BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-137N24
Chromosome5 (Build37)
Map Location 51,980,830 - 51,981,952
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100041015, LOC242987, EG624734, LOC666265, LOC100041059, Ppargc1a
Downstream geneDhx15, Sod3, Gm447, LOC100041805, Lgi2, LOC545750
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-137N24.g
ACCDH937277
length1,104
definitionDH937277|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-137N24, 3' end.
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattctttagttcctggacattgaaacaaccaaagatgttccaagatta
ggtggtactgtgacattatgagcagattcagatagcctcccaagcagcta
tttaccatctagtgttgggtatttgacaagtggttctgcaataatggtga
gccacagctgaacagtaaccccaatctgatttatctggtttaggatatat
ggattattcttcttgggtatatttaatagaatttccatagaggggaaatg
ctatttccggcagagaaattgaggcaggaaaattattctgtgccctcagc
tagtcttcctaaacatatgacttaagacaacacaaaaattggatttaagt
gttgtgtcaaacagggaaatgcacagagcacccctgcataaaatgatgct
atggtatggtgcccacagcatgagaccaggtgctgtgcaaggtaggaaga
aggcttggatacgttcttcaagatgaaaacatgaaatccttggattgtgc
tcacatcatagtgcacgagtgttaacccaacatctaaggatgcaggctga
gttaaccacaagtctttgtgatagaacttcatgtgcgatttcggagccag
agctgagtttcccgggacaacagggatgactctcaaagctgctgactcaa
agctatcctagactcccatgcagtccttgctggaagtgatgctgccctgc
tggggctgcatgtgaacatagctagatgccaacaacaggttcagtaccag
ctatttgtagacaggaaatacctgtgtgtggaaatcagtgtgtggaaagg
gccaatgcttagaatggctttgatgtcaatgggaaaagggctgagacagt
cccaagggttgaatcctcccagaaacgacacattttcatcaaggattcac
attttgctgcttcttctatggatcatttcctagaagataatacaataact
ggaatatgagagctaacacctgacacctttactgagcatcattgcctaga
ctaagtcttacagcttcttctcataatccttttatagccctatgagagaa
tttagattgttcactttatgacggatgtaagaggccttaggctcatcaaa
gaag
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_51980830_51981952
seq2: B6Ng01-137N24.g_69_1172

seq1  GAATTCTTTAGTTCCTGGACATTGAAACAACCAAAGATGTTCCAAGATTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAGTTCCTGGACATTGAAACAACCAAAGATGTTCCAAGATTA  50

seq1  GGTGGTACTGTGACATTATGAGCAGATTCAGATAGCCTCCCAAGCAGCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGTACTGTGACATTATGAGCAGATTCAGATAGCCTCCCAAGCAGCTA  100

seq1  TTTACCATCTAGTGTTGGGTATTTGACAAGTGGTTCTGCAATAATGGTGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCATCTAGTGTTGGGTATTTGACAAGTGGTTCTGCAATAATGGTGA  150

seq1  GCCACAGCTGAACAGTAACCCCAATCTGATTTATCTGGTTTAGGATATAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACAGCTGAACAGTAACCCCAATCTGATTTATCTGGTTTAGGATATAT  200

seq1  GGATTATTCTTCTTGGGTATATTTAATAGAATTTCCATAGAGGGGAAATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATTATTCTTCTTGGGTATATTTAATAGAATTTCCATAGAGGGGAAATG  250

seq1  CTATTTCCGGCAGAGAAATTGAGGCAGGAAAATTATTCTGTGCCCTCAGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTCCGGCAGAGAAATTGAGGCAGGAAAATTATTCTGTGCCCTCAGC  300

seq1  TAGTCTTCCTAAACATATGACTTAAGACAACACAAAAATTGGATTTAAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTTCCTAAACATATGACTTAAGACAACACAAAAATTGGATTTAAGT  350

