BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-158A10
Chromosome5 (Build37)
Map Location 95,212,362 - 95,351,258
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100041179
Upstream geneEG665802, LOC100040408, LOC100040981, EG622719, LOC100041003, BC061212, EG622744, LOC100041032, LOC100041042, LOC624421, AA792892, LOC665521, LOC665551, LOC100041102, LOC665560, LOC100041115, LOC624507, LOC621203, LOC100041153, LOC665499, LOC624698
Downstream geneLOC624655, LOC100041166, LOC665469, LOC622894, EG666121, LOC666125, EG666133, LOC100041296, LOC100041253, LOC100041264, EG624049, EG666159, LOC666164, EG666169, D5Ertd577e, LOC100041354, LOC100040503, LOC666187, EG622731, LOC100041380, EG666203, EG666209, LOC665943, LOC433921
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-158A10.bB6Ng01-158A10.g
ACCDH952097DH952098
length1,1391,078
definitionDH952097|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158A10, 5' end.DH952098|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158A10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,350,112 - 95,351,258)(95,212,362 - 95,213,448)
sequence
gaattcccataagcaggttgatgacaatgggtttctacaattttcaggca
ttcctgggtcgcaaaagcatatcatatccaaaaaagaaaactttgtttaa
atgatgcaaagacaaaggtaagacacatgagtaacacgcaagtttcattc
tagctattgggaatggaaggagatcaaagatgcatggtctacaatgtgag
taagggtctcacaaaaacaaataaagacaattacttcagtgaaaggaaac
aggagggcacatgttagtcataatgatctgatttctaccttaccaagact
cacatggttaacaacatagagcatacttgtctcaaaaaattatatggaga
acaccaatgaaatatacatgctatcatagaaatatattggtgatgaggct
aaaactttatttggaatgaaagccaacatcttcaatgtgttcttctaaag
aaatggaaattaaaatttggaatcctatcctggagtctaaatttctctac
ttcaaactgcatgactgaagggaaaatcatgacatgcctattgtaagcac
agcagatcagtctctgagtctcagatgaaccaggcagctatccaggctcc
aggtctctgaatattatctatgtctccactgaagcctttataaaactctc
tgcctactcctccctgttgcagccatgcctccaaacacaaactggaattg
aattagatctttaaacttcaccctttaaattgtattcataacatccatta
cacggattgattcagagttcattgtgagtatatctccatgttgccccgcc
cctcaaacatttcacttattaattaacatcacatcacttaatttgtgata
tttttccttcatttgcttaattattatgtagttttgagtttgatatgaca
ggtctgtgtcttgctctgaagctatgattttataaatctaagttctagca
atcctcctgcctcagcatcctttttcctgctagtattactgttttgaatc
actgtacctaggtgatgtgttcatatgattaaatcagtctgatttgcctc
agaacatgtttagtctgttgctgataatagacataaaatatcatagatat
tactgtcacttgaattgagaaaacattttctatagtcag
gaattcccagcagaaattcaatagcattctatctacttatctaataccta
atataaaaattcaaaaacttcctcttgacagggagctagagtccctgagc
tctttccttttgatgtctcttgacttcatcttatccctgatcaggaatgg
aaaaaaaaaacgttcaaaataagtaaataaaaatcaaaataattaaaaaa
aactgaacaatttctatagtatagtctttacgcatatgttgatcagagaa
gagaaagaaacaatatgcagaaggagggaaataactaaatataaccttac
ctatttatgtcttagggaaatgtctgactgaaacaacattctttgtgtaa
ttgacatatactaattatcagttacaagtacatactaactaaaggcacca
agcttcaatccaatgttcagaactttgtcttatatcaaaataattgcata
tttcatgactatttagtgtaattataagtggctcatgagaatatatgttg
ctaacatgtttcaggaaaaacttgtttctattcagtttgtggtgagcaaa
gtttaaatgctaacatgtctagctccctgtttatcgtttctttttgtttt
cattaattcatttatgtattcactttaccacctgatcacttcctgcctgt
cttttcctcccagtcctaccctctgacgttttcatctcatttccttctgc
cattctcttcagcaaaggagaggcactcactccccacccctaccaggttc
cacaccactttgacacagcaagttgcatcaggactaaatgcatcctctcc
cactgaagccacacaagtcagcccatcaaggggaaaaggttccaaaggca
gagaacaaagttcaaaaggagacaacacccagtctgatttttaggagagc
cacatttaagaccaaacttcacatctgttccatatgattagaggcctagt
ctagaccatcatgctcttgatcggtagtcagtctgtgtgaacccaaatgg
gtccacatgactagttctgtaggtcttcttctgatgctgacctctgttat
aaagctctgattgaccctagctactggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_95350112_95351258
seq2: B6Ng01-158A10.b_48_1186 (reverse)

seq1  CTGACTATTAGAAAATTGTTTTTCTCAAATCAAGTGACAGTAATATCTAT  50
      ||||||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CTGACTA-TAGAAAAT--GTTTTCTCAATTCAAGTGACAGTAATATCTAT  47

