BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-091O20
Chromosome5 (Build37)
Map Location 74,238,484 - 74,368,822
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneTec, Slain2, Slc10a4, LOC667127, Fryl, Ociad1, Ociad2, LOC667154, LOC100042205, C130090K23Rik, LOC627733, Dcun1d4, BC031901, Sgcb, Spata18
Downstream geneUsp46, 2700023E23Rik, Rasl11b, Scfd2, Fip1l1, Lnx1, EG619945
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-091O20.bB6Ng01-091O20.g
ACCDH903826DH903827
length1,1221,042
definitionDH903826|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091O20, 5' end.DH903827|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091O20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,367,679 - 74,368,822)(74,238,484 - 74,239,522)
sequence
gaattctttcttctcaagtttcctaagcccgagagaggcttgaaagtcga
tagtgtagttttccactattgccctttcgacagggtctagaatttccagt
gggtctaattgtgaaacttgccttcttgatttgtagttgttttgtaatcg
ttgccaaagacacaccatagacattgtaaatgaaacaaaatttactcccc
agcccttttttttgcgtgcctatttttgagataaaaagaatacatctaaa
agttgtaagttggggtttagaaagaaggctcattggactcccgattcaaa
gccctcagtgacatctttcttcactttaactttaaggtctcttacataat
tttgtttgtcagataacctttgtgctattatagtctgaaacactgagaga
agccaaaggcaccattatcagtctagaatttaaacagactgtgctcaagg
caatgggtaaccaacctgactgcatctcagaatagtgggaggcttttacc
attaccgccaccagcagcagcagcaaacttcccataaccaccactacaat
caccaccaattccaacactgcctataatactatcaacatcaacaataatc
aacatcaccaacatcattaataccaccaacaccagccacaacaccacaaa
caccaataccaccgttgccaacaattaccattaccaagaatatcaacata
accagtatcactaacgccaacagccctgccaacactaatgccaccaccac
caccatcaccacagtatcactgtctctcaacatctcctggaccccagatg
cacttggctggagttttggcatgttcattcatgataatttattataacaa
tggagacaagttattatgaaattgataataatcacaacaatgatgtgata
tataacacttacattggtgatgatcttaatgatacctaggaaattagcgt
tatgtactagatcattatataaactagtgcaattctgttaatgtgcataa
ataaacatagtctttctttcattcccaggtatcctctatgttcagacatg
ttcacaacagagatctcgacagcaccacatgtctgagacagccatctcat
tctttctgctctgacttcttgc
gaattcatctccctttactgtctttgcaaacagcaggataagcaagtaga
ggggagtgtggatattcctgggctcatttcatccacgcatcttgtgcagc
ttacatttcaaaatgattggaacaaatgatgctctcagaaccccaccccc
tcctcttgtatatgggggaacatacatgcttggtggaggaacatacatgt
ggagatcagaggaccacagatctctcactggctcagaactttgcccgtag
gccaagtcagctgattccccagctggtccctgtcctctgcctctcatcgt
gctatcactgggtctgtatgctcatgacacgatgcccacctttttacata
gatctaggtaagtgaagagaggagagagagagagagagagagagagagag
agagagagaacatgagccattgcagtatcagctctttgatggtttattgt
tcttgttttattcaagcttatagctctaattctaatcataatctagcctt
aatatttctaattctagcatatattgggcacccataaaatgtttagttca
attactttttttactcattcttctaaccgatagaaattatgatgtgtcca
gcaccaacaatcatttgatcaatgtataaagaaatcagaaagtgattctg
ataaaaccataaactttgtggtcccatcattttatgctcttatattttca
tactccacaatatatagtaatatacagaaatccctgccagccctcatagt
tggtagcagtcagtatcgttaatgtcaagggaaaacccctttccaagcaa
cagtgagcacacctagcttccgtggttattaatgattcacccaagtgcct
ttctgaatttgcaaatatttgtgtattcttataagttcagctaagccttg
actcgatacctgcttgaggtttatatgtcatttcttactaactccttcac
acaatcctataagacctatctaaccaccattccaactctatcaaaggacc
tgagatgcagaatagctaaagttgccagggttcaccagctca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_74367679_74368822
seq2: B6Ng01-091O20.b_47_1168 (reverse)

seq1  GCAAGAAAGTCAGAGCCAGAAAGAATGGAAGATGGCTTGGGCTCAGACAT  50
      ||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||  | |||||||||
seq2  GCAAG-AAGTCAGAG-CAGAAAGAATG--AGATGGCT--GTCTCAGACAT  44

seq1  TGGTGGTGGCTGTCGAGGGATCCTTCTGTTGTTGACATGTCTTGAACATA  100
        ||||| ||||||||  ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||
seq2  --GTGGT-GCTGTCGA--GATC--TCTGTTGTGAACATGTC-TGAACATA  86

