BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-035G14
Chromosome5 (Build37)
Map Location 130,740,722 - 130,922,309
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTyw1, A330070K13Rik
Upstream geneSfrs8, Mmp17, EG620248, Zfp11, 1700016K13Rik, Mrps17, Gbas, Psph, Cct6a, LOC100038887, Sumf2, Phkg1, Chchd2, 2410018M08Rik, 4930579G22Rik, Vkorc1l1, Gusb, Asl, Crcp, Tpst1, Kctd7, Rabgef1, 0610007L01Rik, EG625540, Sbds
Downstream geneCaln1, Wbscr17, Auts2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-035G14.bB6Ng01-035G14.g
ACCDH863881DH863882
length916809
definitionDH863881|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-035G14, 5' end.DH863882|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-035G14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(130,921,388 - 130,922,309)(130,740,722 - 130,741,531)
sequence
gaattcttaccctgggcacatctgccccctcttcataatgtcccccttga
taaaacaattcccccagaattcaccccaggaaccagtgacattattgggc
tttcttacaaagcatgaatgggaaattactgccaggagtgtgggtggccc
caaaacatactggagtcttcacccagcttggacaatgatttccatacaac
tgtacatatggagtgctttaattaatcttttctagactatataccctagc
atagcacttctcaaccttcctaaggctatctttgcccgccccccaagact
taattcagaaagttcagttttaggtgtacccgctactccagtagcacaat
gactctcaaccttcctgaccctgagacgaatagtgtgatgacccctgacc
ttaaaattattgtgttcctacttcataactgtaattttgctacacttatg
aatcataatgtaaacatttttggagatagaagttggccaaaggggtcgag
gcccacaggttgagaagttctgctctagcacctttgagacctgtccccac
ccctgacaccacccagttacagaagtggttagagagactttcagtggccc
accttctaaagggaaacagcaaccagttaacaaacatttcttgccagcag
acacagctaatgtgattaagagggcagctgttttacacaggaacccattg
tttaccaggagttacacatgtcaaagatgtgacctggaggaagggggctt
caagggtcttgtcttctccagaatacaaagccttgagacttcaagagctg
gagaaagtagccagctttgggaagttgttaaaggagtgtttccactgccc
tcacgaatacaactatgtaaggttcaaggtaagggaaaaactgggccaag
acctgacacttgttta
gaattcaagggttttagggactttgggctgagtgacaagggtcagccact
tacattttcacacatacccttgtgctatgctctgtggatagtgatctcgc
ttgctgccctcgccccatcctctaccttttctctcatctatcttctgtgc
ccatcggcacctggtatgctctactgcctcttttgtagaggcatcttcag
gaccagggctttgtccattttgtttgcttctgtgcaatgttgcccagaag
tgaggctggcatcatgagtgtccagtcagtgacgtggtcatagctaacag
tgaagggtgatggcgccaggtcctgggactgccaaggagcaaagaggaga
tgcttttctccgtgtcaacctgcctggaaatttgagctttcctgaggcat
ttggtcatatgctttgggagagctgacaatgttacatgggagagagcaac
tgccccttggtctctgacatctgtatatctttctccatgtggtataataa
cttggttttctgttttcctgccttctctctttgctggcgactccagggcc
tcctcctgtctatttaactggcttcccattctgccacccagctgtgtttg
tatgcatgtgtgtacactagcacatgtgtgtattctattgctgtgtatat
ttgtagagggcatacagatcagcacttgggaaagcaggaatgtcaacaca
gcattgtctctttaacctgtttccacctagaaatctgggaatggatgtag
ttaataacctggtgaactctgggctgtctgtaggccaggccacaccgact
gctcccccc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_130921388_130922309
seq2: B6Ng01-035G14.b_44_959 (reverse)

seq1  TAAACAAGTGTCAGGTCCTGTGGCCCAGTTTCTCCCCTAACCTGGAAGCC  50
      |||||||||||||||||   ||||||||||| | |||| |||| ||| ||
seq2  TAAACAAGTGTCAGGTC--TTGGCCCAGTTT-TTCCCTTACCTTGAA-CC  46

