BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-135C23
Chromosome5 (Build37)
Map Location 97,181,435 - 97,340,300
singlet/doubletdoublet
Overlap geneFras1, Anxa3
Upstream geneLOC665943, LOC433921, Cxcl13, EG666231, Cnot6l, LOC100040559, Mrpl1
Downstream geneEG666266, LOC670358, Bmp2k, Paqr3, LOC100040598, EG433923, EG666293, C80008, Gk2, Antxr2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-135C23.bB6Ng01-135C23.g
ACCDH935290DH935291
length1,166988
definitionDH935290|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-135C23, 5' end.DH935291|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-135C23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(97,181,435 - 97,182,621)(97,339,311 - 97,340,300)
sequence
gaattccttacaaatttattcaagtttcacaaaggaaaatcaacttattg
aactctgcaggaagaagagccacgtgctaacccttatttactagtcatct
gtgttcataacatatacatatgtcatcataagcccagtttccatgtggga
aagcacaccacagtgtgcaggtgcatgctatttgctgttgattgtattgc
catggttattcacaacttatcaccaaaagtttcaaatggtttggaatgtc
tttataatgtaaaccttgtcatacaggcacctcctagttgggcacaaatt
gctagaattcaaagttctattttataaatgtaactgttgagccatttttg
aattcatgccaattctttgatgctacaaagaggaaaactgtcatctagga
aaacttcctatcttgatcctcctgctacaaggctaaatatgtcttgtgtg
ttggtcgtagacgaagaactgcactgtgtacatccatgatgactccatgt
ttgagcctgaggagcagttcagggtctaccttggccatcctcttggaaat
cactggagtggagccagaattgggaagaacagtgtggccactgtcaccat
atccaacgacgaagatggtaacagaagagaaagccttttggttttgcttc
ggtggccgggacattaactgagagcttatcagtaatatcagtgtcttgga
agggaaagtgctacaggagttcctagttaggtcaacctctgaatatttat
ctagaatgtctgtagcaaatgaacacctactgtggggctcacaggaatcc
ttaatctcactatcccctgcattgtcaaagataaagaacaaatacgttta
aaacctagaacaggaaccttaaagcagagaatgaaagtcatgtaagttgt
cacacgtcagaaagggctagacatacaatcagaaatattgagtcccaaga
actaagctggaacactgctgtctgcctggaaaagcctgatttctgattga
cttctcaaacgacagaaacaccagcctcccgagctgtctaggggcagagc
gagaacacccctttccaggaagtgcaacacgtgtgtttgcgccaaaagca
ctgttaaatcgaacatcgtattcactaatagaatatttaaagtacatatt
cctatgcaaaccctgc
gaattcagtgattgttctccagagctcatgctctaagccccccccccctc
catcttgcctaagaagccccgtagagtagagagatgatggatctatggta
ttgtcctgaacaaactttcagctcacttctatttacatctgctccacttg
ccagaattctcttgccaacctttgcagcgagagatagtagctaaatgctc
agaattaaagagcaacccccaaaacctggaaaagagtctaagtgaacaaa
gcctgcctggaatggaagagctctgagtgaagagagtcagcacagagaag
caaacagaggaccctgtaaggtacagttctactagtcttctcagaatctc
agaagtggaatcctttgaccatatgagggggtggccgtaagctattattt
aagaccatagcaatattggagggaactaccttaccaataatcaaatgtaa
gtattactgctattattaattaacaacttgatgtagttaagtgatgcagc
aaggctttagctactttgtggattattctttcttccacccttctccatct
gttttctgtccttttaaccccctaacactagataggagaaaaaaaaggat
agaaaggaaaagggggtgttatcattaataggtgggactgttcctgctaa
caggggtcttgagtttctgggagcaagtttgatctttgctgtcaagatat
gtgatttcttcttgtttcttctttttgcacaggactacttatcaaactgt
aatcaacaacaaccattaacaaccaacaaccaaccaaccaaccaaccaac
caaccaacaatcaacaactccacctctcagggcccttttttatatattcc
ctgaaaacttccagaattccaaacaccacacaatcgcataaaactgtctt
cagtgtcagatcatgcctcccaccagagctcaaggaaaatcagtcagctg
cttcgtacacgctgaagcagccccatgtcccacacctg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_97181435_97182621
seq2: B6Ng01-135C23.b_45_1210

seq1  GAATTCCTTACAAATTTATTCAAGTTTCACAAAGGAAAATCAACTTATTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTTACAAATTTATTCAAGTTTCACAAAGGAAAATCAACTTATTG  50

seq1  AACTCTGCAGGAAGAAGAGCCACGTGCTAACCCTTATTTACTAGTCATCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCTGCAGGAAGAAGAGCCACGTGCTAACCCTTATTTACTAGTCATCT  100

seq1  GTGTTCATAACATATACATATGTCATCATAAGCCCAGTTTCCATGTGGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTCATAACATATACATATGTCATCATAAGCCCAGTTTCCATGTGGGA  150

