seq1: chr5_63639598_63640682
seq2: B6Ng01-216F01.b_46_1134
seq1 GAATTCCAAATTCAAAAGCATGCCATTTTGTAAACCACTTATCCTCTAAA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCCAAATTCAAAAGCATGCCATTTTGTAAACCACTTATCCTCTAAA 50
seq1 GGAGCCCTAGCTTAACAACATGTGGGATATTTAGTTGACCTATGAACTCT 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGAGCCCTAGCTTAACAACATGTGGGATATTTAGTTGACCTATGAACTCT 100
seq1 CACCTATTCCTCATCAAGTTGAAAGGAAGTTTTCTTCTTTGCACTATATC 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CACCTATTCCTCATCAAGTTGAAAGGAAGTTTTCTTCTTTGCACTATATC 150
seq1 CCACAATAACATAATTCAAATTCCATTTTCAAGGAATTCTGAAAATCTGT 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCACAATAACATAATTCAAATTCCATTTTCAAGGAATTCTGAAAATCTGT 200
seq1 GTCAAAAGCTAAAATTTATGTATTCAGAATATCTTCATGTTTCATGATAA 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTCAAAAGCTAAAATTTATGTATTCAGAATATCTTCATGTTTCATGATAA 250
seq1 ATGTCAACATTGTTTTGATTCTACTTTTATTTACATTGTTTATCCTTGTT 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATGTCAACATTGTTTTGATTCTACTTTTATTTACATTGTTTATCCTTGTT 300
seq1 CTAATTCCACTGTTTATGACAGCTTTATACACTTGAATAACAGAATGTCA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTAATTCCACTGTTTATGACAGCTTTATACACTTGAATAACAGAATGTCA 350
seq1 TGGTTCATTCCTATAAAAAACATTCTGTTCCTAACTGTTGCCTCCAATTT 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TGGTTCATTCCTATAAAAAACATTCTGTTCCTAACTGTTGCCTCCAATTT 400
seq1 TACTTGCTTTTTTTTTTTAAATATATTGTCAGCCTTTTCCCAATGTGCAT 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TACTTGCTTTTTTTTTTTAAATATATTGTCAGCCTTTTCCCAATGTGCAT 450
seq1 GTCAGGGAAGAAAAGAAAACATGTCTACTTTGTTGATTGTTACAGCCCTG 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTCAGGGAAGAAAAGAAAACATGTCTACTTTGTTGATTGTTACAGCCCTG 500
seq1 ATATCTTGCACAGACTTTACACTGGATAGGGCTTAATGTAACAACACAGG 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATATCTTGCACAGACTTTACACTGGATAGGGCTTAATGTAACAACACAGG 550
seq1 AAGAATAAAGCTTGAAGCCCATATGTATTTTCTAGGTTTGTGTATAATTA 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGAATAAAGCTTGAAGCCCATATGTATTTTCTAGGTTTGTGTATAATTA 600
seq1 GATCCTATATTCAGCTGGAGTCAGGGCCAATTACTGACAATATGTCAACA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GATCCTATATTCAGCTGGAGTCAGGGCCAATTACTGACAATATGTCAACA 650
seq1 AAATTCTATATGGTCTTTTCCCATTGCCTGCTGGAACTTGGACATTATAG 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAATTCTATATGGTCTTTTCCCATTGCCTGCTGGAACTTGGACATTATAG 700
seq1 AAGATATAGCTTTGATAACACAGACAGTGAGCAATGAAGAAGGGAACTAA 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGATATAGCTTTGATAACACAGACAGTGAGCAATGAAGAAGGGAACTAA 750
seq1 TATTTTCTAGTAGACAACTAATACAGAGTCTGAGCTATAATAACTTGATT 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATTTTCTAGTAGACAACTAATACAGAGTCTGAGCTATAATAACTTGATT 800
seq1 TGGTGTGGAGAACAGAAGTTCATTACGGATGTTTTGTGGGAACTG-AAAT 849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2 TGGTGTGGAGAACAGAAGTTCATTACGGATGTTTTGTGGGAACTGAAAAT 850
seq1 AATAAGACTGAATGATGGATGAGCACC-TTCAAACGCTAGACATGAGGCA 898
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2 AATAAGACTGAATGATGGATGAGCACCTTTCAAACGCTAGACATGAGGCA 900
seq1 AAAGAAATGACCCTGGTGAGGATTTTAGCCTT-GGCAGT-GGGAAACAGA 946
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||
seq2 AAAGAAATGACCCTGGTGAGGATTTTAGCCTTGGGCAGTGGGGAAACAGA 950
seq1 ATAATGCCATTAATCAACTAAGAG-ACGCTTAGGAAGGAAGATGGGATGA 995
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||
seq2 ATAATGCCATTAATCAACTAAGAGAACGCTTAGGAAAGAAGATGGGATGA 1000
seq1 TGTGC-TGTATTTATTGTGATTAGGTTAAAACATTCTCTGAATCTGTGAC 1044
||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||
seq2 TGTGCTTGTATTTATTGTGATTAGGTT-AACCATTCTCTGAATCTGCGAC 1049
seq1 ATCAGTGTGAAGATTTTCAATAAATTTCTCAATTGTTATTT 1085
||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||
seq2 ATCGATGTG-AGATTTCCAGTACATTTCTCAATTGTTATTT 1089
| seq1: chr12_103088869_103089204
seq2: B6Ng01-216F01.g_76_132 (reverse)
seq1 ACAGACACACACACACACACACACACACACACATAATATCAAAGGGAAAC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2 ACAGACACACACACACACACACACACACACACACA--------------- 35
seq1 TGTCTTTCAAGCACACACACACACACACAGAGCTCAGGGTGGCCTCAAAT 100
|| |||||||||||||| | |
seq2 -------CACACACACACACACACATAAA--------------------- 57
seq1 TAGGAATTCTTCTGTCCTGGCTACTAAGTGCTTTACATATATTATTTTAA 150
seq2 -------------------------------------------------- 57
seq1 ATAAATTATTAAAATTAATTGCATGGGGCCCAGGACTTTCTACTCTTGTA 200
seq2 -------------------------------------------------- 57
seq1 GAGCTAGGTTTGGTTCCCAGAGCCCATATTGTGTCTTAGAACCACACGGA 250
seq2 -------------------------------------------------- 57
seq1 ACTCTAGGTTCAGGGGATCTGATGCCCTCACAGACATGAGACATGTACAC 300
seq2 -------------------------------------------------- 57
seq1 ATGGTGCACATAAAGCCATGTAAACACACACATAAA 336
seq2 ------------------------------------ 57
|
