BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155F10
Chromosome5 (Build37)
Map Location 27,446,740 - 27,608,985
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDpp6
Upstream geneLOC434689, LOC664837, 4930584F24Rik, B930011P16Rik
Downstream geneSpeer4b, Paxip1, Htr5a, EG433862, LOC231069, Insig1, En2, Cnpy1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155F10.bB6Ng01-155F10.g
ACCDH950150DH950151
length1,138962
definitionDH950150|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155F10, 5' end.DH950151|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155F10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(27,607,829 - 27,608,985)(27,446,740 - 27,447,707)
sequence
gaattccagttcctttttggaaagagaagctttgctatttttcaatattc
ttctaagaaatggagtaaacatcactcctcaaaaattaaataaataaata
gaaatcagaacagatttcaaatgagagtggcatagaagattttatctcat
tttccacttctaccattactaattcttcattgatacaatggctaaccata
tgacaacatgtcccccagtgaagcctgagaataaagaggattgctgctaa
acccccactcaggacaattgtcaaaacagaaaaatgtcgtatgcacattg
ggatatgcctaaggttgggatatatcagatacactggcatctagtctcac
tctaacaatgagcggcttttttctgtttttctctgtcaccattacctcaa
gcacttattcgttgatattgctattgctgcttttgttaatacagggtatt
tctatgaagtcctggccagcttgaaattcattatggagaccagactggcc
ctgaacattcagcaatcagtcttcttgtttctggctcccgagggcaggga
ttacaggtgtgtacagtgcgaccagcttctaattacatttacttgtagtt
ctcaaatgtgtctggaagcctagataaagtttctttttccagtggcatac
atctgtgtatggacagcagcaatttcccaaggagttcagacaccaaggaa
aacattgggagcaacactgaagagtagaagctggtgctgtaaacttcttg
ctaataggaagctgaatgcactcatgtttgcttttaacagtgcctgtcat
cctgggacacactgagcagcacctgcaggttacagaggctcatcaccttt
ttctcacagtacctaattattaattattaggcaaagctatgagttactac
taaacaatccacccctataacaaaaatcgtgtggaaaatggtatatgtct
atgcatcagccacccaaattacatgatggctacagcagtcagcttcaagt
gtacttacagtctgagagcattgtcttgcgtgcaatgttatgagttgact
gtgtccctgatgtcagtgctagagactgacccccccccccaatgctgtat
ggaaaggaaagttctttagagctgaacataccttatta
gaattcagatgaggtagagcgggttgactggtgaatgagtggctgagctg
taagtccggagctgtagggtgagaactcagtacctgcttcccactcctgc
tgatcacatgggttgcacaaagctgtggtagggtgggcaaaaatgaacaa
atatgtttggcgaattctgcatcccatgcagctaaattcaaggatgtatt
ctaagagttagttgatgttttaaaatgatgggtactcttccaaggctctc
aaagtagacatagagtgtcacacgctccaaccttgcatggtcacagtctg
ttacacctaaagagcatccatgctgcttgaccatccactgggaagtcgct
agtgtgagccaatccaaaaccattttgctttggacatctctgactgtgag
atctaagagaggcttcaaattagcttttgggattcaaagccctcactagc
aaatcaaaaggccctttcaaaagtgggtcaactccttcagatgactcctg
tcctttgttctgtaattacaatgcacatcaagaatatgatcaaagtccta
tttggagaatattggattaacagaatgtttgatgaaatcaataattggaa
tgatgagggacttttactaattacatctggaagagctaatattgtctgtg
gggatgaaataggaggctttgttccttatgtaaatgatggtggtataaag
gaaatgtgtcttggaaggacgccctttggactctggtttctctgtgtttg
atggaagggaatgcaaggagaaaagaatacacaggtccctgaaactttga
gattcttaattacactagaaatgagttcagttcataaatttggggtatgc
ctttcaaaagtaatttcagcctggaaataataaaagacattgaatcttct
ttattacttttgtatactcccttttctctctggtaatcaaggtaatgtga
ttgttttatttt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_27607829_27608985
seq2: B6Ng01-155F10.b_48_1185 (reverse)

seq1  TAATAAGGGTATAGTTCAGCTCTTAAGGGACTTTCCTCTTCACACTACAG  50
      |||||| ||||| ||||||||| ||| | |||||||| | ||   |||||
seq2  TAATAA-GGTAT-GTTCAGCTC-TAAAGAACTTTCCTTTCCA---TACAG  44

seq1  CATTGGGGGGGGGGGGTCAGGTCTCTAGCACTTGACATCAGGGAACACAG  100
      |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||
seq2  CATT-GGGGGGGGGGGTCA-GTCTCTAGCAC-TGACATCAGGG-ACACAG  90

