BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-192O19
Chromosome5 (Build37)
Map Location 61,695,916 - 61,821,361
singlet/doubletdoublet
Overlap geneEG666610
Upstream geneLOC100041498, LOC666597
Downstream geneLOC100041524, G6pd2, LOC100041543
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-192O19.bB6Ng01-192O19.g
ACCGA016036GA016037
length1,1441,118
definitionB6Ng01-192O19.b B6Ng01-192O19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(61,695,916 - 61,697,071)(61,820,240 - 61,821,361)
sequence
gaattctttgctgccagcaatcagcagcccttaaatatcaacacggcagg
catttgttaaccacctcacagaataactttgaaaaacagttaggaaagaa
tagaaaatgaacctggtatatttcttaacacattaagaatatcaacatat
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gatagtgtgcttatagaagaagtaactattactctcagtgtgttgggact
tgtacattaggtagaggattcattaaattaaaataaatgatggatccacg
aactatagcataaataaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_61695916_61697071
seq2: B6Ng01-192O19.b_44_1187

seq1  GAATTCTTTGCTGCCAGCAATCAGCAGCCCTTAAATATCAACACGGCAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTGCTGCCAGCAATCAGCAGCCCTTAAATATCAACACGGCAGG  50

seq1  CATTTGTTAACCACCTCACAGAATAACTTTGAAAAACAGTTAGGAAAGAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  TAGAAAATGAACCTGGTATATTTCTTAACACATTAAGAATATCAACATAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAATGAACCTGGTATATTTCTTAACACATTAAGAATATCAACATAT  150

seq1  AGTATCCATATTTTTTTCTATTTTGCCCCTCAACTCTATAAAACCACACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTATCCATATTTTTTTCTATTTTGCCCCTCAACTCTATAAAACCACACA  200

seq1  GTATTTAATATAACTTTCGAAGTTGGAAATGCTATTTTCAAAGCAAAATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTTAATATAACTTTCGAAGTTGGAAATGCTATTTTCAAAGCAAAATG  250

seq1  TTCCTAGAATAGTTTGCATACAAAACTACACTTTAAGTAGCCAGGCAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTAGAATAGTTTGCATACAAAACTACACTTTAAGTAGCCAGGCAGAA  300

seq1  TTTTGTTACAGAATCAAAAATGGGTGAATCCATGTTCCCTGGCAGAAGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGTTACAGAATCAAAAATGGGTGAATCCATGTTCCCTGGCAGAAGCT  350

seq1  GCCCCTACAAAGTGACTGGCCTATATGGTATTCATAGTCACGTGTTTTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTACAAAGTGACTGGCCTATATGGTATTCATAGTCACGTGTTTTCT  400

seq1  TTAACTTTTAAATACCATTCTGTTATTCACCTTTGTATATGAGCCATATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTTTTAAATACCATTCTGTTATTCACCTTTGTATATGAGCCATATC  450

seq1  CATGTTACAATTAAGTATATGCCCTGAAATATGCAAATGAATGTTGTATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTACAATTAAGTATATGCCCTGAAATATGCAAATGAATGTTGTATG  500

seq1  TTCAACTAACCTAAAAGCTAAGAAGGTTATCACATAATATTGAAGCCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACTAACCTAAAAGCTAAGAAGGTTATCACATAATATTGAAGCCTGT  550

seq1  AAGTAGATCTGTCTTGCTTTGCTGTAATCTGACAGTGAATATGCTACAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTAGATCTGTCTTGCTTTGCTGTAATCTGACAGTGAATATGCTACAAT  600

seq1  GTGTATAAAAGTGTTTTGTTTATGATTTTATGTATTATGTTGTAAAAATA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTATAAAAGTGTTTTGTTTATGATTTTATGTATTATGTTGTAAAAATA  650