seq1  GAATTATTTTATGTCTATTATCAGCAACAGACTAAACACTGTTCTGAGGC  100
      ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GA--TATTTTATGTCTATTATCAGCAACAGACTAAACA-TGTTCTGAGGC  94

seq1  AAATCAGACTGATTTAATCATATGAACAACATTCACCTAGGTACAGTGAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||
seq2  AAATCAGACTGATTTAATCATATGAAC-ACA-TCACCTAGGTACAGTGAT  142

seq1  TCAAAACAGTAATACTAGCAGGAAAAAGGATGCTGAGGCAGGAGGATTGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAACAGTAATACTAGCAGGAAAAAGGATGCTGAGGCAGGAGGATTGC  192

seq1  TAGAACTTAGATTTATAAAATCATAGCTTCAGAGCAAGACACAGACCTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAACTTAGATTTATAAAATCATAGCTTCAGAGCAAGACACAGACCTGT  242

seq1  CATATCAAACTCAAAACTACATAATAATTAAGCAAATGAAGGAAAAATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATCAAACTCAAAACTACATAATAATTAAGCAAATGAAGGAAAAATAT  292

seq1  CACAAATTAAGTGATGTGATGTTAATTAATAAGTGAAATGTTTGAGGGGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAATTAAGTGATGTGATGTTAATTAATAAGTGAAATGTTTGAGGGGC  342

seq1  GGGGCAACATGGAGATATACTCACAATGAACTCTGAATCAATCCGTGTAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCAACATGGAGATATACTCACAATGAACTCTGAATCAATCCGTGTAA  392

seq1  TGGATGTTATGAATACAATTTAAAGGGTGAAGTTTAAAGATCTAATTCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGTTATGAATACAATTTAAAGGGTGAAGTTTAAAGATCTAATTCAA  442

seq1  TTCCAGTTTGTGTTTGGAGGCATGGCTGCAACAGGGAGGAGTAGGCAGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGTTTGTGTTTGGAGGCATGGCTGCAACAGGGAGGAGTAGGCAGAG  492

seq1  AGTTTTATAAAGGCTTCAGTGGAGACATAGATAATATTCAGAGACCTGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTTATAAAGGCTTCAGTGGAGACATAGATAATATTCAGAGACCTGGA  542

seq1  GCCTGGATAGCTGCCTGGTTCATCTGAGACTCAGAGACTGATCTGCTGTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGGATAGCTGCCTGGTTCATCTGAGACTCAGAGACTGATCTGCTGTG  592

seq1  CTTACAATAGGCATGTCATGATTTTCCCTTCAGTCATGCAGTTTGAAGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACAATAGGCATGTCATGATTTTCCCTTCAGTCATGCAGTTTGAAGTA  642

seq1  GAGAAATTTAGACTCCAGGATAGGATTCCAAATTTTAATTTCCATTTCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAATTTAGACTCCAGGATAGGATTCCAAATTTTAATTTCCATTTCTT  692

seq1  TAGAAGAACACATTGAAGATGTTGGCTTTCATTCCAAATAAAGTTTTAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGAACACATTGAAGATGTTGGCTTTCATTCCAAATAAAGTTTTAGC  742

seq1  CTCATCACCAATATATTTCTATGATAGCATGTATATTTCATTGGTGTTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATCACCAATATATTTCTATGATAGCATGTATATTTCATTGGTGTTCT  792

seq1  CCATATAATTTTTTGAGACAAGTATGCTCTATGTTGTTAACCATGTGAGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATATAATTTTTTGAGACAAGTATGCTCTATGTTGTTAACCATGTGAGT  842

seq1  CTTGGTAAGGTAGAAATCAGATCATTATGACTAACATGTGCCCTCCTGTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGTAAGGTAGAAATCAGATCATTATGACTAACATGTGCCCTCCTGTT  892

seq1  TCCTTTCACTGAAGTAATTGTCTTTATTTGTTTTTGTGAGACCCTTACTC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTCACTGAAGTAATTGTCTTTATTTGTTTTTGTGAGACCCTTACTC  942

seq1  ACATTGTAGACCATGCATCTTTGATCTCCTTCCATTCCCAATAGCTAGAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGTAGACCATGCATCTTTGATCTCCTTCCATTCCCAATAGCTAGAA  992

seq1  TGAAACTTGCGTGTTACTCATGTGTCTTACCTTTGTCTTTGCATCATTTA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACTTGCGTGTTACTCATGTGTCTTACCTTTGTCTTTGCATCATTTA  1042

seq1  AACAAAGTTTTCTTTTTTGGATATGATATGCTTTTGCGACCCAGGAATGC  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAGTTTTCTTTTTTGGATATGATATGCTTTTGCGACCCAGGAATGC  1092

seq1  CTGAAAATTGTAGAAACCCATTGTCATCAACCTGCTTATGGGAATTC  1147
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAAATTGTAGAAACCCATTGTCATCAACCTGCTTATGGGAATTC  1139

