BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-095G05
Chromosome5 (Build37)
Map Location 37,474,482 - 37,601,421
singlet/doubletdoublet
Overlap geneJakmip1, EG330070, Gm1043
Upstream geneSorcs2, 2310020A21Rik, Grpel1, Ccdc96, Tbc1d14, D5Ertd579e, LOC100040278, LOC100040825, Cno, Mrfap1, Man2b2, Ppp2r2c, Wfs1
Downstream geneLOC100040936, Crmp1, Evc, Evc2, LOC100040355, LOC100040988, Stk32b, Cytl1, Msx1, Stx18, Nsg1, LOC100040397, Zfp509
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-095G05.bB6Ng01-095G05.g
ACCDH906345DH906346
length1,123763
definitionDH906345|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095G05, 5' end.DH906346|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095G05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,600,281 - 37,601,421)(37,474,482 - 37,475,243)
sequence
gaattctgtggagctcattaagtcagaaataaaactcggtcacaaaaggc
cctgggacagtgttcatgtttcttccactaaatgtgcatcatgggagggt
cctaaaccaatgaagcaagggcacgcaacacttaagagcaaaggtgaaac
cagtgaaccaagttctctgtgggcacacatacgcatctctatgcatacat
acactcatgcatatgacagctaccagcctgacagctatgacaggcagctg
cagctgggctctgggtctccagagagcacgtgggggagatgacaaatcac
ctttgttgctcacgaagtgttttatggaggcaggagcaggtccttgaagg
ggcacagatggggactgaaagatggaggcttccctgggaatgtacaggaa
gagctgtggggacaaatgttcctacacgctgcatccttggaccatcagcc
ttacaggggatagctatgatcagtgattccgaagtgcagacatgacaccc
ccagaagcccatctaagtcaacatggcagatgttttgaaagctgctttgc
ctttttccgccatgcgagtgtgaggtgcccctttgagacacttgaggaaa
cagattgaagcaaacactaactctgccctcccagggctgtgtgtgaacag
agctgggattgtaaagctgcaggaggctctgtgcttgacatcctaccttt
cccccagtgttgtcttcccaaaggctgttatccacagctccttcctcaca
cccagagacagtgctcgggccacacagctcccagagctcaggacacatga
gacagtgcttcatgattgcgctgtatcattgttggattaatacaattgga
tgtctttccaattcctaataggtttttttttttttattacaactcagacc
attgtaatttgtccaattagttacatctgtgtctcagaccagagccacaa
agggtgctattactgtcagcaaacaaagaccttgcatgatggacagcaga
ttggagcttgagctgtgtgaagcattgccaagtctggcccaactagaagc
atttggtgtgagggaagtgcctgatagggagagtcacagcaagcatcagc
aagacttctggacgaggatgtgg
gaattcttatcattgtttttctgtagctgagctatttcttcttggccttg
ttttaggattttcttttccttcatctttggtcagctgcagcttgctgtgt
gatatactcacgtgcaagtacaatgtgtgtacctatggttgggcgtctgc
ggttagttggggaagaccacacatagctttacagaggcctgtggcttttt
ctctcactcttccattcacacctgtgttggctagttttagttcaacctgg
cacaagctagagtctttttagaagagggagccagattgagactatgtccc
caccagattggcttatgagcaaaccagtaaattagcattcccccacggcc
tctgtatcagctcctgcctccagactcttgccttgtttgagttcctgccc
cgatttctgtcagtgatggagtgtgatgtgggactagcagctgaagtaaa
cccttttctcttcaagttgctttcggtgtgtttgagcacagctgttagtc
tagctaatacactgcctcctcactattttgcccttggatagtcttgtctc
tgtctcgttagtcttccattgcctttcagtttgaagacactatgttagta
tctgtgagctcatggacagactctcttcagtttggaaatacaccattggt
gcatctgtgagctcatgggctctttagctctgtgcagtcctgcagaaact
tgtagaaagcttgttttgagttcctctgtagtgtgtgtgtgtgtatgtgt
gtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_37600281_37601421
seq2: B6Ng01-095G05.b_45_1167 (reverse)

seq1  CCACATCCCTCTGTCAGAAGTCCTGCTGGATGCTTGCTTTGTTGACTTCT  50
      |||||| ||||   |||||||| |||| ||||||||||    |||| |||
seq2  CCACAT-CCTCGTCCAGAAGTCTTGCT-GATGCTTGCT---GTGAC-TCT  44

seq1  CCCTATCAGGCACTTCCCTCACACCAAATGCTTTCTAGTTTGGGCCAGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
seq2  CCCTATCAGGCACTTCCCTCACACCAAATGC-TTCTAG-TTGGGCCAGAC  92

seq1  TGTGGCAATGCCTTCACCACAGCCTCAAGCCTCCAATCTGCTGTCCATCA  150
      | |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||
seq2  T-TGGCAATG-CTTCA-CACAG-CTCAAG-CTCCAATCTGCTGTCCATCA  137

seq1  TTGCAAGGTCTTTGTTTTGCCTGACAGTAATAGCACCCTTTGTGGCTTCT  200
       ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||   
seq2  -TGCAAGGTCTTTGTTT--GCTGACAGTAATAGCACCCTTTGTGGCT--C  182

seq1  TGGTCTTGAGACACAGATGTAACTAATTGGACAATTTACAATGGTCTGAG  250
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  TGGTC-TGAGACACAGATGTAACTAATTGGACAAATTACAATGGTCTGAG  231

seq1  TTGTAAT-AAAAAAAAAAAACCTATTAGGAATTGGAAAGACATCCAATTG  299
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAATAAAAAAAAAAAAACCTATTAGGAATTGGAAAGACATCCAATTG  281

seq1  TATTAATCCAACAATGATACAGCGCAATCATGAAGCACTGTCTCATGTGT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAATCCAACAATGATACAGCGCAATCATGAAGCACTGTCTCATGTGT  331

seq1  CCTGAGCTCTGGGAGCTGTGTGGCCCGAGCACTGTCTCTGGGTGTGAGGA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGCTCTGGGAGCTGTGTGGCCCGAGCACTGTCTCTGGGTGTGAGGA  381

seq1  AGGAGCTGTGGATAACAGCCTTTGGGAAGACAACACTGGGGGAAAGGTAG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCTGTGGATAACAGCCTTTGGGAAGACAACACTGGGGGAAAGGTAG  431

seq1  GATGTCAAGCACAGAGCCTCCTGCAGCTTTACAATCCCAGCTCTGTTCAC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTCAAGCACAGAGCCTCCTGCAGCTTTACAATCCCAGCTCTGTTCAC  481

seq1  ACACAGCCCTGGGAGGGCAGAGTTAGTGTTTGCTTCAATCTGTTTCCTCA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGCCCTGGGAGGGCAGAGTTAGTGTTTGCTTCAATCTGTTTCCTCA  531

seq1  AGTGTCTCAAAGGGGCACCTCACACTCGCATGGCGGAAAAAGGCAAAGCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTCTCAAAGGGGCACCTCACACTCGCATGGCGGAAAAAGGCAAAGCA  581

seq1  GCTTTCAAAACATCTGCCATGTTGACTTAGATGGGCTTCTGGGGGTGTCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTCAAAACATCTGCCATGTTGACTTAGATGGGCTTCTGGGGGTGTCA  631

seq1  TGTCTGCACTTCGGAATCACTGATCATAGCTATCCCCTGTAAGGCTGATG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGCACTTCGGAATCACTGATCATAGCTATCCCCTGTAAGGCTGATG  681

seq1  GTCCAAGGATGCAGCGTGTAGGAACATTTGTCCCCACAGCTCTTCCTGTA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCAAGGATGCAGCGTGTAGGAACATTTGTCCCCACAGCTCTTCCTGTA  731

seq1  CATTCCCAGGGAAGCCTCCATCTTTCAGTCCCCATCTGTGCCCCTTCAAG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCCCAGGGAAGCCTCCATCTTTCAGTCCCCATCTGTGCCCCTTCAAG  781

seq1  GACCTGCTCCTGCCTCCATAAAACACTTCGTGAGCAACAAAGGTGATTTG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACCTGCTCCTGCCTCCATAAAACACTTCGTGAGCAACAAAGGTGATTTG  831

seq1  TCATCTCCCCCACGTGCTCTCTGGAGACCCAGAGCCCAGCTGCAGCTGCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATCTCCCCCACGTGCTCTCTGGAGACCCAGAGCCCAGCTGCAGCTGCC  881

seq1  TGTCATAGCTGTCAGGCTGGTAGCTGTCATATGCATGAGTGTATGTATGC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCATAGCTGTCAGGCTGGTAGCTGTCATATGCATGAGTGTATGTATGC  931

seq1  ATAGAGATGCGTATGTGTGCCCACAGAGAACTTGGTTCACTGGTTTCACC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGATGCGTATGTGTGCCCACAGAGAACTTGGTTCACTGGTTTCACC  981