seq1  TTACAATAGTTGTAGTCAGTGAGGGCAGTGGGAAACACTGCCTTTATCAC  100
      |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||| || 
seq2  TTAC-ATAGTTGTATTC-GTGAGGGCAGT-GGAAACACT-CCTTTAACA-  91

seq1  GCTCCCCAAAGCTGGCTACTTTCTTCCAGCTCTTGATGTCTCAGGGCTTT  150
       || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||
seq2  ACTTCCCAAAGCTGGCTACTTTC-TCCAGCTCTTGAAGTCTCAAGGCTTT  140

seq1  GTATCCT-GAGGAGAC-AGACCCTCGATGCCCCCTTCCTCCAGGTCACAT  198
      |||| || ||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTCTGGAGAAGACAAGACCCTTGAAGCCCCCTTCCTCCAGGTCACAT  190

seq1  CTTTGACATGTGTTAGCTCCTGGTAAACTATGGGTTCCTGTGTAAAACAG  248
      |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGACATGTG-TAACTCCTGGTAAACAATGGGTTCCTGTGTAAAACAG  239

seq1  CTGCCCTCTTAATCACATTAGCTGTGTCTGCTGGCAAG-AATGTTTGTTA  297
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CTGCCCTCTTAATCACATTAGCTGTGTCTGCTGGCAAGAAATGTTTGTTA  289

seq1  ACT-GTTGCTGTTCCCTTTTAGAAGGTGGGCCACTG-AAGTCTCTCTAAC  345
      ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  ACTGGTTGCTGTTTCCCTTTAGAAGGTGGGCCACTGAAAGTCTCTCTAAC  339

seq1  CACTTCTGTAACTGGGTGGTGTCAGGGGTGGGGACAGGTCTCAAAGGTGC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTCTGTAACTGGGTGGTGTCAGGGGTGGGGACAGGTCTCAAAGGTGC  389

seq1  TAGAGCAGAACTTCTCAACCTGTGGGCCTCGACCCCTTTGGCCAACTTCT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGCAGAACTTCTCAACCTGTGGGCCTCGACCCCTTTGGCCAACTTCT  439

seq1  ATCTCCAAAAATGTTTACATTATGATTCATAAGTGTAGCAAAATTACAGT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCCAAAAATGTTTACATTATGATTCATAAGTGTAGCAAAATTACAGT  489

seq1  TATGAAGTAGGAACACAATAATTTTAAGGTCAGGGGTCATCACACTATTC  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGAAGTAGGAACACAATAATTTTAAGGTCAGGGGTCATCACACTATTC  539

seq1  GTCTCAGGGTCAGGAAGGTTGAGAGTCATTGTGCTACTGGAGTAGCGGGT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCAGGGTCAGGAAGGTTGAGAGTCATTGTGCTACTGGAGTAGCGGGT  589

seq1  ACACCTAAAACTGAACTTTCTGAATTAAGTCTTGGGGGGCGGGCAAAGAT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTAAAACTGAACTTTCTGAATTAAGTCTTGGGGGGCGGGCAAAGAT  639

seq1  AGCCTTAGGAAGGTTGAGAAGTGCTATGCTAGGGTATATAGTCTAGAAAA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTTAGGAAGGTTGAGAAGTGCTATGCTAGGGTATATAGTCTAGAAAA  689

seq1  GATTAATTAAAGCACTCCATATGTACAGTTGTATGGAAATCATTGTCCAA  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAATTAAAGCACTCCATATGTACAGTTGTATGGAAATCATTGTCCAA  739

seq1  GCTGGGTGAAGACTCCAGTATGTTTTGGGGCCACCCACACTCCTGGCAGT  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGTGAAGACTCCAGTATGTTTTGGGGCCACCCACACTCCTGGCAGT  789

seq1  AATTTCCCATTCATGCTTTGTAAGAAAGCCCAATAATGTCACTGGTTCCT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCCCATTCATGCTTTGTAAGAAAGCCCAATAATGTCACTGGTTCCT  839

seq1  GGGGTGAATTCTGGGGGAATTGTTTTATCAAGGGGGACATTATGAAGAGG  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTGAATTCTGGGGGAATTGTTTTATCAAGGGGGACATTATGAAGAGG  889

