BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-132M02
Chromosome5 (Build37)
Map Location 99,972,643 - 100,093,408
singlet/doubletdoublet
Overlap geneA930011G23Rik
Upstream gene1700007G11Rik, Bmp3, Prkg2, LOC100041680, Rasgef1b
Downstream geneLOC100040738, LOC666364, LOC100040763, LOC100040774, Hnrpd, 4930524J08Rik, Hnrpdl, Enoph1, BC062109, LOC666417, Sec31a, LOC100041797, Lin54, Cops4, Plac8, Coq2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-132M02.bB6Ng01-132M02.g
ACCDH933477DH933478
length1,1691,085
definitionDH933477|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132M02, 5' end.DH933478|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-132M02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(99,972,643 - 99,973,842)(100,092,315 - 100,093,408)
sequence
gaattcagataaagacaagttcttttcacaagttggtcagtcagtagcca
gttttcaatttcacgggaggatcctgttgtaggataaaaccaaagttgct
ggaagtgtgaacggatgctaggaggaagaaagaggttccctgaggtatca
cttcccttgagcatctgaatgtgcgcatgcccagagccaacagccctggc
ctggggcccgattgtatttggcattttccttaagtctcttggagctggtt
tatggcacttataacgatgtgacacagagttcaaattactggcattatta
catatatttgctaaagattcagtgagtgatattaacgggactcacagttc
acaaatgaggcaatttaatgaataatgaaaaactctcacattgacccaag
atggtactcagggtaagtgagaagcacttcaaaagctacctgtgcttgtt
ataagtggttaaggaagcaacgtgcgtgaatcacgacaacacacagacag
gatatgagtctgtgcctttctactgggtgaccttagacaagtcaattaac
ttttcctcacctctatttcctcatctagaaatagagatggtaactgtacc
tcgtgagtccatcgtgaggactaaatggattaatccctacagagggttta
tgagagtcactggcacatataaaccttcaatagctgttatatttatttaa
tagtcaataaatgtgtgtctgttactttccaccacatctgcctcttccct
cctcaacattagctctcgccacattcaagaccacatctggcaccatctgt
tccctgtacctggaatacttttctctcccatatctgtgcaaccagctctt
ctgccccttctttaagcaaataaaaccttctgagtgaccacagattaatt
gaggattaccaggtccacagctacattgccacatagagagtctacatctg
tacggagagatacatttgaaactgcaggatattttacctactctatattc
atggtcctgactggtactcatggtatgatgcatacacactactttctgtc
atagcaataatgtaaacagagtctgtgagtgacaatgaccttagcgtcat
ctcatgactccctagttaagggcagaacagcatcctaatccatgcttgtt
gaacctcttgacctgcagg
gaattctctaagacaaatgcctggaaatagtgccaaaaagtaattctgaa
aattgtatcttcaacttcagtgcactttaacttgactaaaataaaggaaa
agaaaggggaggttaggccccccaacacacacatacacacacacacacgg
atgtacacacacatgcacacacacatacacacatacacatgcacacacac
gtacacacacatgcatactcacaacatgcatgcacacatacacacataca
catgcgcacacacacatatacacacatatgcacgcacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacaccaaaagcacactctaaaagctagaa
tataggaaatggaaagaaagattaatgaaatggactgggaccaacagatg
aaaaagaagttagcttgagcatttttgctttcaatagcatggatgtaaaa
gcaggcacttcccatgtgtgttaacattattcaaaatttagttctaccca
tccatgcatagagacgtcattttaatcattcgtacgtatgataatgcatc
catgaagtatgagccaaataatctctgcttcgtttcacgggccattattt
tccgctgtggagatgagatggtccgttggctgtgtttcttctcagagctt
tgttcctgaggcttggttatactgtattccattcaactcaagatttcgtg
tttgatttctgtgtggtggggatgggctgggtatttcattacagaatcta
tttatctttctcttcacgagacgtttccttacttgatctgtcaagctgtg
attccaaggttatctcagataaaaaacttaaaagtgggccagaaagatgg
ctcagcagtaaaagtggtggctgccagggcctatgaccacgtttgatccc
tggaacctacatgaagaaaggaggaacagattcctgtaaattgttcctct
gacacattttgttcacagcacacacgagcccatgtgacccagagacggta
ataaattaatgtgaagattgttttatgatgataaactagtagagtcaatg
gggatgtaccagactaggatgaagacatacacaca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_99972643_99973842
seq2: B6Ng01-132M02.b_49_1217

seq1  GAATTCAGATAAAGACAAGTTCTTTTCACAAGTTGGTCAGTCAGTAGCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGATAAAGACAAGTTCTTTTCACAAGTTGGTCAGTCAGTAGCCA  50

seq1  GTTTTCAATTTCACGGGAGGATCCTGTTGTAGGATAAAACCAAAGTTGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCAATTTCACGGGAGGATCCTGTTGTAGGATAAAACCAAAGTTGCT  100

seq1  GGAAGTGTGAACGGATGCTAGGAGGAAGAAAGAGGTTCCCTGAGGTATCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTGTGAACGGATGCTAGGAGGAAGAAAGAGGTTCCCTGAGGTATCA  150

