BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-170G10
Chromosome5 (Build37)
Map Location 119,467,457 - 119,653,475
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100039488, EG665194
Upstream geneTesc, Fbxw8, Hrk, Tmem118, 2410131K14Rik, LOC665162, Thrap2
Downstream geneLOC100039529, LOC100039542, Tbx3, EG433945, Tbx5, Rbm19
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-170G10.bB6Ng01-170G10.g
ACCDH961121DH961122
length898725
definitionDH961121|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170G10, 5' end.DH961122|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-170G10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(119,652,841 - 119,653,475)(119,467,457 - 119,468,181)
sequence
gaattcactgtgtggacctagccatccttaaacctacctgctactacttc
ccaagtgctgggattagagacatgtctgtgtctactttcatcttatggtt
tctaaaagcatgtccaagtcttagtcttagcttcaggatgctggagaggc
tgtgggaaaagatgctgctacaaacacaaaccagggcagctgctaatgga
ggtctctcatactaaaaactagactatccacatgacccagctgtgccacc
cctgaccatgtgtgcccaggactatcatgtcagcacagcacagacaggcc
tgcccatccagggttttgcagagtgatttacaatggccaaattactgagt
cagcctaagtgcccatttacaggtggaagtataaccaaaaggtggtatct
acatgcaataaaatgtgaacagtcataaagaatgaaatcatgacaattta
ggaatacagcatgatgggtggagctgaggattataatgcatgatataaaa
caggccctaacttcacaagaggagactaggatggacacatacacacacat
gcatatgcacacacatgcacaaatgcatgcacacaatgcgcacatgcatg
cacacacacatgtgcatatgcatgcacacacatgtgcacatgcatgcaca
gcacacacatgcatatgcacacacatgcactcacacatgcacacacatac
acacacacatacacatgtgtgcacatacacgtttcacacacacacacaca
cacacacgaacacacatggtgatgattttcctttgctctcaggaagctgc
ccactcccacccaccatggctatgggatccaggtctgggggtgaccatta
cctggtttctttaactggttcccacatcctgcagtctttgagtcctga
gaattcactatgtggatccaacttataatttactttttttttttttaaca
agggttatgttcaacagtgaactagcaaagtttcctacaattgagccagg
cctaacacagctctgtatatagatgtgaatttgcatgtctgagtgtgcat
acctttgcaggcccggcaaattactctcagactcgtaatgtctcagaggg
cactacatagaaaaacaaacaaacaacaacaaaaaaataaaacaaaacaa
aaatgaaacggaaggaaagaccatccagagactgcacccacccgcagatc
catcccatatacaaccaacaaacccagacactattgcatatgccagaaag
attttgcttacaggaccttgacatagctctctcttgtgagtctatgccaa
tgtctggcaaatacagaagtggatgctcacagtcatctattggatggaac
atagggcccctaatgaaggagctagagaaagtacacaaggagctaaaggg
gtctgcaatcctataggaggagcaacagtatgaactaaccagtaaccccc
acctcccaccccagagctgtgtctctagttgcatatgtagcagaagatgg
cctagtctgggtcattaatgggaggagaggcccttggtattgagaagatc
atatgccccagtacaggggaatgccagggacaggaagcaggagtgggtgg
gttgggagcagggcagggggagggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_119652841_119653475
seq2: B6Ng01-170G10.b_45_679 (reverse)

seq1  ACATGTGTGTGCATGCATATGCACATGTGTGTGTGCATGCATGTGCGCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTGTGTGCATGCATATGCACATGTGTGTGTGCATGCATGTGCGCAT  50

seq1  TGTGTGCATGCATTTGTGCATGTGTGTGCATATGCATGTGTGTGTATGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGCATGCATTTGTGCATGTGTGTGCATATGCATGTGTGTGTATGTG  100

seq1  TCCATCCTAGTCTCCTCTTGTGAAGTTAGGGCCTGTTTTATATCATGCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCCTAGTCTCCTCTTGTGAAGTTAGGGCCTGTTTTATATCATGCAT  150

seq1  TATAATCCTCAGCTCCACCCATCATGCTGTATTCCTAAATTGTCATGATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATCCTCAGCTCCACCCATCATGCTGTATTCCTAAATTGTCATGATT  200

seq1  TCATTCTTTATGACTGTTCACATTTTATTGCATGTAGATACCACCTTTTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTCTTTATGACTGTTCACATTTTATTGCATGTAGATACCACCTTTTG  250

seq1  GTTATACTTCCACCTGTAAATGGGCACTTAGGCTGACTCAGTAATTTGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATACTTCCACCTGTAAATGGGCACTTAGGCTGACTCAGTAATTTGGC  300

seq1  CATTGTAAATCACTCTGCAAAACCCTGGATGGGCAGGCCTGTCTGTGCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGTAAATCACTCTGCAAAACCCTGGATGGGCAGGCCTGTCTGTGCTG  350

seq1  TGCTGACATGATAGTCCTGGGCACACATGGTCAGGGGTGGCACAGCTGGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGACATGATAGTCCTGGGCACACATGGTCAGGGGTGGCACAGCTGGG  400

seq1  TCATGTGGATAGTCTAGTTTTTAGTATGAGAGACCTCCATTAGCAGCTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTGGATAGTCTAGTTTTTAGTATGAGAGACCTCCATTAGCAGCTGC  450

seq1  CCTGGTTTGTGTTTGTAGCAGCATCTTTTCCCACAGCCTCTCCAGCATCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGTTTGTGTTTGTAGCAGCATCTTTTCCCACAGCCTCTCCAGCATCC  500

seq1  TGAAGCTAAGACTAAGACTTGGACATGCTTTTAGAAACCATAAGATGAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGCTAAGACTAAGACTTGGACATGCTTTTAGAAACCATAAGATGAAA  550

seq1  GTAGACACAGACATGTCTCTAATCCCAGCACTTGGGAAGTAGTAGCAGGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGACACAGACATGTCTCTAATCCCAGCACTTGGGAAGTAGTAGCAGGT  600

seq1  AGGTTTAAGGATGGCTAGGTCCACACAGTGAATTC  635
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTTAAGGATGGCTAGGTCCACACAGTGAATTC  635

seq1: chr5_119467457_119468181
seq2: B6Ng01-170G10.g_66_790

seq1  GAATTCACTATGTGGATCCAACTTATAATTTACTTTTTTTTTTTTTAACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTATGTGGATCCAACTTATAATTTACTTTTTTTTTTTTTAACA  50

seq1  AGGGTTATGTTCAACAGTGAACTAGCAAAGTTTCCTACAATTGAGCCAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTTATGTTCAACAGTGAACTAGCAAAGTTTCCTACAATTGAGCCAGG  100

seq1  CCTAACACAGCTCTGTATATAGATGTGAATTTGCATGTCTGAGTGTGCAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAACACAGCTCTGTATATAGATGTGAATTTGCATGTCTGAGTGTGCAT  150

seq1  ACCTTTGCAGGCCCGGCAAATTACTCTCAGACTCGTAATGTCTCAGAGGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTTGCAGGCCCGGCAAATTACTCTCAGACTCGTAATGTCTCAGAGGG  200

seq1  CACTACATAGAAAAACAAACAAACAACAACAAAAAAATAAAACAAAACAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTACATAGAAAAACAAACAAACAACAACAAAAAAATAAAACAAAACAA  250

seq1  AAATGAAACGGAAGGAAAGACCATCCAGAGACTGCACCCACCCGCAGATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGAAACGGAAGGAAAGACCATCCAGAGACTGCACCCACCCGCAGATC  300

seq1  CATCCCATATACAACCAACAAACCCAGACACTATTGCATATGCCAGAAAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCATATACAACCAACAAACCCAGACACTATTGCATATGCCAGAAAG  350

seq1  ATTTTGCTTACAGGACCTTGACATAGCTCTCTCTTGTGAGTCTATGCCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGCTTACAGGACCTTGACATAGCTCTCTCTTGTGAGTCTATGCCAA  400

seq1  TGTCTGGCAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCATCTATTGGATGGAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGGCAAATACAGAAGTGGATGCTCACAGTCATCTATTGGATGGAAC  450

seq1  ATAGGGCCCCTAATGAAGGAGCTAGAGAAAGTACACAAGGAGCTAAAGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGGGCCCCTAATGAAGGAGCTAGAGAAAGTACACAAGGAGCTAAAGGG  500

seq1  GTCTGCAATCCTATAGGAGGAGCAACAGTATGAACTAACCAGTAACCCCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGCAATCCTATAGGAGGAGCAACAGTATGAACTAACCAGTAACCCCC  550

seq1  ACCTCCCACCCCAGAGCTGTGTCTCTAGTTGCATATGTAGCAGAAGATGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCCACCCCAGAGCTGTGTCTCTAGTTGCATATGTAGCAGAAGATGG  600

seq1  CCTAGTCTGGGTCATTAATGGGAGGAGAGGCCCTTGGTATTGAGAAGATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGTCTGGGTCATTAATGGGAGGAGAGGCCCTTGGTATTGAGAAGATC  650

seq1  ATATGCCCCAGTACAGGGGAATGCCAGGGACAGGAAGCAGGAGTGGGTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGCCCCAGTACAGGGGAATGCCAGGGACAGGAAGCAGGAGTGGGTGG  700

seq1  GTTGGGAGCAGGGCAGGGGGAGGGT  725
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGGAGCAGGGCAGGGGGAGGGT  725