BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-194J13
Chromosome5 (Build37)
Map Location 132,022,477 - 132,168,598
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAuts2
Upstream geneCaln1, Wbscr17
Downstream gene4930563F08Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-194J13.bB6Ng01-194J13.g
ACCGA017246GA017247
length903967
definitionB6Ng01-194J13.b B6Ng01-194J13.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(132,022,477 - 132,023,380)(132,167,636 - 132,168,598)
sequence
gaattctcattgccaccaaatgtacagctgccatctgacagctctgctgt
gatttttttttttttctttcccaaatagaaactgaaagtagctgagggga
cacaggccatgtctccaacctttcctgctctcctgcagggtctaacaaac
cttgagagtctggagatgaggctcaattggtaggacacctgccttgcatg
cacaaagtgctagttccatgccaacagagcataaaccaggaatgttggct
caggcctgtaatcacaatcttcagtaggtagaggcaggaaggtcacgtgt
tcaaggtcatgttccccgacatagtgagttcctggcaaatctaggttccc
atatgaccctgtctcaaaaacaaaaaacaaataaccatggggttgaagag
atgcctcagcagctaagagcacttggtagcctttcagaggacacacattc
aatttctagcactcatgatgggtggctacaactgcttgtaacaccagctc
cagagaccaaacacacttgtctggccttctagcgtgcacacgtgcgcgca
cgcgcacgaacacacacaaataaacaaacaggaactaccttcctccagct
ccaccataattgccttaatcctgtcacccggtgtggtgactcaaacctgt
aatcccaactctggagaagctgaggcagggggatcagatgctcagggata
cccttgcagtcaactctaagttagcctgtgctataaccagactttccaaa
atggggaggggttattcacaaaagcaacccattctacagatcagttaggg
aattaccactaaagtcagtgacaacttcatagccacaggctagccccaga
gagaaatctggtgactggttctaaaggttttaggggtgttgtatgtttca
agg
gaattctctaggctaagttgaactgtatgaagtggccatctcatttggtt
ccgcctaatatttgtatatcatttgatcatatattaattttgtgattaaa
atggcagagacaagtagggttatattttggtggttggaaattacacagct
ctagagatgttagggggtcattaagtgcagttctcttagtggggaaactg
agctccagaccacacgggtaagaggtagattttaaacaaagccacagctg
ggaaatggctcccttagtaaagtgcttgccttgcaaacattaggacctga
cctcactcccaagaacctatttaaaaagctaagtattatggtgtatactt
gtaatcccagtgctggagaggcagagacagagagatccttggccagtcca
gccaagcctaatttgcaagcctctaggccaataggagagcctatcttaaa
aaaacaacatagctcctgtggagtgacacccaagattgtcctcagtcctc
catgcacaatttcacacatggacacaggtacatacatacacatacatagg
acaaacaaaggaatggttcctagctccctggatatacacactgtaataca
cagacttcctcaagtgctggttgctgacccacgtacataataggctccaa
tcctaaatgttgacgctggctcttattgatttgatacttgaaattaaatc
ctggtctttaaacattttaggaaaacagcctaccacttagccataccccc
agcccctttctgggggattctaggctggtgctctaatactgagccacacc
ccagcccctcactgggggattctaggcaggttgctctaccactgagccac
acctcagccccttcactaggggatttgaggcaggggctccaccactgagc
cacgcccccagctcctcactggggggatcttaggctagcactttgttgtt
gagctacatccttactc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_132022477_132023380
seq2: B6Ng01-194J13.b_48_950

seq1  GAATTCTCATTGCCACCAAATGTACAGCTGCCATCTGACAGCTCTGCTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCATTGCCACCAAATGTACAGCTGCCATCTGACAGCTCTGCTGT  50

seq1  GATTTTTTTTTTTTTCTTTCCCAAATAGAAACTGAAAGTAGCTGAGGGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTTTTTTTTTTCTTTCCCAAATAGAAACTGAAAGTAGCTGAGGGGA  100

seq1  CACAGGCCATGTCTCCAACCTTTCCTGCTCTCCTGCAGGGTCTAACAAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGCCATGTCTCCAACCTTTCCTGCTCTCCTGCAGGGTCTAACAAAC  150