seq1  CTTCCCTTGAGCATCTGAATGTGCGCATGCCCAGAGCCAACAGCCCTGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCCTTGAGCATCTGAATGTGCGCATGCCCAGAGCCAACAGCCCTGGC  200

seq1  CTGGGGCCCGATTGTATTTGGCATTTTCCTTAAGTCTCTTGGAGCTGGTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGCCCGATTGTATTTGGCATTTTCCTTAAGTCTCTTGGAGCTGGTT  250

seq1  TATGGCACTTATAACGATGTGACACAGAGTTCAAATTACTGGCATTATTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCACTTATAACGATGTGACACAGAGTTCAAATTACTGGCATTATTA  300

seq1  CATATATTTGCTAAAGATTCAGTGAGTGATATTAACGGGACTCACAGTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATATTTGCTAAAGATTCAGTGAGTGATATTAACGGGACTCACAGTTC  350

seq1  ACAAATGAGGCAATTTAATGAATAATGAAAAACTCTCACATTGACCCAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAATGAGGCAATTTAATGAATAATGAAAAACTCTCACATTGACCCAAG  400

seq1  ATGGTACTCAGGGTAAGTGAGAAGCACTTCAAAAGCTACCTGTGCTTGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTACTCAGGGTAAGTGAGAAGCACTTCAAAAGCTACCTGTGCTTGTT  450

seq1  ATAAGTGGTTAAGGAAGCAACGTGCGTGAATCACGACAACACACAGACAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGTGGTTAAGGAAGCAACGTGCGTGAATCACGACAACACACAGACAG  500

seq1  GATATGAGTCTGTGCCTTTCTACTGGGTGACCTTAGACAAGTCAATTAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATGAGTCTGTGCCTTTCTACTGGGTGACCTTAGACAAGTCAATTAAC  550

seq1  TTTTCCTCACCTCTATTTCCTCATCTAGAAATAGAGATGGTAACTGTACC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTCACCTCTATTTCCTCATCTAGAAATAGAGATGGTAACTGTACC  600

seq1  TCGTGAGTCCATCGTGAGGACTAAATGGATTAATCCCTACAGAGGGTTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTGAGTCCATCGTGAGGACTAAATGGATTAATCCCTACAGAGGGTTTA  650

seq1  TGAGAGTCACTGGCACATATAAACCTTCAATAGCTGTTATATTTATTTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGTCACTGGCACATATAAACCTTCAATAGCTGTTATATTTATTTAA  700

seq1  TAGTCAATAAATGTGTGTCTGTTACTTTCCACCACATCTGCCTCTTCCCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCAATAAATGTGTGTCTGTTACTTTCCACCACATCTGCCTCTTCCCT  750

seq1  CCTCAACATTAGCTCTCGCCACATTCAAGACCACATCTGGCACCATCTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCAACATTAGCTCTCGCCACATTCAAGACCACATCTGGCACCATCTGT  800

seq1  TCCCTGTACCTGGAATACTTTTCTCTCCCATATCTGTGCAACCAGCTCTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGTACCTGGAATACTTTTCTCTCCCATATCTGTGCAACCAGCTCTT  850

seq1  CTGCCCCTTCTTTAAGCAAATAAAACCTTCTGAGTGACCACAGATTAATT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCCTTCTTTAAGCAAATAAAACCTTCTGAGTGACCACAGATTAATT  900

seq1  GAGGATTACCAGGTCCACAGCTACATTGCCACATAGAGAGTCTACATCTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGATTACCAGGTCCACAGCTACATTGCCACATAGAGAGTCTACATCTG  950

seq1  TAACGGAGAGAATACATTTTGAAACTGCAGGGATATTTTTACCTACTCTA  1000
      | |||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||
seq2  T-ACGGAGAG-ATACA-TTTGAAACTGCA-GGATA-TTTTACCTACTCTA  995

seq1  TTATTCATTGGTCCTGAACTGGTACTTCAATGGTATTGATGCAATTACCA  1050
       |||||| |||||||| |||||||||   |||||| |||||||  |||  
seq2  -TATTCA-TGGTCCTG-ACTGGTACT--CATGGTA-TGATGCA--TAC--  1035

seq1  ACACTACTTTCTGTCATAGCATATAATGTAAACAGAGTCTGTGAGTTGAC  1100
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  ACACTACTTTCTGTCATAGCA-ATAATGTAAACAGAGTCTGTGAG-TGAC  1083

seq1  AATGACCTTAGCGTTCATCTCCATGACATCCCTTAAGTAAGGGCAGAAAC  1150
      ||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||  ||||||||| |||
seq2  AATGACCTTAGCG-TCATCT-CATGAC-TCCC-TAGTTAAGGGCAG-AAC  1128

seq1  AGCCATCCCCCAACACCCATGCTTTGTTGACTCCTTCTTGGACCTGCAGG  1200
      || |||||      | |||||| |||||||   | |||| ||||||||||
seq2  AG-CATCC----TAATCCATGC-TTGTTGA--ACCTCTT-GACCTGCAGG  1169

