BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-207G18
Chromosome5 (Build37)
Map Location 128,263,038 - 128,432,974
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTmem132d
Upstream geneLOC100040327, Tmem132c, Slc15a4, Glt1d1
Downstream geneFzd10, LOC100040398, Piwil1, Rimbp2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-207G18.bB6Ng01-207G18.g
ACCGA026576GA026577
length1,046338
definitionB6Ng01-207G18.b B6Ng01-207G18.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,431,930 - 128,432,974)(128,263,038 - 128,263,375)
sequence
gaattcacatcccatttacctcgttcttatcctctcagccatacctggtc
ccagagcatttggctagctttccatcttcagctgttgctaaggcaactac
atcccattgatgctaatgacttcgctgggacactggagctggtccatgtt
tcctctgtccatgcttcctgcccaagcctttgatgctaaacagaaaactt
tttctagccaaacacacgtggtcctctgaagcagggaaaagctagtcctg
accccacccagggcctgtgtggcccaatttttgatagattcactagctag
tgagctcagcattccttacacatggccagcttggtccatttctcactctc
catccatgctagcaagcccagcatcctctctgtgtgttagttccctacag
gctccatctcctttcttctctccctcctaactctatggctgacactcttc
acacattgataagtatatggcctctgatccctgccccagggtctgttttg
agagggatcacaggctaagctgctatttatgatgtcattttaatagcagg
aactttgcacagtctatatacagagacctctaagatatattgagaaaggg
acaaaggattggctttatccagactggtaagatagaaacttgtaccagag
gcatctatattatctgccgcttacaaagataaaaatgatgggtcaggtga
gatagctgagtgtataaggatgcttactaccaaactcggtgtcgtgagtt
caatcccctaaacccacatagcagaaagagagaatctattcccacagtta
tcccacgtgcatgtactaccccaaacatctataaaagatttttaatacca
aggccagcactagtatctcttatgacacccaaaacctcttgttccttcta
gaagagtggctctcaaccttcctaggacttggacacttggatacagttcc
tcacatgggcagtgacccccaaccagaaaaaaaatttgttgctgcttcat
taactgtaatttttcttactgttaagatcataatgtaaaaacaaaa

actctgagtcctgtttacattctggagaccagtctcttcacagggatatg
tgtccctgggacctcctctatagaatgtcacctgaagttgacaggaagct
caggggaacttgaggcagggagcaaattctgggaaacactcttctttcct
cacttgcacataaccaatggctgaagggtatcagtagagtgtagtgatca
agttcaaatcttgtgaacttgcattaaggagcgtggggtttgtatccagt
gtcctatagacaggaagtttctctcaactgctccagtgatatatgtgtgt
gtaatgtatgtatgtgtttatgtatatatatatgtatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_128431930_128432974
seq2: B6Ng01-207G18.b_42_1087 (reverse)

seq1  TTTTGTTTTTTACATTATGATTCCTAACAGTA--GAAAATTACAGTTAAT  48
      ||||| |||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||
seq2  TTTTG-TTTTTACATTATGA-TCTTAACAGTAAGAAAAATTACAGTTAAT  48

seq1  GAAGCAGCAACAAATTTTTTTTCTGGTTGGGGGTCACTG-CCATGTGAGG  97
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GAAGCAGCAACAAATTTTTTTTCTGGTTGGGGGTCACTGCCCATGTGAGG  98

seq1  AACTGTATCCAAGTGTCCAAGTCCTAGGAAGGTTGAGAGCCACTCTTCTA  147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGTATCCAAGTGTCCAAGTCCTAGGAAGGTTGAGAGCCACTCTTCTA  148

seq1  GAAGGAACAAGAGGTTTTGGGTGTCATAAGAGATACTAGTGCTGGCCTTG  197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAACAAGAGGTTTTGGGTGTCATAAGAGATACTAGTGCTGGCCTTG  198

seq1  GTATTAAAAATCTTTTATAGATGTTTGGGGTAGTACATGCACGTGGGATA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTAAAAATCTTTTATAGATGTTTGGGGTAGTACATGCACGTGGGATA  248

seq1  ACTGTGGGAATAGATTCTCTCTTTCTGCTATGTGGGTTTAGGGGATTGAA  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGGGAATAGATTCTCTCTTTCTGCTATGTGGGTTTAGGGGATTGAA  298

seq1  CTCACGACACCGAGTTTGGTAGTAAGCATCCTTATACACTCAGCTATCTC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACGACACCGAGTTTGGTAGTAAGCATCCTTATACACTCAGCTATCTC  348

seq1  ACCTGACCCATCATTTTTATCTTTGTAAGCGGCAGATAATATAGATGCCT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTGACCCATCATTTTTATCTTTGTAAGCGGCAGATAATATAGATGCCT  398