seq1  GAGGGATAACCCTGGGGAATGAAAGAAAGACTATGTTTTATTTATGCACA  150
      || |||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GA-GGATA--CCT-GGGAATGAAAGAAAGACTATG-TTTATTTATGCACA  131

seq1  TTAACAGAATTGCACTAGTTTATTATAATTGATCTAGTAACATAACGCTA  200
      |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  TTAACAGAATTGCACTAGTTTA-TATAA-TGATCTAGT-ACATAACGCTA  178

seq1  ATTTCCTAGGTATCATTAAGATCATCACCAATGTAAGTGTTATATATCAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTCCTAGGTATCATTAAGATCATCACCAATGTAAGTGTTATATATCAC  228

seq1  ATCATTGTTGTGATTATTATCAATTTCATAATAACTTGTCTCCATTGTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTGTTGTGATTATTATCAATTTCATAATAACTTGTCTCCATTGTTA  278

seq1  TAATAAATTATCATGAATGAACATGCCAAAACTCCAGCCAAGTGCATCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATAAATTATCATGAATGAACATGCCAAAACTCCAGCCAAGTGCATCTG  328

seq1  GGGTCCAGGAGATGTTGAGAGACAGTGATACTGTGGTGATGGTGGTGGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTCCAGGAGATGTTGAGAGACAGTGATACTGTGGTGATGGTGGTGGTG  378

seq1  GTGGCATTAGTGTTGGCAGGGCTGTTGGCGTTAGTGATACTGGTTATGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCATTAGTGTTGGCAGGGCTGTTGGCGTTAGTGATACTGGTTATGTT  428

seq1  GATATTCTTGGTAATGGTAATTGTTGGCAACGGTGGTATTGGTGTTTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTCTTGGTAATGGTAATTGTTGGCAACGGTGGTATTGGTGTTTGTG  478

seq1  GTGTTGTGGCTGGTGTTGGTGGTATTAATGATGTTGGTGATGTTGATTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTGTGGCTGGTGTTGGTGGTATTAATGATGTTGGTGATGTTGATTAT  528

seq1  TGTTGATGTTGATAGTATTATAGGCAGTGTTGGAATTGGTGGTGATTGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGATGTTGATAGTATTATAGGCAGTGTTGGAATTGGTGGTGATTGTA  578

seq1  GTGGTGGTTATGGGAAGTTTGCTGCTGCTGCTGGTGGCGGTAATGGTAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTGGTTATGGGAAGTTTGCTGCTGCTGCTGGTGGCGGTAATGGTAAA  628

seq1  AGCCTCCCACTATTCTGAGATGCAGTCAGGTTGGTTACCCATTGCCTTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCCCACTATTCTGAGATGCAGTCAGGTTGGTTACCCATTGCCTTGA  678

seq1  GCACAGTCTGTTTAAATTCTAGACTGATAATGGTGCCTTTGGCTTCTCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGTCTGTTTAAATTCTAGACTGATAATGGTGCCTTTGGCTTCTCTC  728

seq1  AGTGTTTCAGACTATAATAGCACAAAGGTTATCTGACAAACAAAATTATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTCAGACTATAATAGCACAAAGGTTATCTGACAAACAAAATTATG  778

seq1  TAAGAGACCTTAAAGTTAAAGTGAAGAAAGATGTCACTGAGGGCTTTGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAGACCTTAAAGTTAAAGTGAAGAAAGATGTCACTGAGGGCTTTGAA  828

seq1  TCGGGAGTCCAATGAGCCTTCTTTCTAAACCCCAACTTACAACTTTTAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGGGAGTCCAATGAGCCTTCTTTCTAAACCCCAACTTACAACTTTTAGA  878

seq1  TGTATTCTTTTTATCTCAAAAATAGGCACGCAAAAAAAAGGGCTGGGGAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATTCTTTTTATCTCAAAAATAGGCACGCAAAAAAAAGGGCTGGGGAG  928

seq1  TAAATTTTGTTTCATTTACAATGTCTATGGTGTGTCTTTGGCAACGATTA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTTTGTTTCATTTACAATGTCTATGGTGTGTCTTTGGCAACGATTA  978

seq1  CAAAACAACTACAAATCAAGAAGGCAAGTTTCACAATTAGACCCACTGGA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACAACTACAAATCAAGAAGGCAAGTTTCACAATTAGACCCACTGGA  1028

seq1  AATTCTAGACCCTGTCGAAAGGGCAATAGTGGAAAACTACACTATCGACT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTAGACCCTGTCGAAAGGGCAATAGTGGAAAACTACACTATCGACT  1078

seq1  TTCAAGCCTCTCTCGGGCTTAGGAAACTTGAGAAGAAAGAATTC  1144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAGCCTCTCTCGGGCTTAGGAAACTTGAGAAGAAAGAATTC  1122