seq1  TCAACTCATAACATTGGCACGCAAGACAATTGCTCCTTCAGACTGTAAGT  150
      ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||
seq2  TCAACTCATAACATT-GCACGCAAGACAA-TGCTC--TCAGACTGTAAGT  136

seq1  ACAACTTGAAGCTGACTGCTGTAGCCATCATGTAATTTGGGTGGCTGATG  200
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AC-ACTTGAAGCTGACTGCTGTAGCCATCATGTAATTTGGGTGGCTGATG  185

seq1  CATAGACATTATACCATTTTCCCACCACGATTTTTTGTTATAGGGGTGGA  250
      |||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||
seq2  CATAGACA-TATACCATTTTCC--ACACGA-TTTTTGTTATAGGGGTGGA  231

seq1  TTGTTTAGTAGTAACTCATAGCTTTGCCTAATAATTAATAATTAGGTACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTTAGTAGTAACTCATAGCTTTGCCTAATAATTAATAATTAGGTACT  281

seq1  GTGAGAAAAAGGTGATGAGCCTCTGTAACCTGCAGGTGCTGCTCAGTGTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGAAAAAGGTGATGAGCCTCTGTAACCTGCAGGTGCTGCTCAGTGTG  331

seq1  TCCCAGGATGACAGGCACTGTTAAAAGCAAACATGAGTGCATTCAGCTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGGATGACAGGCACTGTTAAAAGCAAACATGAGTGCATTCAGCTTC  381

seq1  CTATTAGCAAGAAGTTTACAGCACCAGCTTCTACTCTTCAGTGTTGCTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTAGCAAGAAGTTTACAGCACCAGCTTCTACTCTTCAGTGTTGCTCC  431

seq1  CAATGTTTTCCTTGGTGTCTGAACTCCTTGGGAAATTGCTGCTGTCCATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGTTTTCCTTGGTGTCTGAACTCCTTGGGAAATTGCTGCTGTCCATA  481

seq1  CACAGATGTATGCCACTGGAAAAAGAAACTTTATCTAGGCTTCCAGACAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGATGTATGCCACTGGAAAAAGAAACTTTATCTAGGCTTCCAGACAC  531

seq1  ATTTGAGAACTACAAGTAAATGTAATTAGAAGCTGGTCGCACTGTACACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGAGAACTACAAGTAAATGTAATTAGAAGCTGGTCGCACTGTACACA  581

seq1  CCTGTAATCCCTGCCCTCGGGAGCCAGAAACAAGAAGACTGATTGCTGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTAATCCCTGCCCTCGGGAGCCAGAAACAAGAAGACTGATTGCTGAA  631

seq1  TGTTCAGGGCCAGTCTGGTCTCCATAATGAATTTCAAGCTGGCCAGGACT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCAGGGCCAGTCTGGTCTCCATAATGAATTTCAAGCTGGCCAGGACT  681

seq1  TCATAGAAATACCCTGTATTAACAAAAGCAGCAATAGCAATATCAACGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATAGAAATACCCTGTATTAACAAAAGCAGCAATAGCAATATCAACGAA  731

seq1  TAAGTGCTTGAGGTAATGGTGACAGAGAAAAACAGAAAAAAGCCGCTCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTGCTTGAGGTAATGGTGACAGAGAAAAACAGAAAAAAGCCGCTCAT  781

seq1  TGTTAGAGTGAGACTAGATGCCAGTGTATCTGATATATCCCAACCTTAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGAGTGAGACTAGATGCCAGTGTATCTGATATATCCCAACCTTAGG  831

seq1  CATATCCCAATGTGCATACGACATTTTTCTGTTTTGACAATTGTCCTGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATCCCAATGTGCATACGACATTTTTCTGTTTTGACAATTGTCCTGAG  881

seq1  TGGGGGTTTAGCAGCAATCCTCTTTATTCTCAGGCTTCACTGGGGGACAT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGTTTAGCAGCAATCCTCTTTATTCTCAGGCTTCACTGGGGGACAT  931

seq1  GTTGTCATATGGTTAGCCATTGTATCAATGAAGAATTAGTAATGGTAGAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTCATATGGTTAGCCATTGTATCAATGAAGAATTAGTAATGGTAGAA  981

seq1  GTGGAAAATGAGATAAAATCTTCTATGCCACTCTCATTTGAAATCTGTTC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAAAATGAGATAAAATCTTCTATGCCACTCTCATTTGAAATCTGTTC  1031

seq1  TGATTTCTATTTATTTATTTAATTTTTGAGGAGTGATGTTTACTCCATTT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTCTATTTATTTATTTAATTTTTGAGGAGTGATGTTTACTCCATTT  1081

seq1  CTTAGAAGAATATTGAAAAATAGCAAAGCTTCTCTTTCCAAAAAGGAACT  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAAGAATATTGAAAAATAGCAAAGCTTCTCTTTCCAAAAAGGAACT  1131

