BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-021G10
Chromosome5 (Build37)
Map Location 133,104,750 - 133,245,306
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneAuts2, 4930563F08Rik
Downstream geneLOC100039731
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-021G10.bB6Ng01-021G10.g
ACCDH853917DH853918
length1,134787
definitionDH853917|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021G10, 5' end.DH853918|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021G10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(133,104,750 - 133,105,904)(133,244,554 - 133,245,306)
sequence
gaattccctttctttaccatcacaagctggaattacagacctgctgccat
gcccacccaacaattagtgggttctggggacccaaactcaagactgagac
ttctttccaggcctagttttgcattttgtacaggaaaaaaaaaaatcagt
actctagaatttggattaatattttttattatctattttcctcattgctt
tgacaaaatatctaacaaaagtaactttagcaagagagggttattctgag
tcacagttccagggtctagtctgtcacagctgggaaggcatggtggcaaa
gtgtgaggtacctggtcacatggcatccacagtcaggaagcagagagaga
tggatgctggtactcagctcactgtctccttctcattcggtccaggacta
gcatatagaataatgtcatccacattcaggatgggcctccccacctcaat
taacccaatctagaaactcccccaagacaagacaagaagtttatctccta
ggtgattctagatcttgtcatgctgacaatcaagagtcaccatgacacat
ttttaaaaaagaatttttccctaagtgaccttcactggtacagttctggg
accttgctactaggaaggttaaggcaagaagaagaccacaggtttaagga
cagtctaacagatagtgtgacttgtctcaaaataacaagtaataggctgg
caagttggctcaatgggaaaaagtagttggcatgcaagcctgatgacccg
agtttgacccatggaatccaaagtggaaggaaagagacgactcccaaagt
tgtcctttcatctccacatatattttgttatgctagtctctctctctctc
ttcatacacactcaacacaataaataaaaattaaaaaattaagtgataaa
agaagagtggtggggtgctcagtgcttagggttcattgctgtgaacagat
accattagccaagccactcgtataggacaacatttaatcgagcttgctta
tagttccgagttcagtgcattatcattcgtggtggagtatggcagcatgc
cgcgacttcatgcctgagaagaccgagagttctacatatgatctttagtg
caaggaaagactggtccaactgggcctggcttga
gaattctcagctttcataattacgagagccagttctatgctttaaggtgt
gtatgtgtgtgcacacacgtacatgcacacatgcacatatgagcataatt
ttgaatgggtatacttctacgtatacatgcttctgtgaacatatgcatac
ttgcatgtgctgagtgtatgtgtgtgcatagttatgtatgtgtatgcttc
tatgtgtgcatgcttctgtgtgtatatgcataattgcatatgtgagcatg
tgtgtgtgtgtttatatgtgtgtatgtgtgtgcattttgctatctattag
tcaacttaaataatgaatacaaaagatttaatctttaattacaaataagg
gaggcactgtagctgagctggattatcagatatacaagtagttacagttt
ttaaaaaatgaagttttgctatattggttaaatattaagcaacaaatggc
ttacaaggtggtttagtgggtaatgacattgctatcaagtatgacaatat
gagttcaagcaatagaatctgtcagtttgctctttgaacataggacttgg
agtaatagatctcaaattgacctggaagcctctgccctgaggactaaaga
ttggaaagtgttatgcaacttgccaatgccaaggaagaaaagccatcaag
actagctataaagtctacaaaccacaacaatgactagactgacaagatat
ccccaatggtatacatgctttctgtgaacatatgcatacttgcatgtgct
gagtgtatgtgtgtgcatagttatgtatgtgtatgct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_133104750_133105904
seq2: B6Ng01-021G10.b_43_1176

seq1  GAATTCCCTTTCTTTACCATCACAAGCTGGAATTACAGACCTGCTGCCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTTTCTTTACCATCACAAGCTGGAATTACAGACCTGCTGCCAT  50

seq1  GCCCACCCAACAATTAGTGGGTTCTGGGGACCCAAACTCAAGACTGAGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCACCCAACAATTAGTGGGTTCTGGGGACCCAAACTCAAGACTGAGAC  100

seq1  TTCTTTCCAGGCCTAGTTTTGCATTTTGTACAGGAAAAAAAAAAATCAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTCCAGGCCTAGTTTTGCATTTTGTACAGGAAAAAAAAAAATCAGT  150

