BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-536A03.T7 (MSMg01no536_a03.b1) | MSMg01-536A03.TJ (MSMg01no536_a03.g1) |
ACC | AG603324 | AG603325 |
length | 749 | 750 |
length of high quality (start - end) | 593 (53 - 645) | 651 (80 - 730) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no536_a03.b1 PHD_FILE: MSMg01no536_a03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:13:59 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no536_a03.g1 PHD_FILE: MSMg01no536_a03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:13:59 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNNCCACCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXCGCGGAATTCATATCAGAGCACTGGGAAGATGGTCCTGTGTTCATATG
AGTTGATAGTTGTCCAGAGATCTGCAACTTTACCACTATGTACTTGAGAC
CAACAGAAAACAACTTCCAGACAAAATGGTATTATTTTTAACTTCCTAAG
ACCATCTAGGTGCTCCACTTTGGCAGTCCGCACTTCCTCAGGCAGCCTAA
AGGTTCCTAGGATTGGGGGTTACCGTGCTGATACTGAACTTCGTGTGGAC
ACTAGTTTGGCATAGCACACTACAGCCCCAAACTCGTGGACAGTCAACTG
ACCCCTTTTCCTGAGACTCCTGAGTAACTTGTCATTATAGGAACTTACTA
CCACAACTGCCTGTATGTTATTCTTAAAAACACATTTTCCTTTTAACATG
TTTGAGTAAAGATCAAAACACTGATCTTTCTGCTTATTCATGTATCTGAG
AGTGAACTTGAGATTGACAAGGTATTTTGTTTTCTCTCTTTTTGTCAGCT
TGCATAAGGATTCCTTTTTTTTTTTTTTGTGGCTATCATTTCCATCCAGC
CATAGGATTAAAACCAGGGTGGCACTAGGTCAAAAACAGATGCCACAACC
AACAGAATACAATGGACTTCTGAACTAAGCCACAAATCATCTTCAAAAAT
CACACACCCTAAACTCCCAATGGGGAAAAAGTTTCTTCTATAGATGATG
| NCCCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATAGGATATAGAAACATAGA
GGAGGACTCAGGCTGCAATAAAGATGAAATTGAAAAACCCATAGCTTAAC
TAGAAAAATCAAAGGAAAGCTTTAAAAGTAGAATGAATCAAGCAAAAGAT
AGAATATTATGATTCAAAGACAAAGTAGAGCATCTGGAACAGATTCGAAA
GGAATAAGAAAAAAATTTTAAAAAAAAACCTCGCAAGAAGGAACATAGAG
GTAATGAGCATGGGACTCTGAAAAACAAAAAACAAAACAAAACAAAACAA
AAAAACAACCAAACCTTCAAGCTATGGGCATAGATGAAGGAGAAGAATCC
CAACTTGATGGCATAAACCAGACCTTCAACAAGGTCATAGAAGAAAACTT
GCCAAAACTAAGGACAGACACATCCATACAAATAATGCACATAGGACCCA
AATAGATAAGACCAGAAAAAAGAAAGTAATATACATAGTAATATTACTAA
GTATACAGAACAGAGAGGGTGTACTGAATACTGCAAGAGAGTCTGGGCGG
GGATCCCAAAACCACAAGTCACATATAAAGGAAAACACAACAGGCTAACA
GTCAATTCCCAACGGAAACTTTGAGATGCAGAAGAGCCAATGCACTCCAC
ATCCTGAAATACCACAACAGTCAACTAAAAACAAGATACCCAGCAAAACT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 3 6 9 17 19 14 13 9 11 13 28 34 37 37 37 29 29 25 30 25 24 22 30 37 37 39 39 28 28 24 24 24 28 37 37 28 28 28 37 37 43 47 37 37 24
23 23 30 37 43 43 42 42 40 40 42 34 34 42 42 42 36 32 42 43 39 39 48 48 48 57 57 68 68 50 50 47 47 42 48 42 37 42 42 57 57 57 48 41 37 37 48 48 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 37 43 37 57 50 50 50 50 50 50 52 52 52 52 52 52 59 59 52 52 52 52 52 52 59 59 59 57 52 52 52 57 57 57 44 43 43
37 38 43 43 52 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 43 43 39 39 44 43 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 52 57 52 52 45 43 44 57 62
43 43 43 52 52 43 43 62 62 62 62 43 47 43 43 35 43 43 52 62 62 62 62 62 43 59 35 35 43 43 52 52 52 62 52 52 43 43 43 31 44 43 62 43 43 39 39 43 62 62
68 68 59 62 39 43 43 43 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 43 43 43 39 44 43 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 47 43 39 35 44 44 68 62 62 52 52
52 43 43 44 44 68 68 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 43 52 52 62 52 52 43 62 39 43 43 35 35 44 43 43 43 39 31 44 44 62 52 43 43 44 31 31 39 43 62 62 62
62 52 52 52 52 52 62 62 52 52 52 43 44 44 62 39 43 43 52 45 43 44 62 68 62 62 62 62 62 62 62 45 45 52 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62