seq1  TTTGCTCTTAAGTGTTGCGTGCCCTTGCTTCATTGGTTTAGGACCCTCCC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGCTCTTAAGTGTTGCGTGCCCTTGCTTCATTGGTTTAGGACCCTCCC  1031

seq1  ATGATGCACATTTAGTGGAAGAAACATGAACACTGTCCCAGGGCCTTTTG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATGCACATTTAGTGGAAGAAACATGAACACTGTCCCAGGGCCTTTTG  1081

seq1  TGACCGAGTTTTATTTCTGACTTAATGAGCTCCACAGAATTC  1141
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACCGAGTTTTATTTCTGACTTAATGAGCTCCACAGAATTC  1123

seq1: chr5_37474482_37475243
seq2: B6Ng01-095G05.g_68_830

seq1  GAATTCTTATCATTGTTTTTCTGTAGCTGAGCTATTTCTTCTTGGCCTTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTATCATTGTTTTTCTGTAGCTGAGCTATTTCTTCTTGGCCTTG  50

seq1  TTTTAGGATTTTCTTTTCCTTCATCTTTGGTCAGCTGCAGCTTGCTGTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAGGATTTTCTTTTCCTTCATCTTTGGTCAGCTGCAGCTTGCTGTGT  100

seq1  GATATACTCACGTGCAAGTACAATGTGTGTACCTATGGTTGGGCGTCTGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATACTCACGTGCAAGTACAATGTGTGTACCTATGGTTGGGCGTCTGC  150

seq1  GGTTAGTTGGGGAAGACCACACATAGCTTTACAGAGGCCTGTGGCTTTTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTAGTTGGGGAAGACCACACATAGCTTTACAGAGGCCTGTGGCTTTTT  200

seq1  CTCTCACTCTTCCATTCACACCTGTGTTGGCTAGTTTTAGTTCAACCTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCACTCTTCCATTCACACCTGTGTTGGCTAGTTTTAGTTCAACCTGG  250

seq1  CACAAGCTAGAGTCTTTTTAGAAGAGGGAGCCAGATTGAGACTATGTCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAGCTAGAGTCTTTTTAGAAGAGGGAGCCAGATTGAGACTATGTCCC  300

seq1  CACCAGATTGGCTTATGAGCAAACCAGTAAATTAGCATTCCCCCACGGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGATTGGCTTATGAGCAAACCAGTAAATTAGCATTCCCCCACGGCC  350

seq1  TCTGTATCAGCTCCTGCCTCCAGACTCTTGCCTTGTTTGAGTTCCTGCCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTATCAGCTCCTGCCTCCAGACTCTTGCCTTGTTTGAGTTCCTGCCC  400

seq1  CGATTTCTGTCAGTGATGGAGTGTGATGTGGGACTAGCAGCTGAAGTAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGATTTCTGTCAGTGATGGAGTGTGATGTGGGACTAGCAGCTGAAGTAAA  450

seq1  CCCTTTTCTCTTCAAGTTGCTTTCGGTGTGTTTGAGCACAGCTGTTAGTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTTTCTCTTCAAGTTGCTTTCGGTGTGTTTGAGCACAGCTGTTAGTC  500

seq1  TAGCTAATACACTGCCTCCTCACTATTTTGCCCTTGGATAGTCTTGTCTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTAATACACTGCCTCCTCACTATTTTGCCCTTGGATAGTCTTGTCTC  550

seq1  TGTCTCGTTAGTCTTCCATTGCCTTTCAGTTTGAAGACACTATGTTAGTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTCGTTAGTCTTCCATTGCCTTTCAGTTTGAAGACACTATGTTAGTA  600

seq1  TCTGTGAGCTCATGGACAGACTCTCTTCAGTTTGGAAATACACCATTGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGAGCTCATGGACAGACTCTCTTCAGTTTGGAAATACACCATTGGT  650

seq1  GCATCTGTGAGCTCATGGGCTCTTTAGCTCTGTGCAGTCCTGCAGAAACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCTGTGAGCTCATGGGCTCTTTAGCTCTGTGCAGTCCTGCAGAAACT  700

seq1  TGTAGAAAGCTTG-TTTGAGTTCCTCTGTAGTGTGTGTGTGTGTATGTGT  749
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGAAAGCTTGTTTTGAGTTCCTCTGTAGTGTGTGTGTGTGTATGTGT  750

seq1  GTGTGTGTGTGTG  762
      |||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTG  763