seq1  AAGCACACCACAGTGTGCAGGTGCATGCTATTTGCTGTTGATTGTATTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCACACCACAGTGTGCAGGTGCATGCTATTTGCTGTTGATTGTATTGC  200

seq1  CATGGTTATTCACAACTTATCACCAAAAGTTTCAAATGGTTTGGAATGTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTTATTCACAACTTATCACCAAAAGTTTCAAATGGTTTGGAATGTC  250

seq1  TTTATAATGTAAACCTTGTCATACAGGCACCTCCTAGTTGGGCACAAATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATAATGTAAACCTTGTCATACAGGCACCTCCTAGTTGGGCACAAATT  300

seq1  GCTAGAATTCAAAGTTCTATTTTATAAATGTAACTGTTGAGCCATTTTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGAATTCAAAGTTCTATTTTATAAATGTAACTGTTGAGCCATTTTTG  350

seq1  AATTCATGCCAATTCTTTGATGCTACAAAGAGGAAAACTGTCATCTAGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCATGCCAATTCTTTGATGCTACAAAGAGGAAAACTGTCATCTAGGA  400

seq1  AAACTTCCTATCTTGATCCTCCTGCTACAAGGCTAAATATGTCTTGTGTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTTCCTATCTTGATCCTCCTGCTACAAGGCTAAATATGTCTTGTGTG  450

seq1  TTGGTCGTAGACGAAGAACTGCACTGTGTACATCCATGATGACTCCATGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTCGTAGACGAAGAACTGCACTGTGTACATCCATGATGACTCCATGT  500

seq1  TTGAGCCTGAGGAGCAGTTCAGGGTCTACCTTGGCCATCCTCTTGGAAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGCCTGAGGAGCAGTTCAGGGTCTACCTTGGCCATCCTCTTGGAAAT  550

seq1  CACTGGAGTGGAGCCAGAATTGGGAAGAACAGTGTGGCCACTGTCACCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGAGTGGAGCCAGAATTGGGAAGAACAGTGTGGCCACTGTCACCAT  600

seq1  ATCCAACGACGAAGATGGTAACAGAAGAGAAAGCCTTTTGGTTTTGCTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAACGACGAAGATGGTAACAGAAGAGAAAGCCTTTTGGTTTTGCTTC  650

seq1  GGTGGCCGGGACATTAACTGAGAGCTTATCAGTAATATCAGTGTCTTGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGCCGGGACATTAACTGAGAGCTTATCAGTAATATCAGTGTCTTGGA  700

seq1  AGGGAAAGTGCTACAGGAGTTCCTAGTTAGGTCAACCTCTGAATATTTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAAAGTGCTACAGGAGTTCCTAGTTAGGTCAACCTCTGAATATTTAT  750

seq1  CTAGAATGTCTGTAGCAAATGAACACCTACTGTGGGGCTCACAGGAATCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAATGTCTGTAGCAAATGAACACCTACTGTGGGGCTCACAGGAATCC  800

seq1  TTAATCTCACTATCCCCTGCATTGTCAAAGATAAAGAACAAATACGTTTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCTCACTATCCCCTGCATTGTCAAAGATAAAGAACAAATACGTTTA  850

seq1  AAACCTAGAACAGGAACCTTAAAGCAGAGAATGAAAGTCATGTAAGTTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTAGAACAGGAACCTTAAAGCAGAGAATGAAAGTCATGTAAGTTGT  900

seq1  CACACGTCAGGAAGGGGCTAGACATACAATCAGAAATATTTGAGTCCCAA  950
      ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CACACGTCA-GAAAGGGCTAGACATACAATCAGAAATA-TTGAGTCCCAA  948

seq1  GAACTAAGCTGGAACACTGCTGTCTGCCTGGAAAAGCCTGATTTCTGATT  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTAAGCTGGAACACTGCTGTCTGCCTGGAAAAGCCTGATTTCTGATT  998

seq1  GACTTCTCAAACCGACAGAAACAACCAGCCTCCCGAGCTGTCTAGGGGCA  1050
      ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTCTCAAA-CGACAGAAAC-ACCAGCCTCCCGAGCTGTCTAGGGGCA  1046

seq1  GAGCGAGAACACCCCTTTCCAGGGAAGTGGCAACACGTGTTGTTTGCGCC  1100
      ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||
seq2  GAGCGAGAACACCCCTTTCCA-GGAAGT-GCAACACGTG-TGTTTGCGCC  1093

seq1  AAACAGCACCTGTTTTAAATCGAAACATCGTTATTTCACTAAAATAGATT  1150
      ||| |||||   | |||||||| ||||||||   ||||||  |||||| |
seq2  AAA-AGCAC---TGTTAAATCG-AACATCGT--ATTCACT--AATAGAAT  1134

seq1  ATTTTAACAGGTGACTATATACTAATGCAAACCCTGC  1187
      |||| ||   || || |||| |  |||||||||||||
seq2  ATTTAAA---GT-AC-ATATTCCTATGCAAACCCTGC  1166