seq1  ACTCTAGAATTTGGATTAATATTTTTTATTATCTATTTTCCTCATTGCTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTAGAATTTGGATTAATATTTTTTATTATCTATTTTCCTCATTGCTT  200

seq1  TGACAAAATATCTAACAAAAGTAACTTTAGCAAGAGAGGGTTATTCTGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACAAAATATCTAACAAAAGTAACTTTAGCAAGAGAGGGTTATTCTGAG  250

seq1  TCACAGTTCCAGGGTCTAGTCTGTCACAGCTGGGAAGGCATGGTGGCAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACAGTTCCAGGGTCTAGTCTGTCACAGCTGGGAAGGCATGGTGGCAAA  300

seq1  GTGTGAGGTACCTGGTCACATGGCATCCACAGTCAGGAAGCAGAGAGAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGAGGTACCTGGTCACATGGCATCCACAGTCAGGAAGCAGAGAGAGA  350

seq1  TGGATGCTGGTACTCAGCTCACTGTCTCCTTCTCATTCGGTCCAGGACTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGCTGGTACTCAGCTCACTGTCTCCTTCTCATTCGGTCCAGGACTA  400

seq1  GCATATAGAATAATGTCATCCACATTCAGGATGGGCCTCCCCACCTCAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATAGAATAATGTCATCCACATTCAGGATGGGCCTCCCCACCTCAAT  450

seq1  TAACCCAATCTAGAAACTCCCCCAAGACAAGACAAGAAGTTTATCTCCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCCAATCTAGAAACTCCCCCAAGACAAGACAAGAAGTTTATCTCCTA  500

seq1  GGTGATTCTAGATCTTGTCATGCTGACAATCAAGAGTCACCATGACACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGATTCTAGATCTTGTCATGCTGACAATCAAGAGTCACCATGACACAT  550

seq1  TTTTAAAAAAGAATTTTTCCCTAAGTGACCTTCACTGGTACAGTTCTGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAAAAGAATTTTTCCCTAAGTGACCTTCACTGGTACAGTTCTGGG  600

seq1  ACCTTGCTACTAGGAAGGTTAAGGCAAGAAGAAGACCACAGGTTTAAGGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGCTACTAGGAAGGTTAAGGCAAGAAGAAGACCACAGGTTTAAGGA  650

seq1  CAGTCTAACAGATAGTGTGACTTGTCTCAAAATAACAAGTAATAGGCTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTAACAGATAGTGTGACTTGTCTCAAAATAACAAGTAATAGGCTGG  700

seq1  CAAGTTGGCTCAATGGGAAAAAGTAGTTGGCATGCAAGCCTGATGACCCG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTGGCTCAATGGGAAAAAGTAGTTGGCATGCAAGCCTGATGACCCG  750

seq1  AGTTTGACCCATGGAATCCAAAGTGGAAGGAAAGAGACGACTCCCAAAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTGACCCATGGAATCCAAAGTGGAAGGAAAGAGACGACTCCCAAAGT  800

seq1  TGTCCTTTCATCTCCACATATATTTTGTTATGCTAGTCTCTCTCTCTCTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTTTCATCTCCACATATATTTTGTTATGCTAGTCTCTCTCTCTCTC  850

seq1  TTCATACACACTCAACACAATAAAATAAAAATTAAAAAAATTAAGTGATA  900
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| 
seq2  TTCATACACACTCAACACAAT-AAATAAAAATT-AAAAAATTAAGTGAT-  897

seq1  AAAAGAAGAGGTGGTGGGGTGCTCAGTGCTTAGGGTTCCATTGCTGTGAA  950
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AAAAGAAGA-GTGGTGGGGTGCTCAGTGCTTAGGGTT-CATTGCTGTGAA  945

seq1  CAGATACCA-TAGCCAAGGCAACTCGTATAAAGGACAACATTTAATCGAG  999
      ||||||||| ||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||| 
seq2  CAGATACCATTAGCCAA-GCCACTCGTAT--AGGACAACATTTAATCGA-  991

seq1  GCTTGCTTATAGTTTCCGAGGTTCAGTGCATTATCA-TCGTGGTGAGAAG  1048
      |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||  | ||
seq2  GCTTGCTTATAG-TTCCGA-GTTCAGTGCATTATCATTCGTGGT--GGAG  1037