seq1  ATAAAGATACTAGAAGCTACTTCATGGAAACATGAAATTTACACTAACGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAGATACTAGAAGCTACTTCATGGAAACATGAAATTTACACTAACGT  700

seq1  ACATTCATATAGTCACCTACATTTGTTTCAGAAGGAGTTATTTCTTATCC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCATATAGTCACCTACATTTGTTTCAGAAGGAGTTATTTCTTATCC  750

seq1  TATTTTTAAAAAGAATGGTGTTTTCTGTTCCAACAAAAAAAGAGTCACAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTTAAAAAGAATGGTGTTTTCTGTTCCAACAAAAAAAGAGTCACAA  800

seq1  GG-AAGGCATTTAGTAAGTAACCCG-TTTTTTTTTTTTTTTCAAAAAAAT  848
      || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGGCATTTAGTAAGTAACCCGTTTTTTTTTTTTTTTTCAAAAAAAT  850

seq1  GCATTGAAACTGATTTTATTTATGTATATTATATAACATTAGAATATATA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTGAAACTGATTTTATTTATGTATATTATATAACATTAGAATATATA  900

seq1  TTCATATTAGAATAAAGTCTTATTAAATTCATATTATTATCACAGATGGA  948
      |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATA-TAGAATAAAGTCTTATT-AATTCATATTATTATCACAGATGGA  948

seq1  AATGAGTGTTATACTATTAATGTGTAGGCTCTGTTCTATGTTTTT-AGTA  997
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AATGAGTGTTATACTATT-ATGTGTAGGCTCTGTTCTATGTTTTTAAGTA  997

seq1  GTTAGAATCCAAAATTCTTTCATTCTTAAGATGCCCAGTTAGATTGGGAG  1047
      | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| 
seq2  G-TAG-ATCCAAAATTCTTTCATTC-TAAGATG-CCAGTTAGATTGGGA-  1042

seq1  GGAAAAGGGCAATCGTTGTGCAATCAGTAGAATGATTTATTTTTTAAACT  1097
      |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |
seq2  GGAAAAGGCCAATCGTTGTGC-ATCAGTAGAATGATTTATTTTTTAACTT  1091

seq1  ACATTCCATGAAATATCCAGGAGCGGTAATAAGAAGTCATAGTTTAATCT  1147
      ||  || ||||||| | ||||||||   ||||| |||||||| |||||||
seq2  AC--TCAATGAAAT-TTCAGGAGCG--TATAAG-AGTCATAGCTTAATCT  1135

seq1  GTTACGCCA  1156
      |||||||||
seq2  GTTACGCCA  1144


seq1: chr5_61820240_61821361
seq2: B6Ng01-192O19.g_65_1182 (reverse)

seq1  TTTATTTATGCTATAG-TCGTGAACTCCATCATTTTATTTTAATTTAATG  49
      |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTTATTTATGCTATAGTTCGTGGA-TCCATCA-TTTATTTTAATTTAATG  48

seq1  ATATTCCTCTACCTAATGTACAGTTCCCA--ACACTGAGAGTTATAGTTA  97
        | ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||
seq2  --AATCCTCTACCTAATGTACAAGTCCCAACACACTGAGAGTAATAGTTA  96

seq1  CTTCTTCTTATTAAGCACACTAT-CCTGATTATAATGCTGTGAAGTTCCC  146
      ||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||
seq2  CTTCTTCT--ATAAGCACACTATCCCTGA-TATAATGCTGTGAAG-TCCC  142

seq1  AAGTTTGCTTTTATCTGGGAGGCTCTGATG-TTATTGTTCTCATGTTCTA  195
      |   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  A--GTTGCTTTTATCTGGGAGGCTCTGATGTTTATTGTTCTCATGTTCTA  190

seq1  ACAAGAGACATACTAAGAGTCATTGCCATCAATGACTTTCTGAAAGCCAT  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGAGACATACTAAGAGTCATTGCCATCAATGACTTTCTGAAAGCCAT  240

