BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-096G14
Chromosome5 (Build37)
Map Location 44,625,062 - 44,734,656
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040717
Upstream geneCpeb2, C1qtnf7, 4833430A08Rik, 5730509K17Rik, Fbxl5, Bst1, Cd38, EG665989, EG665994, LOC100040677, EG384179, Fgfbp1, Prom1, LOC100041413, Tapt1
Downstream geneLOC545747, Ldb2, LOC100041481, LOC100040737
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-096G14.bB6Ng01-096G14.g
ACCDH907069DH907070
length1,2121,120
definitionDH907069|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-096G14, 5' end.DH907070|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-096G14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(44,733,419 - 44,734,656)(44,625,062 - 44,626,196)
sequence
gaattcaagcctggctgagtcctgcttaaatcaacagacttccggccagt
ccacagatgggtaattgagttaaagttcattgttgtgctttccccatcat
aatgtggctgtaaatgccatcattgtaactgctgttgattactaactgct
ccattctcctgggtaaagctcataaatgtatataaaatatacatgtacat
agagagagagatactatagtgtacctgtctcttctgagattgaaatagtc
tatcatgcagaggatccctttaagcagggagataaacaacaacaacaaca
acaacaacaaaacaccttaaagaacttcctgaaactgaccaaattcgctg
agccccatcctgtcaaagtaagcagagtccagctacaaagaaggctctca
gacatgctaagttggcaaaaaagactctgagaggaaaaagaagactctaa
gaccaaacaagctgcctgaaagaagaaaacaagcccatctgcctggaaaa
agcttagacaaactgaggcacctggaaaggacgctctaacctgttgagct
gcccgcaggctgtgcagggtgctccaggttttcagctttgcaagttgtca
cccacgttagggtgggctttgatgatgcagctgtctttgagtcaattctg
cttcctgtaagtaactcttcacccatactccagtaagtaatcccaacaaa
actcattggctcaacaagttggactctggtccctcatgggatccctatct
gggatgagtagacatgtatgttgcatctccccaggaaaagttttgtcaca
caacagatatacacttacacacactgtgatacaacccccctgataactgc
agcatcataatatccaaataccaactgatacaagataaaggtccagtggt
gtgctcgaacaataattgaatacaatgaaaataaatgagctaacactata
cttacaatacagataaatcttaagcaaaatagtacaggcatgtaataatt
catattgtatgactcctgtcctgtgcttagtgtcccatgtctagatgggg
aaattagtcagtatgtaatatctcagaataagtgacaatctcagcaggtg
acctgtaaagcactgtcagtttcatcagactgacctgctgctggcttcac
tctgttctgcacatagcatctgatgctagacaggattatgcctcagtttt
atgtgaccttta
gaattccaaatcaaagcattttagtcactgaagaggcagaagagggtaat
ggctcatgaagctgcttgtgtgaaatttgaagttctagaagattctgaat
aactataaattccaggttggggggagatgctatctgattttcagtctgcg
tgtctgtcctctccccagaatttcacaggtaggatgagtgtatgtcagct
tggcatgagatgctctgttttgatccatttaatttagacacttgttataa
cgtaagtgcttttgctttcactttggcaattggcatgcaattttaattag
cacttggaacacaatagaatgtgttgatgaagcacaagacatgaagaaat
acgttcataatggcctgtcttgaggactctggcagcatccaaaaaagata
ttctcagtgtactgcacaggatttctgagaactcagcctggctggcattt
atgctcttatatattaatcatctcagtgttttcagatgtcaaaatattgg
catgagcagagttgtcatctatgctgcaccaagaatactaatttctctat
tatcttgataaagtggccaatgtataaagaaacgatgtattttctatgcc
ttgccagacttctcttccaacctcggccatccatgtcttcctaagttgtt
aagcccccgcagccatctcttaccagcattcctcctattgctcgcttgct
tctgtttataactattttccgcctctggcaacctgagactgcgctgcatg
gcattttgtcaaaaatgattctcttccctgttgactcttttggttattaa
cattgtcaacttgacaggacctagagtcacccaggagaaaaactatggcg
catgtctgtgatgggggttctagagtgggttaattcatgcagaagaccca
ttctgtaacatctttccgtggtccggggcccagcctgaaaaggagaagca
gccaaataccagcgttcactgctctctgcctcttgtctgctgatgcatgc
gagcagttgcctcaactcctgagactgcctcgcagctcaactgggagcca
aagaaaactcttcataagttgtcactctgatgtctgccacagccacgaga
aagtactaatacaattctca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_44733419_44734656
seq2: B6Ng01-096G14.b_46_1257 (reverse)

seq1  TAAAAGTCACATAAAAACTGAGGCATAAATTTCCTGCTTTGCTTCAGGAT  50
      |||| ||||||| |||||||||||||||   |||||  | || ||| |||
seq2  TAAAGGTCACAT-AAAACTGAGGCATAA---TCCTGTCTAGCATCA-GAT  45

seq1  GCTA-GTGCCAGGGAGCAGAGTGAAGCCAGCAGACAGTCAGATCTTGATG  99
      |||| ||||    || |||||||||||||||||   ||||| || |||||
seq2  GCTATGTGC---AGAACAGAGTGAAGCCAGCAGCAGGTCAG-TC-TGATG  90

seq1  GAAAACTGACAGTTGCTCTACAGTGTCACCTGCCTGAGATTGTCACTTTA  149
        |||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  
seq2  --AAACTGACAG-TGCTTTACAG-GTCACCTG-CTGAGATTGTCACTTAT  135

seq1  TCTGAAGATTATTTACATACCTGACTTAATTTCCCCATCTAGGACATGGG  199
      |||| ||||   ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||
seq2  TCTG-AGAT--ATTACATA-CTGAC-TAATTTCCCCATCTA-GACAT-GG  178

seq1  GACACTAAGCACAGGACAGGAAGTCATACAATATGAATTATTACATGCCT  249
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACTAAGCACAGGACAGG-AGTCATACAATATGAATTATTACATGCCT  227

seq1  GTACTTATTTTTGCTTAAGATTTTATCTGTATTGTTAAGTATAGTGTTAG  299
      |||||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GTACT--ATTTTGCTTAAGA-TTTATCTGTATTG-TAAGTATAGTGTTAG  273

seq1  CTCATTTATTTTCATTGTATTCAATTATTGTTCGAGCACACCACTGGACC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATTTATTTTCATTGTATTCAATTATTGTTCGAGCACACCACTGGACC  323

seq1  TTTATCTTGTATCAGTTGGTATTTGGATATTATGATGCTGCAGTTATCAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCTTGTATCAGTTGGTATTTGGATATTATGATGCTGCAGTTATCAG  373

seq1  GGGGGTTGTATCACAGTGTGTGTAAGTGTATATCTGTTGTGTGACAAAAC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGGTTGTATCACAGTGTGTGTAAGTGTATATCTGTTGTGTGACAAAAC  423

seq1  TTTTCCTGGGGAGATGCAACATACATGTCTACTCATCCCAGATAGGGATC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTGGGGAGATGCAACATACATGTCTACTCATCCCAGATAGGGATC  473

seq1  CCATGAGGGACCAGAGTCCAACTTGTTGAGCCAATGAGTTTTGTTGGGAT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGAGGGACCAGAGTCCAACTTGTTGAGCCAATGAGTTTTGTTGGGAT  523

seq1  TACTTACTGGAGTATGGGTGAAGAGTTACTTACAGGAAGCAGAATTGACT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTACTGGAGTATGGGTGAAGAGTTACTTACAGGAAGCAGAATTGACT  573

seq1  CAAAGACAGCTGCATCATCAAAGCCCACCCTAACGTGGGTGACAACTTGC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGACAGCTGCATCATCAAAGCCCACCCTAACGTGGGTGACAACTTGC  623

seq1  AAAGCTGAAAACCTGGAGCACCCTGCACAGCCTGCGGGCAGCTCAACAGG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCTGAAAACCTGGAGCACCCTGCACAGCCTGCGGGCAGCTCAACAGG  673

seq1  TTAGAGCGTCCTTTCCAGGTGCCTCAGTTTGTCTAAGCTTTTTCCAGGCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGCGTCCTTTCCAGGTGCCTCAGTTTGTCTAAGCTTTTTCCAGGCA  723

seq1  GATGGGCTTGTTTTCTTCTTTCAGGCAGCTTGTTTGGTCTTAGAGTCTTC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGGCTTGTTTTCTTCTTTCAGGCAGCTTGTTTGGTCTTAGAGTCTTC  773

seq1  TTTTTCCTCTCAGAGTCTTTTTTGCCAACTTAGCATGTCTGAGAGCCTTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCCTCTCAGAGTCTTTTTTGCCAACTTAGCATGTCTGAGAGCCTTC  823

seq1  TTTGTAGCTGGACTCTGCTTACTTTGACAGGATGGGGCTCAGCGAATTTG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTAGCTGGACTCTGCTTACTTTGACAGGATGGGGCTCAGCGAATTTG  873

seq1  GTCAGTTTCAGGAAGTTCTTTAAGGTGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGTTTCAGGAAGTTCTTTAAGGTGTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG  923

seq1  TTGTTTATCTCCCTGCTTAAAGGGATCCTCTGCATGATAGACTATTTCAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTATCTCCCTGCTTAAAGGGATCCTCTGCATGATAGACTATTTCAA  973

seq1  TCTCAGAAGAGACAGGTACACTATAGTATCTCTCTCTCTATGTACATGTA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGAAGAGACAGGTACACTATAGTATCTCTCTCTCTATGTACATGTA  1023

seq1  TATTTTATATACATTTATGAGCTTTACCCAGGAGAATGGAGCAGTTAGTA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTATATACATTTATGAGCTTTACCCAGGAGAATGGAGCAGTTAGTA  1073

seq1  ATCAACAGCAGTTACAATGATGGCATTTACAGCCACATTATGATGGGGAA  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAACAGCAGTTACAATGATGGCATTTACAGCCACATTATGATGGGGAA  1123

seq1  AGCACAACAATGAACTTTAACTCAATTACCCATCTGTGGACTGGCCGGAA  1199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACAACAATGAACTTTAACTCAATTACCCATCTGTGGACTGGCCGGAA  1173

seq1  GTCTGTTGATTTAAGCAGGACTCAGCCAGGCTTGAATTC  1238
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTTGATTTAAGCAGGACTCAGCCAGGCTTGAATTC  1212

seq1: chr5_44625062_44626196
seq2: B6Ng01-096G14.g_68_1187

seq1  GAATTCCAAATCAAAGCATTTTAGTCACTGAAGAGGCAGAAGAGGGTAAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAATCAAAGCATTTTAGTCACTGAAGAGGCAGAAGAGGGTAAT  50

seq1  GGCTCATGAAGCTGCTTGTGTGAAATTTGAAGTTCTAGAAGATTCTGAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCATGAAGCTGCTTGTGTGAAATTTGAAGTTCTAGAAGATTCTGAAT  100

seq1  AACTATAAATTCCAGGTTGGGGGGAGATGCTATCTGATTTTCAGTCTGCG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATAAATTCCAGGTTGGGGGGAGATGCTATCTGATTTTCAGTCTGCG  150

seq1  TGTCTGTCCTCTCCCCAGAATTTCACAGGTAGGATGAGTGTATGTCAGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGTCCTCTCCCCAGAATTTCACAGGTAGGATGAGTGTATGTCAGCT  200

seq1  TGGCATGAGATGCTCTGTTTTGATCCATTTAATTTAGACACTTGTTATAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCATGAGATGCTCTGTTTTGATCCATTTAATTTAGACACTTGTTATAA  250

seq1  CGTAAGTGCTTTTGCTTTCACTTTGGCAATTGGCATGCAATTTTAATTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTAAGTGCTTTTGCTTTCACTTTGGCAATTGGCATGCAATTTTAATTAG  300

seq1  CACTTGGAACACAATAGAATGTGTTGATGAAGCACAAGACATGAAGAAAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGGAACACAATAGAATGTGTTGATGAAGCACAAGACATGAAGAAAT  350

seq1  ACGTTCATAATGGCCTGTCTTGAGGACTCTGGCAGCATCCAAAAAAGATA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGTTCATAATGGCCTGTCTTGAGGACTCTGGCAGCATCCAAAAAAGATA  400

seq1  TTCTCAGTGTACTGCACAGGATTTCTGAGAACTCAGCCTGGCTGGCATTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAGTGTACTGCACAGGATTTCTGAGAACTCAGCCTGGCTGGCATTT  450

seq1  ATGCTCTTATATATTAATCATCTCAGTGTTTTCAGATGTCAAAATATTGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCTTATATATTAATCATCTCAGTGTTTTCAGATGTCAAAATATTGG  500

seq1  CATGAGCAGAGTTGTCATCTATGCTGCACCAAGAATACTAATTTCTCTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAGCAGAGTTGTCATCTATGCTGCACCAAGAATACTAATTTCTCTAT  550

seq1  TATCTTGATAAAGTGGCCAATGTATAAAGAAACGATGTATTTTCTATGCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTGATAAAGTGGCCAATGTATAAAGAAACGATGTATTTTCTATGCC  600

seq1  TTGCCAGACTTCTCTTCCAACCTCGGCCATCCATGTCTTCCTAAGTTGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCCAGACTTCTCTTCCAACCTCGGCCATCCATGTCTTCCTAAGTTGTT  650

seq1  AAGCCCCCGCAGCCATCTCTTACCAGCATTCCTCCTATTGCTCGCTTGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCCCCGCAGCCATCTCTTACCAGCATTCCTCCTATTGCTCGCTTGCT  700

seq1  TCTGTTTATAACTATTTTCCGCCTCTGGCAACCTGAGACTGCGCTGCATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTTTATAACTATTTTCCGCCTCTGGCAACCTGAGACTGCGCTGCATG  750

seq1  GCATTTTGTCAAAAATGATTCTCTTCCCTGTTGACTCTTTTGGTTATTAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTTGTCAAAAATGATTCTCTTCCCTGTTGACTCTTTTGGTTATTAA  800

seq1  CATTGTCAACTTGACAGGACCTAGAGTCACCCAGGAGAAAAACTATGGCG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTCAACTTGACAGGACCTAGAGTCACCCAGGAGAAAAACTATGGCG  850

seq1  CATGTCTGTGATGGGGGTTCTAGAGTGGGTTAATTCATGCAGAAGACCCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTCTGTGATGGGGGTTCTAGAGTGGGTTAATTCATGCAGAAGACCCA  900

seq1  TTCTGTAACATCTTTCCGTGGTCCGGGGCCCAGCCTGAAAAGGAGAAAGC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTCTGTAACATCTTTCCGTGGTCCGGGGCCCAGCCTGAAAAGGAG-AAGC  949

seq1  AAGCCAAATACCAGCGTTCACTGCTCTCTGCCTCTTGTCTGCTGATGCAA  1000
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  -AGCCAAATACCAGCGTTCACTGCTCTCTGCCTCTTGTCTGCTGATGC-A  997

seq1  TGCGAGCAGTTGCCTCAAACTCCTGAGACTGCCCTCGCCAGCCTCAAACT  1050
      |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||
seq2  TGCGAGCAGTTGCCTC-AACTCCTGAGACTG-CCTCG-CAG-CTC-AACT  1042

seq1  GGGAGCCAAAGAAAACTCTTCCAATAAAGTTTGTCACTCTGATGTCTTGC  1100
      |||||||||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||| |||
seq2  GGGAGCCAAAGAAAACTCTTC--ATAA--GTTGTCACTCTGATGTC-TGC  1087

seq1  CACAGCAACGAGAAAATTAACTAATACAATTCTCA  1135
      |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||
seq2  CACAGCCACGAGAAAGT--ACTAATACAATTCTCA  1120