seq1: chr5_97339311_97340300
seq2: B6Ng01-135C23.g_68_1055 (reverse)

seq1  CAGGTGTGGGACATGGGGCTGCTTCAGCGTGTACGAAGCAGCTGACTGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTGTGGGACATGGGGCTGCTTCAGCGTGTACGAAGCAGCTGACTGAT  50

seq1  TTTCCTTGAGCTCTGGTGGG-GGCATGATTCTGACACTTGAAGACAGTTT  99
      |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||
seq2  TTTCCTTGAGCTCTGGTGGGAGGCATGA-TCTGACAC-TGAAGACAGTTT  98

seq1  TATGCGATTGTGTGGTGTTTGGAATTCTGGAAAGTTTTCAGGGAATATAT  149
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TATGCGATTGTGTGGTGTTTGGAATTCTGG-AAGTTTTCAGGGAATATAT  147

seq1  AAAAAAGGGCCCTGAGAGGTGGAGTTGTTGATTGTTGGTTGGTTGGTTGG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAGGGCCCTGAGAGGTGGAGTTGTTGATTGTTGGTTGGTTGGTTGG  197

seq1  TTGGTTGGTTGGTTGTTGGTTGTTAATGGTTGTTGTTGATTACAGTTTGA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTGGTTGGTTGTTGGTTGTTAATGGTTGTTGTTGATTACAGTTTGA  247

seq1  TAAGTAGTCCTGTGCAAAAAGAAGAAACAAGAAGAAATCACATATCTTGA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTAGTCCTGTGCAAAAAGAAGAAACAAGAAGAAATCACATATCTTGA  297

seq1  CAGCAAAGATCAAACTTGCTCCCAGAAACTCAAGACCCCTGTTAGCAGGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAAGATCAAACTTGCTCCCAGAAACTCAAGACCCCTGTTAGCAGGA  347

seq1  ACAGTCCCACCTATTAATGATAACACCCCCTTTTCCTTTCTATCCTTTTT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCCCACCTATTAATGATAACACCCCCTTTTCCTTTCTATCCTTTTT  397

seq1  TTTCTCCTATCTAGTGTTAGGGGGTTAAAAGGACAGAAAACAGATGGAGA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCCTATCTAGTGTTAGGGGGTTAAAAGGACAGAAAACAGATGGAGA  447

seq1  AGGGTGGAAGAAAGAATAATCCACAAAGTAGCTAAAGCCTTGCTGCATCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGGAAGAAAGAATAATCCACAAAGTAGCTAAAGCCTTGCTGCATCA  497

seq1  CTTAACTACATCAAGTTGTTAATTAATAATAGCAGTAATACTTACATTTG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAACTACATCAAGTTGTTAATTAATAATAGCAGTAATACTTACATTTG  547

seq1  ATTATTGGTAAGGTAGTTCCCTCCAATATTGCTATGGTCTTAAATAATAG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTGGTAAGGTAGTTCCCTCCAATATTGCTATGGTCTTAAATAATAG  597

seq1  CTTACGGCCACCCCCTCATATGGTCAAAGGATTCCACTTCTGAGATTCTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACGGCCACCCCCTCATATGGTCAAAGGATTCCACTTCTGAGATTCTG  647

seq1  AGAAGACTAGTAGAACTGTACCTTACAGGGTCCTCTGTTTGCTTCTCTGT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGACTAGTAGAACTGTACCTTACAGGGTCCTCTGTTTGCTTCTCTGT  697

seq1  GCTGACTCTCTTCACTCAGAGCTCTTCCATTCCAGGCAGGCTTTGTTCAC  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACTCTCTTCACTCAGAGCTCTTCCATTCCAGGCAGGCTTTGTTCAC  747

seq1  TTAGACTCTTTTCCAGGTTTTGGGGGTTGCTCTTTAATTCTGAGCATTTA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGACTCTTTTCCAGGTTTTGGGGGTTGCTCTTTAATTCTGAGCATTTA  797

seq1  GCTACTATCTCTCGCTGCAAAGGTTGGCAAGAGAATTCTGGCAAGTGGAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTACTATCTCTCGCTGCAAAGGTTGGCAAGAGAATTCTGGCAAGTGGAG  847

seq1  CAGATGTAAATAGAAGTGAGCTGAAAGTTTGTTCAGGACAATACCATAGA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATGTAAATAGAAGTGAGCTGAAAGTTTGTTCAGGACAATACCATAGA  897

seq1  TCCATCATCTCTCTACTCTACGGGGCTTCTTAGGCAAGATGGAGGGGGGG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCATCTCTCTACTCTACGGGGCTTCTTAGGCAAGATGGAGGGGGGG  947

seq1  GGGGCTTAGAGCATGAGCTCTGGAGAACAATCACTGAATTC  990
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCTTAGAGCATGAGCTCTGGAGAACAATCACTGAATTC  988