MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-059E20
Chromosome	5 (Build37)
Map Location	104,517,088 - 104,517,938
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	Sparcl1
Upstream gene	Mapk10, LOC666563, 4930429D17Rik, LOC100041039, 1700021F02Rik, LOC100041049, Ptpn13, Slc10a6, 1700016H13Rik, Aff1, Klhl8, Hsd17b13, EG666629, Hsd17b11, Nudt9
Downstream gene	LOC100041136, Dspp, Dmp1, LOC100041145, Ibsp, Mepe, Spp1, Pkd2, BC005561, LOC100042165, LOC100041172, D930016D06Rik, 2310012P17Rik, LOC640963, LOC100041199, LOC666726, C230055K05Rik, LOC100041216, Abcg3, LOC626471, EG545790, 5830443L24Rik, BC057170
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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-059E20.b	B6Ng01-059E20.g
ACC	DH880624	DH880625
length	852	1,227
definition	DH880624\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-059E20, 5' end.	DH880625\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-059E20, 3' end.
singlet/doublet	singlet	---
BLAST hit	unique	no hit data
sequence	gaattcagaaaatccccatcttccatgtctgtaagtgcttattacaatgg tgcctctgaacttgatgcggtggggaggtttggaattgtctaagtttctt gaaaaaaacaaaaaacaaatagtaaaacaaaactatgcttccaacgtggt cttgtagaatcagaatctcctatgatcagaacctgggaatgcctgagtcg gtcttaatttcagtctgctctcataactatatgaactttttttgtcaata cgtagaattcagagaggcacagacatcaccccaaatccacccacaagtga tgtttggcagcagtggtcagtgtctcacatttgcaagctccgaagtaatc cagctgcagttggtgtccctttttggtcccctccagcctgcacttggtag caaacaggtgacaggagctggcgtaggtttggttgtcagtgccacaagcc tagataaggaaagcaaggagcggtgatggaaccagatactcactggagaa tgcttacctggaactcacagaacacctggtaaatgtgctgtgccaaagat gtgctctggcagagtctgtaaaaatagcgagtctccaatttggcacacat aaaaaaaaaaatctactaagttaaactaatggtgataacttagctcctga tagatctccatagaactgtaattgtgaatgtcccaaggatagaaggaatt caaaatttctcctcctcaaatgctagcgccatcttttaaaattaaaatat aaatattttatgtgcttcgggtataatgcacacactttactctgtgtttc atatgtatgcacagagatgcacatgcatgtatgggtgtgggggggggagg ct	gaattctcctctgaagaaacagacttggaggaggaggaagcagctcatta tgagagaaaagggtaccagccagataaaatgctagctaatcagttaagga aaaagccaaaagcggctggcgaaggccagcatgctgcttggcctccgggc agtcggcttcaaggtcatagtgcacctctgccctatgcggaggccccgcc ctgcatagtgtgccagccctgcgcagagaggcaatggacagagaggcaat gcgcagactcgttcattcccagagaggaacaaaggaaaatgcaacaggca tttccggtctttgaaggagccgagcagtggtggcatacgccgttaatccc agcacttgggagacagaggcaggctcttgcagcctacaaggtcttattgt ccaccctggagttgtagatcaggattataaaggggaacttcaggttctct gttctcgtcctcaagttgtcttttctatatcacaaggagacagaatagct caactaataattttgccaagcctacatggctgtttttccttcctctagta ttcctcgagctgccagagggattggttctactagaaatgattctgattac ttaataatgcctttagattgttgtcaaattttatctactcctcatgtagg ggtaaaccctcgtggcgtcaggccattacaggtctggcaaatggatgtca cgcatatttcctcctttgggagaaatcaatatttaaatgtctctattgac acctgttctggcatcatgtttgcctctcctttaaccggagaaaaggcctc acatgtgattcaacattgcctttgaggcatggagtgcttgggggaaaccc aaactccttaagactgataatggaccagcttatacatctcaaaaattcca gcagttctgccgtcagatggacgtgacccacctgactggacttccataca ccctcaaggacagggtattgtgagtggtgcgcatcgcaccctcaaatcct atctattaaacagaaagggggagtcgaggctctatccgagtaccagagta tctgtgttctatgcactctttacatcattttaatctgatgctctatgtca tctgcggtctacgtcatgtccaagctcgaatgcagtgaatgtctggaatt tttgtacaagcagagcgaccttgagatccatggacgtggtttcaatagag aagaccattggtaccagaactccctca
