BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-240A07
Chromosome5 (Build37)
Map Location 137,075,740 - 137,271,312
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMylc2pl, Emid2
Upstream geneRhbdd2, Por, 2010310D06Rik, Styxl1, Mdh2, 2900083I11Rik, Hspb1, Ywhag, Srcrb4d, Zp3, Dtx2, Upk3b, 2310043J07Rik, Rasa4, Polr2j, 1200011O22Rik, Alkbh4, Tmem142b, Prkrip1, LOC269718, Sh2b2, Cutl1
Downstream geneLOC677021, Rabl5, Fis1, Cldn15, Znhit1, Plod3, LOC639992, Vgf, Ap1s1, Serpine1, Trim56, Muc3, LOC100040941, Ache, 2700038N03Rik, Ars2, Trip6, Slc12a9, Ephb4, Zan, EG665591, Epo, Pop7, EG666372, Perq1, Gnb2, Actl6b, Trfr2, Mospd3, EG640050, Pcolce, Fbxo24, Lrch4, Sap25, Irs3, Hrbl, LOC624083, 6430598A04Rik, Tsc22d4, 2010007H12Rik, Bcdin3, Zcwpw1, Pilra
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-240A07.bB6Ng01-240A07.g
ACCGA050293GA050294
length1,0711,062
definitionB6Ng01-240A07.b B6Ng01-240A07.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(137,270,247 - 137,271,312)(137,075,740 - 137,076,801)
sequence
gaattctgggaatcactcacagggcctacgtgtgaagggctgagtctgga
ttgattgattgattgattgattgattgattgattatttatttatttattt
attgtaaggattgaatcttgggtttcatgtatcactgatccacgccccca
gcccctccctgggggattctaggcaggggctctaccactgagccaaactg
tatcccagttgttgttttgtttttgtttttgtttttgtttttaaacagaa
tctcactaagttgcccagattggccttggatacattctttaggtcaagtt
tttgacaacaggacagactcagtggtaaagtacttgcttaacacgcatga
ggtcctaaattcaatcctagaccacaaaatccacccatccacccacctac
acattcacaaccctcccacccacctacccattcacaaccttcccacccac
ctacccattcacaactctcccacccacctacccattcacaactctcccac
ccacctacccattcacaactctcccacccaactacccattcagacaccca
ctcactcacctacccacctacccatccattcatctatccaccaacatacc
catctacccacccactcacctatccatctacccccaccccacccccaccc
aatccacccactggtccacccacctatctgaaagaaaggaaataatgacc
cagagtcgtgttctactgaagagaaacctgctgtctgtctcagcagctaa
gagaaatcctggtcagagtcctgagaggcaagaacttcatgttccagaga
gacaccaaaatcaaattggcaggagggagaacctgaggcaaagagctaaa
gagcatacatgggagggtgttgacgatgatgtataggggcacccctcagt
gctgcggaatagcaaagaaatcatgagttccagaagaaaccagcccagcc
ccaccttcacatggcttccctggggaagcagttgtgagaaactgaagggg
ataggatggggcggagttggagggcgggtcagccaaacgtcaaggacaga
ctgcttggccgggggtggggc
gaattccagatcaaccttgatctacaaagtgagctccaacagatagccag
gactacagagagaaactttgtctccagaaaccaaaaagaagaagaagaaa
aaaaaatgttactgtttgcattgtatgtttggaacccagggcctcctagg
aaggtgctctactaatgagccacacctcagtttactgcgggattctaggc
tctagttcatattctgctgttcttggcagcatcttcctgtaagcagcatg
catccaagttagaagagaccccaaactgacgctggaaggacaacatcaag
tctaagtctggaagcattgaggttctgagtccctctgaaggtgttctgag
gtggagcagctgccttgaatcccccagggctaggaatatggctcagaggt
agagatttttgtctaggaaggttgatcgtcaaccttcctaatgctggtac
tctttaatatagtcccttgtgttgtggtgactcccaaccataaaattgtg
tttgttgctacttcataactgttattttgttactgttatgtaaatatctg
tgttttcctatggtcttaggtaaaccctatgaaagtgtcatttaactccc
aaagggctcctgacccacaggttgagaactgttggcctaaatagatcaat
ccactgactagttagagctctcgtgatcccaccacatctcaaagattgga
tactcctgctgagaaccaagaattcaagccatgagcctttgggaagatac
attgtatccgtggcctttccttacagacacactgtatcaaaggaattcaa
agttcctttcttgtccaattagaaccacagtgggcgctgagccagtgtct
agttacaaggttgacttacttttccaaagccaggttggaaggattagctg
ttgcagcccagagctctagaccatttgcttatctaggtccctttaccagg
tctaaggtagagttcccagtcaccaatcaacgtgtcataagcattcctca
gggaccaagagtgattgggagttagagctgactccggttagggtttctgc
tactgtcataaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_137270247_137271312
seq2: B6Ng01-240A07.b_46_1116 (reverse)

