTACTCCTTTTCT
CTTGCCTAACGATGCTATGCGTTTAATGTCTTTCCCGCAG
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 10 10 10 8 8 10 15 30 27 29 27 27 22 22 30 21 18 9 9 9 21 21 41 28 28 31 30 29 21 23 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 13 13
20 20 23 30 31 31 33 33 33 33 30 30 39 25 19 10 9 8 9 9 9 9 16 20 20 18 26 18 29 32 27 32 37 39 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 42 42 47 59
59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 53 53 53 53 53 36 33 32 33 33 33 37 26 25 11 11 11 11 16 25 34 37 37 39 50 41 53 53 53 57 53 50 50 53 53 59 50 47
47 47 47 47 53 50 50 42 42 42 47 47 51 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 50 50 48 48 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 48 46 46 57 54 54 68 51 51 51 50 47 42 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 53
53 50 50 59 59 37 25 21 11 11 12 12 12 12 18 18 41 41 59 44 44 53 53 50 50 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 54 54 54 54 57 59 59 59 59
57 57 57 57 57 57 48 48 59 59 59 59 59 59 59 53 50 50 50 50 41 59 41 41 18 7 7 3 0 3 6 3 0 3 6 6 6 8 11 28 34 37 37 37 39 41 48 48 59 59
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 34 34 14 14 14 25 24 14 14 18 18 23 28 28 37 59 59 59 59 59 57 57 59 59 44 43 43 46 59 57 57 57
54 54 57 59 59 59 59 59 59 54 54 43 44 37 43 43 44 44 48 59 44 37 28 28 28 24 24 41 37 37 43 43 43 43 43 46 57 57 48 48 48 47 47 47 47 50 47 57 48 48
48 48 47 46 41 39 39 37 34 29 25 30 30 37 37 37 34 37 35 35 32 39 39 32 30 33 33 43 43 39 39 35 35 35 39 30 32 24 24 17 25 22 22 18 26 13 13 11 12 12
27 30 37 26 28 24 28 28 37 39 48 43 34 34 23 23 23 34 16 15 9 9 8 12 21 30 28 34 25 25 25 25 24 19 19 22 23 25 30 28 19 17 13 10 12 17 30 30 34 32
31 28 25 19 25 35 26 25 10 10 10 13 15 19 17 19 19 31 34 28 16 13 13 13 22 25 23 28 22 19 19 16 17 11 11 11 15 15 20 28 26 12 12 12 12 12 26 19 24 31
28 28 20 22 18 16 10 10 10 11 17 11 12 12 20 12 12 12 12 12 12 15 15 13 14 12 12 11 11 13 18 14 10 10 9 9 10 9 9 9 8 8 8 8 10 8 10 11 11 8
10 10 8 8 9 12 10 10 13 10 11 12 15 10 10 10 10 11 10 10 10 10 9 9 9 9 11 11 14 12 12 11 11 9 9 9 9 9 9 12 10 10 8 8 10 8 8 8 8 6
6 8 13 21 8 8 6 6 8 10 8 9 9 13 11 11 9 9 9 12 10 10 12 10 8 8 6 6 8 6 10 16 17 24 19 7 10 6 7 8 6 8 6 8 8 8 8 10 10 9
9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 3 0 | Open.Hide. 8 8 7 8 19 21 8 6 6 10 8 10 8 9 9 10 9 10 3 0 0 3 9 13 19 23 12 9 9 9 9 9 9 9 9 24 18 18 18 9 6 6 6 6 6 14 10 10 11 19
21 39 44 44 53 53 53 47 47 37 48 41 59 46 59 34 22 15 9 9 9 16 17 23 32 34 33 31 31 29 29 36 38 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 43 42 35
39 42 43 43 68 53 46 57 48 48 48 57 57 48 48 48 48 54 54 54 57 59 57 57 57 40 44 57 57 57 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68
68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 44 44 43 52 52 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 43 42
52 52 59 59 59 57 57 50 59 43 52 43 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 48 59 44 50 43 50 39 41 43 59 48 42 42 35 42 42 47 47 59 47 57
48 48 57 57 59 57 57 59 59 57 57 48 44 44 35 35 47 47 47 46 48 39 39 35 28 28 36 23 27 41 37 42 48 43 43 43 43 46 59 59 59 59 59 59 59 57 43 43 32 32
28 37 41 57 57 48 59 59 59 59 59 36 36 36 37 39 34 37 43 59 37 37 37 37 37 35 35 37 37 37 43 44 39 37 28 37 37 39 43 39 34 37 34 34 34 39 39 39 39 35
28 37 37 28 28 34 31 34 28 26 22 17 14 27 27 30 30 36 30 30 26 31 25 28 25 30 28 28 30 30 28 30 30 37 33 30 37 26 21 10 11 11 11 13 12 21 16 18 18 21
19 19 27 23 23 27 32 32 28 28 30 28 28 22 19 11 10 8 8 8 8 8 10 13 11 8 8 8 11 9 11 14 10 10 10 9 10 10 10 13 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8
8 8 8 8 8 9 14 11 15 14 15 9 10 9 10 8 8 8 10 10 10 10 10 8 10 8 8 8 10 11 11 10 10 14 18 14 9 10 10 10 10 10 11 11 8 8 6 6 8 8
9 10 8 8 8 8 19 10 10 9 9 9 10 10 10 10 10 10 11 10 10 13 12 11 11 8 8 8 9 9 13 10 9 9 9 7 10 8 10 10 10 9 9 9 9 9 12 21 11 11
10 10 10 10 8 8 8 8 8 13 11 19 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 11 12 15 16 8 8
10 10 8 8 8 6 6 8 6 9 9 9 9 9 9 9 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 6 6 10 8 8 8 9 8 8 10 8 8 8 8 12 12 10 14 13 12 8 8 8
8 8 8 10 11 16 12 12 11 9 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 11 15 10 10 8 10 9 9 8 8 8 8 8 10 8 8 11 12 11 11 |