seq1  GGAATTC  1157
      |||||||
seq2  GGAATTC  1138

seq1: chr5_27446740_27447707
seq2: B6Ng01-155F10.g_70_1031

seq1  GAATTCAGATGAGGTAGAGCGGGTTGACTGGTGAATGAGTGGCTGAGCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGATGAGGTAGAGCGGGTTGACTGGTGAATGAGTGGCTGAGCTG  50

seq1  TAAGTCCGGAGCTGTAGGGTGAGAACTCAGTACCTGCTTCCCACTCCTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTCCGGAGCTGTAGGGTGAGAACTCAGTACCTGCTTCCCACTCCTGC  100

seq1  TGATCACATGGGTTGCACAAAGCTGTGGTAGGGTGGGCAAAAATGAACAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATCACATGGGTTGCACAAAGCTGTGGTAGGGTGGGCAAAAATGAACAA  150

seq1  ATATGTTTGGCGAATTCTGCATCCCATGCAGCTAAATTCAAGGATGTATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTTTGGCGAATTCTGCATCCCATGCAGCTAAATTCAAGGATGTATT  200

seq1  CTAAGAGTTAGTTGATGTTTTAAAATGATGGGTACTCTTCCAAGGCTCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGAGTTAGTTGATGTTTTAAAATGATGGGTACTCTTCCAAGGCTCTC  250

seq1  AAAGTAGACATAGAGTGTCACACGCTCCAACCTTGCATGGTCACAGTCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTAGACATAGAGTGTCACACGCTCCAACCTTGCATGGTCACAGTCTG  300

seq1  TTACACCTAAAGAGCATCCATGCTGCTTGACCATCCACTGGGAAGTCGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACACCTAAAGAGCATCCATGCTGCTTGACCATCCACTGGGAAGTCGCT  350

seq1  AGTGTGAGCCAATCCAAAACCATTTTGCTTTGGACATCTCTGACTGTGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGAGCCAATCCAAAACCATTTTGCTTTGGACATCTCTGACTGTGAG  400

seq1  ATCTAAGAGAGGCTTCAAATTAGCTTTTGGGATTCAAAGCCCTCACTAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAGAGAGGCTTCAAATTAGCTTTTGGGATTCAAAGCCCTCACTAGC  450

seq1  AAATCAAAAGGCCCTTTCAAAAGTGGGTCAACTCCTTCAGATGACTCCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCAAAAGGCCCTTTCAAAAGTGGGTCAACTCCTTCAGATGACTCCTG  500

seq1  TCCTTTGTTCTGTAATTACAATGCACATCAAGAATATGATCAAAGTCCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTGTTCTGTAATTACAATGCACATCAAGAATATGATCAAAGTCCTA  550

seq1  TTTGGAGAATATTGGATTAACAGAATGTTTGATGAAATCAATAATTGGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAGAATATTGGATTAACAGAATGTTTGATGAAATCAATAATTGGAA  600

seq1  TGATGAGGGACTTTTACTAATTACATCTGGAAGAGCTAATATTGTCTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGAGGGACTTTTACTAATTACATCTGGAAGAGCTAATATTGTCTGTG  650

seq1  GGGATGAAATAGGAGGCTTTGTTCCTTATGTAAATGATGGTGGTATAAAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGATGAAATAGGAGGCTTTGTTCCTTATGTAAATGATGGTGGTATAAAG  700

seq1  GAAATGTGTCTTGGAAGGACGCCCTTTGGACTCTGGTTTCTCTGTGTTTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAATGTGTCTTGGAAGGACGCCCTTTGGACTCTGGTTTCTCTGTGTTTG  750

seq1  ATGGAAGGGAATGCAAGGAGAAAAGAATACACAGGTCCCTGAAAC-TTGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  ATGGAAGGGAATGCAAGGAGAAAAGAATACACAGGTCCCTGAAACTTTGA  800

seq1  GATTC-TAATTACACTAGAAATGAGTTCAGTTCATAAATT--GGGTATGC  846
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||
seq2  GATTCTTAATTACACTAGAAATGAGTTCAGTTCATAAATTTGGGGTATGC  850

seq1  CTTTCAAAAGTTAAATATCAGCCTGGAAATATAAAAAGACATTTGATCCT  896
      |||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||  ||
seq2  CTTTCAAAAGT--AATTTCAGCCTGGAAATAATAAAAGACA-TTGAATCT  897

seq1  TCATTTATTTACTTTTGTATACTCACATTTTCTCTTCCTGTAAATCAAGG  946
      || |||| |||||||||||||||| | ||||||||  |||  |||||| |
seq2  TC-TTTA-TTACTTTTGTATACTC-CCTTTTCTCT--CTGGTAATCAA-G  941

seq1  GTAATGTGATTTGTTTTATTTT  968
      ||||||||| ||||||||||||
seq2  GTAATGTGA-TTGTTTTATTTT  962