seq1  GCCCCACCCCCG--CCAGCAGCTCTGTCC-TGGCGTTT-GCTGACCCGCC  46
      ||||||||||||  | ||||| ||||||| || ||||| |||||||||||
seq2  GCCCCACCCCCGGCCAAGCAG-TCTGTCCTTGACGTTTGGCTGACCCGCC  49

seq1  CTCCCAACTCCGCCCCAATCCTATCCCC-TCAGTTTCTCAC-ACTGCTTC  94
      || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||
seq2  CT-CCAACTCCGCCCC-ATCCTATCCCCTTCAGTTTCTCACAACTGCTTC  97

seq1  CCCAGGGAAGCCATGTGAAGGTGGGGCTGGGCTGGTTTCTTCTGGAACTC  144
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGGAAGCCATGTGAAGGTGGGGCTGGGCTGGTTTCTTCTGGAACTC  147

seq1  ATGATTTCTTTGCTATTCCGCAGCACTGAGGGGTG-CCCTATACATCATC  193
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  ATGATTTCTTTGCTATTCCGCAGCACTGAGGGGTGCCCCTATACATCATC  197

seq1  GTCAACACCCT-CCATGTATGCTCTTTAGCTCTTTGCCTCAGGTTCTCCC  242
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAACACCCTCCCATGTATGCTCTTTAGCTCTTTGCCTCAGGTTCTCCC  247

seq1  TCCTGCCAATTTGATTTTGGTGTCTCTCTGGAACATGAAGTTCTTGCCTC  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCCAATTTGATTTTGGTGTCTCTCTGGAACATGAAGTTCTTGCCTC  297

seq1  TCAGGACTCTGACCAGGATTTCTCTTAGCTGCTGAGACAGACAGCAGGTT  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGACTCTGACCAGGATTTCTCTTAGCTGCTGAGACAGACAGCAGGTT  347

seq1  TCTCTTCAGTAGAACACGACTCTGGGTCATTATTTCCTTTCTTTCAGATA  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTCAGTAGAACACGACTCTGGGTCATTATTTCCTTTCTTTCAGATA  397

seq1  GGTGGGTGGACCAGTGGGTGGATTGGGTGGGGGTGGGGTGGGGGTAGATG  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGTGGACCAGTGGGTGGATTGGGTGGGGGTGGGGTGGGGGTAGATG  447

seq1  GATAGGTGAGTGGGTGGGTAGATGGGTATGTTGGTGGATAGATGAATGGA  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGGTGAGTGGGTGGGTAGATGGGTATGTTGGTGGATAGATGAATGGA  497

seq1  TGGGTAGGTGGGTAGGTGAGTGAGTGGGTGTCTGAATGGGTAGTTGGGTG  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTAGGTGGGTAGGTGAGTGAGTGGGTGTCTGAATGGGTAGTTGGGTG  547

