BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-166A13
Chromosome5 (Build37)
Map Location 126,882,991 - 127,009,316
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneDhx37, Bri3bp, Aacs, Tmem132b, EG231736, LOC100039178, LOC665760
Downstream geneLOC100040327, Tmem132c
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-166A13.bB6Ng01-166A13.g
ACCDH957929DH957930
length1,133900
definitionDH957929|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166A13, 5' end.DH957930|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-166A13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(126,882,991 - 126,884,122)(127,008,422 - 127,009,316)
sequence
gaattccaaagtgtatctaccttactgagttggcttagagaggaacagcc
caggaccttgcagtagggattgtcagaggataagatgagtcctctgttga
catgcagcccttgatttgaccttactcaattttctccatcataggcccta
gtcagatacttcactgctcctgctgtggagacgtaccatatactaagctg
ctgctcagtgtctgtgaacaccctgctctcacagtggccattgagctgca
gctcctcctgcaaggcccatccagttaattaggacaaattgcctaatgaa
attaccttttacaataaggcaagacaaatcaactctgccaagcatttctg
ctgcagaaaagccacagaagtgcaacaggcttccttatctctcagaacag
accacagagaggttgaggagagcaggtggtactgggaataggaaggctaa
cactcctgcaaattaacctttccattgcacgcctcacacataatatgctc
ccgcactgcacttggtgtgctggcttccttggaacccagataggttgggc
tgaacaaccaccacatcacacttcccacataaaggaaatacagcagggag
ctgcctcacctgggacgacagaccttcagttggatgtggatcatcttttg
gaggagggtggcgagttcttaagctccaccccccagcaggttttaattcg
tttcttcctatgcaacaattgactgtgtgtagacccaccctttactctca
catagtcctgggaggcaatgctatcattgtcttatttccatagactagga
caccaaggtttggaagggataggaagattatcctccaagatgctttggtt
gtaagagaattcaccaggatacactgcatggtagcaacatcttcactccc
ctagaaatcacactaaacaccccaaacctagctccccactatctattatt
tagctctgggtgaaacagcctcaacagagactttatcctttcatagatgc
agacttgcagtgtttaggacagcagtgttgaccctgtttaacacccttag
tgtgactttgtaagtatccacacctcaccctcagtgtcttcatctataaa
ccggatgagggacatccatcccccatactggga
gaattcactggcaagaactttggatcaggaagtaacatctgggccagtaa
attaccagaagataacaagtgactttgctgatgtgaagggacttgagtgg
gtgcgaacagatgtgcataagtcagccggctctcaggggatttgaagacg
ggtgaggtaattaaaagtcaagggtaatagaaaaaaatatgcaaaggtgg
tgaatgaccataatgcttgaaggtactctcctcaaaactggttctatagc
aaagttcacatgaatctctgaataaggagttggaagagattattcattaa
agatagctccaggaccacataggcagagaaggaaattaattccccacagg
tagacgaagagatcagggtagtgatggtagagtagctggaaatgacagca
agaaaatccaccttccaacacacagcagctatcagaagagtgtccaaagg
ccccttaggagcctgagatctctgcactaaagccagacacagtaggtata
tatatttcagccatttggattcccagagccatctcttcttatgaagttca
aaactgagtagaattggttaagttccctcaatggggattgggtgagatgg
tggggtggctaggctaggttgggccaggtatgcgtcaaataagagaaacg
aggaccgtctgttgtgaaatttatagtgcagaaaatgtcgttttcatagg
caaaggctgttaggaaaattcaaattttgcatgcatgcagcttgtttagg
agaaaacacagtgacaaatatgataagtgacagatttgggaagggaaaat
atataaattcaagcgaaagacttggaaagcttgctgtctgaaggctattt
aatgagggaacttgggattatgacagatatttctagaaaacatcgtctga

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_126882991_126884122
seq2: B6Ng01-166A13.b_46_1178

seq1  GAATTCCAAAGTGTATCTACCTTACTGAGTTGGCTTAGAGAGGAACAGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAAGTGTATCTACCTTACTGAGTTGGCTTAGAGAGGAACAGCC  50

seq1  CAGGACCTTGCAGTAGGGATTGTCAGAGGATAAGATGAGTCCTCTGTTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGACCTTGCAGTAGGGATTGTCAGAGGATAAGATGAGTCCTCTGTTGA  100

seq1  CATGCAGCCCTTGATTTGACCTTACTCAATTTTCTCCATCATAGGCCCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAGCCCTTGATTTGACCTTACTCAATTTTCTCCATCATAGGCCCTA  150