seq1  CTTGAGAGTCTGGAGATGAGGCTCAATTGGTAGGACACCTGCCTTGCATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGAGTCTGGAGATGAGGCTCAATTGGTAGGACACCTGCCTTGCATG  200

seq1  CACAAAGTGCTAGTTCCATGCCAACAGAGCATAAACCAGGAATGTTGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAAGTGCTAGTTCCATGCCAACAGAGCATAAACCAGGAATGTTGGCT  250

seq1  CAGGCCTGTAATCACAATCTTCAGTAGGTAGAGGCAGGAAGGTCACGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCCTGTAATCACAATCTTCAGTAGGTAGAGGCAGGAAGGTCACGTGT  300

seq1  TCAAGGTCATGTTCCCCGACATAGTGAGTTCCTGGCAAATCTAGGTTCCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAGGTCATGTTCCCCGACATAGTGAGTTCCTGGCAAATCTAGGTTCCC  350

seq1  ATATGACCCTGTCTCAAAAACAAAAAACAAATAACCATGGGGTTGAAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGACCCTGTCTCAAAAACAAAAAACAAATAACCATGGGGTTGAAGAG  400

seq1  ATGCCTCAGCAGCTAAGAGCACTTGGTAGCCTTTCAGAGGACACACATTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCCTCAGCAGCTAAGAGCACTTGGTAGCCTTTCAGAGGACACACATTC  450

seq1  AATTTCTAGCACTCATGATGGGTGGCTACAACTGCTTGTAACACCAGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTCTAGCACTCATGATGGGTGGCTACAACTGCTTGTAACACCAGCTC  500

seq1  CAGAGACCAAACACACTTGTCTGGCCTTCTAGCGTGCACACGTGCGCGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGACCAAACACACTTGTCTGGCCTTCTAGCGTGCACACGTGCGCGCA  550

seq1  CGCGCACGAACACACACAAATAAACAAACAGGAACTACCTTCCTCCAGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCGCACGAACACACACAAATAAACAAACAGGAACTACCTTCCTCCAGCT  600

seq1  CCACCATAATTGCCTTAATCCTGTCACCCGGTGTGGTGACTCAAACCTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCATAATTGCCTTAATCCTGTCACCCGGTGTGGTGACTCAAACCTGT  650

seq1  AATCCCAACTCTGGAGAAGCTGAGGCAGGGGGATCAGATGCTCAGGGATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCCAACTCTGGAGAAGCTGAGGCAGGGGGATCAGATGCTCAGGGATA  700

seq1  CCCTTGCAGTCAACTCTAAGTTAGCCTGTGCTATAACCAGACTTTCCAAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTGCAGTCAACTCTAAGTTAGCCTGTGCTATAACCAGACTTTCCAAA  750

seq1  ATGGGGAGGGGTTATTCAC-AAAGCAACCCATTCTACAAGATCAGTTAGG  799
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ATGGGGAGGGGTTATTCACAAAAGCAACCCATTCTAC-AGATCAGTTAGG  799

seq1  GAATTACCACTAAAGTCAGTGACAACTTCATAGCCACAGGCTAGCCCCAG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTACCACTAAAGTCAGTGACAACTTCATAGCCACAGGCTAGCCCCAG  849

seq1  AGAGAAATCTTGGTGACTGGTTCTAAGGGTTTTAGGGGTGTTGTATGTTT  899
      ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAATC-TGGTGACTGGTTCTAAAGGTTTTAGGGGTGTTGTATGTTT  898

seq1  TAAGG  904
       ||||
seq2  CAAGG  903

seq1: chr5_132167636_132168598
seq2: B6Ng01-194J13.g_66_1032 (reverse)

seq1  GAGTAAGGATGTAGCTCAACAACAAAGTGCTAGCCT-AGAATCCCCCAGT  49
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||
seq2  GAGTAAGGATGTAGCTCAACAACAAAGTGCTAGCCTAAGATCCCCCCAGT  50

seq1  GAGGAGCTGGGGGCGTGGCTCAGTGGTGGAGCCCCTGCCTCAAATCCCCT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGCTGGGGGCGTGGCTCAGTGGTGGAGCCCCTGCCTCAAATCCCCT  100