seq1  TGGCACACAGCAGCTTGAGCAAAAACACCTAGACATCAACTCTGATGCTC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCACACAGCAGCTTGAGCAAAAACACCTAGACATCAACTCTGATGCTC  290

seq1  TAGCAATTGTACTCTACCATGTGAAGATGAACTTGAAGCAGCTTTCTTTT  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCAATTGTACTCTACCATGTGAAGATGAACTTGAAGCAGCTTTCTTTT  340

seq1  GACAATAACTGTATATTAAGTGTACTGTGGACAATGCTATGCATTATGGC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATAACTGTATATTAAGTGTACTGTGGACAATGCTATGCATTATGGC  390

seq1  ACACACTGGTTGTACTAATTCTTATAACATATTCATTTCCTAAACTGATA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTGGTTGTACTAATTCTTATAACATATTCATTTCCTAAACTGATA  440

seq1  TTTGAGGACTGTCTATGCCATGTGCTC-TTTTTTTTTCTTATTGATGTAA  494
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGGACTGTCTATGCCATGTGCTCTTTTTTTTTTCTTATTGATGTAA  490

seq1  ATGATTACATTGGAAAGGTAGTGTTTCTGTGTCTCAGCTCTTGTTATGTA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTACATTGGAAAGGTAGTGTTTCTGTGTCTCAGCTCTTGTTATGTA  540

seq1  GACACCATATATCAACTGCCTTTCTTTCTTCACATCTATTTTTAAAGCAC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACCATATATCAACTGCCTTTCTTTCTTCACATCTATTTTTAAAGCAC  590

seq1  TCATATATATATATATATTCATTTGATATTGGGTAGTTTAAATAACTACC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATATATATATATATATTCATTTGATATTGGGTAGTTTAAATAACTACC  640

seq1  AATTTCCAGTAATAGTTTATTATTTACAATGTATACATTGTTATATTATT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCCAGTAATAGTTTATTATTTACAATGTATACATTGTTATATTATT  690

seq1  AAGATACTTTAAACCACAATTTGAATCCAAAATGACATAAAAATTGAAAA  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATACTTTAAACCACAATTTGAATCCAAAATGACATAAAAATTGAAAA  740

seq1  TTAGAGAACACACATATAATGGCTGCTCTTGATAATCAATCTGACATACC  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGAACACACATATAATGGCTGCTCTTGATAATCAATCTGACATACC  790

seq1  TAGAAAAGGGGCACTTAGTGGCCTGAGGGCAAGTATATCTATAGACCATT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAAGGGGCACTTAGTGGCCTGAGGGCAAGTATATCTATAGACCATT  840

seq1  TGGTGGTTTTTGATTTTTTTGTGTTTTTTAAACGTTATGTTTTCTTTTTG  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGTTTTTGATTTTTTTGTGTTTTTTAAACGTTATGTTTTCTTTTTG  890

seq1  AGATTAGAAAATTAATCCAAAATTTTTCTATTCCCCTAAACCATCCCATA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTAGAAAATTAATCCAAAATTTTTCTATTCCCCTAAACCATCCCATA  940

seq1  TATATTCTACTGCTTTTTTAAAATATAGCTTCTTTTTTACATTAACTGTT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTCTACTGCTTTTTTAAAATATAGCTTCTTTTTTACATTAACTGTT  990

seq1  GACAGAGATTTATAAACAGCCTGCTGAGACTCTATAACATTATATATATA  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAGATTTATAAACAGCCTGCTGAGACTCTATAACATTATATATATA  1040

seq1  TATATATATATTCATGGTTGAGTAGTTGGTATTGAATACCAAGTTGGTCT  1094
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATTCATGGTTGAGTAGTTGGTATTGAATACCAAGTTGGTCT  1090

seq1  GATCTTTCCTGAACAAGACATAGAATTC  1122
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTTCCTGAACAAGACATAGAATTC  1118


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