BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-071E13
Chromosome5 (Build37)
Map Location 64,069,018 - 64,238,067
singlet/doubletdoublet
Overlap gene3110047P20Rik, LOC100042133, 0610040J01Rik
Upstream geneCentd1
Downstream geneAA536743, LOC100041636, LOC100041646, Pgm1, Tbc1d1, Ppia-ps22, LOC433894, LOC100042198, Klf3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-071E13.bB6Ng01-071E13.g
ACCDH889025DH889026
length1,1721,007
definitionDH889025|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-071E13, 5' end.DH889026|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-071E13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(64,069,018 - 64,070,204)(64,237,386 - 64,238,067)
sequence
gaattctgggttaaaatttgggagatgagtggatggccccatccctcatc
cagtggctattcctagcctctggtatgatctctacaggttctccctcccc
tttgttgggtatttcagctaatgtcaaaggatgacatctttaagaggctt
gttttacttattcattcgttcattcatttttatgtctagcatgcctttga
aacatcacgataacaagtaagttataaaccactgaaatacgttataaatt
atgttctcctcctccacattaagaaccaagttttaacaaaacatttacaa
cagtcactcaacaagtatttattgaaggatttctacatgcaaattaccac
tccacacagctggggactaccattcataacagttctttgtgtatttaaaa
ataactagaagagtataatggttcacagagagaataagtgtttaaataga
tggaaatgatttcagcattagcatcaggaccttggtttcaacacaggtgt
agaaccatcttgctttcccctagaaatgcacagttgctatgtgtcagttt
ttaagtgacaccattaaaacacttggtggtatagaatgtaagtgtgtaga
tggccacgtcactaaatctgtctagctcctaccctcattgtgctcaccat
ctgctgagtggttagattttaatattattgataaatgtagtgagttgtgc
agcacttgtaaagtttttggaagcagtggtaagcacaacaaagagaactg
gaataaaggtaagggcgaatggtgatgggcggttgctgtcccctcccgtt
aggaagtcagagaagtctgtctgatgagatgagattttaatggagaggtt
aacagtgaggaaaagagcaaaccagacaagcaaaagacaagcatttctac
caaggggactagcgaatccaaagctgagttcaagaaccatgtttcagagt
gcagccagggatgttcaatgaacagccagatcaaacagggtagatgatgg
agaggtggggggattttcaaaaatgtatatcctctagggcagaatagcag
ccagccagaaagaatgctatctctatgaacatcaggaagtttaacggtac
attctgtcagatcactgaaatggaaataagatcaggactaggaggtagat
cttgtgaggcccgatgctatct
gaattcattattcagtattcagaggtggtgagctccttcccccttcacat
ttcatgaaatctaggacaaagacataacaatgacatcaaacaaacatttc
tgacctttaaccaaaataagcttattatatgtaggactctagggcaggag
aagaataggttttctaatagatggattttatttatttcattgtgataaga
acacatcctataagatctaacttaacaagctttatgtgctcaacacagat
tgttagtatagtcacaatgcatttacttgtctttaaaacaaaggtttatc
tcacttttatttatatatatgcctatatgcccgtgtatatgtttgtacat
gtgtgagtacaggtacccatgaaggtcagaagaagttgttggatccctgg
agttgtcaggtgccagacatgggtgctaggaaccaaactcaggcctgaag
agcagtgtgtgctctatgccatctctccagctctgcatttatataccttg
tataactatgatgctatatcagtcaaatgtcaccccaacccctcagtccc
ttaacccctagttctcaccactctttatgtatctgtgactttgaggtttc
tgctatctcatgttaaaaaacaaacgaactttgatattccttattttact
tagaacgtcttctgcatccatccatgccatgacaaatggcagggccccct
tctttctcaggctgcacacaccatgtcttccttatctgtttgtctactga
tgagcactctggctgttccctcactcggctattgtgaatgaactgaacac
aggagttcaactgtactactcaggtctgtattcctgttctttaggataga
tccttctaaggcattcttgggtcatgtagcagttctgcttttaattctct
ccgtattgttgcctatctacttttaattctctttgaactgttccctgaca
cagctactcacgagctctgatttccatacttactaactctgtgtagctat
gaccaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_64069018_64070204
seq2: B6Ng01-071E13.b_45_1216

seq1  GAATTCTGGGTTAAAATTTGGGAGATGAGTGGATGGCCCCATCCCTCATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGTTAAAATTTGGGAGATGAGTGGATGGCCCCATCCCTCATC  50