seq1: chr5_74238484_74239522
seq2: B6Ng01-091O20.g_68_1109

seq1  GAATTCATCTCCCTTTACTGTCTTTGCAAACAGCAGGATAAGCAAGTAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCTCCCTTTACTGTCTTTGCAAACAGCAGGATAAGCAAGTAGA  50

seq1  GGGGAGTGTGGATATTCCTGGGCTCATTTCATCCACGCATCTTGTGCAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAGTGTGGATATTCCTGGGCTCATTTCATCCACGCATCTTGTGCAGC  100

seq1  TTACATTTCAAAATGATTGGAACAAATGATGCTCTCAGAACCCCACCCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATTTCAAAATGATTGGAACAAATGATGCTCTCAGAACCCCACCCCC  150

seq1  TCCTCTTGTATATGGGGGAACATACATGCTTGGTGGAGGAACATACATGT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTTGTATATGGGGGAACATACATGCTTGGTGGAGGAACATACATGT  200

seq1  GGAGATCAGAGGACCACAGATCTCTCACTGGCTCAGAACTTTGCCCGTAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGATCAGAGGACCACAGATCTCTCACTGGCTCAGAACTTTGCCCGTAG  250

seq1  GCCAAGTCAGCTGATTCCCCAGCTGGTCCCTGTCCTCTGCCTCTCATCGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAAGTCAGCTGATTCCCCAGCTGGTCCCTGTCCTCTGCCTCTCATCGT  300

seq1  GCTATCACTGGGTCTGTATGCTCATGACACGATGCCCACCTTTTTACATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATCACTGGGTCTGTATGCTCATGACACGATGCCCACCTTTTTACATA  350

seq1  GATCTAGGTAAGTGAAGAGAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTAGGTAAGTGAAGAGAGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG  400

seq1  AGAGAGAGAACATGAGCCATTGCAGTATCAGCTCTTTGATGGTTTATTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGAGAACATGAGCCATTGCAGTATCAGCTCTTTGATGGTTTATTGT  450

seq1  TCTTGTTTTATTCAAGCTTATAGCTCTAATTCTAATCATAATCTAGCCTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGTTTTATTCAAGCTTATAGCTCTAATTCTAATCATAATCTAGCCTT  500

seq1  AATATTTCTAATTCTAGCATATATTGGGCACCCATAAAATGTTTAGTTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATTTCTAATTCTAGCATATATTGGGCACCCATAAAATGTTTAGTTCA  550

seq1  ATTACTTTTTTTACTCATTCTTCTAACCGATAGAAATTATGATGTGTCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACTTTTTTTACTCATTCTTCTAACCGATAGAAATTATGATGTGTCCA  600

seq1  GCACCAACAATCATTTGATCAATGTATAAAGAAATCAGAAAGTGATTCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCAACAATCATTTGATCAATGTATAAAGAAATCAGAAAGTGATTCTG  650

seq1  AT-AAACCATAAACTTTGTGGTCCCATCATTTTATGCTCTTATA-TTTCA  698
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  ATAAAACCATAAACTTTGTGGTCCCATCATTTTATGCTCTTATATTTTCA  700

seq1  TACTCCACAATATATAGTAATATACAGAAATCCCTGCCAGCCCTCATAGT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCCACAATATATAGTAATATACAGAAATCCCTGCCAGCCCTCATAGT  750

seq1  TGGTAGCAGTCAGTATCGTTAATGTCAAGGGAAAACCCCTTTCCAAGCAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAGCAGTCAGTATCGTTAATGTCAAGGGAAAACCCCTTTCCAAGCAA  800

seq1  CAGTGAGCACACCTAGC-TCCGTGGTTATTAATGATTCACCCAAGTG-CT  846
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CAGTGAGCACACCTAGCTTCCGTGGTTATTAATGATTCACCCAAGTGCCT  850

seq1  TTCTGAATTTGCAAATATTTGTGTATTCTTATAAGTTCAGCTAAGCCTTG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGAATTTGCAAATATTTGTGTATTCTTATAAGTTCAGCTAAGCCTTG  900

seq1  ACTCGATAACTGCTTGAGGTTTATATGTCATTTCTTACTAACTCC-TCAC  945
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  ACTCGATACCTGCTTGAGGTTTATATGTCATTTCTTACTAACTCCTTCAC  950

seq1  AACAATCCTATAAGACCTATCTAACCACCATCCCAAACTCTAGCAGAGGA  995
       |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||
seq2  -ACAATCCTATAAGACCTATCTAACCACCATTCC-AACTCTATCAAAGGA  998

seq1  ACTGAGATGCAG-AGAGCTAAAGTTGCCCAGGGTTGCACAGCTCA  1039
       ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||   |||||||
seq2  CCTGAGATGCAGAATAGCTAAAGTTG-CCAGGGTTCACCAGCTCA  1042