BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-091C02
Chromosome5 (Build37)
Map Location 69,499,034 - 69,672,849
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKctd8
Upstream geneAY616753, LOC666996
Downstream geneLOC545756, Yipf7, Guf1, Gnpda2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-091C02.bB6Ng01-091C02.g
ACCDH903245DH903246
length1,1631,123
definitionDH903245|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091C02, 5' end.DH903246|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091C02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,671,679 - 69,672,849)(69,499,034 - 69,500,158)
sequence
gaattcaagtataaatcaactgagtcagacacggttactctgtaattgca
ctgaggcaatctcaagctgccttagaacaccgtggctcctggctcatgga
gttcagactcagatctggatagattccactgacatcttggttatcatgaa
ctaacattcaatttcactttggctttcctgttcctttatcagacaactcg
acacaggcttttgtggctttcatatgtttgaacctggctgaggtgaatgt
ggtcataaagtattttcactgcaaaagcaagaggaccggatctggatctc
cactatgtacgtagaactctggctttgtggtgcaagactggaaaccttgc
actgggcatatgcattgctgggacaaatggactcattggccagctaatcc
agtctagctaaaatagcaattaaactctgagtacagggagagaaactttc
tcaaaataataaggtggagagtgatagaggatagtagtgccagacattaa
cttttggcttcaacatttgcattcataggcctgtacacacttatacaaca
cacgcacatgcacatgcacacacacatgtgcacacacacacactgtgaac
aaaactcacataatatctgaccatccagggttttctgggaaatgctaaca
cagtggacaatcctgtcagttggctaacttgacattcacgcgctgcactg
ctgacagtctcagaaattgaacctagaaaagaaacattccaaacttctct
tccaaatgcagctggccatgcaactcagttgtagcttatgtgattgaaat
acacgagagagagagagagagacaagacttcttggaagtttttgcttttc
ctataaaggggaatggtaattaagattcctgacaaccattccatttcttt
ttgtactttaaaataaaacatgattcttaagctgtgatttttttttcaac
tagaagaatgcagcagaatacaatgcaaggaaaatccttctaagatctca
gaacagaaatccggaacatctgtctggtagcatcatgagcattctagcag
tagcagtgtgagcaggtgttgtgtgaaggagtcttcatgttgataacact
taacctctgactggctaaggtctcaatttgtaatgaagacagggtaatat
gtcttctattatt
gaattctttctattagaattctacttgagctagttcattaagaaacacac
agagggtgcaaggaagttttcaatcatagtgcttaccatttgtttctgga
ctttgttttatagggaatcactgtggatcttacaatgtgtttttggtcag
ctggcttctacttatgttgaaagaggaagttatatggaggaaattagaat
gtagaaggaaattatgaggtgagtaatttcccctctgtctttgctagggt
tctttctttagaagtgagtgtgattcattaaaggatatagttcttattaa
tttgcttgtcactctatattttaaatttactatttgatagtgatagctac
ttaattctataggataaccatttttgtttggttttctttccagatcaatg
aaaaatagccaaacatttatataaattatattctagagaacttattgtaa
ttttgattgtgtgtgtgtgtactctctgtatgtatacttatgtgagtagg
cacatagagaataggtatgtatggaagccaaagctttatattagatatct
cactcagctttctccatcatgtgtattgaagagatcactctcacctgagc
ccagatgttttagaatcagcttgcttaactagctagcttgatccttccta
ggtgtctcgatctgaactctgaccatcatgtttgcacaacaagctcttta
cctactgagccagctcctcaaccctctgaaatcatccttataacactgta
acacttttattacccatcaaatacataaaggttaagtgaaagatattgga
tgggaagcctggatacctgagagtctccatacctgacctccatgcatgtt
ttgcatgtatatcaaaccacactgaaaactgccaacttcctgaaattata
agcagaaattgagagaagagacattcccaaatcttgacagctaactgaaa
gttaatcatgtcttagtgtcttttttggtactgggtagatactactttaa
ataattgtactatgaaaatcaaatactacccagaaataaatgcatttttt
ttttaagtttcaaatgatggggtttttattctctgtctgcttgaaagaga
tacgttgcagatacccccactcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_69671679_69672849
seq2: B6Ng01-091C02.b_43_1205 (reverse)

seq1  AATAATAGAAGACATTATTACCTTGTC-TCATTACAAATCTGAGACTTTA  49
      |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||
seq2  AATAATAGAAGACA-TATTACCCTGTCTTCATTACAAAT-TGAGACCTTA  48

seq1  GCAAGTCAGAG--TTAGTGTTATCAACATGAAGACTCTCTTCACAC-ACA  96
      || ||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||
seq2  GCCAGTCAGAGGTTAAGTGTTATCAACATGAAGACTC-CTTCACACAACA  97

seq1  CCTGCTCACACTGCTACTGCTTAGATGCTCATGATGCTACCAGGAACAGG  146
      |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||| |
seq2  CCTGCTCACACTGCTACTGCTAGAATGCTCATGATGCTACCAG--ACA-G  144

