BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-242B24
Chromosome5 (Build37)
Map Location 132,681,524 - 132,802,372
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAuts2
Upstream geneWbscr17, 4930563F08Rik
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-242B24.bB6Ng01-242B24.g
ACCGA051854GA051855
length774656
definitionB6Ng01-242B24.b B6Ng01-242B24.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(132,801,601 - 132,802,372)(132,681,524 - 132,682,177)
sequence
gaattctactgtgccattggttttgacgcaggatcttgttggatagatca
gggttacccccaaatccagatcctcccgccagagcctctcgagtgccagg
atcacgcacattacaactgtccactttatggcagcttttagaccaaaata
tcaatgagatagtactgtaattgtaaatgatgcatgtactggctctttct
agtcactggtgactgtcacttaatactaagaaatacatgtctgaaatatc
tttggttactcttgaaacacatttttattctgaagtaggactttgattag
gttttacacagctatcttaaaaaaaaaatacagagcttgttttgtttctg
tgtatgtgtgtttacctctttagttggtggtggagcctaaaaggatagac
cctaaaaatgaggtggattaaagtctcatacaatagttaacttccttcag
agtgtcagacattattaaatctgagggttaaacatgagtgaagtgtccaa
ttataagaggtcaggcagcacttggcaaaaacttgtttttccatagaggc
atataatagcagcaaactgtaattaggagtaaattcacagcgatccactg
cacctggggaggcacaaaagcacattccaagaacaattttgtttctgaag
aaactgagtttacaaagctcctcctcctccttctcctcttcctcctccac
ctcccttctccctcttcctcctcttccacctcttccttttctcctcctcc
ctctcttctacctcatcttcctcc

gaattctcttcaggacttgcataccctatggaatgtgaccctactgactc
acgggccctatgatggaacaatatggaactagatattaagtatgaatgat
gcttaattcatttactaaagatccaaagtatatctatgaatcacttcacc
cctttacctctctatgtgttccagaaaccatgcagtgtgtctggaggaag
aagagattcaacatacagctcttcaagcctggattacagaatctattcag
taaattaatacacccctcacatgtatatatgttgatgaagtttaagaaaa
aaggaaatctttgagcaccctgaacatggtaagggtatcatttcatgaaa
cctagttccctaatgtttatacatgaatgtgaatttatttttgaccatgt
atgtatatgagcacaggctgaagtgtatgtgtgtgtggggggaggttctt
gatcatgtgaacatgagtatgtacatgtgaacatgagtgtctagctcaat
aaagaacacggtggatcccctggagctacaaaaatttgagctacccaggg
tagctttctaggatccaaagttggggtctttttgaaaagcagtaagcatg
ggtcattgttgagtaataccatcagcccctaaaatatatttttaactgta
tgagct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_132801601_132802372
seq2: B6Ng01-242B24.b_47_820 (reverse)

seq1  GGAGGAAGAGGAGGTAGAAGAGAGGGAGGAGGAG-AAAGGAAGAGGGGGA  49
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||
seq2  GGAGGAAGATGAGGTAGAAGAGAGGGAGGAGGAGAAAAGGAAGAGGTGGA  50

seq1  AGAGGAGGAAGA-GGAGAAGGGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGAAGGAGGA  98
      |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGAGGAAGAGGGAGAAGGGAGGTGGAGGAGGAAGAGGAGAAGGAGGA  100

seq1  GGAGGAGCTTTGTAAACTCAGTTTCTTCAGAAACAAAATTGTTCTTGGAA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGAGCTTTGTAAACTCAGTTTCTTCAGAAACAAAATTGTTCTTGGAA  150

seq1  TGTGCTTTTGTGCCTCCCCAGGTGCAGTGGATCGCTGTGAATTTACTCCT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCTTTTGTGCCTCCCCAGGTGCAGTGGATCGCTGTGAATTTACTCCT  200

seq1  AATTACAGTTTGCTGCTATTATATGCCTCTATGGAAAAACAAGTTTTTGC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACAGTTTGCTGCTATTATATGCCTCTATGGAAAAACAAGTTTTTGC  250

seq1  CAAGTGCTGCCTGACCTCTTATAATTGGACACTTCACTCATGTTTAACCC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGCTGCCTGACCTCTTATAATTGGACACTTCACTCATGTTTAACCC  300

seq1  TCAGATTTAATAATGTCTGACACTCTGAAGGAAGTTAACTATTGTATGAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGATTTAATAATGTCTGACACTCTGAAGGAAGTTAACTATTGTATGAG  350

seq1  ACTTTAATCCACCTCATTTTTAGGGTCTATCCTTTTAGGCTCCACCACCA  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTAATCCACCTCATTTTTAGGGTCTATCCTTTTAGGCTCCACCACCA  400

