BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-120A18
Chromosome5 (Build37)
Map Location 151,858,781 - 151,976,411
singlet/doubletdoublet
Overlap geneStard13
Upstream geneRxfp2, LOC667470, Fry, LOC100042068, Gm5, XM_359419, Brca2, B230342M21Rik, BC037393, Aprin, LOC100040180, Kl, LOC667510
Downstream geneLOC630708, LOC625175, LOC100042166, EG435877, EG632649, EG632671, Rfc3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-120A18.bB6Ng01-120A18.g
ACCDH924096DH924097
length1,171798
definitionDH924096|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-120A18, 5' end.DH924097|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-120A18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,975,232 - 151,976,411)(151,858,781 - 151,859,575)
sequence
gaattctaattttcccctctcatttctcatgagctctgaagggtcacgga
catcatttggtacttttacttgactaagcattgtttcatccttcatgaac
aatttcctgtaaccattagcaaagcaacaccttttaaaacaggagatatt
gtgtcacagtgtgagggactgtgacagggcaatgtaaagggtaggctttt
gggtttatggaaggccagctcactgcccaaggctaagatcctgtgcagtg
tcgccaagcaagttgggaggcctttaggcatgttctcagatcttagctgc
ttgtacgactttgaggggacaaaaggaggctggggttacactgcccagat
ggtttgactcttcatagtcacctcctagctcaagtcttatgagagaagag
cagaagacagcaaacacacagtgtgtagacacatctcattctgtactctg
tttcaatatccgttttattctatttgctttaactatttgtttgcctatcc
tggctggatttgaggagacagtcactacttagcaagactcaaatgaagtc
tctgaaaagtgctcagtgcatctggttatggtttggaaaggctgtgtaag
tctgaattcagtggcgggaactggagggaggacatgaacaaagaccaaag
gggcctgtttggtggaggaatacctaagctcatggcttgccaaaaccgtt
tccttcacctgggacttcactgacttcatccctgctctccaacgtgagaa
tagcatctacccatgtccatgtccacatccatacaaacacaagatgcctc
tctctgggtttcccaacagcctttgtcttagtggaatactttttttttcc
ttcatagctggatctgcctggtgcatagacatttaaatacattagcatgt
ttgtgattgatattagcaatttggcttgtgtgctatgaagacttcagaac
cttgatttaacatgaagcaccagaggctgagtcttttctgaaatttctag
tgtgtagtatatgcatcagttaagccaccagcttgttattttccagatgg
gtcaaatccagtctttcatacttctaagtgatctggagtatttcccatga
tccctgcaacctgtttcgtagcttataagaagtactgatgatggctactc
tatgcagttgtggagaatgaa
gaattcaaatttcatctaaatagtattaaatctcctccctggcatcctgt
ttatgctaatccttgcagggcttaatgatgtttatcaagacttccatttc
ctcttctttagaaatgggcctcagctaatgaagaaaggttggctttattc
agaaagcaagagtcataaagtagtgtgtgctatgggcagcgattctgcgc
gtgcgcggtgttggtttagcctttcactgcaggagcttcgtatttatcag
tagccagagataacctgagctgcggcggtgcgtgggtgatttaagacaga
tgtgaaagctcacacaacaaagcaaggctggtctcacaagccaccatgtc
gaatacaaatggctggcaattgaaggctaaacctcttcacttcatctgca
gccatctgcgagggtgaaaatggatatgctgtacttcttcatacataaac
tgcagtatgctggggagtgtgggaagtgagtgctggcaatgttttagggt
tctgtgctgctggctggctttgacagccttctgatgagtgctgatgttcg
agtgtttagccttcagggaagggacccccacctcccactctgctcaatgt
cagagcttcatggaagtcttggaagatggttcccatggaatgtggcttac
aggaaggatgtgtgggggtggtggtattcctggtctcccacaatcctggg
ttgagagtggaagggcctgtgcaaaagtgaattttcaattccaatgggat
acccagggcagagaaaggacttcctgattcccttccccttccctggcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_151975232_151976411
seq2: B6Ng01-120A18.b_47_1217 (reverse)

seq1  TTCATTCT-CACAACTGCATGGAGTAGCCATCATCAGTA-TTCTGTATAG  48
      |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| 
seq2  TTCATTCTCCACAACTGCATAGAGTAGCCATCATCAGTACTTCT-TATAA  49

seq1  CTTACGAAACAAGTTTGCAGGGATCATGGGAAATACTCAAGATCACTTTA  98
        |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||  
seq2  GCTACGAAAC-AGGTTGCAGGGATCATGGGAAATACTCCAGATCACTT--  96