seq1  ATGTTCCCGGATTTTCTGTTCTGAGATCTTAAGAAGGATTTTTCCTTGCA  196
      ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
seq2  ATGTT-CCGGA-TTTCTGTTCTGAGATCTT-AGAAGGA-TTTTCCTTGCA  190

seq1  TTGTATTCTGCTTGCATTCTTCTAGTTGAAAAAAAAAATCACAGCTTAAG  246
      ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATTCTGC-TGCATTCTTCTAGTTG-AAAAAAAAATCACAGCTTAAG  238

seq1  AATCATGTTTTATTTTAAAGTACAAAAAGAAATGGAATGGTTGTCAGGAA  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCATGTTTTATTTTAAAGTACAAAAAGAAATGGAATGGTTGTCAGGAA  288

seq1  TCTTAATTACCATTCCCCTTTATAGGAAAAGCAAAAACTTCCAAGAAGTC  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAATTACCATTCCCCTTTATAGGAAAAGCAAAAACTTCCAAGAAGTC  338

seq1  TTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGTATTTCAATCACATAAGCTACAACTG  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTGTATTTCAATCACATAAGCTACAACTG  388

seq1  AGTTGCATGGCCAGCTGCATTTGGAAGAGAAGTTTGGAATGTTTCTTTTC  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGCATGGCCAGCTGCATTTGGAAGAGAAGTTTGGAATGTTTCTTTTC  438

seq1  TAGGTTCAATTTCTGAGACTGTCAGCAGTGCAGCGCGTGAATGTCAAGTT  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGTTCAATTTCTGAGACTGTCAGCAGTGCAGCGCGTGAATGTCAAGTT  488

seq1  AGCCAACTGACAGGATTGTCCACTGTGTTAGCATTTCCCAGAAAACCCTG  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAACTGACAGGATTGTCCACTGTGTTAGCATTTCCCAGAAAACCCTG  538

seq1  GATGGTCAGATATTATGTGAGTTTTGTTCACAGTGTGTGTGTGTGCACAT  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTCAGATATTATGTGAGTTTTGTTCACAGTGTGTGTGTGTGCACAT  588

seq1  GTGTGTGTGCATGTGCATGTGCGTGTGTTGTATAAGTGTGTACAGGCCTA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGCATGTGCATGTGCGTGTGTTGTATAAGTGTGTACAGGCCTA  638

seq1  TGAATGCAAATGTTGAAGCCAAAAGTTAATGTCTGGCACTACTATCCTCT  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATGCAAATGTTGAAGCCAAAAGTTAATGTCTGGCACTACTATCCTCT  688

seq1  ATCACTCTCCACCTTATTATTTTGAGAAAGTTTCTCTCCCTGTACTCAGA  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACTCTCCACCTTATTATTTTGAGAAAGTTTCTCTCCCTGTACTCAGA  738

seq1  GTTTAATTGCTATTTTAGCTAGACTGGATTAGCTGGCCAATGAGTCCATT  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAATTGCTATTTTAGCTAGACTGGATTAGCTGGCCAATGAGTCCATT  788

seq1  TGTCCCAGCAATGCATATGCCCAGTGCAAGGTTTCCAGTCTTGCACCACA  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCAGCAATGCATATGCCCAGTGCAAGGTTTCCAGTCTTGCACCACA  838

seq1  AAGCCAGAGTTCTACGTACATAGTGGAGATCCAGATCCGGTCCTCTTGCT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCAGAGTTCTACGTACATAGTGGAGATCCAGATCCGGTCCTCTTGCT  888

seq1  TTTGCAGTGAAAATACTTTATGACCACATTCACCTCAGCCAGGTTCAAAC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCAGTGAAAATACTTTATGACCACATTCACCTCAGCCAGGTTCAAAC  938

seq1  ATATGAAAGCCACAAAAGCCTGTGTCGAGTTGTCTGATAAAGGAACAGGA  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGAAAGCCACAAAAGCCTGTGTCGAGTTGTCTGATAAAGGAACAGGA  988

seq1  AAGCCAAAGTGAAATTGAATGTTAGTTCATGATAACCAAGATGTCAGTGG  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCAAAGTGAAATTGAATGTTAGTTCATGATAACCAAGATGTCAGTGG  1038

seq1  AATCTATCCAGATCTGAGTCTGAACTCCATGAGCCAGGAGCCACGGTGTT  1096
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTATCCAGATCTGAGTCTGAACTCCATGAGCCAGGAGCCACGGTGTT  1088

seq1  CTAAGGCAGCTTGAGATTGCCTCAGTGCAATTACAGAGTAACCGTGTCTG  1146
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGCAGCTTGAGATTGCCTCAGTGCAATTACAGAGTAACCGTGTCTG  1138

seq1  ACTCAGTTGATTTATACTTGAATTC  1171
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGTTGATTTATACTTGAATTC  1163

seq1: chr5_69499034_69500158
seq2: B6Ng01-091C02.g_67_1189

seq1  GAATTCTTTCTATTAGAATTCTACTTGAGCTAGTTCATTAAGAAACACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCTATTAGAATTCTACTTGAGCTAGTTCATTAAGAAACACAC  50