seq1  ACTAAAGAGGTAAACACACATACACAGAAACAAAACAAGCTCTGTATTTT  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAAGAGGTAAACACACATACACAGAAACAAAACAAGCTCTGTATTTT  450

seq1  TTTTTTAAGATAGCTGTGTAAAACCTAATCAAAGTCCTACTTCAGAATAA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTAAGATAGCTGTGTAAAACCTAATCAAAGTCCTACTTCAGAATAA  500

seq1  AAATGTGTTTCAAGAGTAACCAAAGATATTTCAGACATGTATTTCTTAGT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGTGTTTCAAGAGTAACCAAAGATATTTCAGACATGTATTTCTTAGT  550

seq1  ATTAAGTGACAGTCACCAGTGACTAGAAAGAGCCAGTACATGCATCATTT  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAGTGACAGTCACCAGTGACTAGAAAGAGCCAGTACATGCATCATTT  600

seq1  ACAATTACAGTACTATCTCATTGATATTTTGGTCTAAAAGCTGCCATAAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAATTACAGTACTATCTCATTGATATTTTGGTCTAAAAGCTGCCATAAA  650

seq1  GTGGACAGTTGTAATGTGCGTGATCCTGGCACTCGAGAGGCTCTGGCGGG  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGACAGTTGTAATGTGCGTGATCCTGGCACTCGAGAGGCTCTGGCGGG  700

seq1  AGGATCTGGATTTGGGGGTAACCCTGATCTATCCAACAAGATCCTGCGTC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCTGGATTTGGGGGTAACCCTGATCTATCCAACAAGATCCTGCGTC  750

seq1  AAAACCAATGGCACAGTAGAATTC  772
      ||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACCAATGGCACAGTAGAATTC  774


seq1: chr5_132681524_132682177
seq2: B6Ng01-242B24.g_65_720

seq1  GAATTCTCTTCAGGACTTGCATACCCTATGGAATGTGACCCTACTGACTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTTCAGGACTTGCATACCCTATGGAATGTGACCCTACTGACTC  50

seq1  ACGGGCCCTATGATGGAACAATATGGAACTAGATATTAAGTATGAATGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGGCCCTATGATGGAACAATATGGAACTAGATATTAAGTATGAATGAT  100

seq1  GCTTAATTCATTTACTAAAGATCCAAAGTATATCTATGAATCACTTCACC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTAATTCATTTACTAAAGATCCAAAGTATATCTATGAATCACTTCACC  150

seq1  CCTTTACCTCTCTATGTGTTCCAGAAACCATGCAGTGTGTCTGGAGGAAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTACCTCTCTATGTGTTCCAGAAACCATGCAGTGTGTCTGGAGGAAG  200

seq1  AAGAGATTCAACATACAGCTCTTCAAGCCTGGATTACAGAATCTATTCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGATTCAACATACAGCTCTTCAAGCCTGGATTACAGAATCTATTCAG  250

seq1  TAAATTAATACACCCCTCACATGTATATATGTTGATGAAGTTTAAGAAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATTAATACACCCCTCACATGTATATATGTTGATGAAGTTTAAGAAAA  300

seq1  AAGGAAATCTTTGAGCACCCTGAACATGGTAAGGGTATCATTTCATGAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAATCTTTGAGCACCCTGAACATGGTAAGGGTATCATTTCATGAAA  350

seq1  CCTAGTTCCCTAATGTTTATACATGAATGTGAATTTATTTTTGACCATGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGTTCCCTAATGTTTATACATGAATGTGAATTTATTTTTGACCATGT  400

seq1  ATGTATATGAGCACAGGCTGAAGTGTATGTGTGTGTGGGGGGAGGTTCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATATGAGCACAGGCTGAAGTGTATGTGTGTGTGGGGGGAGGTTCTT  450

seq1  GATCATGTGAACATGAGTATGTACATGTGAACATGAGTGTCTAGCTCAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCATGTGAACATGAGTATGTACATGTGAACATGAGTGTCTAGCTCAAT  500

seq1  AAAGAACACGGTGGATCCCCTGGAGCTACAAAAATTTGAGCTACCCAGGG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAACACGGTGGATCCCCTGGAGCTACAAAAATTTGAGCTACCCAGGG  550

seq1  TAGC-TTCTAGGATCCAAAGTT-GGGTCCTTTTGAAAAGCAGTAAGCATG  598
      |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTTCTAGGATCCAAAGTTGGGGTCTTTTTGAAAAGCAGTAAGCATG  600

seq1  GGTCATTGTTGAGTAATACCATCAGCCCCTAAAATATATTTTTAACTGTA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCATTGTTGAGTAATACCATCAGCCCCTAAAATATATTTTTAACTGTA  650

seq1  TGAGCT  654
      ||||||
seq2  TGAGCT  656


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |