BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-186H14
Chromosome5 (Build37)
Map Location 74,632,968 - 74,782,642
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneFryl, Ociad1, Ociad2, LOC667154, LOC100042205, C130090K23Rik, LOC627733, Dcun1d4, BC031901, Sgcb, Spata18, Usp46, 2700023E23Rik, Rasl11b
Downstream geneScfd2, Fip1l1, Lnx1, EG619945, Chic2, Gsh2, LOC100039083, Olfr1401-ps1, Pdgfra, LOC100039125
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-186H14.bB6Ng01-186H14.g
ACCGA011309GA011310
length1,2101,050
definitionB6Ng01-186H14.b B6Ng01-186H14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,632,968 - 74,634,161)(74,781,596 - 74,782,642)
sequence
gaattcactgacagtttccagaaggtctgatggcaagatggagggagatg
gcagcgccacacctcacatgccaactcatcacctgtcatgtgacccctct
gaggtcataggtgcaggcttgcctgcagagcatgaggacagtgacacaca
ggcttaggtactcctgtgagtaggcactgctatggcctcaccatggtgac
acagtcattcaggcctcacctgcaggctatagcacaccaccaccatttca
tttctgtgttagcacatggctatagtgcatttgactgtatggatatacta
caattcatgtgtctgctcaggtgcccagattatcaaaggcagtttcccag
ttggcaggcatctgggccgttcctgtctctcagttatcatgatgatgctg
gtagtcttgcagctacatgttttcatgtggacatgcactttcgttcctct
gaagaatgccaggtccacactgctttcctgaggactttacatccccacca
acacccgagggtttcagttcctccacatctttgtcgacatttactaatat
tgattttcttaaccttagctgtgctaatgcctatgaaataaggggatact
tgtcaaggctgacaatcaaggaaatcatcctagggagggagagggagagt
caaacaagtctagaccagacggggatatatccagcatacacaaaagtatt
caaaggaccccagccacatccacagacaggtggtatgtgaatggctgagc
ccatactcttaattagtatgtgacactgtatgtaataattcttaggggtg
aacagaattacctaatacatgtttcctggtttccacacaagtatctgaca
tgttgccattaaaatgaaacagaatgtaacaaaacactgaacctgtgtca
tggtggtctgaatgagaaatgccccccacaggctcaagggattggaagaa
ctggccctctattagtggcactgcttggggggagatatggaactttcagg
atataagagcctttgctgggaagaagtgcgttaactggggaggaggagct
atatcttgaatgaaaatgttgatcagctagctttcccatttccagaacat
tagtgcctgttctccttgacattcagactctattccctttgaagccatag
cccaaccaaactctttggctcctaagttgccatggtctaagttattcatt
cagagcagca
gaattcattcaagaaactgttaggactgagtggaggctgctccttaggga
cctatactcctccaaatctgtcccttgcttcatcgtgtaatattacctac
agccaccaatgtcacggtgtgtgctgtactctgcactgtcactgctgtgt
tcatggtcacctccccggcagtggcaggaacaagccattgggaatctatt
ccaaagtggctccctcggtctgtcacatcatggcaaacttgagaaggcac
tcgaaacctccacaggcacaagtgtcctcagagatccaaaaatgcatcac
acatagaatgcagcacatgagccacttgttaactgtggccactgggatcc
tgagagctaggggacctggggtctttggcttggttggaagaggacatgaa
gaggtagcttaggaatattaattacatccttaaaagcctgcagattttgg
atggaggtcagcaattttctatttgcagaaaatctaggcttctattttta
ttgttaaaggttaccttggctactgtcttgtcaagctattgtgagagtac
tgaactttgatgaccttataaatttcaacacacttccttttcattccaga
aaatgtcctcttgagttcagtcaagccagactatctctaacctagcactc
tttctcccatgtaggctatgtctaaattaacaaggagcactaattttgtt
aacaccaggctctgcccttccagacaaagtacaagttagccgtcctttta
ccacactgtcttaggagtgaatacccaaatcacctggtgtggctttgcat
actggttatgttgtcaatagtcctgagcaacttatgcaaccttttttgtg
ttagtcttctgaactagtcgtgcctgaatcatgacatcaacaagatgtag
tatgtgggtgtctccatcaaatgacagcttatgctctcgtgaggtagtga
ttacagcacctgatgtccgctttcagttatagacaacgcagtcactaagc
tcatttttgagatttggttttggtgtcccttttccctagttttattgggg

quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_74632968_74634161
seq2: B6Ng01-186H14.b_34_1243

seq1  GAATTCACTGACAGTTTCCAGAAGGTCTGATGGCAAGATGGAGGGAGATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGACAGTTTCCAGAAGGTCTGATGGCAAGATGGAGGGAGATG  50

seq1  GCAGCGCCACACCTCACATGCCAACTCATCACCTGTCATGTGACCCCTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCGCCACACCTCACATGCCAACTCATCACCTGTCATGTGACCCCTCT  100

seq1  GAGGTCATAGGTGCAGGCTTGCCTGCAGAGCATGAGGACAGTGACACACA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTCATAGGTGCAGGCTTGCCTGCAGAGCATGAGGACAGTGACACACA  150

seq1  GGCTTAGGTACTCCTGTGAGTAGGCACTGCTATGGCCTCACCATGGTGAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTAGGTACTCCTGTGAGTAGGCACTGCTATGGCCTCACCATGGTGAC  200

seq1  ACAGTCATTCAGGCCTCACCTGCAGGCTATAGCACACCACCACCATTTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGTCATTCAGGCCTCACCTGCAGGCTATAGCACACCACCACCATTTCA  250

seq1  TTTCTGTGTTAGCACATGGCTATAGTGCATTTGACTGTATGGATATACTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGTGTTAGCACATGGCTATAGTGCATTTGACTGTATGGATATACTA  300

seq1  CAATTCATGTGTCTGCTCAGGTGCCCAGATTATCAAAGGCAGTTTCCCAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTCATGTGTCTGCTCAGGTGCCCAGATTATCAAAGGCAGTTTCCCAG  350

seq1  TTGGCAGGCATCTGGGCCGTTCCTGTCTCTCAGTTATCATGATGATGCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGCAGGCATCTGGGCCGTTCCTGTCTCTCAGTTATCATGATGATGCTG  400

seq1  GTAGTCTTGCAGCTACATGTTTTCATGTGGACATGCACTTTCGTTCCTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTCTTGCAGCTACATGTTTTCATGTGGACATGCACTTTCGTTCCTCT  450

seq1  GAAGAATGCCAGGTCCACACTGCTTTCCTGAGGACTTTACATCCCCACCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAATGCCAGGTCCACACTGCTTTCCTGAGGACTTTACATCCCCACCA  500

seq1  ACACCCGAGGGTTTCAGTTCCTCCACATCTTTGTCGACATTTACTAATAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCCGAGGGTTTCAGTTCCTCCACATCTTTGTCGACATTTACTAATAT  550

seq1  TGATTTTCTTAACCTTAGCTGTGCTAATGCCTATGAAATAAGGGGATACT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTTTCTTAACCTTAGCTGTGCTAATGCCTATGAAATAAGGGGATACT  600

seq1  TGTCAAGGCTGACAATCAAGGAAATCATCCTAGGGAGGGAGAGGGAGAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCAAGGCTGACAATCAAGGAAATCATCCTAGGGAGGGAGAGGGAGAGT  650

seq1  CAAACAAGTCTAGACCAGACGGGGATATATCCAGCATACACAAAAGTATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACAAGTCTAGACCAGACGGGGATATATCCAGCATACACAAAAGTATT  700

seq1  CAAAGGACCCCAGCCACATCCACAGACAGGTGGTATGTGAATGGCTGAGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGGACCCCAGCCACATCCACAGACAGGTGGTATGTGAATGGCTGAGC  750