seq1  CTGGTACAAGTTTCTATCTTACCAGTCTGGATAAAGCCAATCCTTTGTCC  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTACAAGTTTCTATCTTACCAGTCTGGATAAAGCCAATCCTTTGTCC  448

seq1  CTTTCTCAATATATCTTAGAGGTCTCTGTATATAGACTGTGCAAAGTTCC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCAATATATCTTAGAGGTCTCTGTATATAGACTGTGCAAAGTTCC  498

seq1  TGCTATTAAAATGACATCATAAATAGCAGCTTAGCCTGTGATCCCTCTCA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTATTAAAATGACATCATAAATAGCAGCTTAGCCTGTGATCCCTCTCA  548

seq1  AAACAGACCCTGGGGCAGGGATCAGAGGCCATATACTTATCAATGTGTGA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGACCCTGGGGCAGGGATCAGAGGCCATATACTTATCAATGTGTGA  598

seq1  AGAGTGTCAGCCATAGAGTTAGGAGGGAGAGAAGAAAGGAGATGGAGCCT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTGTCAGCCATAGAGTTAGGAGGGAGAGAAGAAAGGAGATGGAGCCT  648

seq1  GTAGGGAACTAACACACAGAGAGGATGCTGGGCTTGCTAGCATGGATGGA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGGGAACTAACACACAGAGAGGATGCTGGGCTTGCTAGCATGGATGGA  698

seq1  GAGTGAGAAATGGACCAAGCTGGCCATGTGTAAGGAATGCTGAGCTCACT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGAGAAATGGACCAAGCTGGCCATGTGTAAGGAATGCTGAGCTCACT  748

seq1  AGCTAGTGAATCTATCAAAAATTGGGCCACACAGGCCCTGGGTGGGGTCA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGTGAATCTATCAAAAATTGGGCCACACAGGCCCTGGGTGGGGTCA  798

seq1  GGACTAGCTTTTCCCTGCTTCAGAGGACCACGTGTGTTTGGCTAGAAAAA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTAGCTTTTCCCTGCTTCAGAGGACCACGTGTGTTTGGCTAGAAAAA  848

seq1  GTTTTCTGTTTAGCATCAAAGGCTTGGGCAGGAAGCATGGACAGAGGAAA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTCTGTTTAGCATCAAAGGCTTGGGCAGGAAGCATGGACAGAGGAAA  898

seq1  CATGGACCAGCTCCAGTGTCCCAGCGAAGTCATTAGCATCAATGGGATGT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGACCAGCTCCAGTGTCCCAGCGAAGTCATTAGCATCAATGGGATGT  948

seq1  AGTTGCCTTAGCAACAGCTGAAGATGGAAAGCTAGCCAAATGCTCTGGGA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTGCCTTAGCAACAGCTGAAGATGGAAAGCTAGCCAAATGCTCTGGGA  998

seq1  CCAGGTATGGCTGAGAGGATAAGAACGAGGTAAATGGGATGTGAATTC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTATGGCTGAGAGGATAAGAACGAGGTAAATGGGATGTGAATTC  1046


seq1: chr5_128263038_128263375
seq2: B6Ng01-207G18.g_74_411

seq1  ACTCTGAGTCCTGTTTACATTCTGGAGACCAGTCTCTTCACAGGGATATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTGAGTCCTGTTTACATTCTGGAGACCAGTCTCTTCACAGGGATATG  50

seq1  TGTCCCTGGGACCTCCTCTATAGAATGTCACCTGAAGTTGACAGGAAGCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCTGGGACCTCCTCTATAGAATGTCACCTGAAGTTGACAGGAAGCT  100

seq1  CAGGGGAACTTGAGGCAGGGAGCAAATTCTGGGAAACACTCTTCTTTCCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGAACTTGAGGCAGGGAGCAAATTCTGGGAAACACTCTTCTTTCCT  150

seq1  CACTTGCACATAACCAATGGCTGAAGGGTATCAGTAGAGTGTAGTGATCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGCACATAACCAATGGCTGAAGGGTATCAGTAGAGTGTAGTGATCA  200

seq1  AGTTCAAATCTTGTGAACTTGCATTAAGGAGCGTGGGGTTTGTATCCAGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCAAATCTTGTGAACTTGCATTAAGGAGCGTGGGGTTTGTATCCAGT  250

seq1  GTCCTATAGACAGGAAGTTTCTCTCAACTGCTCCAGTGATATATGTGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTATAGACAGGAAGTTTCTCTCAACTGCTCCAGTGATATATGTGTGT  300

seq1  GTAATGTATGTATGTGTTTATGTATATATATATGTATG  338
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATGTATGTATGTGTTTATGTATATATATATGTATG  338


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |