seq1: chr5_6824511_6824785
seq2: B6Ng01-146E06.b_51_325 (reverse)
seq1 CCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCATTCTTCTACCTGATCCTCTTTTTT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCATTCTTCTACCTGATCCTCTTTTTT 50
seq1 CTTTCTTTCTTTTGATGGAGATGCACTATGTCGTTGTCCTGGAAATTATG 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTTCTTTCTTTTGATGGAGATGCACTATGTCGTTGTCCTGGAAATTATG 100
seq1 ATTCTCCTGTTTGAGAATTCAAATTACTAGGATTACAATATATGCCACTA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTCTCCTGTTTGAGAATTCAAATTACTAGGATTACAATATATGCCACTA 150
seq1 TATCCAGCTTGAAAATACTTATTTAAAAAATTGATTTAGGATGTATTGTG 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATCCAGCTTGAAAATACTTATTTAAAAAATTGATTTAGGATGTATTGTG 200
seq1 GTTTTGTGATTGTCTATTGACAGGTGAGTGAAAATAGAGGTTGTCACTCA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTTTTGTGATTGTCTATTGACAGGTGAGTGAAAATAGAGGTTGTCACTCA 250
seq1 GGATAATGATATGGGAAGATAAAGT 275
|||||||||||||||||||||||||
seq2 GGATAATGATATGGGAAGATAAAGT 275
| seq1: chr5_6655714_6656762
seq2: B6Ng01-146E06.g_66_1112
seq1 GAATTCCCATGACTCCTTAACTAGCAGAAACCAAATGGATCCTGTGTTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCCCATGACTCCTTAACTAGCAGAAACCAAATGGATCCTGTGTTTC 50
seq1 CTTGAGGTGACAATTTAAATTCTAATTTTGACTACTCATTTTAAAAGAAA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTGAGGTGACAATTTAAATTCTAATTTTGACTACTCATTTTAAAAGAAA 100
seq1 CAGGAGGCACCCAGCTAAAGCCCAGCATGTAATTGGACCTAAGTCACAGT 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGGAGGCACCCAGCTAAAGCCCAGCATGTAATTGGACCTAAGTCACAGT 150
seq1 TTCTGCTTGTAATGATGTCCCTGAAGTCAGATGGTTTAAACTAGGAATAA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCTGCTTGTAATGATGTCCCTGAAGTCAGATGGTTTAAACTAGGAATAA 200
seq1 AACCATGATTTTAGCTTCTTCAGTTGAGGATTATAGTTATTTTGTATATA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AACCATGATTTTAGCTTCTTCAGTTGAGGATTATAGTTATTTTGTATATA 250
seq1 AGTTGTATATTTTCTAGGGCCATATATAGTTTAATTATTTTTAAAATGCA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTTGTATATTTTCTAGGGCCATATATAGTTTAATTATTTTTAAAATGCA 300
seq1 CTTATTGGCAATAATTAGTAAAACAAGAGTACGAGGTGTGAAAATAAAAA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTATTGGCAATAATTAGTAAAACAAGAGTACGAGGTGTGAAAATAAAAA 350
seq1 TAGAATAGAAAAAAATCAAATCAGGCAACAATAAGTTGGATAATGTTGGA 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGAATAGAAAAAAATCAAATCAGGCAACAATAAGTTGGATAATGTTGGA 400
seq1 GTAAATTAAAAGGTCATAATAGAGGTCTAGAAAATATATGCAAGAAAATT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTAAATTAAAAGGTCATAATAGAGGTCTAGAAAATATATGCAAGAAAATT 450
seq1 AAAATGTACATGTGGATCATTTGGCTGGAGGGTCTGGAAGATACTCAATC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAAATGTACATGTGGATCATTTGGCTGGAGGGTCTGGAAGATACTCAATC 500
seq1 TTAGCAATTAATGCAACTAATATTATATGTGATACTCTGGACTGCAATAT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTAGCAATTAATGCAACTAATATTATATGTGATACTCTGGACTGCAATAT 550
seq1 GCTTAAGAAGGATTGTGATGAAAGGAGCTTCACAGACCACTCACAAAAAT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCTTAAGAAGGATTGTGATGAAAGGAGCTTCACAGACCACTCACAAAAAT 600
seq1 CCAGGAGTGGGATCGTAGTGTACAGCAAAGAATGGGAAAATGAGCCAAAC 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCAGGAGTGGGATCGTAGTGTACAGCAAAGAATGGGAAAATGAGCCAAAC 650
seq1 TGGGTCAAGCAAAGAGGGGTTGATAAATAAAATGATGTGCATAAGAGAGA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGGTCAAGCAAAGAGGGGTTGATAAATAAAATGATGTGCATAAGAGAGA 700
seq1 GGAGAGAACGGAGGGGTGATATCAGGAATGGGAAGGATC-AACAAC-TAA 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
seq2 GGAGAGAACGGAGGGGTGATATCAGGAATGGGAAGGATCAAACAACTTAA 750
seq1 GGCAGCACACGACTTTATACTTCTATTTAGAGATCTGCATGCTGTAATCA 798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGCAGCACACGACTTTATACTTCTATTTAGAGATCTGCATGCTGTAATCA 800
seq1 TAGCTTTGGGGTATACATTTGCCTTTCCTTGAATAAATAGTGGATGTACA 848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGCTTTGGGGTATACATTTGCCTTTCCTTGAATAAATAGTGGATGTACA 850
seq1 TTATGTAAAAAGGATATTCCTTTCTTTCCTAGTATTTTTAACTACTGAGA 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTATGTAAAAAGGATATTCCTTTCTTTCCTAGTATTTTTAACTACTGAGA 900
seq1 AAGACAAATCTAGGTGGGTAGCTGGCCTTCAAAGAAATTCTCTAAATATA 948
||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||
seq2 AAGACAATTCTGGGTGGGTAGCTGGCCTTCAAAG-AATTCTCT-AATATA 948
seq1 GATGGTTGCTTGAAAGTTCATTCTAGACTTAATTACATATTATTAATTTG 998
||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||| |||
seq2 GATTGTTGCTTGAAAG-TCATTCTAGACTTATTTAC--AATATTAA-TTG 994
seq1 TTCCTAGTA-GGAGAGACATT-CTTGTTTAAGACTCATGAAAACCCTGAG 1046
||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCCTAGTAGGGAAAGACATTCCTGGTTTAAGACTCATGAAAACCCTGAG 1044
seq1 AAG 1049
|||
seq2 AAG 1047
|