seq1  GGGCAGATGTGCCCAGGGTAAGAATTC  922
      |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCAGATGTGCCCAGGGTAAGAATTC  916

seq1: chr5_130740722_130741531
seq2: B6Ng01-035G14.g_70_878

seq1  GAATTCAAGGGTTTTAGGGACTTTGGGCTGAGTGACAAGGGTCAGCCACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGGTTTTAGGGACTTTGGGCTGAGTGACAAGGGTCAGCCACT  50

seq1  TACATTTTCACACATACCCTTGTGCTATGCTCTGTGGATAGTGATCTCGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTTTCACACATACCCTTGTGCTATGCTCTGTGGATAGTGATCTCGC  100

seq1  TTGCTGCCCTCGCCCCATCCTCTACCTTTTCTCTCATCTATCTTCTGTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGCCCTCGCCCCATCCTCTACCTTTTCTCTCATCTATCTTCTGTGC  150

seq1  CCATCGGCACCTGGTATGCTCTACTGCCTCTTTTGTAGAGGCATCTTCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCGGCACCTGGTATGCTCTACTGCCTCTTTTGTAGAGGCATCTTCAG  200

seq1  GACCAGGGCTTTGTCCATTTTGTTTGCTTCTGTGCAATGTTGCCCAGAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCAGGGCTTTGTCCATTTTGTTTGCTTCTGTGCAATGTTGCCCAGAAG  250

seq1  TGAGGCTGGCATCATGAGTGTCCAGTCAGTGACGTGGTCATAGCTAACAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCTGGCATCATGAGTGTCCAGTCAGTGACGTGGTCATAGCTAACAG  300

seq1  TGAAGGGTGATGGCGCCAGGTCCTGGGACTGCCAAGGAGCAAAGAGGAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGGGTGATGGCGCCAGGTCCTGGGACTGCCAAGGAGCAAAGAGGAGA  350

seq1  TGCTTTTCTCCGTGTCAACCTGCCTGGAAATTTGAGCTTTCCTGAGGCAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTTCTCCGTGTCAACCTGCCTGGAAATTTGAGCTTTCCTGAGGCAT  400

seq1  TTGGTCATATGCTTTGGGAGAGCTGACAATGTTACATGGGAGAGAGCAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTCATATGCTTTGGGAGAGCTGACAATGTTACATGGGAGAGAGCAAC  450

seq1  TGCCCCTTGGTCTCTGACATCTGTATATCTTTCTCCATGTGGTATAATAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCCTTGGTCTCTGACATCTGTATATCTTTCTCCATGTGGTATAATAA  500

seq1  CTTGGTTTTCTG-TTTCCTGCCTTCTCTCTTTGCTGGCGACTCCAGGGCC  549
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTTTTCTGTTTTCCTGCCTTCTCTCTTTGCTGGCGACTCCAGGGCC  550

seq1  TCCTCCTGTCTA-TTAACTGGCTTCCCATTCTGCCACCCAGCTGTGTTTG  598
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCTGTCTATTTAACTGGCTTCCCATTCTGCCACCCAGCTGTGTTTG  600

seq1  TATGCATGTGTGTACACTAGCACATGTGTGTATTCTATTGCTGTGTATAT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCATGTGTGTACACTAGCACATGTGTGTATTCTATTGCTGTGTATAT  650

seq1  TTGTAGAGGGCATACAGATCAGCACTTGGGAAAGCAGGAATGTCAAACAC  698
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TTGTAGAGGGCATACAGATCAGCACTTGGGAAAGCAGGAATGTC-AACAC  699

seq1  AGCATTGTCTCTTTAACCTGTTTCCACCTAGAAATCTGGGAATGGATGTA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATTGTCTCTTTAACCTGTTTCCACCTAGAAATCTGGGAATGGATGTA  749

seq1  GTTAATAACCTGGTGAACTCTGGGCTGTCTGTAGGGCCAGGCCACACCCG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||
seq2  GTTAATAACCTGGTGAACTCTGGGCTGTCTGTA-GGCCAGGCCACA-CCG  797

seq1  ACTGCTCCCCCC  810
      ||||||||||||
seq2  ACTGCTCCCCCC  809