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
seq1: chr5_104517088_104517938 seq2: B6Ng01-059E20.b_47_898 seq1 GAATTCAGAAAATCCCCATCTTCCATGTCTGTAAGTGCTTATTACAATGG 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATTCAGAAAATCCCCATCTTCCATGTCTGTAAGTGCTTATTACAATGG 50 seq1 TGCCTCTGAACTTGATGCGGTGGGGAGGTTTGGAATTGTCTAAGTTTCTT 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGCCTCTGAACTTGATGCGGTGGGGAGGTTTGGAATTGTCTAAGTTTCTT 100 seq1 GAAAAAAACAAAAAACAAATAGTAAAACAAAACTATGCTTCCAACGTGGT 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAAAAAAACAAAAAACAAATAGTAAAACAAAACTATGCTTCCAACGTGGT 150 seq1 CTTGTAGAATCAGAATCTCCTATGATCAGAACCTGGGAATGCCTGAGTCG 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTTGTAGAATCAGAATCTCCTATGATCAGAACCTGGGAATGCCTGAGTCG 200 seq1 GTCTTAATTTCAGTCTGCTCTCATAACTATATGAACTTTTTTTGTCAATA 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTCTTAATTTCAGTCTGCTCTCATAACTATATGAACTTTTTTTGTCAATA 250 seq1 CGTAGAATTCAGAGAGGCACAGACATCACCCCAAATCCACCCACAAGTGA 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CGTAGAATTCAGAGAGGCACAGACATCACCCCAAATCCACCCACAAGTGA 300 seq1 TGTTTGGCAGCAGTGGTCAGTGTCTCACATTTGCAAGCTCCGAAGTAATC 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGTTTGGCAGCAGTGGTCAGTGTCTCACATTTGCAAGCTCCGAAGTAATC 350 seq1 CAGCTGCAGTTGGTGTCCCTTTTTGGTCCCCTCCAGCCTGCACTTGGTAG 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAGCTGCAGTTGGTGTCCCTTTTTGGTCCCCTCCAGCCTGCACTTGGTAG 400 seq1 CAAACAGGTGACAGGAGCTGGCGTAGGTTTGGTTGTCAGTGCCACAAGCC 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAAACAGGTGACAGGAGCTGGCGTAGGTTTGGTTGTCAGTGCCACAAGCC 450 seq1 TAGATAAGGAAAGCAAGGAGCGGTGATGGAACCAGATACTCACTGGAGAA 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAGATAAGGAAAGCAAGGAGCGGTGATGGAACCAGATACTCACTGGAGAA 500 seq1 TGCTTACCTGGAACTCACAGAACACCTGGTAAATGTGCTGTGCCAAAGAT 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGCTTACCTGGAACTCACAGAACACCTGGTAAATGTGCTGTGCCAAAGAT 550 seq1 GTGCTCTGGCAGAGTCTGTAAAAATAGCGAGTCTCCAATTTGGCACACAT 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTGCTCTGGCAGAGTCTGTAAAAATAGCGAGTCTCCAATTTGGCACACAT 600 seq1 AAAAAAAAAAATCTACTAAGTTAAACTAATGGTGATAACTTAGCTCCTGA 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAAAAAAAAAATCTACTAAGTTAAACTAATGGTGATAACTTAGCTCCTGA 650 seq1 TAGATCTCCATAGAACTGTAATTGTGAATGTCCCAAGGATAGAAGGAATT 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TAGATCTCCATAGAACTGTAATTGTGAATGTCCCAAGGATAGAAGGAATT 700 seq1 CAAAATTTCTCCTCCTCAAATGCTAGCGCCATCTTTTAAAATTAAAATAT 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAAAATTTCTCCTCCTCAAATGCTAGCGCCATCTTTTAAAATTAAAATAT 750 seq1 AAATATTTTATGTGCTTCGGGTATAATGCACACACTTTACTCTGTGTTTC 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAATATTTTATGTGCTTCGGGTATAATGCACACACTTTACTCTGTGTTTC 800 seq1 ATATGTATGCACAGAGATGCACATGCATGTATGGGTGT-GGGGGGGGAGG 849 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATATGTATGCACAGAGATGCACATGCATGTATGGGTGTGGGGGGGGGAGG 850 seq1 CT 851 \|\| seq2 CT 852