seq1  GTCAGATACTTCACTGCTCCTGCTGTGGAGACGTACCATATACTAAGCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGATACTTCACTGCTCCTGCTGTGGAGACGTACCATATACTAAGCTG  200

seq1  CTGCTCAGTGTCTGTGAACACCCTGCTCTCACAGTGGCCATTGAGCTGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTCAGTGTCTGTGAACACCCTGCTCTCACAGTGGCCATTGAGCTGCA  250

seq1  GCTCCTCCTGCAAGGCCCATCCAGTTAATTAGGACAAATTGCCTAATGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCCTCCTGCAAGGCCCATCCAGTTAATTAGGACAAATTGCCTAATGAA  300

seq1  ATTACCTTTTACAATAAGGCAAGACAAATCAACTCTGCCAAGCATTTCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTACCTTTTACAATAAGGCAAGACAAATCAACTCTGCCAAGCATTTCTG  350

seq1  CTGCAGAAAAGCCACAGAAGTGCAACAGGCTTCCTTATCTCTCAGAACAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCAGAAAAGCCACAGAAGTGCAACAGGCTTCCTTATCTCTCAGAACAG  400

seq1  ACCACAGAGAGGTTGAGGAGAGCAGGTGGTACTGGGAATAGGAAGGCTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCACAGAGAGGTTGAGGAGAGCAGGTGGTACTGGGAATAGGAAGGCTAA  450

seq1  CACTCCTGCAAATTAACCTTTCCATTGCACGCCTCACACATAATATGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTCCTGCAAATTAACCTTTCCATTGCACGCCTCACACATAATATGCTC  500

seq1  CCGCACTGCACTTGGTGTGCTGGCTTCCTTGGAACCCAGATAGGTTGGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCACTGCACTTGGTGTGCTGGCTTCCTTGGAACCCAGATAGGTTGGGC  550

seq1  TGAACAACCACCACATCACACTTCCCACATAAAGGAAATACAGCAGGGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACAACCACCACATCACACTTCCCACATAAAGGAAATACAGCAGGGAG  600

seq1  CTGCCTCACCTGGGACGACAGACCTTCAGTTGGATGTGGATCATCTTTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTCACCTGGGACGACAGACCTTCAGTTGGATGTGGATCATCTTTTG  650

seq1  GAGGAGGGTGGCGAGTTCTTAAGCTCCACCCCCCAGCAGGTTTTAATTCG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGGGTGGCGAGTTCTTAAGCTCCACCCCCCAGCAGGTTTTAATTCG  700

seq1  TTTCTTCCTATGCAACAATTGACTGTGTGTAGACCCACCCTTTACTCTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTCCTATGCAACAATTGACTGTGTGTAGACCCACCCTTTACTCTCA  750

seq1  CATAGTCCTGGGAGGCAATGCTATCATTGTCTTATTTCCATAGACTAGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGTCCTGGGAGGCAATGCTATCATTGTCTTATTTCCATAGACTAGGA  800

seq1  CACCAAGGTTTGGAAGGGATAGGAAGATTATCCTCCAAGATGCTTTGGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAAGGTTTGGAAGGGATAGGAAGATTATCCTCCAAGATGCTTTGGTT  850

seq1  GTAAGAGAATTCACCAGGATACACTGCATGGTAGCAACATCTTCACTCCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGAGAATTCACCAGGATACACTGCATGGTAGCAACATCTTCACTCCC  900

seq1  CTAGAAATCACACTAAACACCCCAAACCTAGCTCCCCACTATCTATTATT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAAATCACACTAAACACCCCAAACCTAGCTCCCCACTATCTATTATT  950

seq1  TAGCTCTGGGTGAAACAGCCTCAACAGAGACTTTATCCTTCCATAGATGC  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TAGCTCTGGGTGAAACAGCCTCAACAGAGACTTTATCCTTTCATAGATGC  1000

seq1  AGACTTGCAGTGTTTAAGGGACAGCAGTGTGAACTCTGTTT-ACACACTT  1049
      ||||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||| |||| |||
seq2  AGACTTGCAGTGTTTA--GGACAGCAGTGTTGACCCTGTTTAACACCCTT  1048

seq1  AGTGTGACTTTGTAAAGTTAATCACA-CTCA-CCTCAGTGTCTTCATCTA  1097
      |||||||||||||||   ||  |||| |||| ||||||||||||||||||
seq2  AGTGTGACTTTGTAA--GTATCCACACCTCACCCTCAGTGTCTTCATCTA  1096

seq1  TAAACC-GATGAAGGACAT-CATCCCCCATACTGGGA  1132
      |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||
seq2  TAAACCGGATGAGGGACATCCATCCCCCATACTGGGA  1133

seq1: chr5_127008422_127009316
seq2: B6Ng01-166A13.g_69_968 (reverse)

seq1  TCAGACGATGTTTTCTAGAACTATCTGTCAT-ATCCCATGTTCCCTCATT  49
      |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||
seq2  TCAGACGATGTTTTCTAGAAATATCTGTCATAATCCCAAGTTCCCTCATT  50

seq1  AAATAGCC-TCAGACAGCAAGCTTTCCAGGTCTTTCGCCTGAATTTATAT  98
      |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  AAATAGCCTTCAGACAGCAAGCTTTCCAAGTCTTTCGCTTGAATTTATAT  100

seq1  ATTTTCCCTTCCC-AATCTGTCACTTTTCATTTTTGTCACTGTGTTTTCT  147
      ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCCCTTCCCAAATCTGTCACTTATCATATTTGTCACTGTGTTTTCT  150

seq1  CCT-AACAAGCTGCATGCATGC-AAATTTGAATTTTCCTAACAGCCTTTG  195
      ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAAACAAGCTGCATGCATGCAAAATTTGAATTTTCCTAACAGCCTTTG  200

seq1  CCTATGAAAACGACATTTTCTGCACTATAAATTTCACAACAGACGGTCCT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTATGAAAACGACATTTTCTGCACTATAAATTTCACAACAGACGGTCCT  250

seq1  CGTTTCTCTTATTTGACGCATACCTGGCCCAACCTAGCCTAGCCACCCCA  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTTCTCTTATTTGACGCATACCTGGCCCAACCTAGCCTAGCCACCCCA  300

seq1  CCATCTCACCCAATCCCCATTGAGGGAACTTAACCAATTCTACTCAGTTT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCTCACCCAATCCCCATTGAGGGAACTTAACCAATTCTACTCAGTTT  350

seq1  TGAACTTCATAAGAAGAGATGGCTCTGGGAATCCAAATGGCTGAAATATA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTTCATAAGAAGAGATGGCTCTGGGAATCCAAATGGCTGAAATATA  400

seq1  TATACCTACTGTGTCTGGCTTTAGTGCAGAGATCTCAGGCTCCTAAGGGG  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACCTACTGTGTCTGGCTTTAGTGCAGAGATCTCAGGCTCCTAAGGGG  450

seq1  CCTTTGGACACTCTTCTGATAGCTGCTGTGTGTTGGAAGGTGGATTTTCT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGGACACTCTTCTGATAGCTGCTGTGTGTTGGAAGGTGGATTTTCT  500

seq1  TGCTGTCATTTCCAGCTACTCTACCATCACTACCCTGATCTCTTCGTCTA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGTCATTTCCAGCTACTCTACCATCACTACCCTGATCTCTTCGTCTA  550

seq1  CCTGTGGGGAATTAATTTCCTTCTCTGCCTATGTGGTCCTGGAGCTATCT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGGGGAATTAATTTCCTTCTCTGCCTATGTGGTCCTGGAGCTATCT  600

seq1  TTAATGAATAATCTCTTCCAACTCCTTATTCAGAGATTCATGTGAACTTT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATGAATAATCTCTTCCAACTCCTTATTCAGAGATTCATGTGAACTTT  650

seq1  GCTATAGAACCAGTTTTGAGGAGAGTACCTTCAAGCATTATGGTCATTCA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTATAGAACCAGTTTTGAGGAGAGTACCTTCAAGCATTATGGTCATTCA  700

seq1  CCACCTTTGCATATTTTTTTCTATTACCCTTGACTTTTAATTACCTCACC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTTTGCATATTTTTTTCTATTACCCTTGACTTTTAATTACCTCACC  750

seq1  CGTCTTCAAATCCCCTGAGAGCCGGCTGACTTATGCACATCTGTTCGCAC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCTTCAAATCCCCTGAGAGCCGGCTGACTTATGCACATCTGTTCGCAC  800

seq1  CCACTCAAGTCCCTTCACATCAGCAAAGTCACTTGTTATCTTCTGGTAAT  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCAAGTCCCTTCACATCAGCAAAGTCACTTGTTATCTTCTGGTAAT  850

seq1  TTACTGGCCCAGATGTTACTTCCTGATCCAAAGTTCTTGCCAGTGAATTC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTGGCCCAGATGTTACTTCCTGATCCAAAGTTCTTGCCAGTGAATTC  900