seq1  CCATACTCTTAATTAGTATGTGACACTGTATGTAATAATTCTTAGGGGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATACTCTTAATTAGTATGTGACACTGTATGTAATAATTCTTAGGGGTG  800

seq1  AACAGAATTACCTAATACATGTTTCCTGGTTTCCACACAAGTATCTGACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGAATTACCTAATACATGTTTCCTGGTTTCCACACAAGTATCTGACA  850

seq1  TGTTGCCATTAAAATGAAACAGAATGTAACAAAACACTGAACCTGTGTCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGCCATTAAAATGAAACAGAATGTAACAAAACACTGAACCTGTGTCA  900

seq1  TGGTGGTCTGAATGAGAAATGCCCCCCACAGGCTC-AGGGATTGGAAGAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TGGTGGTCTGAATGAGAAATGCCCCCCACAGGCTCAAGGGATTGGAAGAA  950

seq1  CTGGCCCTCTATTAGTGGCACTGCTT-GGGGGAGATATGGAACTTTCAGG  998
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCCTCTATTAGTGGCACTGCTTGGGGGGAGATATGGAACTTTCAGG  1000

seq1  ATAT-AGAGCC-TTGCT-GGAGAAAGTGCG-TCACT-GGGAGGAGGAGC-  1042
      |||| |||||| ||||| |||  ||||||| | ||| |||||||||||| 
seq2  ATATAAGAGCCTTTGCTGGGAAGAAGTGCGTTAACTGGGGAGGAGGAGCT  1050

seq1  -TATCTTG-ATGAAAATG-TGACCAGCTAGC-TTCCCA-TTCCAG-ACA-  1085
       ||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||| |||||| ||| 
seq2  ATATCTTGAATGAAAATGTTGATCAGCTAGCTTTCCCATTTCCAGAACAT  1100

seq1  TGGTGCCCTGTTCTCCCTGCCATTCCAGACTCTA-TCCCTTTGTAGCCAT  1134
      | ||| |||||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||||
seq2  TAGTG-CCTGTTCTCCTTGACATT-CAGACTCTATTCCCTTTGAAGCCAT  1148

seq1  AAGCCAAACAAACTCTT--GCTCCCTAAGTTGCTTTGGTC-ATGGTATTT  1181
      |  |||| |||||||||  ||| ||||||||||  ||||| | | |||| 
seq2  AGCCCAACCAAACTCTTTGGCT-CCTAAGTTGCCATGGTCTAAGTTATTC  1197

seq1  CATCAGAGCAGCA  1194
        |||||||||||
seq2  ATTCAGAGCAGCA  1210

seq1: chr5_74781596_74782642
seq2: B6Ng01-186H14.g_64_1113 (reverse)

seq1  CCCCAATAAAACTAGGGAAAAGGGACA-CAAAACCAATTCTCAAAAATGA  49
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||
seq2  CCCCAATAAAACTAGGGAAAAGGGACACCAAAACCAAATCTCAAAAATGA  50

seq1  GCTTAGTGACTGCG-TGTCTATAACTGAAGGCGGACATCA-GTGCTGTAA  97
      |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||
seq2  GCTTAGTGACTGCGTTGTCTATAACTGAAAGCGGACATCAGGTGCTGTAA  100

seq1  TCACTACCTCACGAGAGCATAAGCTGTCATTTGATGGGAGACACCCACAT  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TCACTACCTCACGAGAGCATAAGCTGTCATTTGAT-GGAGACACCCACAT  149

seq1  ACTACATCTTGTTGATGTCATGATTCAGGCACGACTAGTTCAGAAGACTA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACATCTTGTTGATGTCATGATTCAGGCACGACTAGTTCAGAAGACTA  199

seq1  ACAC-AAAAAGGTTGCATAAGTTGCTCAGGACTATTGACAACATAACCAG  246
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAAAAAAGGTTGCATAAGTTGCTCAGGACTATTGACAACATAACCAG  249