seq1  GTTGTGTCAAACAGGGAAATGCACAGAGCACCCCTGCATAAAATGATGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTGTCAAACAGGGAAATGCACAGAGCACCCCTGCATAAAATGATGCT  400

seq1  ATGGTATGGTGCCCACAGCATGAGACCAGGTGCTGTGCAAGGTAGGAAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTATGGTGCCCACAGCATGAGACCAGGTGCTGTGCAAGGTAGGAAGA  450

seq1  AGGCTTGGATACGTTCTTCAAGATGAAAACATGAAATCCTTGGATTGTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTTGGATACGTTCTTCAAGATGAAAACATGAAATCCTTGGATTGTGC  500

seq1  TCACATCATAGTGCACGAGTGTTAACCCAACATCTAAGGATGCAGGCTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATCATAGTGCACGAGTGTTAACCCAACATCTAAGGATGCAGGCTGA  550

seq1  GTTAACCACAAGTCTTTGTGATAGAACTTCATGTGCGATTTCGGAGCCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAACCACAAGTCTTTGTGATAGAACTTCATGTGCGATTTCGGAGCCAG  600

seq1  AGCTGAGTTTCCCGGGACAACAGGGATGACTCTCAAAGCTGCTGACTCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAGTTTCCCGGGACAACAGGGATGACTCTCAAAGCTGCTGACTCAA  650

seq1  AGCTATCCTAGACTCCCATGCAGTCCTTGCTGGAAGTGATGCTGCCCTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTATCCTAGACTCCCATGCAGTCCTTGCTGGAAGTGATGCTGCCCTGC  700

seq1  TGGGGCTGCATGTGAACATAGCTAGATGCCAACAACAGGTTCAGTACCAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGCTGCATGTGAACATAGCTAGATGCCAACAACAGGTTCAGTACCAG  750

seq1  CTATTTGTAGACAGGAAATACCTGTGTGTGGAAATCAGTGTGTGG-AAGG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  CTATTTGTAGACAGGAAATACCTGTGTGTGGAAATCAGTGTGTGGAAAGG  800

seq1  GCCAATGCTTAGAATGGCTTTGATGTCAAT-GGAAAAGGGCTGAGACAGT  848
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  GCCAATGCTTAGAATGGCTTTGATGTCAATGGGAAAAGGGCTGAGACAGT  850

seq1  CCCAA-GGTTGAATCCTCCCAGAAACGACAACATTTCAATCAAGGATTCA  897
      ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||
seq2  CCCAAGGGTTGAATCCTCCCAGAAACGAC-ACATTTTCATCAAGGATTCA  899

seq1  CATTTTGCTGCCTTCTTCTATGGATCATTTTCCTAG-AGATAATAACAAT  946
      |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||
seq2  CATTTTGCTG-CTTCTTCTATGGATCA-TTTCCTAGAAGATAAT-ACAAT  946

seq1  AACTGGAATAATGAGGAGGCTAACACCTGACACCTTTTACTGAGCATTCA  996
      ||||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||
seq2  AACTGGAAT-ATGAG--AGCTAACACCTGACACC-TTTACTGAGCA-TCA  991

seq1  TTTGCCCTAGACTAAGTCTTTACAAGGCTCTTCTCATTAAATCTTTTTAA  1046
      ||   ||||||||||||| |||| ||  |||||||||  |||| |||| |
seq2  TT--GCCTAGACTAAGTC-TTAC-AGCTTCTTCTCAT--AATCCTTTT-A  1034

seq1  TAGCCCTATGAGGAAGATATTAGTATTGTTCCACTTTATAGCAGAGTGTT  1096
      ||||||||||||  |||  |||| |||||| ||||||||  | || ||| 
seq2  TAGCCCTATGAG--AGAATTTAG-ATTGTT-CACTTTATGACGGA-TGT-  1078

seq1  AAAGAGGCCCTAAGCTCATCAAAGAAG  1123
       |||||||| || ||||||||||||||
seq2  -AAGAGGCCTTAGGCTCATCAAAGAAG  1104