BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-267O15
Chromosome5 (Build37)
Map Location 9,151,288 - 9,251,097
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDmtf1
Upstream geneAdam22, Dbf4, Slc25a40, Gm440, Abcb1a, EG330031, Abcb1b, Abcb4, Crot, 4930420K17Rik
Downstream geneLOC654361, 9330182L06Rik, Grm3, LOC100042768, LOC625446, LOC435832, LOC100041395, LOC381612
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-267O15.bB6Ng01-267O15.g
ACCGA070912GA070913
length1,1481,137
definitionB6Ng01-267O15.b B6Ng01-267O15.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(9,151,288 - 9,152,454)(9,249,962 - 9,251,097)
sequence
gaattccagtttaaattgctgtccatcacttgctgttttgtatgtaacag
cacatttggtgtgcttgttctcaaacaattggagtcttagaacaaggtca
gtatcttgtggctaacagagatcaaagtactggactactaatgcctgatt
gaagtctacagaatcttataatatagttcttgtttcaacaggttttcccc
atataccttttactgataaaacagacaaaagtcttgaagtgtattcaatt
actcagtatatgacccacataggtatcaatccatttatatatagtttaat
tccatttaaattttttcctttggcaaaaaacacaactatattaatgttta
catggtaaagcttcaatgagtagtatgcgcttactatatcaaagaactta
attttacaattgtaatgacaccattttcaagataaagatgaatggaactc
ctggtgtagttatgaggtctgctaaccactgggtggattctgcaataaag
ggagacttacctagaccacaggtggattagctacaggccttcccatagaa
tcccacctctgtgcttcggccagcagcatcactcacgttaaccaaactgc
ttctcctccatgcttgtgcatctgtgatcctctagaacacggacagcaga
atacgaggctcagacacaacaagtactatttgagtactagttataatgct
atagcactttggcctcacacctgatacctcacccaccagagaaagacaca
actttcttctgcatgcattttatggcaagctgcctgaacaccagtattgt
ataaacaaagacagaaacaatccattctttatccacttagagctcataga
aagtttcttaacccaagcagccactcagcaaacagtcagatgtcctctga
aaacaggtttaggtatacaagtggttacagtaaccttggaaccactgtgc
acttaccgcatatgaaactaacattcccaccagtatatattaacacccct
gaaataccttatttcatctaaaccattaaaattatttacacatctatcat
cagaaccacataagagacagttaaacaccctataaaggatcaggaggtca
gcacatttctgggtatagctatttctacatatccctcgtatggaaaga
gaattctctatccactcagagtcctaactcttctttaaactgtcataaga
cagacacttcataatgatagtttttgtggatatagtacccaactccaaga
acagcggccttaatcatttttctataaaaagattttattgaccaaaagca
acactggtgagatgacatctagtcatggcatccactaagttaacagaagc
agcatggtggcctccaaactatccagattgttgttccagcaagaacaaaa
gcttgttctacactggaagaaatgtggtgcaatccgcagaagaaaagtca
atgtaacaatttttcaattgatcattagcctgtggtggtcgccagctatc
agttctttattgagacgtgtgtgatcttcattactatggtggtaggccct
tcgttgtgtatgacttcattgacaattgactgacatcaacatgatgggtc
aactgactcatgtgatcatagtccctttgtttaaaacaaatggttctcaa
atggttcattcaccattattctccaatcttccttaccaccagccttctga
tcttgttgtctgccatcttttcccctacgtagccaaacctctccatacct
atgaactgtagatatttgatcacaccatcatccaggtaatatataccaag
ttatatgcattactggactgccctttctccactgtcccacagggcttatt
tttaaagttggcccttaagtttaaaaataaaaataatttaaggctaagaa
taatgaaccaaaaggcaaggaaaaattaaatcacttataagcagaatgtt
ccactaaatgagacagtaaatgctgacacaattattcccgtgagacacat
tattcaaagggcagtaacaaggtccattgtgaagcatatctcaatgtttg
catatctattaactaatattgaccttgctatgggtaggagtattataaga
tgttaaagcagttatagaacaaaattttattattatacatgtatgaacct
gtcagagtaaaaatgggaaaaaataaaatttattttgacagagttttcag
tcattttttcaactttcctatttagaagaaatgcaagtgtgaatgccatg
ttacattttcaattctcattcccaagatgtctcaggt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr5_9151288_9152454
seq2: B6Ng01-267O15.b_46_1193

seq1  GAATTCCAGTTTAAATTGCTGTCCATCACTTGCTGTTTTGTATGTAACAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTTTAAATTGCTGTCCATCACTTGCTGTTTTGTATGTAACAG  50

seq1  CACATTTGGTGTGCTTGTTCTCAAACAATTGGAGTCTTAGAACAAGGTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATTTGGTGTGCTTGTTCTCAAACAATTGGAGTCTTAGAACAAGGTCA  100

seq1  GTATCTTGTGGCTAACAGAGATCAAAGTACTGGACTACTAATGCCTGATT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCTTGTGGCTAACAGAGATCAAAGTACTGGACTACTAATGCCTGATT  150

seq1  GAAGTCTACAGAATCTTATAATATAGTTCTTGTTTCAACAGGTTTTCCCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTCTACAGAATCTTATAATATAGTTCTTGTTTCAACAGGTTTTCCCC  200

seq1  ATATACCTTTTACTGATAAAACAGACAAAAGTCTTGAAGTGTATTCAATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACCTTTTACTGATAAAACAGACAAAAGTCTTGAAGTGTATTCAATT  250

seq1  ACTCAGTATATGACCCACATAGGTATCAATCCATTTATATATAGTTTAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGTATATGACCCACATAGGTATCAATCCATTTATATATAGTTTAAT  300

seq1  TCCATTTAAATTTTTTCCTTTGGCAAAAAACACAACTATATTAATGTTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTTAAATTTTTTCCTTTGGCAAAAAACACAACTATATTAATGTTTA  350

seq1  CATGGTAAAGCTTCAATGAGTAGTATGCGCTTACTATATCAAAGAACTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGGTAAAGCTTCAATGAGTAGTATGCGCTTACTATATCAAAGAACTTA  400

seq1  ATTTTACAATTGTAATGACACCATTTTCAAGATAAAGATGAATGGAACTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTACAATTGTAATGACACCATTTTCAAGATAAAGATGAATGGAACTC  450

seq1  CTGGTGTAGTTATGAGGTCTGCTAACCACTGGGTGGATTCTGCAATAAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGTAGTTATGAGGTCTGCTAACCACTGGGTGGATTCTGCAATAAAG  500

seq1  GGAGACTTACCTAGACCACAGGTGGATTAGCTACAGGCCTTCCCATAGAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGACTTACCTAGACCACAGGTGGATTAGCTACAGGCCTTCCCATAGAA  550

seq1  TCCCACCTCTGTGCTTCGGCCAGCAGCATCACTCACGTTAACCAAACTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCACCTCTGTGCTTCGGCCAGCAGCATCACTCACGTTAACCAAACTGC  600

seq1  TTCTCCTCCATGCTTGTGCATCTGTGATCCTCTAGAACACGGACAGCAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCCTCCATGCTTGTGCATCTGTGATCCTCTAGAACACGGACAGCAGA  650

seq1  ATACGAGGCTCAGACACAACAAGTACTATTTGAGTACTAGTTATAATGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACGAGGCTCAGACACAACAAGTACTATTTGAGTACTAGTTATAATGCT  700

seq1  ATAGCACTTTGGCCTCACACCTGATACCTCACCCACCAGAGAAAGACACA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCACTTTGGCCTCACACCTGATACCTCACCCACCAGAGAAAGACACA  750

seq1  ACTTTCTTCTGCATGCATTTTATGGCAAGCTGCCTGAACACCAGTATTGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTCTTCTGCATGCATTTTATGGCAAGCTGCCTGAACACCAGTATTGT  800

seq1  ATAAACAAAGACAGAAACAATCCATTCTTTATCCACTTAGAGCTCATAGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAACAAAGACAGAAACAATCCATTCTTTATCCACTTAGAGCTCATAGA  850

seq1  AAGTTTCTTAACCCAAGCAGCCACTCAGCAAACAGTCAGATGTCCTCTGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTCTTAACCCAAGCAGCCACTCAGCAAACAGTCAGATGTCCTCTGA  900

seq1  AAACAGGTTTAGGTATACAAGTGGTTACAGTAAACCTTGGAACCACTGTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AAACAGGTTTAGGTATACAAGTGGTTACAGT-AACCTTGGAACCACTGTG  949

seq1  CACTTACCGCATATGAAAAACTAACATTCCCACCAGTAATATATTAACAC  1000
      |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  CACTTACCGCATATG--AAACTAACATTCCCACCAGT-ATATATTAACAC  996

seq1  CCCTGAAATACCTTATTTCATCTTAAACCATTAAAAATTATTTACAACAT  1050
      |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||
seq2  CCCTGAAATACCTTATTTCATC-TAAACCATT-AAAATTATTTAC-ACAT  1043

seq1  CTATTCAATCAGAAACCACATAAGAGGACAGGTAAACAACCCTATAAAGG  1100
      ||||   ||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||
seq2  CTAT--CATCAG-AACCACATAAGA-GACAGTTAAAC-ACCCTATAAAGG  1088

seq1  AATCAGGAGGTCAGCAACATTTTCTGGGTATAGCTAATTTCTAACATATC  1150
       |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||
seq2  -ATCAGGAGGTCAGC-ACA-TTTCTGGGTATAGCT-ATTTCT-ACATATC  1133

seq1  CCTCAGTATGGAGAAGA  1167
      |||| ||||||| ||||
seq2  CCTC-GTATGGA-AAGA  1148

seq1: chr5_9249962_9251097
seq2: B6Ng01-267O15.g_66_1202 (reverse)

seq1  ACCTGAGACATCTGGGGAAATGAGATGGAAAAATGT-ACATGCCAATCAC  49
      ||||||||||||| ||| |||||||    ||||||| ||||| || ||||
seq2  ACCTGAGACATCTTGGG-AATGAGAATTGAAAATGTAACATGGCATTCAC  49