seq1  AGAAGTATG-AAGACTTGGATTTGAACCCCATCTGGAAAATAACAAGGCT  147
      ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||
seq2  AGAAGTATGAAAGAC-TGGATTTGA--CCCATCTGGAAAATAACAA-GCT  142

seq1  GGTGGCCTTAACTGATGCATATTACCTACACACTAGAAATTTCAGAAAAG  197
      ||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGG-CTTAACTGATGCATAT--ACTACACACTAGAAATTTCAGAAAAG  189

seq1  ACTCAGCCTCTTGGTGCTTCATGTTAAATCAAGGTTCTGAAGTCTTCATA  247
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGCCTC-TGGTGCTTCATGTTAAATCAAGGTTCTGAAGTCTTCATA  238

seq1  GCACACAAGCCAAATTGCTAATATCAATCACAAACATGCTAATGTATTTA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACACAAGCCAAATTGCTAATATCAATCACAAACATGCTAATGTATTTA  288

seq1  AATGTCTATGCACCAGGCAGATCCAGCTATGAAGGAAAAAAAAAGTATTC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTCTATGCACCAGGCAGATCCAGCTATGAAGGAAAAAAAAAGTATTC  338

seq1  CACTAAGACAAAGGCTGTTGGGAAACCCAGAGAGAGGCATCTTGTGTTTG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTAAGACAAAGGCTGTTGGGAAACCCAGAGAGAGGCATCTTGTGTTTG  388

seq1  TATGGATGTGGACATGGACATGGGTAGATGCTATTCTCACGTTGGAGAGC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGATGTGGACATGGACATGGGTAGATGCTATTCTCACGTTGGAGAGC  438

seq1  AGGGATGAAGTCAGTGAAGTCCCAGGTGAAGGAAACGGTTTTGGCAAGCC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATGAAGTCAGTGAAGTCCCAGGTGAAGGAAACGGTTTTGGCAAGCC  488

seq1  ATGAGCTTAGGTATTCCTCCACCAAACAGGCCCCTTTGGTCTTTGTTCAT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGCTTAGGTATTCCTCCACCAAACAGGCCCCTTTGGTCTTTGTTCAT  538

seq1  GTCCTCCCTCCAGTTCCCGCCACTGAATTCAGACTTACACAGCCTTTCCA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTCCCTCCAGTTCCCGCCACTGAATTCAGACTTACACAGCCTTTCCA  588

seq1  AACCATAACCAGATGCACTGAGCACTTTTCAGAGACTTCATTTGAGTCTT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCATAACCAGATGCACTGAGCACTTTTCAGAGACTTCATTTGAGTCTT  638

seq1  GCTAAGTAGTGACTGTCTCCTCAAATCCAGCCAGGATAGGCAAACAAATA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAGTAGTGACTGTCTCCTCAAATCCAGCCAGGATAGGCAAACAAATA  688

seq1  GTTAAAGCAAATAGAATAAAACGGATATTGAAACAGAGTACAGAATGAGA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAAGCAAATAGAATAAAACGGATATTGAAACAGAGTACAGAATGAGA  738

seq1  TGTGTCTACACACTGTGTGTTTGCTGTCTTCTGCTCTTCTCTCATAAGAC  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCTACACACTGTGTGTTTGCTGTCTTCTGCTCTTCTCTCATAAGAC  788

seq1  TTGAGCTAGGAGGTGACTATGAAGAGTCAAACCATCTGGGCAGTGTAACC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGCTAGGAGGTGACTATGAAGAGTCAAACCATCTGGGCAGTGTAACC  838

seq1  CCAGCCTCCTTTTGTCCCCTCAAAGTCGTACAAGCAGCTAAGATCTGAGA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCTCCTTTTGTCCCCTCAAAGTCGTACAAGCAGCTAAGATCTGAGA  888

seq1  ACATGCCTAAAGGCCTCCCAACTTGCTTGGCGACACTGCACAGGATCTTA  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCCTAAAGGCCTCCCAACTTGCTTGGCGACACTGCACAGGATCTTA  938

seq1  GCCTTGGGCAGTGAGCTGGCCTTCCATAAACCCAAAAGCCTACCCTTTAC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTGGGCAGTGAGCTGGCCTTCCATAAACCCAAAAGCCTACCCTTTAC  988

seq1  ATTGCCCTGTCACAGTCCCTCACACTGTGACACAATATCTCCTGTTTTAA  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCCCTGTCACAGTCCCTCACACTGTGACACAATATCTCCTGTTTTAA  1038

seq1  AAGGTGTTGCTTTGCTAATGGTTACAGGAAATTGTTCATGAAGGATGAAA  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGTTGCTTTGCTAATGGTTACAGGAAATTGTTCATGAAGGATGAAA  1088

seq1  CAATGCTTAGTCAAGTAAAAGTACCAAATGATGTCCGTGACCCTTCAGAG  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGCTTAGTCAAGTAAAAGTACCAAATGATGTCCGTGACCCTTCAGAG  1138

seq1  CTCATGAGAAATGAGAGGGGAAAATTAGAATTC  1180
      |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGAGAAATGAGAGGGGAAAATTAGAATTC  1171

seq1: chr5_151858781_151859575
seq2: B6Ng01-120A18.g_65_862

seq1  GAATTCAAATTTCATCTAAATAGTATTAAATCTCCTCCCTGGCATCCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATTTCATCTAAATAGTATTAAATCTCCTCCCTGGCATCCTGT  50

seq1  TTATGCTAATCCTTGCAGGGCTTAATGATGTTTATCAAGACTTCCATTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGCTAATCCTTGCAGGGCTTAATGATGTTTATCAAGACTTCCATTTC  100

seq1  CTCTTCTTTAGAAATGGGCCTCAGCTAATGAAGAAAGGTTGGCTTTATTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTCTTTAGAAATGGGCCTCAGCTAATGAAGAAAGGTTGGCTTTATTC  150

seq1  AGAAAGCAAGAGTCATAAAGTAGTGTGTGCTATGGGCAGCGATTCTGCGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGCAAGAGTCATAAAGTAGTGTGTGCTATGGGCAGCGATTCTGCGC  200

seq1  GTGCGCGGTGTTGGTTTAGCCTTTCACTGCAGGAGCTTCGTATTTATCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCGCGGTGTTGGTTTAGCCTTTCACTGCAGGAGCTTCGTATTTATCAG  250

seq1  TAGCCAGAGATAACCTGAGCTGCGGCGGTGCGTGGGTGATTTAAGACAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCCAGAGATAACCTGAGCTGCGGCGGTGCGTGGGTGATTTAAGACAGA  300

seq1  TGTGAAAGCTCACACAACAAAGCAAGGCTGGTCTCACAAGCCACCATGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGAAAGCTCACACAACAAAGCAAGGCTGGTCTCACAAGCCACCATGTC  350

seq1  GAATACAAATGGCTGGCAATTGAAGGCTAAACCTCTTCACTTCATCTGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATACAAATGGCTGGCAATTGAAGGCTAAACCTCTTCACTTCATCTGCA  400

seq1  GCCATCTGCGAGGGTGAAAATGGATATGCTGTACTTCTTCATACATAAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATCTGCGAGGGTGAAAATGGATATGCTGTACTTCTTCATACATAAAC  450

seq1  TGCAGTATGCTGGGGAGTGTGGGAAGTGAGTGCTGGCAATGTTTTAGGGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTATGCTGGGGAGTGTGGGAAGTGAGTGCTGGCAATGTTTTAGGGT  500

seq1  TCTGTGCTGCTGGCTGGCTTTGACAGCCTTCTGATGAGTGCTGATGTTCG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGCTGCTGGCTGGCTTTGACAGCCTTCTGATGAGTGCTGATGTTCG  550

seq1  AGTGTTTAGCCTTCAGGGAAGGGACCCCCACCTCCCACTCTGCTCAATGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTAGCCTTCAGGGAAGGGACCCCCACCTCCCACTCTGCTCAATGT  600

seq1  CAGAGCTTCATGGAAGTCTTGGAAGATGGTTCCCATGGAATGTGGCTTAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCTTCATGGAAGTCTTGGAAGATGGTTCCCATGGAATGTGGCTTAC  650

seq1  AGGAAGGATGTGTGGGGGTGGTGGTATTCCTGGTCTCCCACAATCCTGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGGATGTGTGGGGGTGGTGGTATTCCTGGTCTCCCACAATCCTGGG  700

seq1  TTGAGAGTGCAAGGCCCTGTGCAGAAGTGAA-TTTCAATTCCAATGGGAT  749
      ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAGTGGAAGGGCCTGTGCAAAAGTGAATTTTCAATTCCAATGGGAT  750

seq1  ACCCAGGGCAGAGAAAGGACTT-CTGTTTCCCTTCCCCTT-CCTGGCC  795
      |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||
seq2  ACCCAGGGCAGAGAAAGGACTTCCTGATTCCCTTCCCCTTCCCTGGCC  798