seq1  AGTG-AGGGGCTGAGGTGTGGCTCAGTGGTAGAGC-ACCTGCCTAGAATC  147
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AGTGAAGGGGCTGAGGTGTGGCTCAGTGGTAGAGCAACCTGCCTAGAATC  150

seq1  CCCCAGTGAGGGGCTGGGGTGTGGCTCAGTATTAGAGCACCAGCCTAGAA  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGTGAGGGGCTGGGGTGTGGCTCAGTATTAGAGCACCAGCCTAGAA  200

seq1  TCCCCCAGAAAGGGGCTGGGGGTATGGCTAAGTGGTAGGCTGTTTTCCTA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCCAGAAAGGGGCTGGGGGTATGGCTAAGTGGTAGGCTGTTTTCCTA  250

seq1  AAATGTTTAAAGACCAGGATTTAATTTCAAGTATC-AATCAATAAGAGCC  296
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AAATGTTTAAAGACCAGGATTTAATTTCAAGTATCAAATCAATAAGAGCC  300

seq1  AGCGTCAACATTTAGGATTGGAGCCTATTATGTACGTGGGTCAGCAACCA  346
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGTCAACATTTAGGATTGGAGCCTATTATGTACGTGGGTCAGCAACCA  350

seq1  GCACTTGAGGAAGTCTGTGTATTACAGTGTGTATATCCAGGGAGCTAGGA  396
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTTGAGGAAGTCTGTGTATTACAGTGTGTATATCCAGGGAGCTAGGA  400

seq1  ACCATTCCTTTGTTTGTCCTATGTATGTGTATGTATGTACCTGTGTCCAT  446
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATTCCTTTGTTTGTCCTATGTATGTGTATGTATGTACCTGTGTCCAT  450

seq1  GTGTGAAATTGTGCATGGAGGACTGAGGACAATCTTGGGTGTCACTCCAC  496
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGAAATTGTGCATGGAGGACTGAGGACAATCTTGGGTGTCACTCCAC  500

seq1  AGGAGCTATGTTGTTTTTTTAAGATAGGCTCTCCTATTGGCCTAGAGGCT  546
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCTATGTTGTTTTTTTAAGATAGGCTCTCCTATTGGCCTAGAGGCT  550

seq1  TGCAAATTAGGCTTGGCTGGACTGGCCAAGGATCTCTCTGTCTCTGCCTC  596
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAATTAGGCTTGGCTGGACTGGCCAAGGATCTCTCTGTCTCTGCCTC  600

seq1  TCCAGCACTGGGATTACAAGTATACACCATAATACTTAGCTTTTTAAATA  646
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGCACTGGGATTACAAGTATACACCATAATACTTAGCTTTTTAAATA  650

seq1  GGTTCTTGGGAGTGAGGTCAGGTCCTAATGTTTGCAAGGCAAGCACTTTA  696
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCTTGGGAGTGAGGTCAGGTCCTAATGTTTGCAAGGCAAGCACTTTA  700

seq1  CTAAGGGAGCCATTTCCCAGCTGTGGCTTTGTTTAAAATCTACCTCTTAC  746
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGGGAGCCATTTCCCAGCTGTGGCTTTGTTTAAAATCTACCTCTTAC  750

seq1  CCGTGTGGTCTGGAGCTCAGTTTCCCCACTAAGAGAACTGCACTTAATGA  796
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGTGTGGTCTGGAGCTCAGTTTCCCCACTAAGAGAACTGCACTTAATGA  800

seq1  CCCCCTAACATCTCTAGAGCTGTGTAATTTCCAACCACCAAAATATAACC  846
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCTAACATCTCTAGAGCTGTGTAATTTCCAACCACCAAAATATAACC  850

seq1  CTACTTGTCTCTGCCATTTTAATCACAAAATTAATATATGATCAAATGAT  896
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTTGTCTCTGCCATTTTAATCACAAAATTAATATATGATCAAATGAT  900

seq1  ATACAAATATTAGGCGGAACCAAATGAGATGGCCACTTCATACAGTTCAA  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAATATTAGGCGGAACCAAATGAGATGGCCACTTCATACAGTTCAA  950

seq1  CTTAGCCTAGAGAATTC  963
      |||||||||||||||||
seq2  CTTAGCCTAGAGAATTC  967