seq1  ACTTGCATTTCTCTTAAAATAGGGAAGTTG-AAAAATGACTTAAAAACTC  98
      |||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||||| | |||||||
seq2  ACTTGCATTTCT-TCTAAATAGGAAAGTTGAAAAAATGAC-TGAAAACTC  97

seq1  TGTC-ACATAAATTTTA-TTTTTCCCATTTTTAACTCTGACAGTTTCATA  146
      |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||
seq2  TGTCAAAATAAATTTTATTTTTTCCCATTTTT-ACTCTGACAGGTTCATA  146

seq1  CATGTAT-ATAATAAAATTTTGTTCTATAACTGCTTTAACATCTTATAAT  195
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTATAATAATAAAATTTTGTTCTATAACTGCTTTAACATCTTATAAT  196

seq1  ACTCCTACCCATAGCAAGGTCAATATTAGTTAATAGATATGCAAACATTG  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCCTACCCATAGCAAGGTCAATATTAGTTAATAGATATGCAAACATTG  246

seq1  AGATATGCTTCACAATGGACCTTGTTACTGCCCTTTGAATAATGTGTCTC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATGCTTCACAATGGACCTTGTTACTGCCCTTTGAATAATGTGTCTC  296

seq1  ACGGGAATAATTGTGTCAGCATTTACTGTCTCATTTAGTGGAACATTCTG  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGGAATAATTGTGTCAGCATTTACTGTCTCATTTAGTGGAACATTCTG  346

seq1  CTTATAAGTGATTTAATTTTTCCTTGCCTTTTGGTTCATTATTCTTAGCC  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATAAGTGATTTAATTTTTCCTTGCCTTTTGGTTCATTATTCTTAGCC  396

seq1  TTAAATTATTTTTATTTTTAAACTTAAGGGCCAACTTTAAAAATAAGCCC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATTATTTTTATTTTTAAACTTAAGGGCCAACTTTAAAAATAAGCCC  446

seq1  TGTGGGACAGTGGAGAAAGGGCAGTCCAGTAATGCATATAACTTGGTATA  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGACAGTGGAGAAAGGGCAGTCCAGTAATGCATATAACTTGGTATA  496

seq1  TATTACCTGGATGATGGTGTGATCAAATATCTACAGTTCATAGGTATGGA  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTACCTGGATGATGGTGTGATCAAATATCTACAGTTCATAGGTATGGA  546

seq1  GAGGTTTGGCTACGTAGGGGAAAAGATGGCAGACAACAAGATCAGAAGGC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGTTTGGCTACGTAGGGGAAAAGATGGCAGACAACAAGATCAGAAGGC  596

seq1  TGGTGGTAAGGAAGATTGGAGAATAATGGTGAATGAACCATTTGAGAACC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGGTAAGGAAGATTGGAGAATAATGGTGAATGAACCATTTGAGAACC  646

seq1  ATTTGTTTTAAACAAAGGGACTATGATCACATGAGTCAGTTGACCCATCA  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGTTTTAAACAAAGGGACTATGATCACATGAGTCAGTTGACCCATCA  696

seq1  TGTTGATGTCAGTCAATTGTCAATGAAGTCATACACAACGAAGGGCCTAC  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGATGTCAGTCAATTGTCAATGAAGTCATACACAACGAAGGGCCTAC  746

seq1  CACCATAGTAATGAAGATCACACACGTCTCAATAAAGAACTGATAGCTGG  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCATAGTAATGAAGATCACACACGTCTCAATAAAGAACTGATAGCTGG  796

seq1  CGACCACCACAGGCTAATGATCAATTGAAAAATTGTTACATTGACTTTTC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGACCACCACAGGCTAATGATCAATTGAAAAATTGTTACATTGACTTTTC  846

seq1  TTCTGCGGATTGCACCACATTTCTTCCAGTGTAGAACAAGCTTTTGTTCT  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGCGGATTGCACCACATTTCTTCCAGTGTAGAACAAGCTTTTGTTCT  896

seq1  TGCTGGAACAACAATCTGGATAGTTTGGAGGCCACCATGCTGCTTCTGTT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGAACAACAATCTGGATAGTTTGGAGGCCACCATGCTGCTTCTGTT  946

seq1  AACTTAGTGGATGCCATGACTAGATGTCATCTCACCAGTGTTGCTTTTGG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTAGTGGATGCCATGACTAGATGTCATCTCACCAGTGTTGCTTTTGG  996

seq1  TCAATAAAATCTTTTTATAGAAAAATGATTAAGGCCGCTGTTCTTGGAGT  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATAAAATCTTTTTATAGAAAAATGATTAAGGCCGCTGTTCTTGGAGT  1046

seq1  TGGGTACTATATCCACAAAAACTATCATTATGAAGTGTCTGTCTTATGAC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTACTATATCCACAAAAACTATCATTATGAAGTGTCTGTCTTATGAC  1096

seq1  AGTTTAAAGAAGAGTTAGGACTCTGAGTGGATAGAGAATTC  1136
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTAAAGAAGAGTTAGGACTCTGAGTGGATAGAGAATTC  1137