seq1: chr5_119423402_119423486
seq2: B6Ng01-249F21.b_52_136 (reverse)
seq1 TCCCTCTACCCACTCCTCTCTCCTCTAGTCTCCTCTCTCCTCCTCCCTTC 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCCTCTACCCACTCCTCTCTCCTCTAGTCTCCTCTCTCCTCCTCCCTTC 50
seq1 TTCCATGAACCTCGTAGAGCAGATATTTTCATCTG 85
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCCATGAACCTCGTAGAGCAGATATTTTCATCTG 85
| seq1: chr5_119213711_119214781
seq2: B6Ng01-249F21.g_68_1159
seq1 GAATTCTTACAGAAAGCCAGGTCTCTCCTTTCATTAGATCAAAAGGGACT 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAATTCTTACAGAAAGCCAGGTCTCTCCTTTCATTAGATCAAAAGGGACT 50
seq1 CGTGTACATATCACAACCAAAGTGTTTGCTCACGAAACCAGTTACAAACA 100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CGTGTACATATCACAACCAAAGTGTTTGCTCACGAAACCAGTTACAAACA 100
seq1 CAGTGAATTTTTTCTGGACCATAGGAATATTGTTTCAAAGAAATAGTGCA 150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CAGTGAATTTTTTCTGGACCATAGGAATATTGTTTCAAAGAAATAGTGCA 150
seq1 ACTCAACCGTTACATCAGTACTTGAAGCTGAGCCTCTATGTGGGACTTTA 200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ACTCAACCGTTACATCAGTACTTGAAGCTGAGCCTCTATGTGGGACTTTA 200
seq1 AAAAAAAAAAAAAAAGCCTTTTTAAAGCATTCGCAGCTGATTGAAGTATT 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAAAAAAAAAAAAAAGCCTTTTTAAAGCATTCGCAGCTGATTGAAGTATT 250
seq1 CTTGACTCCCTGTCCCAGACCTTAGGGTTGACTTTGAAACCCTGTTTCTA 300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTTGACTCCCTGTCCCAGACCTTAGGGTTGACTTTGAAACCCTGTTTCTA 300
seq1 GCCCTTATGTCGTATGTTTCTGTCTGTGGGTGGTGGGTGTAGACCGGCTT 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCCCTTATGTCGTATGTTTCTGTCTGTGGGTGGTGGGTGTAGACCGGCTT 350
seq1 CCCAGAGCCTCCTGACAGGCCCGGCACTGAGCCCGGCTCCCGTGGGAGAG 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCCAGAGCCTCCTGACAGGCCCGGCACTGAGCCCGGCTCCCGTGGGAGAG 400
seq1 TCATGCAAACTAAGTTCTTCCAAGAGACTTTCATGTCCTGGTTATTAACA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCATGCAAACTAAGTTCTTCCAAGAGACTTTCATGTCCTGGTTATTAACA 450
seq1 AAGAAAAGGAAAAAAATGTAATAATTGATATGGTTTTGTAAAAGTATTTT 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAGAAAAGGAAAAAAATGTAATAATTGATATGGTTTTGTAAAAGTATTTT 500
seq1 TCTTGAGATAATCTAACGTTTAAAACATTATATTAACATGTGGTGGGGAT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTTGAGATAATCTAACGTTTAAAACATTATATTAACATGTGGTGGGGAT 550
seq1 GTGAAAGCAGAGAAATAACTTGTACATGGGTGACTGTTCTCTGTCTCACC 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GTGAAAGCAGAGAAATAACTTGTACATGGGTGACTGTTCTCTGTCTCACC 600
seq1 AACTGGGGGGGTTGCTTTCCAATGTATAGCTTAAAAAATCTGATATATCA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AACTGGGGGGGTTGCTTTCCAATGTATAGCTTAAAAAATCTGATATATCA 650
seq1 AACCGTTTGTATCTAACGTGTACAGTGTAAAATTGACTTAAAATATCGCA 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AACCGTTTGTATCTAACGTGTACAGTGTAAAATTGACTTAAAATATCGCA 700
seq1 G-TGCTA--TTTTTTCTTATCAGCGAGGAAATCCTCAAGGCC-TTTTGAA 746
| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2 GTTGCTATTTTTTTTCTTATCAGCGAGGAAATCCTCAAGGCCTTTTTGAA 750
seq1 GAGCGTAAGATGACGGAGA-TGTAAAC-TTGTAT-AAAGTCACCTCGGGG 793
||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||
seq2 GAGCGTAAGATGACGGAGATTGTAAACTTTGTATAAAAGTCACCTCGGGG 800
seq1 AGGACGGGCTGTAAACTAGATATTTGTAAT-CTTTACC-ACTTGGGATTG 841
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||
seq2 AGGACGGGCTGTAAACTAGATATTTGTAATCCTTTACCAACTTGGGATTG 850
seq1 CTTCCTCTCAGAG-TTCACC-AGAAC-TTTGAATTT-CTCTCTCTCTCTC 887
||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||
seq2 CTTCCTCTCAGAGTTTCACCAAGAACTTTTGAATTTCCTCTCTCTCTCTC 900
seq1 --TCTTTTTTAAATGGG-CTG-TTTTTAC-TGC-AGGGGCTTTT--CTTC 929
||||||| || |||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||||
seq2 CTTCTTTTTAAATTGGGCCTGTTTTTTACATGCAAGGGGCTTTTTGCTTC 950
seq1 CCTAGA--AACCCAACTCTACGCAGAAAAAGTGAAAA-GGAAAAAAAAAA 976
|||||| | |||| |||| ||| ||||| ||||||| |||||||| | |
seq2 CCTAGAATACCCCATCTCTTCGCCGAAAAGGTGAAAACGGAAAAAATATA 1000
seq1 CACAAAAAAAACCAGAAAAAAAAGCTATAAAAAGTTTTAAAAGAAGGCAG 1026
| | || || || |||||||||||||| |||||||| | | ||| ||
seq2 C-CTAATTAACCCTGAAAAAAAAGCTAT-AAAAGTTTCACA--GAGGGAG 1046
seq1 CAAA-GGGTAGTTTCCATCTGGTGTCTTTTATTTAAGTTTTT-TAAG 1071
|||| || || | || ||||||||| ||||| ||||||||| ||||
seq2 CAAATGGTTAATCTCTCTCTGGTGTC-TTTATATAAGTTTTTCTAAG 1092
|