BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-185J19
Chromosome5 (Build37)
Map Location 14,714,366 - 14,752,118
singlet/doubletdoublet
Overlap genePclo
Upstream geneLOC208055, LOC626053, Speer3, EG626067, LOC668085, LOC384149, LOC384148, Sema3e, LOC100042957
Downstream geneENSMUSG00000033219, LOC624245, Speer8-ps1, Speer4c, Speer4d, 4930572O03Rik, Speer7-ps1, 4930519H02Rik, LOC100041781, Cacna2d1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-185J19.bB6Ng01-185J19.g
ACCGA010676GA010677
length1,1541,192
definitionB6Ng01-185J19.b B6Ng01-185J19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(14,750,969 - 14,752,118)(14,714,366 - 14,715,551)
sequence
gaattcaaaactgaaataaaatatttttttaaatgaaataagaacagaat
ctctagtgctatgatattggggtgatgctttatactaagaataaaaacca
aagttgctccatatacaatctacaacatttatgacgtgacatactcctga
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gaattcagaagaagaaagtccactaagtcctgttggccagccaatgggaa
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ccaaagtgttttgctacttttttgggtaggcagtacatactacactaaat
ttgctcaagtaaaatctttaacaaatgtgaaaattaaagagttattttgt
acatctatatgacacccacaccccactattcattggctataatataatta
cttcattaacctcttggacatagatccctattcttaatagtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
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seq2: B6Ng01-185J19.b_47_1200 (reverse)

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       ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||
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      | |||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||  ||||| ||||
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      ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||
seq2  TTGAATTC  1154

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seq2: B6Ng01-185J19.g_66_1257

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      | |||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||
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      ||||||||||||||||  | || || |||||| ||||||||  ||||||
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