seq1  AGAGGGTGCAAGGAAGTTTTCAATCATAGTGCTTACCATTTGTTTCTGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGTGCAAGGAAGTTTTCAATCATAGTGCTTACCATTTGTTTCTGGA  100

seq1  CTTTGTTTTATAGGGAATCACTGTGGATCTTACAATGTGTTTTTGGTCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTTTTATAGGGAATCACTGTGGATCTTACAATGTGTTTTTGGTCAG  150

seq1  CTGGCTTCTACTTATGTTGAAAGAGGAAGTTATATGGAGGAAATTAGAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCTTCTACTTATGTTGAAAGAGGAAGTTATATGGAGGAAATTAGAAT  200

seq1  GTAGAAGGAAATTATGAGGTGAGTAATTTCCCCTCTGTCTTTGCTAGGGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGAAGGAAATTATGAGGTGAGTAATTTCCCCTCTGTCTTTGCTAGGGT  250

seq1  TCTTTCTTTAGAAGTGAGTGTGATTCATTAAAGGATATAGTTCTTATTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCTTTAGAAGTGAGTGTGATTCATTAAAGGATATAGTTCTTATTAA  300

seq1  TTTGCTTGTCACTCTATATTTTAAATTTACTATTTGATAGTGATAGCTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTTGTCACTCTATATTTTAAATTTACTATTTGATAGTGATAGCTAC  350

seq1  TTAATTCTATAGGATAACCATTTTTGTTTGGTTTTCTTTCCAGATCAATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTCTATAGGATAACCATTTTTGTTTGGTTTTCTTTCCAGATCAATG  400

seq1  AAAAATAGCCAAACATTTATATAAATTATATTCTAGAGAACTTATTGTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATAGCCAAACATTTATATAAATTATATTCTAGAGAACTTATTGTAA  450

seq1  TTTTGATTGTGTGTGTGTGTACTCTCTGTATGTATACTTATGTGAGTAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGATTGTGTGTGTGTGTACTCTCTGTATGTATACTTATGTGAGTAGG  500

seq1  CACATAGAGAATAGGTATGTATGGAAGCCAAAGCTTTATATTAGATATCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATAGAGAATAGGTATGTATGGAAGCCAAAGCTTTATATTAGATATCT  550

seq1  CACTCAGCTTTCTCCATCATGTGTATTGAAGAGATCACTCTCACCTGAGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCAGCTTTCTCCATCATGTGTATTGAAGAGATCACTCTCACCTGAGC  600

seq1  CCAGATGTTTTAGAATCAGCTTGCTTAACTAGCTAGCTTGATCCTTCCTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATGTTTTAGAATCAGCTTGCTTAACTAGCTAGCTTGATCCTTCCTA  650

seq1  GGTGTCTCGATCTGAACTCTGACCATCATGTTTGCACAACAAGCTCTTTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGTCTCGATCTGAACTCTGACCATCATGTTTGCACAACAAGCTCTTTA  700

seq1  CCTACTGAGCCAGCTCCTCAACCCTCTGAAATCATCCTTATAACACTGTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACTGAGCCAGCTCCTCAACCCTCTGAAATCATCCTTATAACACTGTA  750

seq1  ACACTTTTATTACCCATCAAATACATAAAGGTTAAGTGAAAGATATTGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTTTTATTACCCATCAAATACATAAAGGTTAAGTGAAAGATATTGGA  800

seq1  TGGGAAGCCTGGATACCTGAGAGTCTCCATACCTGACCTCCATGCATGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAAGCCTGGATACCTGAGAGTCTCCATACCTGACCTCCATGCATGTT  850

seq1  TTGCATGTATATCAAACCACACTGAAAACTGCCAACTTCCTGAAATTATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCATGTATATCAAACCACACTGAAAACTGCCAACTTCCTGAAATTATA  900

seq1  AGCAGAAATTGAGAGAAGAGACATTCCCAAATCTTGACAGCTAACTGAAA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGAAATTGAGAGAAGAGACATTCCCAAATCTTGACAGCTAACTGAAA  950

seq1  GTTAATCATGTCTTAGGTGTCTTTTTTGGTACTGGGTAGATACTACTTTA  1000
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAATCATGTCTTA-GTGTCTTTTTTGGTACTGGGTAGATACTACTTTA  999

seq1  TATAATTGTACTATGAAAATCAAATACTACCCAGAAATAAATGCATTTTT  1050
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATTGTACTATGAAAATCAAATACTACCCAGAAATAAATGCATTTTT  1049

seq1  TTTTTAAGTTTCAAATGATGGTGTTTATATTCTCTGTCTGCTTGAATAGA  1100
      ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||
seq2  TTTTTAAGTTTCAAATGATGGGGTTTTTATTCTCTGTCTGCTTGAA-AGA  1098

seq1  G-TACGTTGCAAGTACCACCCACTCC  1125
      | |||||||||  |||| ||||||||
seq2  GATACGTTGCAGATACC-CCCACTCC  1123