seq1  CAGTGGCTATTCCTAGCCTCTGGTATGATCTCTACAGGTTCTCCCTCCCC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGCTATTCCTAGCCTCTGGTATGATCTCTACAGGTTCTCCCTCCCC  100

seq1  TTTGTTGGGTATTTCAGCTAATGTCAAAGGATGACATCTTTAAGAGGCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTGGGTATTTCAGCTAATGTCAAAGGATGACATCTTTAAGAGGCTT  150

seq1  GTTTTACTTATTCATTCGTTCATTCATTTTTATGTCTAGCATGCCTTTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTACTTATTCATTCGTTCATTCATTTTTATGTCTAGCATGCCTTTGA  200

seq1  AACATCACGATAACAAGTAAGTTATAAACCACTGAAATACGTTATAAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATCACGATAACAAGTAAGTTATAAACCACTGAAATACGTTATAAATT  250

seq1  ATGTTCTCCTCCTCCACATTAAGAACCAAGTTTTAACAAAACATTTACAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCTCCTCCTCCACATTAAGAACCAAGTTTTAACAAAACATTTACAA  300

seq1  CAGTCACTCAACAAGTATTTATTGAAGGATTTCTACATGCAAATTACCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCACTCAACAAGTATTTATTGAAGGATTTCTACATGCAAATTACCAC  350

seq1  TCCACACAGCTGGGGACTACCATTCATAACAGTTCTTTGTGTATTTAAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCACACAGCTGGGGACTACCATTCATAACAGTTCTTTGTGTATTTAAAA  400

seq1  ATAACTAGAAGAGTATAATGGTTCACAGAGAGAATAAGTGTTTAAATAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTAGAAGAGTATAATGGTTCACAGAGAGAATAAGTGTTTAAATAGA  450

seq1  TGGAAATGATTTCAGCATTAGCATCAGGACCTTGGTTTCAACACAGGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAATGATTTCAGCATTAGCATCAGGACCTTGGTTTCAACACAGGTGT  500

seq1  AGAACCATCTTGCTTTCCCCTAGAAATGCACAGTTGCTATGTGTCAGTTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAACCATCTTGCTTTCCCCTAGAAATGCACAGTTGCTATGTGTCAGTTT  550

seq1  TTAAGTGACACCATTAAAACACTTGGTGGTATAGAATGTAAGTGTGTAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTGACACCATTAAAACACTTGGTGGTATAGAATGTAAGTGTGTAGA  600

seq1  TGGCCACGTCACTAAATCTGTCTAGCTCCTACCCTCATTGTGCTCACCAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCACGTCACTAAATCTGTCTAGCTCCTACCCTCATTGTGCTCACCAT  650

seq1  CTGCTGAGTGGTTAGATTTTAATATTATTGATAAATGTAGTGAGTTGTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTGAGTGGTTAGATTTTAATATTATTGATAAATGTAGTGAGTTGTGC  700

seq1  AGCACTTGTAAAGTTTTTGGAAGCAGTGGTAAGCACAACAAAGAGAACTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACTTGTAAAGTTTTTGGAAGCAGTGGTAAGCACAACAAAGAGAACTG  750

seq1  GAATAAAGGTAAGGGCGAATGGTGATGGGCGGTTGCTGTCCCCTCCCGTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAAAGGTAAGGGCGAATGGTGATGGGCGGTTGCTGTCCCCTCCCGTT  800

seq1  AGGAAGTCAGAGAAGGTCTGTCTGATGAGATGAGATTTTAATGGAGAGGT  850
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGTCAGAGAA-GTCTGTCTGATGAGATGAGATTTTAATGGAGAGGT  849

seq1  TAACAGTGAGGAAAAGAGCAAACCAGACAAGCAAAAGACAAGCATTTCTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAGTGAGGAAAAGAGCAAACCAGACAAGCAAAAGACAAGCATTTCTA  899

seq1  CCAAGGGGACTAGCGAATCCAAAGCTGAGTTCAAGAACCATGTTTCAGAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGGGGACTAGCGAATCCAAAGCTGAGTTCAAGAACCATGTTTCAGAG  949

seq1  TGCAGCCAGGGATGTTCAATGAACAGCCAGATCAAACAGGGTAGATGATG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGCCAGGGATGTTCAATGAACAGCCAGATCAAACAGGGTAGATGATG  999

seq1  GAGAGGT-GGGTGATTTTCAAAAAATGTAATATCCTCTAAGGGCAG-ATA  1048
      ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||
seq2  GAGAGGTGGGGGGATTTTC-AAAAATGT-ATATCCTCT-AGGGCAGAATA  1046

seq1  GCAGCCAGCCAGAAGAGATGCTATCTCTATGAACATCCAGGAAGTTCTAT  1098
      ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| || 
seq2  GCAGCCAGCCAGAAAGAATGCTATCTCTATGAACAT-CAGGAAGTT-TAA  1094

seq1  CTGTACATGTCTGTCAGGTATCAGCTGAGATAGGAAATAAGATCAAGGGA  1148
      | |||||| ||||||||  |||| |||| || |||||||||||||  |||
seq2  CGGTACAT-TCTGTCAG--ATCA-CTGAAAT-GGAAATAAGATCA--GGA  1137

seq1  CTAGGGGAGGGTAGATCATGTGAGGCCAGGATGCTATCT  1187
      |||||    |||||||| |||||||||  ||||||||||
seq2  CTAGG---AGGTAGATCTTGTGAGGCC-CGATGCTATCT  1172

seq1: chr5_64237386_64238067
seq2: B6Ng01-071E13.g_64_745 (reverse)

seq1  TCATGGCATGGATGGATGCAGAAGACGTTCTAAGTAAAATAAGGAATATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGGCATGGATGGATGCAGAAGACGTTCTAAGTAAAATAAGGAATATC  50

seq1  AAAGTTCGTTTGTTTTTTAACATGAGATAGCAGAAACCTCAAAGTCACAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTCGTTTGTTTTTTAACATGAGATAGCAGAAACCTCAAAGTCACAG  100

seq1  ATACATAAAGAGTGGTGAGAACTAGGGGTTAAGGGACTGAGGGGTTGGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATAAAGAGTGGTGAGAACTAGGGGTTAAGGGACTGAGGGGTTGGGG  150

seq1  TGACATTTGACTGATATAGCATCATAGTTATACAAGGTATATAAATGCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACATTTGACTGATATAGCATCATAGTTATACAAGGTATATAAATGCAG  200

seq1  AGCTGGAGAGATGGCATAGAGCACACACTGCTCTTCAGGCCTGAGTTTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGAGAGATGGCATAGAGCACACACTGCTCTTCAGGCCTGAGTTTGG  250

seq1  TTCCTAGCACCCATGTCTGGCACCTGACAACTCCAGGGATCCAACAACTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTAGCACCCATGTCTGGCACCTGACAACTCCAGGGATCCAACAACTT  300

seq1  CTTCTGACCTTCATGGGTACCTGTACTCACACATGTACAAACATATACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGACCTTCATGGGTACCTGTACTCACACATGTACAAACATATACAC  350

seq1  GGGCATATAGGCATATATATAAATAAAAGTGAGATAAACCTTTGTTTTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCATATAGGCATATATATAAATAAAAGTGAGATAAACCTTTGTTTTAA  400

seq1  AGACAAGTAAATGCATTGTGACTATACTAACAATCTGTGTTGAGCACATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAAGTAAATGCATTGTGACTATACTAACAATCTGTGTTGAGCACATA  450

seq1  AAGCTTGTTAAGTTAGATCTTATAGGATGTGTTCTTATCACAATGAAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTTGTTAAGTTAGATCTTATAGGATGTGTTCTTATCACAATGAAATA  500

seq1  AATAAAATCCATCTATTAGAAAACCTATTCTTCTCCTGCCCTAGAGTCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAAATCCATCTATTAGAAAACCTATTCTTCTCCTGCCCTAGAGTCCT  550

seq1  ACATATAATAAGCTTATTTTGGTTAAAGGTCAGAAATGTTTGTTTGATGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATATAATAAGCTTATTTTGGTTAAAGGTCAGAAATGTTTGTTTGATGT  600

seq1  CATTGTTATGTCTTTGTCCTAGATTTCATGAAATGTGAAGGGGGAAGGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTTATGTCTTTGTCCTAGATTTCATGAAATGTGAAGGGGGAAGGAG  650

seq1  CTCACCACCTCTGAATACTGAATAATGAATTC  682
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCACCTCTGAATACTGAATAATGAATTC  682