seq1  GGAGAGTTGTGAATGGGTAGGTGGGTGGGAGAGTTGTGAATGGGTAGGTG  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGTTGTGAATGGGTAGGTGGGTGGGAGAGTTGTGAATGGGTAGGTG  597

seq1  GGTGGGAGAGTTGTGAATGGGTAGGTGGGTGGGAAGGTTGTGAATGGGTA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGAGAGTTGTGAATGGGTAGGTGGGTGGGAAGGTTGTGAATGGGTA  647

seq1  GGTGGGTGGGAGGGTTGTGAATGTGTAGGTGGGTGGATGGGTGGATTTTG  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGTGGGAGGGTTGTGAATGTGTAGGTGGGTGGATGGGTGGATTTTG  697

seq1  TGGTCTAGGATTGAATTTAGGACCTCATGCGTGTTAAGCAAGTACTTTAC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTCTAGGATTGAATTTAGGACCTCATGCGTGTTAAGCAAGTACTTTAC  747

seq1  CACTGAGTCTGTCCTGTTGTCAAAAACTTGACCTAAAGAATGTATCCAAG  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGAGTCTGTCCTGTTGTCAAAAACTTGACCTAAAGAATGTATCCAAG  797

seq1  GCCAATCTGGGCAACTTAGTGAGATTCTGTTTAAAAACAAAAACAAAAAC  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAATCTGGGCAACTTAGTGAGATTCTGTTTAAAAACAAAAACAAAAAC  847

seq1  AAAAACAAAACAACAACTGGGATACAGTTTGGCTCAGTGGTAGAGCCCCT  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAACAAAACAACAACTGGGATACAGTTTGGCTCAGTGGTAGAGCCCCT  897

seq1  GCCTAGAATCCCCCAGGGAGGGGCTGGGGGCGTGGATCAGTGATACATGA  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTAGAATCCCCCAGGGAGGGGCTGGGGGCGTGGATCAGTGATACATGA  947

seq1  AACCCAAGATTCAATCCTTACAATAAATAAATAAATAAATAATCAATCAA  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCCAAGATTCAATCCTTACAATAAATAAATAAATAAATAATCAATCAA  997

seq1  TCAATCAATCAATCAATCAATCAATCCAGACTCAGCCCTTCACACGTAGG  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATCAATCAATCAATCAATCAATCCAGACTCAGCCCTTCACACGTAGG  1047

seq1  CCCTGTGAGTGATTCCCAGAATTC  1066
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGTGAGTGATTCCCAGAATTC  1071

seq1: chr5_137075740_137076801
seq2: B6Ng01-240A07.g_66_1127

seq1  GAATTCCAGATCAACCTTGATCTACAAAGTGAGCTCCAACAGATAGCCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGATCAACCTTGATCTACAAAGTGAGCTCCAACAGATAGCCAG  50

seq1  GACTACAGAGAGAAACTTTGTCTCCAGAAACCAAAAAGAAGAAGAAGAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTACAGAGAGAAACTTTGTCTCCAGAAACCAAAAAGAAGAAGAAGAAA  100

seq1  AAAAAATGTTACTGTTTGCATTGTATGTTTGGAACCCAGGGCCTCCTAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAATGTTACTGTTTGCATTGTATGTTTGGAACCCAGGGCCTCCTAGG  150

seq1  AAGGTGCTCTACTAATGAGCCACACCTCAGTTTACTGCGGGATTCTAGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTGCTCTACTAATGAGCCACACCTCAGTTTACTGCGGGATTCTAGGC  200

seq1  TCTAGTTCATATTCTGCTGTTCTTGGCAGCATCTTCCTGTAAGCAGCATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGTTCATATTCTGCTGTTCTTGGCAGCATCTTCCTGTAAGCAGCATG  250

seq1  CATCCAAGTTAGAAGAGACCCCAAACTGACGCTGGAAGGACAACATCAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCAAGTTAGAAGAGACCCCAAACTGACGCTGGAAGGACAACATCAAG  300

seq1  TCTAAGTCTGGAAGCATTGAGGTTCTGAGTCCCTCTGAAGGTGTTCTGAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGTCTGGAAGCATTGAGGTTCTGAGTCCCTCTGAAGGTGTTCTGAG  350

seq1  GTGGAGCAGCTGCCTTGAATCCCCCAGGGCTAGGAATATGGCTCAGAGGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAGCAGCTGCCTTGAATCCCCCAGGGCTAGGAATATGGCTCAGAGGT  400

seq1  AGAGATTTTTGTCTAGGAAGGTTGATCGTCAACCTTCCTAATGCTGGTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATTTTTGTCTAGGAAGGTTGATCGTCAACCTTCCTAATGCTGGTAC  450

seq1  TCTTTAATATAGTCCCTTGTGTTGTGGTGACTCCCAACCATAAAATTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTAATATAGTCCCTTGTGTTGTGGTGACTCCCAACCATAAAATTGTG  500

seq1  TTTGTTGCTACTTCATAACTGTTATTTTGTTACTGTTATGTAAATATCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTGCTACTTCATAACTGTTATTTTGTTACTGTTATGTAAATATCTG  550

seq1  TGTTTTCCTATGGTCTTAGGTAAACCCTATGAAAGTGTCATTTAACTCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTTCCTATGGTCTTAGGTAAACCCTATGAAAGTGTCATTTAACTCCC  600

seq1  AAAGGGCTCCTGACCCACAGGTTGAGAACTGTTGGCCTAAATAGATCAAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGGCTCCTGACCCACAGGTTGAGAACTGTTGGCCTAAATAGATCAAT  650

seq1  CCACTGACTAGTTAGAGCTCTCGTGATCCCACCACATCTCAAAGATTGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGACTAGTTAGAGCTCTCGTGATCCCACCACATCTCAAAGATTGGA  700

seq1  TACTCCTGCTGAGAACCAAGAATTCAAGCCATGAGCCTTTGGGAAGATAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCCTGCTGAGAACCAAGAATTCAAGCCATGAGCCTTTGGGAAGATAC  750

seq1  ATTGTATCCGTGGCCTTTCCTTACAGACACACTGTATCAAAGGAATTCAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTATCCGTGGCCTTTCCTTACAGACACACTGTATCAAAGGAATTCAA  800

seq1  AGTTCCTTTCTTGTCCAATTAGAACCACAGTGGGCGCTGAGCCAGTGTCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCCTTTCTTGTCCAATTAGAACCACAGTGGGCGCTGAGCCAGTGTCT  850

seq1  AGTTACAAGGTTGACTTACTTTTCCAAAGCCAGG-TGGAAGGATTAGCTG  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  AGTTACAAGGTTGACTTACTTTTCCAAAGCCAGGTTGGAAGGATTAGCTG  900

seq1  TTGCAGCCCAGAGCTCTAGACCATTTGCTTATCTAGGTCCC-TTACCAGG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TTGCAGCCCAGAGCTCTAGACCATTTGCTTATCTAGGTCCCTTTACCAGG  950

seq1  TCTAAGGTAGAGTTCCCAGTCACCCAATCAACGTGTCATAAGCAATCCTC  998
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||
seq2  TCTAAGGTAGAGTTCCCAGTCA-CCAATCAACGTGTCATAAGCATTCCTC  999

seq1  AGGGACCAAGGAGTGATTTGGGAGTAAGAGCTGACTCC-GTTAGGGTTTC  1047
      ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||
seq2  AGGGACCAA-GAGTGA-TTGGGAGTTAGAGCTGACTCCGGTTAGGGTTTC  1047

seq1  TGCTACTGTCATAAA  1062
      |||||||||||||||
seq2  TGCTACTGTCATAAA  1062