62 52 52 52 52 52 52 57 52 52 52 57 59 59 68 68 68 68 68 59 59 52 52 52 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 54 54 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57
68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 52 52 52 59 59 68 68 59 57 44 43 43 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57
57 57 57 57 59 57 68 57 57 57 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 54 54 59 59 54 54 54 57 57 57 57 59 59 59 57 54 54 54 57 57 59
57 57 57 57 57 47 42 42 42 43 43 47 53 59 59 57 57 50 50 50 50 50 50 59 59 59 23 23 10 10 10 11 11 22 26 39 39 41 34 34 28 24 24 33 32 39 35 36 36 39
39 39 39 36 36 36 30 25 29 41 41 59 39 37 37 41 31 32 25 28 28 23 19 19 19 23 24 22 25 28 30 25 28 39 39 37 32 35 34 34 28 25 25 16 16 19 24 21 19 18
18 16 24 29 30 15 19 11 12 10 11 23 23 24 22 23 27 34 28 28 28 28 20 20 22 21 19 15 27 25 26 28 28 22 25 29 31 31 30 26 20 19 17 10 10 12 28 25 26 17
12 12 11 12 12 25 18 16 11 11 8 13 8 8 8 10 16 15 22 19 28 24 30 22 30 25 27 32 29 24 24 18 18 13 16 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 8 | Open.Hide. 0 3 6 6 7 10 15 8 8 8 8 8 19 25 32 30 37 41 31 31 41 37 37 37 37 37 37 32 25 29 32 37 37 39 30 26 17 17 22 21 22 25 25 30 31 33 33 53 53 57
57 44 44 47 42 42 42 47 59 59 59 57 57 57 42 37 29 29 36 34 43 43 43 42 47 42 42 36 33 32 42 42 57 50 50 50 50 50 51 57 68 57 48 42 47 42 42 48 57 68
68 68 68 57 57 57 42 42 37 30 42 37 57 57 48 48 48 57 57 68 68 51 51 50 50 50 51 57 51 51 51 51 68 68 59 59 52 52 52 52 43 50 57 52 52 57 57 59 52 52
57 57 57 68 68 48 48 46 32 32 32 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 43 43 33 44 43 52 52 59 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 43 43 39 62 62 62 62 52 52 62 62 68 68 68 59 59 47 43 62 52 52 52 62 62 62 62 62 52 62 44 44 43 26 27 44 44 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 43 43 43 35 35 43 43 62 62 68 68 68 62 62 62 52 43 44 59 68 62 62
62 68 68 68 68 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 52 52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 43 43 39 62 62 43 43 39 62 62 43 43 45 62
62 68 62 62 52 52 43 43 43 43 45 62 62 52 52 43 43 39 39 44 43 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 43 43 43
39 39 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 35 59 43 43 43 43 43 31 31 43 43 52 57 44 44 35 35 43 44 44 68 68 68 68 68 44 44 52 52 52 57
57 52 45 45 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 43 43 43 52 44 44 52 52 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 43 43
50 57 68 68 68 68 68 68 57 50 43 43 43 43 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 47 47 47 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 47 43 43 59 59
59 68 59 48 46 40 40 40 48 46 46 43 59 59 59 59 59 59 57 57 47 59 43 43 43 48 57 48 48 48 48 47 43 39 39 47 41 37 41 39 41 36 36 37 43 37 41 44 44 59
41 39 39 39 39 37 35 31 37 39 39 31 24 32 28 28 36 36 39 41 43 43 48 43 47 47 59 59 59 59 44 41 37 37 41 39 39 36 36 36 37 39 37 37 41 41 41 47 46 39
39 31 31 28 32 39 37 37 39 36 39 39 39 43 44 37 37 41 41 41 43 43 46 39 39 35 37 28 32 28 34 34 28 28 30 32 25 29 29 31 43 43 41 34 34 28 24 20 34 34
39 35 37 35 16 11 11 11 11 18 25 31 28 32 37 39 39 28 26 22 17 17 18 22 34 39 27 24 26 17 16 17 25 23 25 22 25 25 19 19 19 28 34 30 29 29 29 27 32 26
|