BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-014O21
Chromosome5 (Build37)
Map Location 69,115,872 - 69,265,111
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAtp8a1, EG330097, EG666977, AY616753
Downstream geneLOC666996, Kctd8, LOC545756, Yipf7, Guf1, Gnpda2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-014O21.bB6Ng01-014O21.g
ACCDH849336DH849337
length9251,139
definitionDH849336|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-014O21, 5' end.DH849337|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-014O21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,115,872 - 69,116,796)(69,263,963 - 69,265,111)
sequence
gaattcttcagctcctgagttttcatttcccagattaatggttctggtag
catggctcgattgttaagaagatgaactgttcttacaggagatcacagtt
cagttcccagcatccacatagcagtttacatgtgactccagcttcaaggg
atacattgtcctcctgtggtctgcacgaacttctgcattaatgcacatga
gccagtgtgtaggcaaaactcagacatatacataataaaaatgaacacat
atttaaaaacaagccatgtcagaatatgtctagaaccactgaaaagttat
gatacttgaatccttacctgtataagtttctctgagtaaaagttgacctg
tatactgactgacattttatggctcagagaatcccaagtgaacaactcag
ctcttgtacaatctaaggactgaccactctgccatagccaatgctgagct
cagagataaactttcactagtccacctatatccatgaaggacatagtcca
tgtgctgtgaacttatgaaaccatagactttgcttataccatgatgtaac
tttcctaactatacatacctatgaaaaattttaacatatatgttaattag
caaacacgtaagctttactgtatcagtgggagcacaaggattgcagtttc
acaaagagctatagctttcagggagtctttgttggatagatttgagttct
tctacaaggattaagtctgaatgtacgagtgaatataataataaaatgaa
aagattaaagtacagaaaaaaaataccaatctctccctctccccctcctt
cttccactcttactttctccttccctctgtccctgtgtctctctctgtct
ctctctctgtctctctctgaccctgtgtccctgtctcttctctctctctc
tctctctctctctctctctctctcc
gaattctatatttctgtatagataaaaatattccactgtgtacaccacaa
gggcttgcttactctgtaaaatctcccacgtttaaaaaataaaaaaacca
cctatcttataactcaaatattttcttatagtcatttaccaagggaaagg
aaaatatatgctcaaatatattttttgagttttgaaataagctatatttg
taatagtctaaactagaaactgtcaactgttgaatcaacaaaatgtgacc
tatattttcaattcaacactattcagtaaagaagacacaaactcctgcat
atgacagaataaaatatatgtgaaaataaaaacaaaagcatcattaaaag
aacagcttggaaaaatgcaattctatgtgcataaaattagcatagagtaa
acaaaaaccattgttgttataaatatgagaagctgataagtacattacaa
agtgtacaaaagtaagttatgagagtaataattatgttgtcatctagata
atgctgatattttgaaatccattcatcttcaatctatcacctatatgtca
ttccatctatttatttatctcttgtcaataatgacaatttaggatttgag
aaaagaatgtattttatattcaacaatgaagtcacataattttttgcagt
tttaaatagagagggttatctaaaattccaagattgtaattgtgaagggg
aggaaacattagttctgactgtatattgaactatattagaagttgattgt
ttgtagtctttgatattccaatgctttaatcttttatgtattcaatcttt
atctattcatttattcttgttggcaatcatcagtacagtagatgtcccac
aaatttcttaatgctcttgagagcatgactacaacacaggttacagactg
agatagatttttaactaggtctatcactgatactgtgtgattttacctaa
tgttaactattgtatttctaaatttatatgaggcaagtgtagcagtagta
ctagtaaattaggaacaaataaaccttgatgtacttttgacttaatagag
aacgatgaggcaaatttaatagattcctgtctgttgtagtggtcacttaa
gagacgggcgtgctgcaattcagtcacgttttgttgtag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_69115872_69116796
seq2: B6Ng01-014O21.b_46_970

seq1  GAATTCTTCAGCTCCTGAGTTTTCATTTCCCAGATTAATGGTTCTGGTAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCAGCTCCTGAGTTTTCATTTCCCAGATTAATGGTTCTGGTAG  50

seq1  CATGGCTCGATTGTTAAGAAGATGAACTGTTCTTACAGGAGATCACAGTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGCTCGATTGTTAAGAAGATGAACTGTTCTTACAGGAGATCACAGTT  100

seq1  CAGTTCCCAGCATCCACATAGCAGTTTACATGTGACTCCAGCTTCAAGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTCCCAGCATCCACATAGCAGTTTACATGTGACTCCAGCTTCAAGGG  150