seq1  TATGGCAGCATGCCGGCAGACATCATGCTGGAGAAGGAACCGAGAGTTCT  1098
      |||||||||||||||   ||| ||||||  ||||||  ||||||||||||
seq2  TATGGCAGCATGCCG--CGACTTCATGCCTGAGAAG--ACCGAGAGTTCT  1083

seq1  ACATATTGATCTGTAGGTAGCAAGGAGAAGACTGGGTCAACACTGGGCGT  1148
      ||||| |||||| |||   ||||||| ||||||||  ||  ||||||| |
seq2  ACATA-TGATCTTTAG--TGCAAGGA-AAGACTGGTCCA--ACTGGGCCT  1127

seq1  GGCTTGA  1155
      |||||||
seq2  GGCTTGA  1134

seq1: chr5_133244554_133245306
seq2: B6Ng01-021G10.g_99_852 (reverse)

seq1  AGCATACACATACATAACTATGCACACACATACACTCAGCACATGCAAGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATACACATACATAACTATGCACACACATACACTCAGCACATGCAAGT  50

seq1  ATGCATATGTTCACAG-AAGCATGTATACCATTGGGGATATCTTGTCAGT  99
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATATGTTCACAGAAAGCATGTATACCATTGGGGATATCTTGTCAGT  100

seq1  CTAGTCATTGTTGTGGTTTGTAGACTTTATAGCTAGTCTTGATGGCTTTT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGTCATTGTTGTGGTTTGTAGACTTTATAGCTAGTCTTGATGGCTTTT  150

seq1  CTTCCTTGGCATTGGCAAGTTGCATAACACTTTCCAATCTTTAGTCCTCA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTTGGCATTGGCAAGTTGCATAACACTTTCCAATCTTTAGTCCTCA  200

seq1  GGGCAGAGGCTTCCAGGTCAATTTGAGATCTATTACTCCAAGTCCTATGT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAGAGGCTTCCAGGTCAATTTGAGATCTATTACTCCAAGTCCTATGT  250

seq1  TCAAAGAGCAAACTGACAGATTCTATTGCTTGAACTCATATTGTCATACT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGAGCAAACTGACAGATTCTATTGCTTGAACTCATATTGTCATACT  300

seq1  TGATAGCAATGTCATTACCCACTAAACCACCTTGTAAGCCATTTGTTGCT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGCAATGTCATTACCCACTAAACCACCTTGTAAGCCATTTGTTGCT  350

seq1  TAATATTTAACCAATATAGCAAAACTTCATTTTTTAAAAACTGTAACTAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATTTAACCAATATAGCAAAACTTCATTTTTTAAAAACTGTAACTAC  400

seq1  TTGTATATCTGATAATCCAGCTCAGCTACAGTGCCTCCCTTATTTGTAAT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATATCTGATAATCCAGCTCAGCTACAGTGCCTCCCTTATTTGTAAT  450

seq1  TAAAGATTAAATCTTTTGTATTCATTATTTAAGTTGACTAATAGATAGCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGATTAAATCTTTTGTATTCATTATTTAAGTTGACTAATAGATAGCA  500

seq1  AAATGCACACACATACACACATATAAACACACACACACATGCTCACATAT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCACACACATACACACATATAAACACACACACACATGCTCACATAT  550

seq1  GCAATTATGCATATACACACAGAAGCATGCACACATAGAAGCATACACAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAATTATGCATATACACACAGAAGCATGCACACATAGAAGCATACACAT  600

seq1  ACATAACTATGCACACACATACACTCAGCACATGCAAGTATGCATATGTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAACTATGCACACACATACACTCAGCACATGCAAGTATGCATATGTT  650

seq1  CACAGAAGCATGTATACGTAGAAGTATACCCATTCAAAATTATGCTCATA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAAGCATGTATACGTAGAAGTATACCCATTCAAAATTATGCTCATA  700

seq1  TGTGCATGTGTGCATGTACGTGTGTGCACACACATACACACCTTAAAGCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCATGTGTGCATGTACGTGTGTGCACACACATACACACCTTAAAGCA  750

seq1  TAGA  753
      ||||
seq2  TAGA  754