seq1: chr5_95212362_95213448
seq2: B6Ng01-158A10.g_69_1146

seq1  GAATTCCCAGCAGAAATTCAATAGCATTCTATCTACTTATCTAATACCTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCAGCAGAAATTCAATAGCATTCTATCTACTTATCTAATACCTA  50

seq1  ATATAAAAATTCAAAAACTTCCTCTTGACAGGGAGCTAGAGTCCCTGAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAAAAATTCAAAAACTTCCTCTTGACAGGGAGCTAGAGTCCCTGAGC  100

seq1  TCTTTCCTTTTGATGTCTCTTGACTTCATCTTATCCCTGATCAGGAATGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCCTTTTGATGTCTCTTGACTTCATCTTATCCCTGATCAGGAATGG  150

seq1  AAAAAAAAAACGTTCAAAATAAGTAAATAAAAATCAAAATAATTAAAAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAAAAACGTTCAAAATAAGTAAATAAAAATCAAAATAATTAAAAAA  200

seq1  AACTGAACAATTTCTATAGTATAGTCTTTACGCATATGTTGATCAGAGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAACAATTTCTATAGTATAGTCTTTACGCATATGTTGATCAGAGAA  250

seq1  GAGAAAGAAACAATATGCAGAAGGAGGGAAATAACTAAATATAACCTTAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAAAGAAACAATATGCAGAAGGAGGGAAATAACTAAATATAACCTTAC  300

seq1  CTATTTATGTCTTAGGGAAATGTCTGACTGAAACAACATTCTTTGTGTAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTATGTCTTAGGGAAATGTCTGACTGAAACAACATTCTTTGTGTAA  350

seq1  TTGACATATACTAATTATCAGTTACAAGTACATACTAACTAAAGGCACCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACATATACTAATTATCAGTTACAAGTACATACTAACTAAAGGCACCA  400

seq1  AGCTTCAATCCAATGTTCAGAACTTTGTCTTATATCAAAATAATTGCATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCAATCCAATGTTCAGAACTTTGTCTTATATCAAAATAATTGCATA  450

seq1  TTTCATGACTATTTAGTGTAATTATAAGTGGCTCATGAGAATATATGTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATGACTATTTAGTGTAATTATAAGTGGCTCATGAGAATATATGTTG  500

seq1  CTAACATGTTTCAGGAAAAACTTGTTTCTATTCAGTTTGTGGTGAGCAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACATGTTTCAGGAAAAACTTGTTTCTATTCAGTTTGTGGTGAGCAAA  550

seq1  GTTTAAATGCTAACATGTCTAGCTCCCTGTTTATCGTTTCTTTTTGTTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAAATGCTAACATGTCTAGCTCCCTGTTTATCGTTTCTTTTTGTTTT  600

seq1  CATTAATTCATTTATGTATTCACTTTACCACCTGATCACTTCCTGCCTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTAATTCATTTATGTATTCACTTTACCACCTGATCACTTCCTGCCTGT  650

seq1  CTTTTCCTCCCAGTCCTACCCTCTGACGTTTTCATCTCATTTCCTTCTGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCCTCCCAGTCCTACCCTCTGACGTTTTCATCTCATTTCCTTCTGC  700

seq1  CATTCTCTTCAGCAAAGGAGAGGCACTCACTCCCCACCCCTACCAGGTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTCTCTTCAGCAAAGGAGAGGCACTCACTCCCCACCCCTACCAGGTTC  750

seq1  CACACCACTTTGACACAGCAAGTTGCATCAGGACTAAATGCATCCTCTCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACCACTTTGACACAGCAAGTTGCATCAGGACTAAATGCATCCTCTCC  800

seq1  CACTGAAGCCACACAAGTCAGCCCATCAAGGGGAAAAGGTTCCAAAGGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGAAGCCACACAAGTCAGCCCATCAAGGGGAAAAGGTTCCAAAGGCA  850

seq1  GAGAACAAAGTTCAAAAGGAGACAACACCCAGTCTGATTTTTAGGAGAGC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAACAAAGTTCAAAAGGAGACAACACCCAGTCTGATTTTTAGGAGAGC  900

seq1  CACATTTAAGACCAAACTTCACATCTGTTCCATATGATTAGGAGGCCTAG  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| 
seq2  CACATTTAAGACCAAACTTCACATCTGTTCCATATGATTA-GAGGCCTA-  948

seq1  GTCTAGACCATTCATGCTCTTTGATTGGTAGTTCAGTCTGTGTGAACCCC  1000
      |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||
seq2  GTCTAGACCA-TCATGCTC-TTGATCGGTAG-TCAGTCTGTGTGAA-CCC  994

seq1  AAATGGGTCCACATGACTTAGTTCTGTAGGTCTCCTTCTGGAATGCTTGA  1050
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||   
seq2  AAATGGGTCCACATGAC-TAGTTCTGTAGGTCTTCTTCTG--ATGCTGAC  1041

seq1  CTCTGTTATAAAGCTCTGA-TGACCCTTAGCTACTGGG  1087
      ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||
seq2  CTCTGTTATAAAGCTCTGATTGACCC-TAGCTACTGGG  1078