seq1  TATGCAAAGCCACACCAGGTGATTTGGGTATTCACTCCTAAGACAGTGTG  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCAAAGCCACACCAGGTGATTTGGGTATTCACTCCTAAGACAGTGTG  299

seq1  GTAAAAGGACGGCTAACTTGTACTTTGTCTGGAAGGGCAGAGCCTGGTGT  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAAGGACGGCTAACTTGTACTTTGTCTGGAAGGGCAGAGCCTGGTGT  349

seq1  TAACAAAATTAGTGCTCCTTGTTAATTTAGACATAGCCTACATGGGAGAA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACAAAATTAGTGCTCCTTGTTAATTTAGACATAGCCTACATGGGAGAA  399

seq1  AGAGTGCTAGGTTAGAGATAGTCTGGCTTGACTGAACTCAAGAGGACATT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGCTAGGTTAGAGATAGTCTGGCTTGACTGAACTCAAGAGGACATT  449

seq1  TTCTGGAATGAAAAGGAAGTGTGTTGAAATTTATAAGGTCATCAAAGTTC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGAATGAAAAGGAAGTGTGTTGAAATTTATAAGGTCATCAAAGTTC  499

seq1  AGTACTCTCACAATAGCTTGACAAGACAGTAGCCAAGGTAACCTTTAACA  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTCTCACAATAGCTTGACAAGACAGTAGCCAAGGTAACCTTTAACA  549

seq1  ATAAAAATAGAAGCCTAGATTTTCTGCAAATAGAAAATTGCTGACCTCCA  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAATAGAAGCCTAGATTTTCTGCAAATAGAAAATTGCTGACCTCCA  599

seq1  TCCAAAATCTGCAGGCTTTTAAGGATGTAATTAATATTCCTAAGCTACCT  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAAAATCTGCAGGCTTTTAAGGATGTAATTAATATTCCTAAGCTACCT  649

seq1  CTTCATGTCCTCTTCCAACCAAGCCAAAGACCCCAGGTCCCCTAGCTCTC  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCATGTCCTCTTCCAACCAAGCCAAAGACCCCAGGTCCCCTAGCTCTC  699

seq1  AGGATCCCAGTGGCCACAGTTAACAAGTGGCTCATGTGCTGCATTCTATG  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCCCAGTGGCCACAGTTAACAAGTGGCTCATGTGCTGCATTCTATG  749

seq1  TGTGATGCATTTTTGGATCTCTGAGGACACTTGTGCCTGTGGAGGTTTCG  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGATGCATTTTTGGATCTCTGAGGACACTTGTGCCTGTGGAGGTTTCG  799

seq1  AGTGCCTTCTCAAGTTTGCCATGATGTGACAGACCGAGGGAGCCACTTTG  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCCTTCTCAAGTTTGCCATGATGTGACAGACCGAGGGAGCCACTTTG  849

seq1  GAATAGATTCCCAATGGCTTGTTCCTGCCACTGCCGGGGAGGTGACCATG  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGATTCCCAATGGCTTGTTCCTGCCACTGCCGGGGAGGTGACCATG  899

seq1  AACACAGCAGTGACAGTGCAGAGTACAGCACACACCGTGACATTGGTGGC  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAGCAGTGACAGTGCAGAGTACAGCACACACCGTGACATTGGTGGC  949

seq1  TGTAGGTAATATTACACGATGAAGCAAGGGACAGATTTGGAGGAGTATAG  996
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGGTAATATTACACGATGAAGCAAGGGACAGATTTGGAGGAGTATAG  999

seq1  GTCCCTAAGGAGCAGCCTCCACTCAGTCCTAACAGTTTCTTGAATGAATT  1046
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCTAAGGAGCAGCCTCCACTCAGTCCTAACAGTTTCTTGAATGAATT  1049

seq1  C  1047
      |
seq2  C  1050