BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-070F18
Chromosome5 (Build37)
Map Location 127,122,985 - 127,274,173
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneTmem132b, EG231736, LOC100039178, LOC665760
Downstream geneLOC100040327, Tmem132c, Slc15a4, Glt1d1, Tmem132d
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-070F18.bB6Ng01-070F18.g
ACCDH888387DH888388
length1,1421,087
definitionDH888387|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070F18, 5' end.DH888388|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070F18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(127,122,985 - 127,124,146)(127,273,084 - 127,274,173)
sequence
gaattcaaagtcagaaagaaatgatggacttatgaaaatgattaaggttc
tctgcaagaacagatccagcaggatgtggaatgtacacagttacaagaga
gggtttattagatgggttgacattgtcagaggctggaaaggccaattcac
atgtgtttaaaacaatgtagaaaattaggctctttcaatacattatccaa
ggcagaaaaggctcccagtatagttagctcaggtgcccttacttagctcc
caagtttcttccatctctctgttcacagaagtatcatcctccttgaagta
ttttcatagggctaggtcttgacttgcaaagaaataagatggggaaagag
aagaaaatggttcctatatcaaaattctaaagacttttaattattatcta
ttgtaaggacaacttgggctgtgtgttcactcttgaaccaagagctgcca
tcagtaggacatggagtcctgaatagcttatgcaaccttgaaggtaagca
tatcatcaatcttcctacagggaagttgtgtcatgaattctcaactctat
ggtctcctaaacataacctaaacaccagtcaacagctcaccatgggtgag
ggaaatataaggccccattcgtatataaagagctataagcaaacaatggt
ttctgagagagggaggatctgtctgctccagagatgagcatcctggaagg
ttatccaatctcaagcagtcagccctaagcatgtctacatacattcaaca
cgaaatggacacaacaggttgtgtgtttatagcaacagtaattaaagaag
gggtcatatatctgcgagggaatgagtgggagaggtaagaggagctgggg
gaggagcgagaagggtggaaatacagtacgcgcataagaaattctgaaaa
gaaaacagaagcgtggttatttcatgagagctttgttttcttaaaaccca
gttatgttatatgaatctgtttgtgttttatcccagtgtgggatgtgaag
ctgcctcagtgtgtcacagttgtactatgattgtctctgctctcgaaggg
acatgattttgtcactgccaatagttatatggaacgctggaagttataat
aacagctccagaggggcaagaatcgctctgggaggagaggag
gaattccagatgacccacccccaactttctacccaaaagatgttgggact
tctgacttggaccctttgtttctatcagtttcacatagccagtattaaag
atgtttttctggtcataatccccaacacaatggcaaagggagctgtggct
gagtcatggtgacaataaacatgttttattaaaactagttcctgcagcca
ggactgacctcagcactcaaggcttctgtttcttttcttgttagacattt
tctccttcaaaatgggttgttttaggcttctacctaaaatgattaaacct
cccatagcagagctctaacatggaatcttgctcatccctgcaacttaatc
tcttaagagtccacccttttatatcatcaaactgaagccatctttccatt
cttggcctataacaaagcaaacctgcatctgtgcaaaaatgaaagtgaat
tctattctctggtgtctgaaatgaaaatgtactggctgttctgacagagg
acctgagttcagttctcagcacccacatggcagctcataaccacctgaaa
ctctagttccatgggatctgacaccctctgctggtttctgcatgtactgc
aagcacatggtacacatacaacatgcaggctaacattcatgcgcataaac
attttttaaagcagtttttctgagactagtggtttgtgctgataattctt
ggcacaaggcaaggattattgcttgagattctgaagcaggaggattgcta
tgaatttgagaccagcctgggctctctggtctgtatagtgaattctagat
cagctaaaactatgcagtgagacattgtctcagagagagagacagagaca
gagagacagagacagacagagacagacagagacagagtaaaagtgatttg
aattccataatcaaatgttattataaatcacttacaagtgacagaccagc
agtggatgggtcaactaatggctggaggaatttgaggaacatgtcataga
gaagaacagttgtggtggaagctagggatttctcctatcagaggagaagg
cagcaacatgattgtccatagtgcaaccatgataaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_127122985_127124146
seq2: B6Ng01-070F18.b_42_1183

seq1  GAATTCAAAGTCAGAAAGAAATGATGGACTTATGAAAATGATTAAGGTTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGTCAGAAAGAAATGATGGACTTATGAAAATGATTAAGGTTC  50

seq1  TCTGCAAGAACAGATCCAGCAGGATGTGGAATGTACACAGTTACAAGAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAAGAACAGATCCAGCAGGATGTGGAATGTACACAGTTACAAGAGA  100

seq1  GGGTTTATTAGATGGGTTGACATTGTCAGAGGCTGGAAAGGCCAATTCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTATTAGATGGGTTGACATTGTCAGAGGCTGGAAAGGCCAATTCAC  150

seq1  ATGTGTTTAAAACAATGTAGAAAATTAGGCTCTTTCAATACATTATCCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTTTAAAACAATGTAGAAAATTAGGCTCTTTCAATACATTATCCAA  200

seq1  GGCAGAAAAGGCTCCCAGTATAGTTAGCTCAGGTGCCCTTACTTAGCTCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGAAAAGGCTCCCAGTATAGTTAGCTCAGGTGCCCTTACTTAGCTCC  250

seq1  CAAGTTTCTTCCATCTCTCTGTTCACAGAAGTATCATCCTCCTTGAAGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTTTCTTCCATCTCTCTGTTCACAGAAGTATCATCCTCCTTGAAGTA  300

seq1  TTTTCATAGGGCTAGGTCTTGACTTGCAAAGAAATAAGATGGGGAAAGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCATAGGGCTAGGTCTTGACTTGCAAAGAAATAAGATGGGGAAAGAG  350

seq1  AAGAAAATGGTTCCTATATCAAAATTCTAAAGACTTTTAATTATTATCTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAAATGGTTCCTATATCAAAATTCTAAAGACTTTTAATTATTATCTA  400

seq1  TTGTAAGGACAACTTGGGCTGTGTGTTCACTCTTGAACCAAGAGCTGCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAAGGACAACTTGGGCTGTGTGTTCACTCTTGAACCAAGAGCTGCCA  450

seq1  TCAGTAGGACATGGAGTCCTGAATAGCTTATGCAACCTTGAAGGTAAGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTAGGACATGGAGTCCTGAATAGCTTATGCAACCTTGAAGGTAAGCA  500

seq1  TATCATCAATCTTCCTACAGGGAAGTTGTGTCATGAATTCTCAACTCTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCATCAATCTTCCTACAGGGAAGTTGTGTCATGAATTCTCAACTCTAT  550

seq1  GGTCTCCTAAACATAACCTAAACACCAGTCAACAGCTCACCATGGGTGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCCTAAACATAACCTAAACACCAGTCAACAGCTCACCATGGGTGAG  600

seq1  GGAAATATAAGGCCCCATTCGTATATAAAGAGCTATAAGCAAACAATGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATATAAGGCCCCATTCGTATATAAAGAGCTATAAGCAAACAATGGT  650

seq1  TTCTGAGAGAGGGAGGATCTGTCTGCTCCAGAGATGAGCATCCTGGAAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAGAGAGGGAGGATCTGTCTGCTCCAGAGATGAGCATCCTGGAAGG  700

seq1  TTATCCAATCTCAAGCAGTCAGCCCTAAGCATGTCTACATACATTCAACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCCAATCTCAAGCAGTCAGCCCTAAGCATGTCTACATACATTCAACA  750

seq1  CGAAATGGACACAACAGGTTGTGTGTTTATAGCAACAGTAATTAAAGAAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAATGGACACAACAGGTTGTGTGTTTATAGCAACAGTAATTAAAGAAG  800

seq1  GGGTCATATATCTGCGAGGGAATGAGTGGGAGAGGTAAGAGGAGCTGGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCATATATCTGCGAGGGAATGAGTGGGAGAGGTAAGAGGAGCTGGGG  850

seq1  GAGGAGCGAGAAGGGTGGAAATACAGTACGCGCATAAGAAATTCTGAAAA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGCGAGAAGGGTGGAAATACAGTACGCGCATAAGAAATTCTGAAAA  900

seq1  GAAAACAGAAGCGTGGTTATTTCATGAGAGCTTTGTTTTCTTTAAAAACC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||
seq2  GAAAACAGAAGCGTGGTTATTTCATGAGAGCTTTGTTTTCTT--AAAACC  948

seq1  CAGTTATGTTATATGAATCTGTTTGTGTTTTAATCCCAGGTGTGGGATGT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
seq2  CAGTTATGTTATATGAATCTGTTTGTGTTTT-ATCCCA-GTGTGGGATGT  996

seq1  GAAGCTGCCTCAGTGTGTCCACAGTTGTTAACTATGATTGTCTCTTGCTC  1050
      |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||
seq2  GAAGCTGCCTCAGTGTGT-CACAGTTGT--ACTATGATTGTCTC-TGCTC  1042

seq1  TCGAAGGGACATGATTTTTGTCAGCTGCAGATAGTTTAATTATGGAAACG  1100
      |||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||    ||||| ||||
seq2  TCGAAGGGACATGA-TTTTGTCA-CTGCCAATAGTT---ATATGG-AACG  1086

seq1  CTGGAGAGGTTATAAATAACAGGGCTCCAAGAGGGGCAAGGAATGCTCT-  1149
      |||  || ||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |  ||||| 
seq2  CTG--GAAGTTAT-AATAACA--GCTCC-AGAGGGGCAAGAATCGCTCTG  1130

seq1  GGAGGAGGAGGAG  1162
      |||||| ||||||
seq2  GGAGGA-GAGGAG  1142

seq1: chr5_127273084_127274173
seq2: B6Ng01-070F18.g_64_1150 (reverse)

seq1  ATTTATCATGGTGGCACTATGGACAAATCATGTTGCTGCCCTCT-CTCTG  49
      |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| 
seq2  ATTTATCATGGTTGCACTATGGAC-AATCATGTTGCTGCCTTCTCCTCT-  48