seq1  ATACATTGTCCTCCTGTGGTCTGCACGAACTTCTGCATTAATGCACATGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATTGTCCTCCTGTGGTCTGCACGAACTTCTGCATTAATGCACATGA  200

seq1  GCCAGTGTGTAGGCAAAACTCAGACATATACATAATAAAAATGAACACAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGTGTGTAGGCAAAACTCAGACATATACATAATAAAAATGAACACAT  250

seq1  ATTTAAAAACAAGCCATGTCAGAATATGTCTAGAACCACTGAAAAGTTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAAAACAAGCCATGTCAGAATATGTCTAGAACCACTGAAAAGTTAT  300

seq1  GATACTTGAATCCTTACCTGTATAAGTTTCTCTGAGTAAAAGTTGACCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATACTTGAATCCTTACCTGTATAAGTTTCTCTGAGTAAAAGTTGACCTG  350

seq1  TATACTGACTGACATTTTATGGCTCAGAGAATCCCAAGTGAACAACTCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACTGACTGACATTTTATGGCTCAGAGAATCCCAAGTGAACAACTCAG  400

seq1  CTCTTGTACAATCTAAGGACTGACCACTCTGCCATAGCCAATGCTGAGCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGTACAATCTAAGGACTGACCACTCTGCCATAGCCAATGCTGAGCT  450

seq1  CAGAGATAAACTTTCACTAGTCCACCTATATCCATGAAGGACATAGTCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGATAAACTTTCACTAGTCCACCTATATCCATGAAGGACATAGTCCA  500

seq1  TGTGCTGTGAACTTATGAAACCATAGACTTTGCTTATACCATGATGTAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTGTGAACTTATGAAACCATAGACTTTGCTTATACCATGATGTAAC  550

seq1  TTTCCTAACTATACATACCTATGAAAAATTTTAACATATATGTTAATTAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCCTAACTATACATACCTATGAAAAATTTTAACATATATGTTAATTAG  600

seq1  CAAACACGTAAGCTTTACTGTATCAGTGGGAGCACAAGGATTGCAGTTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACACGTAAGCTTTACTGTATCAGTGGGAGCACAAGGATTGCAGTTTC  650

seq1  ACAAAGAGCTATAGCTTTCAGGGAGTCTTTGTTGGATAGATTTGAGTTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGAGCTATAGCTTTCAGGGAGTCTTTGTTGGATAGATTTGAGTTCT  700

seq1  TCTACAAGGATTAAGTCTGAATGTACGAGTGAATATAATAATAAAATGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACAAGGATTAAGTCTGAATGTACGAGTGAATATAATAATAAAATGAA  750

seq1  AAGATTAAAGTACAGAAAAAAAATACCAATCTCTCCCTCTCCCCCTCCTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATTAAAGTACAGAAAAAAAATACCAATCTCTCCCTCTCCCCCTCCTT  800

seq1  CTTCCACTCTTACTTTCTCCTTCCCTCTGTCTCTGTGTCTCTCTCTGTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CTTCCACTCTTACTTTCTCCTTCCCTCTGTCCCTGTGTCTCTCTCTGTCT  850

seq1  CTCTCTCTGTCTCTCTCTGTCTCTGTGTCTCTGTCTCTTCTCTCTCTCTC  900
      ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCTCTGTCTCTCTCTGACCCTGTGTCCCTGTCTCTTCTCTCTCTCTC  900

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCC  925
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCC  925

seq1: chr5_69263963_69265111
seq2: B6Ng01-014O21.g_67_1205 (reverse)

seq1  CTACAACAAAACTGTAACTGAATTGCAGCA-GCC--GCTCCTAAGTG-CC  46
      |||||||||||| || |||||||||||||| |||   ||| |||||| ||
seq2  CTACAACAAAAC-GTGACTGAATTGCAGCACGCCCGTCTCTTAAGTGACC  49

seq1  ACATCAACAGACAGGAATCTATTTAAATTTGCTCTTATTCGGCTCTCTAT  96
      ||  ||||||||||||||||| |||||||||| || ||   | |||||||
seq2  ACTACAACAGACAGGAATCTA-TTAAATTTGC-CTCAT--CGTTCTCTAT  95

seq1  T-AGTC-AAAGTACATCAAGTTTATTTTGTTTCCTAATTTACTAGTTACT  144
      | |||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||
seq2  TAAGTCAAAAGTACATCAAGGTTTATTTG-TTCCTAATTTACTAG-TACT  143