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seq1: chr5_104517088_104517938
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAAAATCCCCATCTTCCATGTCTGTAAGTGCTTATTACAATGG  50

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCTGAACTTGATGCGGTGGGGAGGTTTGGAATTGTCTAAGTTTCTT  100

seq1  GAAAAAAACAAAAAACAAATAGTAAAACAAAACTATGCTTCCAACGTGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAAACAAAAAACAAATAGTAAAACAAAACTATGCTTCCAACGTGGT  150

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTAGAATCAGAATCTCCTATGATCAGAACCTGGGAATGCCTGAGTCG  200

seq1  GTCTTAATTTCAGTCTGCTCTCATAACTATATGAACTTTTTTTGTCAATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTTAATTTCAGTCTGCTCTCATAACTATATGAACTTTTTTTGTCAATA  250

seq1  CGTAGAATTCAGAGAGGCACAGACATCACCCCAAATCCACCCACAAGTGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTAGAATTCAGAGAGGCACAGACATCACCCCAAATCCACCCACAAGTGA  300

seq1  TGTTTGGCAGCAGTGGTCAGTGTCTCACATTTGCAAGCTCCGAAGTAATC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGGCAGCAGTGGTCAGTGTCTCACATTTGCAAGCTCCGAAGTAATC  350

seq1  CAGCTGCAGTTGGTGTCCCTTTTTGGTCCCCTCCAGCCTGCACTTGGTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGCAGTTGGTGTCCCTTTTTGGTCCCCTCCAGCCTGCACTTGGTAG  400

seq1  CAAACAGGTGACAGGAGCTGGCGTAGGTTTGGTTGTCAGTGCCACAAGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAGGTGACAGGAGCTGGCGTAGGTTTGGTTGTCAGTGCCACAAGCC  450

seq1  TAGATAAGGAAAGCAAGGAGCGGTGATGGAACCAGATACTCACTGGAGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATAAGGAAAGCAAGGAGCGGTGATGGAACCAGATACTCACTGGAGAA  500

seq1  TGCTTACCTGGAACTCACAGAACACCTGGTAAATGTGCTGTGCCAAAGAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTACCTGGAACTCACAGAACACCTGGTAAATGTGCTGTGCCAAAGAT  550

seq1  GTGCTCTGGCAGAGTCTGTAAAAATAGCGAGTCTCCAATTTGGCACACAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCTCTGGCAGAGTCTGTAAAAATAGCGAGTCTCCAATTTGGCACACAT  600

seq1  AAAAAAAAAAATCTACTAAGTTAAACTAATGGTGATAACTTAGCTCCTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAAATCTACTAAGTTAAACTAATGGTGATAACTTAGCTCCTGA  650

seq1  TAGATCTCCATAGAACTGTAATTGTGAATGTCCCAAGGATAGAAGGAATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATCTCCATAGAACTGTAATTGTGAATGTCCCAAGGATAGAAGGAATT  700

seq1  CAAAATTTCTCCTCCTCAAATGCTAGCGCCATCTTTTAAAATTAAAATAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATTTCTCCTCCTCAAATGCTAGCGCCATCTTTTAAAATTAAAATAT  750

seq1  AAATATTTTATGTGCTTCGGGTATAATGCACACACTTTACTCTGTGTTTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ATATGTATGCACAGAGATGCACATGCATGTATGGGTGT-GGGGGGGGAGG  849
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  ATATGTATGCACAGAGATGCACATGCATGTATGGGTGTGGGGGGGGGAGG  850

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