seq1  GATA-GAGAAATCCCTAGGCTTCCA-CACAACTGTTCCTTCTCTATGACA  97
      |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||
seq2  GATAGGAGAAATCCCTA-GCTTCCACCACAACTGTT-CTTCTCTATGACA  96

seq1  TGTTCCCTCAAATTCCTCCAGCCATTAGTTGACCCATCCACTGCTGGTCT  147
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTT-CCTCAAATTCCTCCAGCCATTAGTTGACCCATCCACTGCTGGTCT  145

seq1  GTCACCTTGTAAGTGATTTATAATAACATTTGATTATGGAATTCAAATCA  197
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCA-CTTGTAAGTGATTTATAATAACATTTGATTATGGAATTCAAATCA  194

seq1  CTTTTACTCTGTCTCTGTCTGTCTCTGTCTGTCTCTGTCTCTCTGTCTCT  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTACTCTGTCTCTGTCTGTCTCTGTCTGTCTCTGTCTCTCTGTCTCT  244

seq1  GTCTCTCTCTCTGAGACAATGTCTCACTGCATAGTTTTAGCTGATCTAGA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTCTCTCTGAGACAATGTCTCACTGCATAGTTTTAGCTGATCTAGA  294

seq1  ATTCACTATACAGACCAGAGAGCCCAGGCTGGTCTCAAATTCATAGCAAT  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACTATACAGACCAGAGAGCCCAGGCTGGTCTCAAATTCATAGCAAT  344

seq1  CCTCCTGCTTCAGAATCTCAAGCAATAATCCTTGCCTTGTGCCAAGAATT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCTGCTTCAGAATCTCAAGCAATAATCCTTGCCTTGTGCCAAGAATT  394

seq1  ATCAGCACAAACCACTAGTCTCAGAAAAACTGCTTTAAAAAATGTTTATG  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGCACAAACCACTAGTCTCAGAAAAACTGCTTTAAAAAATGTTTATG  444

seq1  CGCATGAATGTTAGCCTGCATGTTGTATGTGTACCATGTGCTTGCAGTAC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCATGAATGTTAGCCTGCATGTTGTATGTGTACCATGTGCTTGCAGTAC  494

seq1  ATGCAGAAACCAGCAGAGGGTGTCAGATCCCATGGAACTAGAGTTTCAGG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGAAACCAGCAGAGGGTGTCAGATCCCATGGAACTAGAGTTTCAGG  544

seq1  TGGTTATGAGCTGCCATGTGGGTGCTGAGAACTGAACTCAGGTCCTCTGT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTATGAGCTGCCATGTGGGTGCTGAGAACTGAACTCAGGTCCTCTGT  594

seq1  CAGAACAGCCAGTACATTTTCATTTCAGACACCAGAGAATAGAATTCACT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAACAGCCAGTACATTTTCATTTCAGACACCAGAGAATAGAATTCACT  644

seq1  TTCATTTTTGCACAGATGCAGGTTTGCTTTGTTATAGGCCAAGAATGGAA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTTTTGCACAGATGCAGGTTTGCTTTGTTATAGGCCAAGAATGGAA  694

seq1  AGATGGCTTCAGTTTGATGATATAAAAGGGTGGACTCTTAAGAGATTAAG  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGCTTCAGTTTGATGATATAAAAGGGTGGACTCTTAAGAGATTAAG  744

seq1  TTGCAGGGATGAGCAAGATTCCATGTTAGAGCTCTGCTATGGGAGGTTTA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGGGATGAGCAAGATTCCATGTTAGAGCTCTGCTATGGGAGGTTTA  794

seq1  ATCATTTTAGGTAGAAGCCTAAAACAACCCATTTTGAAGGAGAAAATGTC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTTTAGGTAGAAGCCTAAAACAACCCATTTTGAAGGAGAAAATGTC  844

seq1  TAACAAGAAAAGAAACAGAAGCCTTGAGTGCTGAGGTCAGTCCTGGCTGC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAAGAAAAGAAACAGAAGCCTTGAGTGCTGAGGTCAGTCCTGGCTGC  894

seq1  AGGAACTAGTTTTAATAAAACATGTTTATTGTCACCATGACTCAGCCACA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAACTAGTTTTAATAAAACATGTTTATTGTCACCATGACTCAGCCACA  944

seq1  GCTCCCTTTGCCATTGTGTTGGGGATTATGACCAGAAAAACATCTTTAAT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCCTTTGCCATTGTGTTGGGGATTATGACCAGAAAAACATCTTTAAT  994

seq1  ACTGGCTATGTGAAACTGATAGAAACAAAGGGTCCAAGTCAGAAGTCCCA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGCTATGTGAAACTGATAGAAACAAAGGGTCCAAGTCAGAAGTCCCA  1044

seq1  ACATCTTTTGGGTAGAAAGTTGGGGGTGGGTCATCTGGAATTC  1090
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTTTTGGGTAGAAAGTTGGGGGTGGGTCATCTGGAATTC  1087