seq1: chr5_100092315_100093408
seq2: B6Ng01-132M02.g_70_1154 (reverse)

seq1  TGTGTGTATGTCTTCCTCCTAGTCCTGGTACCCTTCCCCATTTTGGCTCT  50
      ||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||||||  ||| ||||
seq2  TGTGTGTATGTCTTCATCCTAGT-CTGGTA--CATCCCCA--TTGACTCT  45

seq1  ACTAGTTATCCATCATTAAAACAATCTTCACATTTATTTATTTACCGTCT  100
      |||||||   ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||
seq2  ACTAGTTTATCATCA-TAAAACAATCTTCACATTAATTTA-TTACCGTCT  93

seq1  CTGGGTCACATGGGCTCCGTGTGTGCCTGTGGACAAAATGTGTCAGAGG-  149
      |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| 
seq2  CTGGGTCACATGGGCT-CGTGTGTG-CTGTGAACAAAATGTGTCAGAGGA  141

seq1  ACAATTTACAGGATTCTGTTTCCTCCTTTCTTCATGTAGGTTCCAGGGAT  199
      ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTTACAGGAATCTG-TTCCTCCTTTCTTCATGTAGGTTCCAGGGAT  190

seq1  CAAACGTGGTCATAGGCCCTGGCAGCCACCACTTTTACCTGCTGAGCCAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CAAACGTGGTCATAGGCCCTGGCAGCCACCACTTTTA-CTGCTGAGCCAT  239

seq1  CTTTCTGGCCCACTTTTAAGTTTTTTATCTGAGATAACCTTGGAATCACA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTGGCCCACTTTTAAGTTTTTTATCTGAGATAACCTTGGAATCACA  289

seq1  GCTTGACAGATCAAGTAAGGAAACGTCTCGTGAAGAG-AAGATAAATAGA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  GCTTGACAGATCAAGTAAGGAAACGTCTCGTGAAGAGAAAGATAAATAGA  339

seq1  TTCTGTAATGAAATACCCAGCCCATCCCCACCACACAGAAATCAAACACG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGTAATGAAATACCCAGCCCATCCCCACCACACAGAAATCAAACACG  389

seq1  AAATCTTGAGTTGAATGGAATACAGTATAACCAAGCCTCAGGAACAAAGC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTTGAGTTGAATGGAATACAGTATAACCAAGCCTCAGGAACAAAGC  439

seq1  TCTGAGAAGAAACACAGCCAACGGACCATCTCATCTCCACAGCGGAAAAT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGAAGAAACACAGCCAACGGACCATCTCATCTCCACAGCGGAAAAT  489

seq1  AATGGCCCGTGAAACGAAGCAGAGATTATTTGGCTCATACTTCATGGATG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGCCCGTGAAACGAAGCAGAGATTATTTGGCTCATACTTCATGGATG  539

seq1  CATTATCATACGTACGAATGATTAAAATGACGTCTCTATGCATGGATGGG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTATCATACGTACGAATGATTAAAATGACGTCTCTATGCATGGATGGG  589

seq1  TAGAACTAAATTTTGAATAATGTTAACACACATGGGAAGTGCCTGCTTTT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACTAAATTTTGAATAATGTTAACACACATGGGAAGTGCCTGCTTTT  639

seq1  ACATCCATGCTATTGAAAGCAAAAATGCTCAAGCTAACTTCTTTTTCATC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCCATGCTATTGAAAGCAAAAATGCTCAAGCTAACTTCTTTTTCATC  689

seq1  TGTTGGTCCCAGTCCATTTCATTAATCTTTCTTTCCATTTCCTATATTCT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGGTCCCAGTCCATTTCATTAATCTTTCTTTCCATTTCCTATATTCT  739

seq1  AGCTTTTAGAGTGTGCTTTTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTTTAGAGTGTGCTTTTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  789

seq1  TGTGTGTGTGTGCGTGCATATGTGTGTATATGTGTGTGTGCGCATGTGTA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTGTGTGCGTGCATATGTGTGTATATGTGTGTGTGCGCATGTGTA  839

seq1  TGTGTGTATGTGTGCATGCATGTTGTGAGTATGCATGTGTGTGTACGTGT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGTATGTGTGCATGCATGTTGTGAGTATGCATGTGTGTGTACGTGT  889

seq1  GTGTGCATGTGTATGTGTGTATGTGTGTGTGCATGTGTGTGTACATCCGT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGCATGTGTATGTGTGTATGTGTGTGTGCATGTGTGTGTACATCCGT  939

seq1  GTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTTGGGGGGCCTAACCTCCCCTTTCTTTTC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTTGGGGGGCCTAACCTCCCCTTTCTTTTC  989

seq1  CTTTATTTTAGTCAAGTTAAAGTGCACTGAAGTTGAAGATACAATTTTCA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATTTTAGTCAAGTTAAAGTGCACTGAAGTTGAAGATACAATTTTCA  1039

seq1  GAATTACTTTTTGGCACTATTTCCAGGCATTTGTCTTAGAGAATTC  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTACTTTTTGGCACTATTTCCAGGCATTTGTCTTAGAGAATTC  1085