seq1  ACTGCTACCACCTGCCTCATTATAAAATTTAGAAATACAATAAGTTAAAC  194
      ||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||
seq2  ACTGCTA-CACTTGCCTCA-TAT-AAATTTAGAAATACAAT-AGTT-AAC  188

seq1  ATTAGGTTAAAATCACACAGTATTCAGTGATAGACCTAGTTAAAAATCTA  244
      |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATTAGG-TAAAATCACACAGTA-TCAGTGATAGACCTAGTTAAAAATCT-  235

seq1  ATCTCAGTCTGTAACCTGTGTTGTTAGTCATGCTCTCAAGAGCATTAAGA  294
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCAGTCTGTAACCTGTGTTG-TAGTCATGCTCTCAAGAGCATTAAGA  284

seq1  AATTTGTGGGACATCTACTGTACTGATGATTGCCAACAAGAATAAATGAA  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTGTGGGACATCTACTGTACTGATGATTGCCAACAAGAATAAATGAA  334

seq1  TAGATAAAGATTGAATACATAAAAGATTAAAGCATTGGAATATCAAAGAC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAAAGATTGAATACATAAAAGATTAAAGCATTGGAATATCAAAGAC  384

seq1  TACAAACAATCAACTTCTAATATAGTTCAATATACAGTCAGAACTAATGT  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAAACAATCAACTTCTAATATAGTTCAATATACAGTCAGAACTAATGT  434

seq1  TTCCTCCCCTTCACAATTACAATCTTGGAATTTTAGATAACCCTCTCTAT  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCCCCTTCACAATTACAATCTTGGAATTTTAGATAACCCTCTCTAT  484

seq1  TTAAAACTGCAAAAAATTATGTGACTTCATTGTTGAATATAAAATACATT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAACTGCAAAAAATTATGTGACTTCATTGTTGAATATAAAATACATT  534

seq1  CTTTTCTCAAATCCTAAATTGTCATTATTGACAAGAGATAAATAAATAGA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCTCAAATCCTAAATTGTCATTATTGACAAGAGATAAATAAATAGA  584

seq1  TGGAATGACATATAGGTGATAGATTGAAGATGAATGGATTTCAAAATATC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATGACATATAGGTGATAGATTGAAGATGAATGGATTTCAAAATATC  634

seq1  AGCATTATCTAGATGACAACATAATTATTACTCTCATAACTTACTTTTGT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTATCTAGATGACAACATAATTATTACTCTCATAACTTACTTTTGT  684

seq1  ACACTTTGTAATGTACTTATCAGCTTCTCATATTTATAACAACAATGGTT  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTTGTAATGTACTTATCAGCTTCTCATATTTATAACAACAATGGTT  734

seq1  TTTGTTTACTCTATGCTAATTTTATGCACATAGAATTGCATTTTTCCAAG  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTACTCTATGCTAATTTTATGCACATAGAATTGCATTTTTCCAAG  784

seq1  CTGTTCTTTTAATGATGCTTTTGTTTTTATTTTCACATATATTTTATTCT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCTTTTAATGATGCTTTTGTTTTTATTTTCACATATATTTTATTCT  834

seq1  GTCATATGCAGGAGTTTGTGTCTTCTTTACTGAATAGTGTTGAATTGAAA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATATGCAGGAGTTTGTGTCTTCTTTACTGAATAGTGTTGAATTGAAA  884

seq1  ATATAGGTCACATTTTGTTGATTCAACAGTTGACAGTTTCTAGTTTAGAC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGGTCACATTTTGTTGATTCAACAGTTGACAGTTTCTAGTTTAGAC  934

seq1  TATTACAAATATAGCTTATTTCAAAACTCAAAAAATATATTTGAGCATAT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTACAAATATAGCTTATTTCAAAACTCAAAAAATATATTTGAGCATAT  984

seq1  ATTTTCCTTTCCCTTGGTAAATGACTATAAGAAAATATTTGAGTTATAAG  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCCTTTCCCTTGGTAAATGACTATAAGAAAATATTTGAGTTATAAG  1034

seq1  ATAGGTGGTTTTTTTATTTTTTAAACGTGGGAGATTTTACAGAGTAAGCA  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGTGGTTTTTTTATTTTTTAAACGTGGGAGATTTTACAGAGTAAGCA  1084

seq1  AGCCCTTGTGGTGTACACAGTGGAATATTTTTATCTATACAGAAATATAG  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCTTGTGGTGTACACAGTGGAATATTTTTATCTATACAGAAATATAG  1134

seq1  AATTC  1149
      |||||
seq2  AATTC  1139